Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 604,018 (bp)   Positions: 585
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
--
.406
.001
.0
.0
.038
.0
.0
.005
.011
.013
.0
.0
.725
.0
.0
.001
.678
--
--
--
--
--
.0
.0
.003
.0
.328
.001
.001
.0
.001
.003
.011
.002
.005
.0
.002
.045
.0
.001
.002
.0
.0
.001
.002
.094
.014
.014
.013
.002
.005
.001
.0
.001
.0
.0
.0
.0
.0
.001
.0
.0
.0
.003
.0
.0
.019
.002
.0
.0
.001
.007
.979
.874
.906
.998
.03
.009
.009
.003
.038
.001
.993
1.0
.998
.99
.998
.02
.379
.003
.009
.003
.047
.078
.032
.015
.017
.35
.005
.227
.001
.0
.002
.002
.168
.015
.0
.008
.0
.0
.143
.027
.002
.086
.0
.0
.001
.001
--
--
.001
.001
.006
.008
.0
.041
.127
.023
.002
.005
.051
.027
.085
--
--
--
--
--
--
--
.031
.11
.002
.095
.0
.0
.0
.0
.0
.007
.995
.731
.984
.002
.001
.0
.0
.0
.001
.001
.0
.018
.0
.012
.036
.008
.008
.001
.002
.001
.008
--
--
.092
.005
.0
.001
.011
.001
.969
.0
.001
.001
.001
.002
.007
.004
.001
.684
.079
.103
.329
.0
--
--
.023
.005
.003
.0
.0
.011
--
--
.017
.01
.001
.0
.009
.012
--
--
.004
.006
.032
.035
.014
.005
.0
.029
.001
.001
.006
.134
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.282
.001
.002
.0
.0
.001
.001
.0
.003
.002
.047
.0
.052
.002
.002
.0
.001
.0
1.0
.001
.002
.006
.006
.002
.033
.0
.0
.0
.001
.0
.0
.0
.002
.001
.001
.0
.0
.0
.994
.006
.0
.001
--
--
.001
.0
.0
.012
.002
.001
--
.0
.039
.002
.0
.0
.0
.001
.0
.0
.201
.062
.005
.003
.001
.0
.004
.0
.0
.0
.0
.001
.003
.017
--
--
--
--
--
--
--
.003
.043
.011
.004
.001
.004
.001
.002
.008
.055
.0
.0
.0
.001
.001
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.09
.728
.002
.331
.004
.019
.072
.105
.0
.006
.001
.308
.001
.015
.027
.729
.95
1.0
.99
.703
.479
.988
1.0
.0
.004
.004
.002
.001
.066
.025
.001
.007
.011
.006
.0
.0
.0
.004
.0
.013
.064
.0
.001
.943
.003
.0
--
.019
.018
.081
.003
.029
.004
--
--
.011
--
--
.036
.015
.005
.201
.01
.005
.002
.006
.002
--
.024
.106
.078
.008
.002
.157
.0
.0
.001
.0
.036
.008
.001
.0
.001
.007
.0
.001
.002
.0
.016
.003
.036
.001
.044
.242
.386
.006
.0
.0
.008
.015
.107
.094
.324
.052
.013
.009
.01
.233
.108
.071
.037
.346
.204
.126
.137
.054
.042
.356
.326
.087
.011
.06
.648
--
.005
.013
.012
.045
.001
.071
.007
.997
.024
--
--
.013
.009
.0
.0
.002
.003
.001
.0
.0
.0
.01
--
--
.008
.001
.076
.012
.013
.117
.059
.049
.026
.133
.018
.0
.004
--
.901
.002
--
--
--
--
--
--
.004
--
.0
.001
.0
.001
.11
.001
.002
.144
.0
.049
.0
.001
.001
.245
.004
.457
.005
.004
.002
.002
.0
.004
.046
.0
.001
.001
.054
.03
.006
.001
.0
.001
.0
.005
.001
.003
.009
.004
.098
.019
.002
.003
.012
.0
.213
.001
.005
.0
.0
.114
.001
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Pclo
Pclo
Pclo
Pclo
Pclo
Pclo
Pclo
Pclo
Pclo
Pclo
Pclo
Pclo
Pclo
Pclo
Pclo
Pclo
Pclo
Pclo
Pclo
Pclo
Pclo
Pclo
Pclo
Pclo
Pclo
Pclo
Pclo
Pclo
Pclo
Pclo
Pclo
Pclo
Pclo
Pclo
Pclo
Pclo
Pclo
Pclo
Pclo
Pclo
Pclo
Pclo
Pclo
Pclo
Pclo
Pclo
Pclo
Pclo
Pclo
Pclo
Pclo
Pclo
Pclo
Pclo
Pclo
Pclo
Pclo
Pclo
Pclo
G
T
A
T
C
A
A
C
G
C
T
T
G
T
A
G
A
T
C
C
C
G
G
T
T
G
C
A
C
T
A
T
A
C
T
T
C
C
C
A
G
T
C
A
T
C
C
G
A
C
G
C
T
G
G
T
G
C
G
T
T
C
C
G
C
C
C
A
G
C
A
C
A
A
A
A
A
C
C
C
A
A
T
C
T
A
G
T
A
A
C
T
T
G
A
C
T
T
A
A
T
C
C
C
A
G
A
T
G
C
T
A
C
C
A
A
G
T
C
C
C
A
A
T
T
G
C
A
G
T
A
T
A
G
G
A
A
C
T
C
A
C
A
T
A
C
A
A
C
T
G
A
T
C
T
T
A
T
A
C
G
C
C
A
T
A
G
T
G
T
T
A
A
A
T
A
G
A
A
T
A
G
A
C
A
C
C
C
A
A
A
G
C
G
C
A
A
T
G
A
G
T
C
T
C
C
T
T
A
A
C
T
A
T
C
A
T
C
C
A
T
A
T
G
T
T
G
G
T
T
C
C
C
G
G
G
G
C
G
T
C
C
T
C
T
C
C
T
T
C
A
T
T
C
A
G
G
T
C
A
C
C
T
T
G
T
C
T
T
T
A
C
A
G
T
C
C
C
G
G
G
A
A
C
A
A
A
T
G
T
C
C
C
C
G
C
T
C
A
G
G
A
G
C
G
G
T
C
T
A
C
A
C
T
A
G
T
C
T
T
C
A
C
G
T
G
A
C
T
A
C
A
G
G
A
A
T
C
C
C
A
C
T
C
T
T
C
C
A
A
A
G
G
T
C
A
G
T
T
C
C
G
A
C
A
A
C
T
G
A
G
T
A
C
G
A
C
G
A
G
T
T
A
A
T
A
A
A
T
G
C
A
C
C
T
C
C
A
C
C
C
C
G
T
A
G
G
C
C
A
T
A
C
G
G
T
T
G
C
C
G
T
G
G
G
C
G
T
G
T
T
A
A
A
T
G
C
A
G
A
T
T
T
C
A
G
C
C
T
A
A
T
T
C
C
G
T
G
A
A
A
C
T
G
C
A
C
C
G
C
C
C
T
T
A
C
C
G
A
G
G
T
G
T
C
T
G
G
T
C
C
G
C
C
C
C
C
T
A
G
A
T
C
G
C
A
T
A
A
T
G
C
A
C
G
C
A
T
T
G
T
T
T
A
G
G
T
T
T
T
T
A
A
C
T
G
G
A
A
G
A
G
A
T
A
C
G
C
C
G
A
C
T
A
A
G
G
T
A
C
C
C
G
G
A
A
T
C
A
T
T
A
A
G
A
C
C
T
A
G
C
G
C
A
C
  16,483,934
  16,488,527
  16,500,161
  16,502,425
  16,503,647
  16,503,657
  16,504,743
  16,507,443
  16,510,237
  16,511,292
  16,511,293
  16,512,487
  16,512,488
  16,513,930
  16,515,631
  16,518,619
  16,518,710
  16,519,378
  16,519,995
  16,520,056
  16,520,143
  16,520,216
  16,520,397
  16,520,763
  16,520,828
  16,520,865
  16,521,196
  16,521,333
  16,521,575
  16,521,700
  16,522,255
  16,522,318
  16,522,485
  16,522,945
  16,523,615
  16,523,629
  16,524,201
  16,524,212
  16,524,751
  16,524,757
  16,524,758
  16,525,157
  16,525,205
  16,525,206
  16,525,314
  16,525,325
  16,525,338
  16,525,361
  16,525,385
  16,525,402
  16,525,417
  16,525,422
  16,525,436
  16,525,524
  16,525,529
  16,525,604
  16,525,626
  16,526,001
  16,526,046
  16,526,397
  16,526,698
  16,526,772
  16,526,792
  16,527,067
  16,527,139
  16,527,164
  16,527,260
  16,527,322
  16,527,489
  16,527,555
  16,527,613
  16,527,697
  16,527,893
  16,528,042
  16,528,145
  16,528,370
  16,528,539
  16,528,562
  16,528,577
  16,528,611
  16,528,896
  16,528,978
  16,529,216
  16,529,284
  16,529,392
  16,529,547
  16,529,605
  16,529,618
  16,529,707
  16,529,753
  16,529,822
  16,529,840
  16,529,973
  16,530,036
  16,530,341
  16,530,519
  16,530,631
  16,530,977
  16,531,101
  16,536,431
  16,536,464
  16,536,834
  16,536,927
  16,537,348
  16,537,359
  16,537,637
  16,537,722
  16,537,777
  16,537,916
  16,538,006
  16,538,186
  16,538,478
  16,538,501
  16,539,010
  16,539,629
  16,540,348
  16,540,678
  16,540,997
  16,541,470
  16,541,981
  16,541,983
  16,543,176
  16,544,149
  16,544,534
  16,544,991
  16,545,121
  16,546,496
  16,546,609
  16,546,651
  16,546,668
  16,547,097
  16,547,361
  16,547,364
  16,547,448
  16,547,695
  16,547,748
  16,547,942
  16,548,017
  16,548,063
  16,548,201
  16,548,219
  16,548,294
  16,548,519
  16,549,087
  16,549,716
  16,549,993
  16,549,994
  16,550,147
  16,550,458
  16,550,645
  16,551,751
  16,551,979
  16,552,240
  16,552,265
  16,552,891
  16,553,853
  16,554,174
  16,554,260
  16,554,393
  16,554,550
  16,555,083
  16,555,110
  16,555,144
  16,555,335
  16,556,125
  16,556,136
  16,560,905
  16,560,986
  16,561,089
  16,561,173
  16,562,950
  16,563,543
  16,564,791
  16,566,405
  16,567,842
  16,568,830
  16,574,366
  16,574,585
  16,574,595
  16,574,598
  16,574,792
  16,575,380
  16,575,415
  16,575,606
  16,575,717
  16,576,151
  16,576,198
  16,576,218
  16,576,448
  16,576,690
  16,576,886
  16,577,098
  16,577,690
  16,578,531
  16,578,940
  16,579,305
  16,579,576
  16,580,051
  16,580,616
  16,580,878
  16,580,895
  16,581,519
  16,581,722
  16,582,042
  16,582,115
  16,582,227
  16,582,244
  16,582,506
  16,582,659
  16,582,986
  16,584,329
  16,584,953
  16,585,379
  16,585,680
  16,585,953
  16,586,585
  16,586,686
  16,586,717
  16,587,134
  16,587,240
  16,587,514
  16,587,516
  16,587,545
  16,587,607
  16,587,775
  16,587,863
  16,587,911
  16,588,518
  16,588,882
  16,589,088
  16,589,333
  16,589,697
  16,590,589
  16,590,604
  16,590,701
  16,591,443
  16,592,255
  16,592,360
  16,592,379
  16,592,757
  16,593,103
  16,593,152
  16,593,203
  16,593,633
  16,593,774
  16,593,791
  16,593,862
  16,594,019
  16,594,475
  16,594,543
  16,594,544
  16,594,572
  16,594,586
  16,594,632
  16,594,896
  16,595,447
  16,595,487
  16,595,543
  16,595,673
  16,595,710
  16,595,820
  16,595,879
  16,596,383
  16,598,029
  16,598,763
  16,599,470
  16,599,598
  16,599,643
  16,599,855
  16,600,328
  16,600,431
  16,600,592
  16,601,444
  16,601,729
  16,601,968
  16,602,137
  16,603,125
  16,603,145
  16,603,152
  16,603,169
  16,603,170
  16,603,223
  16,603,520
  16,603,749
  16,603,899
  16,604,083
  16,604,098
  16,604,368
  16,604,562
  16,604,649
  16,605,362
  16,605,364
  16,605,366
  16,607,223
  16,609,217
  16,609,311
  16,609,824
  16,610,774
  16,610,871
  16,611,624
  16,611,645
  16,611,758
  16,611,841
  16,612,058
  16,612,065
  16,612,538
  16,614,603
  16,614,798
  16,614,981
  16,615,115
  16,615,162
  16,615,164
  16,615,908
  16,616,220
  16,617,421
  16,617,873
  16,618,140
  16,619,015
  16,619,273
  16,619,434
  16,619,448
  16,620,314
  16,620,416
  16,620,487
  16,620,593
  16,621,070
  16,621,272
  16,621,623
  16,621,680
  16,622,525
  16,623,007
  16,624,882
  16,625,262
  16,625,341
  16,626,342
  16,626,371
  16,626,704
  16,627,371
  16,627,661
  16,627,857
  16,627,991
  16,628,094
  16,629,142
  16,629,679
  16,631,379
  16,631,386
  16,631,431
  16,632,171
  16,632,172
  16,632,346
  16,632,679
  16,633,649
  16,634,617
  16,636,177
  16,636,199
  16,636,309
  16,636,537
  16,636,619
  16,637,143
  16,638,220
  16,638,963
  16,641,330
  16,641,665
  16,642,290
  16,643,502
  16,643,773
  16,643,994
  16,645,169
  16,645,857
  16,646,385
  16,646,683
  16,646,734
  16,648,239
  16,649,407
  16,649,500
  16,650,093
  16,650,431
  16,652,306
  16,652,834
  16,652,861
  16,653,375
  16,653,498
  16,653,813
  16,654,797
  16,655,073
  16,655,136
  16,655,255
  16,655,292
  16,655,294
  16,655,707
  16,655,743
  16,655,776
  16,655,805
  16,664,191
  16,664,292
  16,664,477
  16,664,483
  16,665,117
  16,667,770
  16,670,701
  16,670,926
  16,672,665
  16,673,135
  16,673,210
  16,673,501
  16,674,351
  16,674,802
  16,679,058
  16,685,751
  16,699,800
  16,700,865
  16,701,072
  16,701,643
  16,702,061
  16,703,004
  16,703,225
  16,709,958
  16,710,639
  16,711,002
  16,711,697
  16,711,795
  16,711,876
  16,711,966
  16,712,806
  16,713,377
  16,713,477
  16,713,825
  16,714,112
  16,715,235
  16,715,430
  16,715,885
  16,715,947
  16,716,715
  16,716,721
  16,717,031
  16,719,156
  16,719,779
  16,720,998
  16,722,362
  16,723,022
  16,723,183
  16,723,216
  16,723,412
  16,723,526
  16,724,338
  16,725,303
  16,725,349
  16,725,401
  16,726,590
  16,727,136
  16,727,456
  16,727,774
  16,728,841
  16,729,281
  16,729,294
  16,729,877
  16,729,909
  16,730,073
  16,730,325
  16,732,593
  16,732,745
  16,796,233
  16,796,236
  16,796,285
  16,796,545
  16,796,690
  16,796,700
  16,796,752
  16,797,178
  16,797,216
  16,797,219
  16,797,354
  16,797,400
  16,797,418
  16,797,529
  16,797,542
  16,797,721
  16,797,801
  16,798,010
  16,798,102
  16,798,178
  16,798,236
  16,807,832
  16,809,138
  16,814,138
  16,823,621
  16,826,112
  16,916,325
  16,970,926
  16,970,969
  16,976,545
  16,979,740
  16,980,322
  16,982,647
  16,982,951
  16,983,273
  16,983,564
  16,984,283
  16,984,396
  16,985,839
  16,986,734
  16,987,047
  16,987,818
  16,988,332
  16,992,075
  16,992,098
  16,992,682
  16,993,586
  16,993,604
  16,994,722
  16,995,464
  16,995,764
  16,996,018
  16,996,432
  16,996,738
  16,997,053
  16,997,529
  16,997,955
  16,998,770
  16,999,453
  17,000,629
  17,001,662
  17,002,580
  17,005,235
  17,005,336
  17,008,826
  17,009,079
  17,009,167
  17,009,385
  17,009,804
  17,010,013
  17,012,021
  17,012,448
  17,013,808
  17,014,089
  17,014,724
  17,017,959
  17,018,803
  17,020,773
  17,023,524
  17,023,552
  17,027,245
  17,029,808
  17,030,050
  17,030,769
  17,031,009
  17,032,046
  17,032,416
  17,032,543
  17,035,223
  17,035,307
  17,035,940
  17,036,139
  17,036,149
  17,036,220
  17,036,239
  17,036,386
  17,037,484
  17,038,441
  17,039,171
  17,039,380
  17,040,009
  17,040,280
  17,040,517
  17,040,856
  17,041,140
  17,041,250
  17,041,474
  17,041,909
  17,042,285
  17,042,347
  17,042,707
  17,043,651
  17,044,369
  17,044,490
  17,045,220
  17,046,310
  17,048,727
  17,048,897
  17,048,978
  17,049,207
  17,049,522
  17,051,622
  17,051,817
  17,054,572
A
A
T
C
T
G
T
A
A
G
G
C
A
A
G
A
G
C
T
T
G
A
T
C
C
A
T
G
T
G
G
A
G
T
G
C
T
T
T
C
A
C
T
G
C
T
G
A
G
T
C
T
C
A
A
C
A
T
A
C
C
T
T
T
T
G
T
G
A
T
G
T
G
G
G
C
G
T
T
T
G
G
C
T
C
C
A
A
C
C
T
A
C
T
G
T
G
C
G
T
C
A
A
T
G
A
C
G
A
A
C
G
T
T
G
C
A
C
T
G
T
C
C
C
C
A
A
T
A
A
C
C
G
A
T
C
G
G
C
T
G
A
C
C
G
T
G
G
T
C
A
G
C
T
G
C
T
G
G
T
A
T
T
G
C
G
A
A
A
A
C
G
G
G
C
G
A
C
T
A
G
A
T
T
G
A
T
T
G
G
G
T
T
T
A
G
G
A
A
G
A
A
T
G
A
T
C
C
C
G
T
A
T
A
T
G
G
T
T
T
C
G
G
A
A
C
A
A
C
C
T
A
T
A
C
T
C
A
C
C
T
T
C
T
G
T
A
C
G
T
C
C
A
T
G
A
T
C
T
G
T
T
G
A
A
C
A
C
C
A
C
T
G
T
C
T
T
T
A
C
A
C
G
T
C
T
T
A
C
C
T
T
T
T
A
T
A
T
T
C
C
T
A
G
A
C
C
T
C
G
T
G
T
G
G
C
C
G
C
C
T
G
T
A
C
T
G
T
C
T
T
G
A
A
C
C
C
A
T
G
T
A
C
T
C
C
A
T
G
T
G
T
A
C
T
G
A
G
C
T
T
A
G
T
G
T
T
C
T
T
A
C
T
T
A
G
T
C
G
A
C
C
G
G
C
G
G
G
G
A
T
G
G
T
C
T
A
G
A
A
G
T
A
C
G
C
A
T
G
C
C
G
A
C
A
C
C
T
A
T
T
C
A
A
A
T
A
G
A
C
A
C
G
G
C
A
T
G
A
A/G
C
C
C
T
C
A
A
T
C
G
G
C
A
T
A
C
C
A
C
C
T
T
G
A
G
G
G
T
A
T
T
A
G
C
C
A
T
A
G
A
A
C
C
G
A
C
A
T
C
A
T
A
T
A
T
T
G
C
C
A
T
G
G
A
A
C
C
C
G
C
C
T
G
G
A
G
G
A
C
C
C
C
C
G
C
A
C
C
C
G
C
G
G
T
C
A
A
G
T
A
G
A
G
C
A/G
T
A
T
G
A
G
A
C
G
G
A
A
C
G
T
T
T
T
A
T
G
C
T
G
C
A
G
G
A
T
T
T
G
C
A
G
A
T
G
T