Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 92,702 (bp)   Positions: 309
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.0
.0
.006
.0
.003
.0
.0
.0
.0
.004
.002
.006
.0
.013
.001
.004
.0
.001
.0
.001
.0
.0
.003
.008
.001
.002
.031
.026
.007
.006
.01
.0
.001
.0
.001
.0
.001
.0
.0
.022
.004
.039
.641
.038
.001
.9
.892
.001
.034
.065
.171
.002
.001
.409
.08
.032
.008
.002
.0
.011
.001
.002
.012
.097
.083
.081
.016
.878
.023
.078
.0
.977
.987
.224
.111
.318
.001
.002
.026
.009
.0
.008
.001
.001
.019
.0
.011
.0
.001
.017
.007
.0
.0
.0
.0
.0
.002
.001
.015
.0
.027
.0
.005
.447
.001
.01
.0
.093
.073
.264
.0
.016
.03
.006
.005
.0
.024
.0
.98
.965
.966
.031
.07
.003
.004
.002
.0
.012
.002
.019
.019
.009
.032
.102
.193
.003
.003
.01
.001
.019
--
--
--
.006
.0
.0
.066
.154
.006
.007
.0
.001
.004
.042
.056
.004
.008
.0
.002
.002
.004
.001
.01
.002
.001
.002
.008
.001
.001
.052
.016
.036
.001
.002
.0
.0
.003
.004
.001
.022
.0
.002
.005
.0
.0
.001
.0
.02
--
.009
.01
.0
.024
.0
.006
.002
.0
.007
.0
.005
.003
.0
.002
.068
.001
.002
.004
.009
.145
--
--
--
--
.0
.001
.004
.223
.102
.0
.0
.001
.001
.117
.0
.0
.012
.001
.0
.001
.0
.0
.006
.001
.047
--
.0
.0
.007
.0
.0
.007
.003
.007
.012
.001
.002
.001
.172
.128
.112
.003
.004
.007
.004
.0
.013
.004
.002
.931
.658
.0
.001
.0
.015
.0
.005
.005
.069
.047
.072
.008
.069
.035
.021
.077
.008
--
--
.014
.003
.0
.015
.019
1.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.031
.0
.0
.001
.179
.0
.065
--
.006
.0
Pde9a
Pde9a
Pde9a
Pde9a
Pde9a
Pde9a
Pde9a
Pde9a
Pde9a
Pde9a
Pde9a
Pde9a
Pde9a
Pde9a
Pde9a
Pde9a
Pde9a
Pde9a
Pde9a
Pde9a
Pde9a
Pde9a
Pde9a
Pde9a
Pde9a
Pde9a
Pde9a
Pde9a
Pde9a
Pde9a
Pde9a
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
G
A
-
T
-
T
C
A
A
A
G
T
C
T
C
T
T
T
A
G
T
4
T
-
T
C
-
A
A
A
G
A
-
T
G
T
C
G
G
120
-
A
8
A
G
A
-
G
A
T
G
-
T
G
G
T
G
G
G
G
G
G
A
A
T
C
T
A
C
T
C
G
C
4
G
A
G
G
G
A
T
A
G
G
G
C
A
C
T
C
G
T
T
G
C
C
T
T
C
C
C
A
A
C
G
A
A
A
A
C
C
A
G
C
T
C
A
G
G
T
G
C
C
T
G
T
C
C
A
A
G
-
G
-
-
A
C
A
T
A
-
-
-
G
2
C
G
T
T
C
G
-
A
G
A
T
A
A
C
T
A
A
A
C
T
20
5
6
A
A
G
G
G
A
G
G
C
G
C
-
G
G
G
T
C
-
C
C
T
T
-
A
C
C
G
C
A
G
T
-
-
C
A
G
C
A
G
C
-
G
A
G
C
G
G
G
A
A
A
T
G
G
A
A
T
T
4
A
C
G
G
G
G
A
G
G
C
C
A
C
G
-
T
A
T
G
C
-
-
-
-
-
-
G
T
A
A
A
T
T
C
C
A
C
C
G
G
-
C
T
A
-
C
G
-
T
C
16
-
A
A
A
A
A
T
G
A
C
C
G
C
C
C
G
C
C
A
G
-
C
G
A
A
A
A
C
C
C
A
  10,123,874
  10,124,406
  10,124,574
  10,124,677
  10,124,829
  10,125,376
  10,125,729
  10,126,005
  10,126,657
  10,126,711
  10,126,771
  10,126,853
  10,126,865
  10,126,868
  10,127,379
  10,127,479
  10,127,658
  10,127,659
  10,127,685
  10,127,910
  10,128,008
  10,128,010
  10,128,192
  10,128,404
  10,128,468
  10,128,470
  10,128,532
  10,128,735
  10,128,756
  10,128,873
  10,129,220
  10,129,290
  10,129,470
  10,129,534
  10,129,877
  10,129,892
  10,130,194
  10,130,208
  10,130,220
  10,130,276
  10,130,439
  10,130,453
  10,130,467
  10,130,672
  10,130,682
  10,130,751
  10,130,753
  10,130,813
  10,130,936
  10,130,963
  10,130,994
  10,131,151
  10,131,545
  10,131,804
  10,131,964
  10,132,049
  10,132,068
  10,132,353
  10,132,867
  10,133,237
  10,133,513
  10,133,520
  10,133,622
  10,133,821
  10,134,087
  10,134,341
  10,134,350
  10,134,556
  10,134,833
  10,134,951
  10,135,010
  10,136,114
  10,137,969
  10,138,105
  10,138,165
  10,138,367
  10,138,781
  10,138,810
  10,138,910
  10,138,991
  10,139,422
  10,139,641
  10,139,648
  10,139,855
  10,140,305
  10,141,071
  10,141,338
  10,144,406
  10,145,461
  10,146,097
  10,146,602
  10,147,355
  10,147,356
  10,147,358
  10,147,359
  10,147,360
  10,147,482
  10,147,491
  10,147,617
  10,147,638
  10,148,022
  10,148,387
  10,149,091
  10,150,379
  10,151,115
  10,151,472
  10,152,392
  10,153,091
  10,153,108
  10,153,170
  10,154,189
  10,154,194
  10,155,305
  10,156,305
  10,156,881
  10,156,917
  10,157,243
  10,157,502
  10,159,892
  10,160,218
  10,160,219
  10,160,658
  10,160,675
  10,160,921
  10,161,732
  10,162,864
  10,164,009
  10,164,039
  10,164,247
  10,164,532
  10,164,570
  10,164,635
  10,167,361
  10,168,883
  10,169,000
  10,169,508
  10,169,738
  10,170,347
  10,170,660
  10,174,242
  10,176,341
  10,176,377
  10,177,268
  10,183,368
  10,183,869
  10,185,398
  10,185,758
  10,186,007
  10,186,441
  10,186,442
  10,186,756
  10,186,774
  10,186,858
  10,186,865
  10,186,869
  10,186,912
  10,186,920
  10,186,926
  10,186,928
  10,186,942
  10,186,971
  10,186,987
  10,187,033
  10,187,044
  10,187,096
  10,187,169
  10,187,192
  10,187,201
  10,187,243
  10,187,258
  10,187,273
  10,187,274
  10,187,310
  10,187,323
  10,187,327
  10,187,386
  10,187,395
  10,187,481
  10,187,991
  10,188,668
  10,189,687
  10,189,688
  10,189,879
  10,189,921
  10,189,958
  10,190,287
  10,190,898
  10,191,291
  10,191,384
  10,192,004
  10,192,544
  10,192,693
  10,192,816
  10,193,300
  10,193,432
  10,193,483
  10,193,589
  10,194,220
  10,194,311
  10,194,545
  10,194,734
  10,194,790
  10,194,812
  10,194,907
  10,195,236
  10,195,237
  10,195,465
  10,195,795
  10,196,015
  10,196,241
  10,196,242
  10,196,247
  10,196,260
  10,196,623
  10,197,386
  10,197,835
  10,197,897
  10,197,898
  10,197,937
  10,198,351
  10,198,396
  10,198,771
  10,199,678
  10,200,577
  10,200,930
  10,201,081
  10,201,353
  10,201,502
  10,201,565
  10,201,582
  10,201,637
  10,201,675
  10,202,102
  10,202,291
  10,202,725
  10,203,117
  10,203,243
  10,203,309
  10,203,340
  10,203,481
  10,203,841
  10,203,905
  10,204,008
  10,204,101
  10,204,188
  10,204,196
  10,204,385
  10,204,557
  10,204,601
  10,204,602
  10,204,614
  10,204,615
  10,204,616
  10,205,421
  10,205,501
  10,205,518
  10,205,529
  10,205,572
  10,205,687
  10,205,698
  10,206,087
  10,206,318
  10,206,333
  10,206,346
  10,206,367
  10,206,670
  10,206,790
  10,206,812
  10,206,843
  10,206,848
  10,207,037
  10,207,168
  10,207,381
  10,208,536
  10,209,135
  10,209,176
  10,209,191
  10,209,232
  10,209,352
  10,210,357
  10,210,393
  10,210,486
  10,210,798
  10,211,104
  10,212,125
  10,212,162
  10,212,167
  10,212,184
  10,212,252
  10,212,272
  10,212,285
  10,212,594
  10,212,664
  10,212,685
  10,212,692
  10,212,713
  10,212,716
  10,212,787
  10,212,877
  10,213,072
  10,213,595
  10,213,599
  10,213,654
  10,214,156
  10,214,234
  10,214,477
  10,215,397
  10,215,679
  10,216,264
C
G
13
G
8
C
T
G
G
G
A
C
T
C
T
C
C
C
G
A
C
-
C
15
C
G
2
T
G
G
A
C
18
C
A
C
T
A
A
-
T
T
-
G
A
G
G
A
-
G
A
4
C
A
A
C
C
A
-
C
A
T
G
G
C
T
C
G
A
G
T
A
G
4/-
A
G
A
A
A
-
C
G
A
A
A
T
G
T
C
A
A
A
A
A
A
A
C
G
-
A
C/-
C
G
T
A
G
G
G
T
G
G
G
A
T
C
A
G
-
-
C
A
T
T
C
A
C
G
A
G
G
A
T
T
T
G
G
T
G
C
G
-/T
G
T
A
-
A
T
G
G
T
A
10
G
A
G
C
G
G
T
C
T
G
G
G
A
-
-
-
G
T
A
C
A
G
A
-
-
A
T
4
C
T
A
C
T
G
T
T
-
C
C
G
T
G
A
T
G
A
C
3
52
T
G
A
T
G
A
T
3
A
G
T
T
A
A
C
T
G
G
G
A
T
G
C
G
C
-
C
A
T
A
A
A
G
A
T
A
-
C
T
A
A
C
G
C
C
A
4
2
16
2
T
4
A
G
-
C
G
C
-
T
T
G
A
T
A
A
4
A
C
G
2
T
A
A
C
A
-
2
G
C
G
G
G
C
G/A
A/G
C/T
C/A
G/A
C/A
T
T
G/A
C/T
C/T
A/G
-
-/A
A
C
G
G
G
G
T
T
T
G