Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 346,371 (bp)   Positions: 271
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.054
.003
.18
.002
.001
.003
.147
.003
.245
.027
.221
.25
--
.008
.002
.006
--
.007
.115
.911
.974
.964
.952
.98
.98
.965
.934
.839
.984
.986
.978
.058
.032
.007
.005
.597
.005
.031
.0
.07
.001
.026
.011
.004
--
--
.031
.015
.001
.001
.0
.001
.003
.984
.034
--
.016
.004
.003
.0
.003
.013
.002
.002
.962
.944
.061
.066
.013
.014
.015
.01
.004
.008
.0
.01
.003
.004
.996
.377
.969
.981
.988
--
.008
.016
--
--
--
.256
.067
--
--
.232
--
.702
.659
--
--
.861
.982
.002
.002
.0
.006
.0
.0
.035
.098
--
--
.006
--
--
.322
.283
.251
.029
.008
.073
.01
.2
.116
.248
.097
.024
--
--
.003
.059
.003
.001
.013
.007
.013
.001
.003
.0
.002
.0
.016
.008
.0
.0
.0
.017
.675
.015
.012
.0
.002
.0
.001
.0
.0
.0
.008
.003
.001
.01
.0
.002
.0
.294
.002
--
.002
.0
.036
.229
.256
.005
--
.001
.083
.007
.999
.0
.001
.735
.014
.528
.815
.848
.856
.93
.93
.053
.553
.0
.003
.003
--
--
.006
.001
.002
.001
.0
.001
.0
.001
.034
.001
.0
.002
--
--
--
.013
.017
.005
.007
.004
.18
.0
.036
.004
.604
.002
.011
.905
.712
.016
--
.002
.03
.002
1.0
.009
.005
.0
.003
.0
--
.002
.001
.0
.018
.2
.054
.044
.001
.006
.002
.114
--
.0
.0
.008
1.0
.0
.0
.005
.068
.002
.001
.997
.998
.148
.001
.001
.001
.0
.001
.996
.0
.004
.0
.0
1.0
Pcca
Pcca
Pcca
Pcca
Pcca
Pcca
Pcca
Pcca
Pcca
Pcca
Pcca
Pcca
Pcca
Pcca
Pcca
Pcca
Pcca
Pcca
Pcca
Pcca
Pcca
Pcca
Pcca
Pcca
Pcca
Pcca
Pcca
Pcca
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
A
T
T
T
C
T
T
T
C
T
G
G
G
T
A
T
C
A
C
A
T
C
T
C
A
T
A
C
G
G
A
T
C
G
G
T
A
T
T
C
T
G
G
A
C
C
A
T
C
A
T
T
C
G
A
T
T
T
C
T
A
C
C
A
A
T
T
C
T
T
T
T
A
A
T
T
G
C
G
G
C
G
G
A
T
A
T
T
T
T
G
C
A
C
A
A
C
T
C
C
G
A
G
C
C
A
T
C
G
T
G
G
A
A
A
T
C
T
G
A
T
T
A
C
C
A
C
C
T
A
A
G
T
C
G
G
A
G
G
C
G
T
T
G
A
T
G
T
A
G
G
A
A
A
C
T
T
G
T
G
T
T
C
T
G
T
C
G
C
A
A
T
G
C
T
A
A
C
G
A
C
A
T
G
T
T
G
T
G
C
G
G
A
G
T
G
G
T
C
G
T
A
T
G
T
C
C
A
C
T
G
T
T
T
T
A
G
C
C
T
C
A
G
A
C
G
G
A
T
C
G
C
C
T
G
G
A
C
T
A
A
G
T
G
G
A
T
C
A
T
T
T
G
C
T
G
A
C
A
C
G
A
T
T
T
G
G
A
A
G
T
  108,961,598
  108,962,460
  108,962,916
  108,966,163
  108,966,167
  108,966,651
  108,967,221
  108,969,660
  108,969,897
  108,970,222
  108,972,974
  108,973,740
  108,974,022
  108,974,447
  108,974,639
  108,974,644
  108,975,908
  108,977,759
  108,977,896
  108,978,348
  108,978,401
  108,978,486
  108,978,515
  108,978,629
  108,978,630
  108,978,654
  108,978,711
  108,978,732
  108,978,794
  108,978,908
  108,979,074
  108,979,867
  108,981,839
  108,984,003
  108,984,083
  108,984,545
  108,986,241
  108,986,437
  108,987,246
  108,988,699
  108,989,037
  108,989,750
  108,990,108
  108,996,100
  108,996,228
  108,996,232
  108,997,608
  109,001,564
  109,002,636
  109,002,740
  109,003,834
  109,008,422
  109,009,993
  109,011,193
  109,011,299
  109,016,811
  109,020,482
  109,020,688
  109,021,823
  109,022,138
  109,023,491
  109,027,658
  109,030,318
  109,031,818
  109,034,641
  109,035,523
  109,037,737
  109,037,745
  109,038,924
  109,038,928
  109,038,932
  109,040,638
  109,041,170
  109,042,045
  109,042,671
  109,042,831
  109,042,866
  109,043,344
  109,043,693
  109,043,706
  109,043,761
  109,043,766
  109,043,771
  109,043,820
  109,045,717
  109,048,241
  109,051,208
  109,052,037
  109,053,026
  109,053,602
  109,054,159
  109,055,892
  109,058,075
  109,058,604
  109,059,678
  109,060,608
  109,060,609
  109,061,371
  109,061,417
  109,062,253
  109,062,445
  109,064,532
  109,064,607
  109,064,676
  109,067,266
  109,073,494
  109,074,077
  109,077,193
  109,077,384
  109,077,956
  109,078,170
  109,079,884
  109,081,319
  109,081,951
  109,083,182
  109,083,197
  109,084,402
  109,085,812
  109,086,394
  109,088,875
  109,090,759
  109,095,831
  109,105,975
  109,106,143
  109,106,264
  109,106,273
  109,111,271
  109,111,500
  109,112,448
  109,113,621
  109,114,834
  109,115,063
  109,118,418
  109,118,485
  109,118,681
  109,118,757
  109,123,701
  109,123,959
  109,124,357
  109,125,441
  109,125,907
  109,125,919
  109,127,892
  109,129,286
  109,129,478
  109,130,168
  109,130,882
  109,131,836
  109,133,317
  109,133,857
  109,136,328
  109,136,416
  109,136,452
  109,136,921
  109,136,950
  109,136,953
  109,137,008
  109,137,017
  109,137,062
  109,137,081
  109,137,138
  109,137,154
  109,137,161
  109,137,824
  109,139,818
  109,144,726
  109,145,947
  109,145,968
  109,146,853
  109,151,062
  109,151,936
  109,152,796
  109,159,701
  109,160,094
  109,160,140
  109,161,086
  109,163,659
  109,166,587
  109,168,015
  109,168,538
  109,171,444
  109,172,073
  109,173,626
  109,173,638
  109,173,639
  109,173,727
  109,173,729
  109,174,409
  109,179,661
  109,179,763
  109,181,083
  109,182,803
  109,182,871
  109,182,872
  109,185,013
  109,187,298
  109,188,189
  109,188,217
  109,190,674
  109,194,279
  109,195,777
  109,197,529
  109,200,111
  109,200,237
  109,202,400
  109,204,401
  109,206,713
  109,209,103
  109,209,874
  109,210,476
  109,215,952
  109,220,145
  109,220,466
  109,222,129
  109,222,206
  109,222,761
  109,225,090
  109,227,558
  109,232,302
  109,232,947
  109,236,346
  109,238,428
  109,239,543
  109,240,915
  109,249,017
  109,253,405
  109,253,497
  109,256,401
  109,257,530
  109,260,165
  109,263,430
  109,263,437
  109,263,449
  109,266,688
  109,267,298
  109,268,247
  109,268,253
  109,268,262
  109,270,834
  109,272,966
  109,273,062
  109,273,763
  109,276,596
  109,281,086
  109,281,145
  109,282,080
  109,282,588
  109,283,113
  109,283,114
  109,283,215
  109,286,249
  109,286,827
  109,286,888
  109,288,342
  109,288,840
  109,290,383
  109,290,528
  109,291,501
  109,291,502
  109,292,833
  109,293,291
  109,297,185
  109,298,139
  109,298,614
  109,299,870
  109,300,900
  109,302,012
  109,302,105
  109,304,246
  109,305,663
  109,306,808
T
C
C
T/C
C/T
C
G
C
T
C
A
A
G/A
G
A/C
T/A
C/T
G
G
A/G
T/G
C/T
T/C
C/T
G
T/G
A/G
C/T
G/A
G/A
G
C
C/T
A
A
C
G
C
C
T
C
T
A
G
C/T
C/T
G
C
T
G
C
G
T
A
C
T/C
A
C
A
C
G
T
A
G
G
G
C
T
T/C
T/C
T/C
C
C
G
G
A
T
A
G/C
G/A
C/T
G/A
G/C
A/G
C
C
C
C
C
C
A
G
C
T
C
G
G
C
T
T
T
C
A
T
T
G
C
G
A
C
A
T
G
G
G
C
T
C
A
C
C
A
G
T
T
C
T
C/A
C
G
G
A
G
T
A
A
G
A
C
C/T
C
C
C
A
G
C
T
C
G
G/A
T
G
G
A/C
C/T
T/C
T/C
G/A
T/C
G/A
T/A
T/C
C/T
C
A
G
T
A
T
C
G
C
A
G
C
G
G
T
A
T
T
C
T/C
A
C
G
A
C
C
T
A
A
C
T
C
A
T
C
T
A
C
G
C
A
C
T
T
G
T
C
A
C
C
C
A
G
A
T
T
A
G
C
A
G
T
A
A
G
G
T
C
A
A
C
G/A
G/A
A/G
C/G
C
G
G
A
C
C
A
C
C
T
G
G
C
C
C
T
A
A
G
T
G
T
T
T
A
G
G
A
A
C
G
A
C