Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 314,065 (bp)   Positions: 340
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.06
.0
.0
.002
.001
.0
.003
.0
.137
.837
.114
.037
.009
.007
.027
.02
.22
.177
.001
.157
.001
--
--
--
--
--
--
.0
.012
.067
.007
.002
.014
.001
.998
.17
.001
.0
.007
.008
.026
.022
.039
.0
.0
.0
.998
.968
.0
1.0
.001
.0
.007
.045
.001
.245
.093
.006
.004
.001
--
--
.022
.854
.009
.014
--
.027
.016
.023
.004
.994
.029
.905
.0
--
--
.002
.971
.0
.004
.006
.163
.0
.0
.026
.245
.022
--
--
--
--
--
.001
.024
.019
.011
.027
.001
.002
.694
.001
.001
.001
.075
.006
.003
.0
.008
.001
.002
.001
.0
.0
.0
.001
.0
.0
.001
.231
.123
.016
.01
.013
.046
.1
.042
.028
.001
.012
.003
.001
.0
.001
.001
.002
.0
.001
.002
.0
.009
.014
.002
.053
.004
.009
.008
.001
.0
.001
.0
.001
.001
.0
.014
.008
.0
.0
.001
.054
.006
.007
.0
.0
.006
.001
.0
.113
.101
.002
.002
.997
.917
.0
.037
.017
.001
.0
.001
1.0
.998
.002
.0
.037
.04
.008
--
--
.016
.007
.007
.001
.0
.008
.007
.024
.022
.0
1.0
.001
1.0
.0
.003
.418
.187
.003
.004
.002
.0
.008
.016
.0
.001
.01
.0
.0
.004
.002
.007
.029
.045
.057
.802
.001
.001
.001
.014
.0
--
--
.002
.014
.032
.003
.009
.059
.122
.0
.001
.997
.017
--
.003
--
.009
.0
.006
.041
.02
.021
.001
.043
.832
.014
.918
.997
--
.002
.001
.004
.119
.028
.003
.006
.001
.432
.004
.0
.02
.023
.034
.004
.067
.036
.0
.001
.042
.126
.0
.935
.008
.002
.001
.048
.056
.0
.001
.03
.0
.001
.002
.071
.571
.0
.041
.0
.0
.0
.001
.004
.217
.127
.001
.075
.001
.476
.036
.072
.03
.001
.001
.047
.173
.809
.039
.023
.004
.0
.002
.0
.001
.003
.005
.007
.001
.003
.003
.015
.0
.086
.021
.006
.001
.016
.0
.001
.001
.0
.002
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Pde7b
Pde7b
Pde7b
Pde7b
Pde7b
Pde7b
Pde7b
Pde7b
Pde7b
Pde7b
Pde7b
Pde7b
Pde7b
Pde7b
Pde7b
Pde7b
Pde7b
Pde7b
Pde7b
Pde7b
Pde7b
Pde7b
Pde7b
Pde7b
Pde7b
Pde7b
Pde7b
Pde7b
Pde7b
Pde7b
Pde7b
Pde7b
Pde7b
Pde7b
G
A
G
C
A
C
G
T
T
G
T
C
T
A
G
C
T
A
T
C
A
G
A
T
C
C
G
C
T
C
T
T
C
A
G
T
A
C
T
T
A
C
A
T
C
C
T
A
G
A
C
A
T
G
A
A
T
G
G
T
T
C
G
T
C
C
T
G
G
G
A
G
T
G
T
C
C
T
T
T
T
C
T
C
A
C
T
G
G
C
C
G
T
G
A
G
T
A
T
C
T
G
T
C
A
A
G
C
A
C
T
A
A
C
T
G
C
T
G
A
C
A
G
C
T
G
A
C
A
G
T
A
A
T
C
A
A
T
T
T
C
T
A
T
C
A
A
T
T
T
C
A
T
C
G
C
G
A
C
C
G
C
G
C
G
T
G
G
C
A
A
G
T
G
G
T
A
A
T
T
C
C
A
A
T
A
T
A
G
C
T
A
T
G
C
G
C
G
C
G
A
C
G
A
G
A
T
G
C
C
A
A
T
A
A
T
C
G
C
G
G
G
G
A
C
C
A
T
G
T
C
G
G
G
G
G
G
T
G
G
A
T
C
T
A
C
T
T
G
G
G
T
G
G
A
T
G
G
C
C
C
A
C
C
A
T
G
A
G
G
G
G
A
T
C
C
T
C
A
C
C
T
C
G
A
C
T
A
A
T
C
A
G
C
G
G
G
C
G
T
G
A
T
G
A
G
G
A
G
C
T
T
A
A
G
A
G
C
G
G
G
A
C
C
A
G
T
G
T
T
T
A
G
G
G
G
C
A
A
A
  15,889,943
  15,890,238
  15,890,255
  15,890,279
  15,890,373
  15,890,406
  15,890,506
  15,891,310
  15,891,358
  15,893,142
  15,894,597
  15,894,702
  15,894,819
  15,894,820
  15,894,861
  15,894,925
  15,895,085
  15,895,551
  15,895,757
  15,896,429
  15,896,773
  15,897,473
  15,897,486
  15,897,501
  15,897,517
  15,897,587
  15,898,697
  15,899,133
  15,899,438
  15,899,570
  15,899,700
  15,900,310
  15,900,581
  15,901,064
  15,901,247
  15,902,120
  15,902,198
  15,903,142
  15,903,194
  15,903,380
  15,903,526
  15,903,534
  15,903,604
  15,903,648
  15,903,672
  15,903,673
  15,903,832
  15,903,838
  15,904,187
  15,904,271
  15,904,364
  15,904,450
  15,905,128
  15,905,193
  15,905,645
  15,905,818
  15,905,863
  15,907,008
  15,907,082
  15,907,151
  15,907,623
  15,907,686
  15,908,118
  15,908,296
  15,909,060
  15,909,966
  15,910,187
  15,917,782
  15,917,785
  15,918,292
  15,918,637
  15,918,649
  15,918,937
  15,944,149
  15,959,043
  15,970,653
  15,982,643
  15,988,076
  16,091,000
  16,091,849
  16,091,851
  16,091,855
  16,095,131
  16,095,267
  16,095,350
  16,095,413
  16,095,474
  16,096,186
  16,096,466
  16,096,468
  16,096,662
  16,096,845
  16,096,979
  16,097,238
  16,097,313
  16,097,455
  16,097,712
  16,097,994
  16,098,488
  16,098,504
  16,098,653
  16,098,679
  16,099,087
  16,100,444
  16,102,460
  16,102,495
  16,102,558
  16,102,852
  16,102,927
  16,103,126
  16,103,151
  16,103,230
  16,103,233
  16,103,307
  16,103,369
  16,103,380
  16,103,414
  16,103,430
  16,103,431
  16,103,588
  16,103,619
  16,103,636
  16,103,778
  16,103,794
  16,103,876
  16,103,906
  16,103,960
  16,103,999
  16,104,030
  16,104,120
  16,104,137
  16,104,148
  16,104,184
  16,104,197
  16,104,203
  16,104,268
  16,104,300
  16,104,301
  16,104,314
  16,104,627
  16,104,774
  16,104,886
  16,104,895
  16,104,898
  16,105,085
  16,105,201
  16,105,788
  16,106,415
  16,106,631
  16,106,688
  16,106,725
  16,106,756
  16,106,886
  16,106,971
  16,107,024
  16,107,119
  16,107,456
  16,108,020
  16,108,330
  16,108,562
  16,108,741
  16,108,778
  16,109,121
  16,109,141
  16,109,688
  16,116,623
  16,117,764
  16,118,859
  16,119,241
  16,120,560
  16,120,563
  16,121,074
  16,121,080
  16,121,751
  16,126,291
  16,126,468
  16,126,472
  16,126,835
  16,126,839
  16,127,141
  16,127,151
  16,127,682
  16,128,250
  16,128,513
  16,128,521
  16,128,532
  16,128,732
  16,129,237
  16,129,359
  16,132,546
  16,132,632
  16,133,403
  16,133,446
  16,134,241
  16,134,494
  16,134,653
  16,134,654
  16,134,685
  16,135,825
  16,136,199
  16,136,904
  16,137,534
  16,137,692
  16,138,107
  16,139,292
  16,139,683
  16,139,827
  16,140,528
  16,140,727
  16,140,800
  16,140,864
  16,141,661
  16,142,591
  16,143,737
  16,144,365
  16,145,053
  16,146,219
  16,146,223
  16,146,235
  16,146,239
  16,146,243
  16,146,247
  16,146,616
  16,146,839
  16,147,874
  16,148,845
  16,149,123
  16,150,032
  16,150,600
  16,150,617
  16,150,835
  16,150,914
  16,151,196
  16,151,470
  16,151,487
  16,151,513
  16,151,793
  16,152,035
  16,152,045
  16,152,252
  16,152,464
  16,154,025
  16,154,858
  16,155,903
  16,155,973
  16,156,217
  16,156,372
  16,157,253
  16,157,258
  16,157,367
  16,158,158
  16,158,941
  16,159,269
  16,159,518
  16,160,075
  16,160,273
  16,160,811
  16,161,844
  16,162,250
  16,164,513
  16,164,693
  16,165,287
  16,165,302
  16,165,413
  16,165,703
  16,165,722
  16,165,816
  16,165,823
  16,165,966
  16,166,386
  16,166,956
  16,166,968
  16,167,026
  16,167,130
  16,167,204
  16,167,207
  16,167,330
  16,167,419
  16,167,932
  16,167,999
  16,168,135
  16,168,144
  16,168,191
  16,168,795
  16,168,797
  16,169,405
  16,169,796
  16,169,836
  16,170,535
  16,171,079
  16,171,263
  16,172,622
  16,172,830
  16,174,030
  16,174,129
  16,174,197
  16,174,243
  16,174,648
  16,175,423
  16,176,130
  16,176,780
  16,176,799
  16,177,892
  16,179,264
  16,187,107
  16,187,371
  16,188,427
  16,188,944
  16,189,112
  16,189,537
  16,189,593
  16,189,671
  16,189,772
  16,190,153
  16,190,340
  16,190,906
  16,192,341
  16,194,931
  16,195,634
  16,195,748
  16,196,448
  16,196,834
  16,196,929
  16,197,194
  16,197,813
  16,198,041
  16,199,194
  16,199,224
  16,199,432
  16,199,907
  16,199,959
  16,200,028
  16,201,163
  16,201,309
  16,201,340
  16,201,409
  16,201,416
  16,201,460
  16,201,488
  16,202,535
A
G
T
G
G
T
A
C
C
A
C
G
C
G
C
T
C
C
C
G
C
G/T
A/G
T/G
C/T
T
A
G
A
T
G
A
T
G
A
A
G
T
G
C
G
T
C
C
T
T
C
G
A
G
C/T
G
C
A
C
T
C
A
A
G
G
A
T
C
T
T
C
A
A
C
C
A
G
G/A
C
A
A
G
C
C
C
A
C
T
T
A
C
C
A
A
T
T
C
A
T
A
C
G
C
T
G
C
G
T
G
T
A
T
G
T
C
T
T
T
C
T
G
C
A
G
T
G
A
T
C
A
G
T
G
T
G
G
C
G
A
T
G
C
C
C
T
C
T
C
A
T
G
C
T/C
C
T
G
C
T
A
T
A
G
T
T
A
T
A
T
A
C
A
G/T
T
A/G
A/G
A
C
A
A
C
T
G
C
C
T
T
G
G
G
G
G
G
T
T
A
G
G
A
T
A
T
A
T
A
T
A
T
C
A
T
C
T
T
T
G
G
C
G
G
C
C/G
G/C
C/G
G/C
G/C
C
A
G
T
T
G
C
C
G
T
A
C
A
A
A
T
C
A
A
G
C
T
C
G
T
C
C
A
A
T
G
A
A
G
C
A
A
T
A
T
G
T
T
G
C
A
C
A
T
A
G/A
A/G
A
A
A
C
A
G
T
G
C
T
A
G
G
A
T
G
G
A
C
T
G
A
C
A
T
T
T/G
G/T
A/G
C
C
G
A
A
T
A
A
C
G
G
G
A
G
T
T
A
C
T
C
T
T
G
A
C
A
G
C
C
G
T
A
A
A
T
G
C
G