Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 151,400 (bp)   Positions: 400
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.0
.304
.001
.053
.019
.028
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.004
.021
.038
.049
--
.029
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.0
.044
.001
.056
--
--
--
--
--
.02
.394
.108
.31
.015
.009
.014
.583
.21
.252
.3
.355
.077
.007
.033
.023
.004
.002
.01
.006
.002
.009
.138
.574
.379
.251
--
.055
--
--
--
--
--
--
.005
.007
.0
.002
.001
.042
.991
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.024
.0
.001
.002
--
.045
.004
.0
.0
.381
.801
.23
.336
.002
--
--
--
--
--
--
--
.001
.006
.049
.113
.023
--
--
.072
.184
.002
.008
.005
--
--
--
--
--
--
--
--
.017
.01
.258
.057
.843
.087
.396
.001
.005
.001
.002
.0
.015
.084
.062
.0
--
.053
.448
.0
.036
--
.001
.18
.401
.01
.146
.006
.133
.027
.734
.559
.039
.023
.005
.001
.0
.001
.003
.025
.022
--
--
--
--
.242
--
.002
.002
.116
.009
.002
.012
.121
--
.004
.002
.597
.002
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.109
.029
.063
.001
.003
--
.003
.023
.022
.02
.029
.007
.013
.018
.024
.029
.028
.02
.017
--
.002
.0
.003
.035
.006
.002
.001
.013
--
.0
.001
.013
.013
.333
.106
--
.006
.025
.03
.0
.008
.0
.006
.0
.045
.007
.005
.048
.096
.034
.023
.029
.0
.001
.043
.064
.012
.003
.059
.061
.345
.007
.06
.528
.022
.629
.015
.004
.364
.0
.068
.008
.057
.001
.002
.0
.012
.0
.077
.037
.101
--
--
--
--
--
--
--
--
.087
.221
.277
.027
.11
.13
.049
.317
.35
.172
.184
.0
.01
.0
.186
.976
.012
.003
.021
.001
.014
.0
.0
.453
.011
.01
.002
.001
.011
.0
.002
.001
.0
.047
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.103
.001
.07
.175
.888
.989
.006
.188
.01
.002
.123
.009
.002
.074
.117
.002
.023
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Dynll1l
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Parn
Parn
Parn
Parn
Parn
Parn
Parn
Parn
Parn
Parn
Parn
Parn
Parn
Parn
Parn
Parn
Parn
Parn
Parn
Parn
Parn
Parn
Parn
Parn
Parn
Parn
Parn
Parn
Parn
Parn
Parn
Parn
Parn
Parn
Parn
Parn
Parn
Parn
Parn
Parn
T
A
A
A
C
2
A
G
A
T
C
9
T
-
T
G
-
A
-
C
T
C
-
C
C
G
G
C
T
A
A
-
C
G
C
A
T
G
T
T
C
G
T
C
T
A
G
A
C
G
-
-
C
T
G
C
A
T
A
A
2
G
2
G
2
2
-
2
-
A
C
T
A
A
A
G
C
A
A
-
G
C
A
C
A
C
G
C
A
C
T
C
G
3
T
G
C
-
G
G
8
T
G
G
T
C
A
C
A
G
-
-
C
C
C
10
17
5
3
-
A
A
A
8
A
-
G
T
C
T
T
T
-
C
C
3
A
-
G
G
A
C
G
A
G
A
C
-
A
G
80
G
G
2
C
C
C
A
T
G
A
A
A
A
T
C
C
T
G
T
C
C
C
T
G
-
C
T
T
T
G
-
T
A
C
C
G
C
-
G
G
C
-
G
G
T
-
A
T
-
-
G
C
C
C
G
A
G
A
T
G
T
-
G
C
C
3
T
-
A
C
A
C
-
-
G
A
A
A
A
A
A
A
A
A
C
2
14
109
A
A
G
G
G
6
G
C
C
T
C
G
A
G
T
G
-
A
T
G
G
G
T
G
G
C
A
C
C
G
A
G
T
C
A
T
T
A
A
A
G
G
G
A
C
G
T
T
T
C
A
C
G
C
T
-
A
T
G
G
C
G
C
A
T
G
C
A
T
C
C
-
C
6
-
C
G
T
-
A
A
A
T
G
C
C
-
-
A
G
A
G
G
T
A
-
G
C
C
-
C
-
A
C
A
C
G
G
T
T
G
G
T
T
T
G
G
C
C
G
T
-
A
A
2
G
T
C
A
-
C
A
A
A
G
C
A
C
G
T
G
G
C
A
16
C
A
C
4
T
A
G
A
G
C
T
-
A
-
A
3
  1,309,883
  1,312,866
  1,313,021
  1,314,416
  1,314,426
  1,314,438
  1,314,483
  1,314,531
  1,314,550
  1,314,557
  1,314,586
  1,314,589
  1,314,647
  1,314,692
  1,314,700
  1,314,716
  1,314,738
  1,314,791
  1,314,803
  1,314,819
  1,314,984
  1,315,077
  1,315,331
  1,315,484
  1,315,510
  1,315,764
  1,316,200
  1,316,478
  1,316,525
  1,316,781
  1,317,042
  1,317,557
  1,318,490
  1,321,292
  1,321,358
  1,321,537
  1,321,789
  1,322,089
  1,322,100
  1,322,241
  1,322,281
  1,322,902
  1,327,655
  1,327,832
  1,327,969
  1,328,112
  1,328,293
  1,328,344
  1,328,659
  1,329,398
  1,330,308
  1,330,317
  1,330,328
  1,330,714
  1,331,885
  1,332,650
  1,333,052
  1,333,105
  1,333,312
  1,333,838
  1,334,850
  1,334,858
  1,334,861
  1,334,863
  1,334,868
  1,334,876
  1,334,902
  1,334,906
  1,335,995
  1,336,164
  1,336,251
  1,336,420
  1,336,516
  1,336,541
  1,336,577
  1,336,678
  1,337,258
  1,337,432
  1,338,071
  1,338,346
  1,338,485
  1,338,499
  1,338,648
  1,339,624
  1,339,938
  1,339,955
  1,339,968
  1,339,982
  1,340,082
  1,340,100
  1,340,151
  1,340,158
  1,340,159
  1,340,843
  1,342,211
  1,342,954
  1,343,286
  1,343,289
  1,343,498
  1,343,850
  1,343,877
  1,344,343
  1,344,360
  1,344,545
  1,344,755
  1,344,821
  1,344,926
  1,345,030
  1,345,615
  1,345,749
  1,345,949
  1,345,956
  1,346,271
  1,346,284
  1,346,288
  1,358,875
  1,358,890
  1,358,929
  1,358,943
  1,359,091
  1,359,198
  1,359,208
  1,359,403
  1,359,455
  1,359,908
  1,359,916
  1,359,923
  1,363,548
  1,363,706
  1,364,137
  1,364,192
  1,364,209
  1,364,516
  1,364,964
  1,364,978
  1,365,223
  1,365,235
  1,365,589
  1,373,725
  1,373,800
  1,374,217
  1,374,432
  1,374,819
  1,375,000
  1,375,079
  1,375,468
  1,376,120
  1,376,124
  1,376,358
  1,377,355
  1,377,464
  1,378,711
  1,378,904
  1,379,727
  1,380,057
  1,380,785
  1,381,154
  1,381,248
  1,381,738
  1,381,839
  1,383,718
  1,383,751
  1,383,902
  1,383,955
  1,384,548
  1,384,778
  1,384,784
  1,384,799
  1,384,800
  1,384,814
  1,384,817
  1,384,821
  1,384,826
  1,387,332
  1,387,789
  1,387,807
  1,388,402
  1,388,436
  1,388,438
  1,388,440
  1,388,787
  1,388,901
  1,389,234
  1,389,401
  1,389,852
  1,390,026
  1,390,379
  1,390,419
  1,390,482
  1,391,165
  1,392,346
  1,392,839
  1,393,574
  1,394,040
  1,394,616
  1,394,735
  1,394,858
  1,394,993
  1,395,530
  1,395,880
  1,395,903
  1,395,954
  1,396,166
  1,396,356
  1,396,424
  1,396,428
  1,396,453
  1,396,464
  1,396,511
  1,396,517
  1,396,733
  1,396,839
  1,397,884
  1,398,253
  1,398,278
  1,398,324
  1,398,535
  1,399,250
  1,399,263
  1,400,502
  1,401,200
  1,401,866
  1,402,076
  1,402,164
  1,402,166
  1,402,169
  1,402,922
  1,403,370
  1,403,372
  1,403,374
  1,403,376
  1,403,378
  1,403,380
  1,403,382
  1,403,424
  1,403,515
  1,403,931
  1,403,963
  1,404,128
  1,405,004
  1,405,625
  1,406,338
  1,407,196
  1,407,573
  1,408,016
  1,408,246
  1,408,536
  1,409,125
  1,409,291
  1,409,439
  1,409,636
  1,410,163
  1,410,767
  1,411,598
  1,413,025
  1,413,066
  1,415,290
  1,416,367
  1,416,947
  1,417,519
  1,417,529
  1,417,532
  1,418,037
  1,418,189
  1,418,479
  1,418,516
  1,418,737
  1,419,015
  1,419,292
  1,419,437
  1,419,711
  1,420,246
  1,420,269
  1,420,501
  1,420,736
  1,421,282
  1,421,827
  1,422,259
  1,422,311
  1,422,431
  1,422,500
  1,423,140
  1,423,953
  1,424,588
  1,424,950
  1,425,148
  1,425,363
  1,425,441
  1,425,540
  1,426,093
  1,426,100
  1,426,547
  1,427,074
  1,427,327
  1,427,859
  1,428,155
  1,428,270
  1,429,525
  1,429,554
  1,429,638
  1,429,665
  1,429,669
  1,429,670
  1,429,684
  1,429,693
  1,430,003
  1,430,053
  1,430,068
  1,430,098
  1,430,235
  1,430,443
  1,430,744
  1,431,001
  1,431,031
  1,431,266
  1,431,270
  1,431,871
  1,432,168
  1,432,778
  1,433,405
  1,433,540
  1,433,781
  1,433,782
  1,433,935
  1,434,393
  1,434,688
  1,435,056
  1,435,058
  1,435,222
  1,435,721
  1,436,143
  1,436,191
  1,436,554
  1,437,116
  1,437,561
  1,437,798
  1,437,977
  1,437,981
  1,438,412
  1,438,849
  1,439,030
  1,439,392
  1,439,398
  1,439,402
  1,439,429
  1,439,534
  1,439,538
  1,439,539
  1,439,543
  1,439,546
  1,439,548
  1,439,557
  1,439,664
  1,439,684
  1,440,122
  1,440,247
  1,440,365
  1,440,387
  1,440,903
  1,441,084
  1,441,403
  1,441,622
  1,444,322
  1,444,681
  1,444,747
  1,444,816
  1,444,822
  1,445,069
  1,445,282
  1,445,462
  1,447,534
  1,447,954
  1,448,328
  1,448,379
  1,448,515
  1,448,845
  1,448,898
  1,449,006
  1,449,276
  1,449,329
  1,449,458
  1,450,465
  1,450,766
  1,451,162
  1,451,833
  1,452,520
  1,453,466
  1,453,552
  1,453,559
  1,454,617
  1,454,829
  1,454,874
  1,455,531
  1,456,351
  1,457,284
  1,457,335
  1,457,365
  1,457,422
  1,458,059
  1,460,519
C
T
T
G
-
-
-
-
-
-
-
9/-
-
T
C
-
A
-
A
A
C
A
-/T
T
T
A
A
A
C
T
G
A
T
A
T
G
C
C
C
G
T
A
C
T
G
C
C
G
T
C
4
6
G
C
T
T
G
C
A/C
G
-
-
-
C
-
-
2
-
A
C
-
C
T
G
T
A
G
G
G
G
A
T
G
A
G
T
A
T
G
T
C
A
C
-
C
A
G
4
A
A
-
C
A
A
A
T
-
A
C
A
C
C
G
T
T
-
-
-
-
A
G
G
G
-
C
A
A
C
G
C
C
C
2
T
T
-
G
2
A
-
G
G
C
C
A
G
A
3
G
A
-
A
A
-
T
T
T
G
G
A
G
-
T
G
C
A
A
G
A
A
T
A
A
C
T
A
T
A
A
A
C
3
C
G
A
A
A
T
C
A
A
T
4
A
T
A
4
G
C
T
4
C
T
G
T
A
G
A
G
C
A
C
2
T
T
-
-
C
5/A
G
T
C
T
4
4
A
G
T
T
T
T
T
T
T
G
T
-
-
-
-
T
A
A
A
-
A
T
T
C
T
A
G
A
C
A
5
G
C
A
T
A
C
A
A
T
G
T
T
A
G
A
C
G
G
A
C
G
G
G
A
A
A
G
G
A
G
C
A
T
G
T
A
T
C
T
G
C
A
A
T
A
T
G
C
T
T
G
C
T
T
A
T
-
6
T
A
C
2
C
-
T
C
A
T
T
G
3
T
A
G
A
A
-
C
2
A
T
T
T
T
A
T
A
C
A
A
A
C
C
A
A
C
C
A
C
A
T
A
A
T/G
A
T
T
-
C
C
T
-
3
T
G
G
T
A
T
G
G
A
C
T
A
T
G
-
T
G
T
-
A
G
A
C
C
T
-
2
T
4
G
-