Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 195,054 (bp)   Positions: 377
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.019
.087
.981
.002
.001
.0
.0
.121
.002
.0
.002
.334
.17
.034
.0
.023
.004
.0
.188
.024
.0
.005
.985
.005
.0
.138
.001
.0
.0
.001
.004
.003
.022
.738
.001
.001
.86
.108
.002
.861
.721
.001
.01
.085
.073
.003
.32
.0
.988
.012
.046
.006
.432
.089
.027
.001
.013
.005
.754
.65
.98
1.0
.0
.346
.968
.025
.042
.049
.242
.08
.825
.003
.019
.016
.0
.039
.0
.002
.0
.091
.001
.001
.848
1.0
.993
.996
1.0
.76
.35
1.0
.999
.009
.997
.001
.003
.006
.975
.951
.0
.0
.483
.0
.214
.919
.599
.757
1.0
1.0
.301
1.0
.048
.005
.003
1.0
1.0
.653
.728
.0
.0
.0
.0
.0
1.0
.027
.037
.001
.001
.301
.013
.001
.003
.018
.002
.002
.005
.019
1.0
.001
.014
.14
.235
.673
.045
.001
.045
.028
.861
.98
.484
1.0
.964
1.0
.399
.945
.007
.034
.016
.0
.0
.0
.0
.004
.001
.001
.004
.006
.009
.026
.0
.179
.029
.023
.019
.002
.002
1.0
.42
.719
.209
.008
.001
.0
.0
.001
.006
.0
.053
.885
1.0
1.0
1.0
1.0
1.0
1.0
.002
.003
.038
.021
.009
.0
.005
.0
.93
.896
.761
.868
.946
.933
.401
.358
.009
.0
.104
.634
.011
.143
.232
.026
.001
.001
.0
.0
.006
.0
.001
.0
.289
.088
.076
.0
.848
.0
.006
.0
.0
.0
.0
.0
.012
.001
.005
.403
.05
.006
.003
.319
.021
.002
.031
.046
.062
.452
1.0
.994
.997
.999
.998
1.0
1.0
1.0
.998
1.0
1.0
.999
1.0
1.0
1.0
.993
.994
.998
1.0
.803
.802
.998
1.0
1.0
1.0
.995
.593
.996
.996
.998
1.0
.96
.543
.84
.982
.982
.001
.009
.359
1.0
1.0
.989
.991
1.0
.999
.997
1.0
1.0
1.0
1.0
1.0
1.0
.999
1.0
1.0
1.0
1.0
.999
.027
.018
.001
.013
.105
.007
.003
.0
.0
.001
.009
.0
.006
.025
.036
.135
.006
.0
.926
.085
.006
.004
.005
.001
.412
.763
.951
.99
1.0
.011
.752
.392
.279
.995
.001
.006
.001
.014
.002
.0
.002
.012
.015
.022
.006
.01
.013
.0
.008
.0
.003
.0
.01
.002
.009
.247
.219
.221
.153
.024
.07
.104
.015
.004
.032
.001
.663
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Pbx3
Pbx3
Pbx3
Pbx3
Pbx3
Pbx3
Pbx3
Pbx3
Pbx3
Pbx3
Pbx3
Pbx3
Pbx3
Pbx3
Pbx3
Pbx3
Pbx3
Pbx3
Pbx3
Pbx3
Pbx3
Pbx3
Pbx3
Pbx3
Pbx3
Pbx3
Pbx3
Pbx3
Pbx3
Pbx3
Pbx3
Pbx3
Pbx3
Pbx3
Pbx3
Pbx3
Pbx3
Pbx3
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
G
T
C
G
T
G
A
C
C
T
G
G
A
-
T
C
A
C
6
G
A
A
A
G
C
G
A
T
T
C
A
A
C
-
C
C
G
C
G
G
C
C
T
T
C
-
T
T
C
A
C
T
A
G
A
A
G
T
T
A
C
G
A
C
6
C
4
-
T
T
T
-
C
C
C
A
T
-
A
G
A
G
T
A
G
T
-
G
-
T
C
G
C
C
9
C
T
G
G
G
A
C
A
C
A
8
T
T
A
A
A
C
T
T
-
C
G
T
G
G
A
A
T
T
A
T
C
5
G
2
C
T
G
T
-
T
6
T
G
T
T
-
A
A
G
C
A
C
G
G
G
-
T
C
C
A
T
G
C
A
A
T
-
C
15
T
T
T
G
G
G
-
G
G
G
A
C
C
G
A
C
G
A
G
G
A
-
4
C
G
G
A
G
G
-
G
G
G
-
C
C
-
C
C
G
G
C
G
-
C
G
G
-
A
T
T
2
G
G
G
T
2
G
-
T
C
G
G
C
G
T
-
G
5
C
T
C
G
C
-
2
G
A
A
-
-
G
C
T
2
-
G
-
C
G
G
C
T
2
C
C
G
C
G
A
C
G
G
-
-
G
G
G
C
T
G
G
G
C
2
T
T
G
2
-
-
C
-
C
G
G
G
G
G
G
G
G
C
A
A
G
G
G
G
G
G
G
G
A
G
C
G
C
A
C
T
G
T
G
-
G
C
-
A
T
G
C
A
A
A
G
T
A
C
T
C
-
C
G
-
4
26
G
C
T
G
-
G
C
C
A
C
4
T
G
A
G
A
-
-
2
-
3
T
T
A
T
A
A
T
T
A
G
A
G
T
  13,256,186
  13,256,190
  13,256,556
  13,256,964
  13,257,202
  13,257,248
  13,257,331
  13,257,399
  13,257,622
  13,257,728
  13,258,021
  13,258,198
  13,258,663
  13,258,881
  13,259,215
  13,259,340
  13,259,684
  13,259,763
  13,259,883
  13,260,419
  13,261,001
  13,261,064
  13,262,267
  13,262,747
  13,264,964
  13,266,015
  13,267,792
  13,269,913
  13,270,370
  13,270,863
  13,271,076
  13,273,503
  13,279,338
  13,279,573
  13,280,119
  13,283,020
  13,286,684
  13,286,702
  13,287,448
  13,289,084
  13,289,554
  13,290,237
  13,290,375
  13,290,420
  13,290,422
  13,290,462
  13,292,902
  13,293,132
  13,293,499
  13,294,746
  13,295,593
  13,296,091
  13,296,373
  13,296,621
  13,296,892
  13,297,261
  13,297,379
  13,297,890
  13,298,320
  13,298,995
  13,300,145
  13,300,167
  13,300,740
  13,300,857
  13,301,527
  13,302,312
  13,302,320
  13,302,880
  13,303,431
  13,303,529
  13,304,176
  13,304,561
  13,304,830
  13,304,921
  13,305,003
  13,305,427
  13,305,467
  13,305,687
  13,305,710
  13,305,782
  13,306,005
  13,306,063
  13,306,693
  13,306,776
  13,307,742
  13,308,136
  13,308,209
  13,308,318
  13,308,337
  13,309,382
  13,309,407
  13,310,044
  13,311,167
  13,312,089
  13,312,397
  13,312,424
  13,312,812
  13,313,443
  13,314,670
  13,314,728
  13,314,746
  13,315,439
  13,315,626
  13,315,665
  13,315,758
  13,315,969
  13,316,260
  13,316,565
  13,317,672
  13,318,087
  13,318,717
  13,319,288
  13,319,381
  13,319,845
  13,319,989
  13,320,720
  13,320,739
  13,320,790
  13,321,610
  13,322,033
  13,322,065
  13,323,436
  13,324,744
  13,328,698
  13,329,573
  13,330,097
  13,330,251
  13,331,242
  13,335,675
  13,337,729
  13,339,329
  13,339,397
  13,339,665
  13,340,712
  13,341,163
  13,341,495
  13,342,464
  13,343,144
  13,343,534
  13,344,209
  13,345,085
  13,345,741
  13,349,070
  13,350,152
  13,353,232
  13,353,398
  13,353,401
  13,353,406
  13,353,412
  13,354,192
  13,354,376
  13,354,983
  13,355,508
  13,356,298
  13,357,451
  13,357,872
  13,358,468
  13,359,415
  13,360,898
  13,361,416
  13,362,232
  13,362,297
  13,362,418
  13,362,473
  13,363,201
  13,363,203
  13,363,338
  13,363,359
  13,363,393
  13,363,699
  13,363,764
  13,363,772
  13,363,797
  13,364,646
  13,364,789
  13,367,983
  13,368,732
  13,369,645
  13,370,142
  13,370,290
  13,370,358
  13,370,480
  13,370,575
  13,371,077
  13,372,108
  13,373,665
  13,375,076
  13,375,401
  13,376,018
  13,376,033
  13,376,035
  13,376,053
  13,376,063
  13,376,072
  13,376,186
  13,376,190
  13,376,200
  13,376,204
  13,376,206
  13,376,210
  13,376,219
  13,376,222
  13,376,237
  13,376,239
  13,376,258
  13,376,259
  13,376,266
  13,376,267
  13,376,275
  13,376,279
  13,376,298
  13,376,301
  13,376,304
  13,376,314
  13,376,324
  13,376,338
  13,376,347
  13,376,355
  13,376,370
  13,376,381
  13,376,385
  13,376,386
  13,376,394
  13,376,402
  13,376,404
  13,376,414
  13,376,431
  13,376,435
  13,376,437
  13,376,447
  13,376,463
  13,376,471
  13,376,478
  13,376,486
  13,376,499
  13,376,514
  13,376,515
  13,376,524
  13,376,536
  13,376,552
  13,376,558
  13,376,567
  13,376,583
  13,376,591
  13,376,600
  13,376,614
  13,376,630
  13,376,639
  13,376,663
  13,376,667
  13,376,669
  13,376,678
  13,376,692
  13,376,704
  13,376,708
  13,376,713
  13,376,716
  13,376,722
  13,376,723
  13,376,735
  13,376,739
  13,376,742
  13,376,746
  13,376,770
  13,376,776
  13,376,777
  13,376,808
  13,376,826
  13,376,836
  13,376,858
  13,376,862
  13,376,865
  13,376,868
  13,376,873
  13,376,877
  13,376,878
  13,376,896
  13,376,901
  13,376,911
  13,376,920
  13,376,942
  13,376,953
  13,376,980
  13,376,986
  13,376,994
  13,376,999
  13,377,002
  13,377,003
  13,377,016
  13,377,027
  13,378,013
  13,378,182
  13,378,184
  13,378,200
  13,378,202
  13,378,210
  13,378,214
  13,378,220
  13,378,229
  13,378,233
  13,378,239
  13,378,251
  13,378,253
  13,378,261
  13,378,268
  13,378,270
  13,378,274
  13,378,292
  13,378,295
  13,378,328
  13,378,820
  13,379,042
  13,379,697
  13,379,932
  13,381,574
  13,383,939
  13,384,082
  13,384,414
  13,384,794
  13,384,983
  13,385,152
  13,385,225
  13,385,619
  13,385,802
  13,386,852
  13,387,179
  13,388,297
  13,389,141
  13,389,186
  13,389,484
  13,389,658
  13,389,836
  13,391,068
  13,391,158
  13,391,691
  13,391,696
  13,391,705
  13,391,723
  13,391,868
  13,392,158
  13,400,911
  13,400,951
  13,400,965
  13,401,281
  13,401,549
  13,401,565
  13,401,620
  13,401,679
  13,401,756
  13,401,880
  13,401,910
  13,401,922
  13,402,024
  13,402,065
  13,402,108
  13,402,114
  13,402,183
  13,402,348
  13,402,514
  13,402,621
  13,402,622
  13,402,623
  13,402,627
  13,402,644
  13,405,817
  13,406,012
  13,406,818
  13,406,819
  13,406,898
  13,407,012
  13,407,027
  13,407,221
  13,407,293
  13,407,903
  13,407,976
  13,408,127
  13,435,121
T
A
C
T
A
C
A
T
A
T
C
A
C
T
2
C
T
T
T
-
A
G
C
G
A
T
C
G
G
C
T
G
A/-
A
4
T
T
A
T
A
T
T
T
T/-
-
-
3
G
C
T
G
T
C
T
A
T
C
A
G
C
C
-
A
-
T
-
T
-
A
C
C
G
C
T
A
T
C
G
4
G
A
G
C
C
T
A
C
A
T
T
C
T
A
T
T
-
A
C
A
A
A
G
T
-
T
C
-
G
C
G
C
G
T
C
C
A
-
A
C
A
A
-
G
C
-
G
A
A
-
A
-
A
C
C
-
T
C
-
A
A
C
C
2
-
G
T
-
G
G
C
A
A
A
C
A
G
G
C
C
T
G
G
G
5
-
-
G
C
G/GG
A
T
A
A
A
T
A
G
G
T
A
G
T
C
G
-
A
G
T
-
-
-
-
-
-
A
T
T
T
-
T
-
A
A
A
-
T
-
T
-
A
A
A
-
C
G
-
-
-
-
-
-
A
-
A
A
-
-
T
-
-
T
-
T
T
-
T
C
-
-
-
A
-
T
-
-
C
C
-
-
-
-
G
-
C
T
-
-
T
C
-
-
-
-
-
A
T
T
T
-
T
T
T
T
-
-
G
T
-
T
-
-
-
-
-
-
T
T
G
T
T
A
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
T
-
A
T
C
A
-
G
-
A
-
A
A
A
T
8
G
C
A
T
G
T
G
A
A
G
G
C
T
T
T
A
8
-
-
A
T
-
A
A
A
T
T
G
A
-
G
T
G
A
G
T
4
-
2
-
A
G
G
C
G
C
A
A
G
C
G
A
G