Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 149,046 (bp)   Positions: 336
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.071
.002
.001
.001
.67
.0
.016
.128
.063
.0
.0
.002
.001
.005
.001
.0
.002
.0
.008
.008
.929
.671
.002
.364
.089
.001
.033
.124
.0
.008
.132
.0
.219
.0
.0
.014
.0
.001
.007
.001
.001
.001
.11
.998
.0
.002
.0
.0
.002
.001
.002
.001
.001
.001
.074
.001
.995
.0
.001
.002
.0
.508
.004
.0
.608
.112
.001
.111
.005
.001
--
.253
.007
.006
.0
.0
.004
.0
.078
.016
.0
.052
.014
.019
.0
.762
.946
.0
.004
.001
.0
.0
.0
.026
.019
.02
.003
.001
.002
.0
.006
.381
.001
.039
.003
.053
.005
.0
.001
.006
.026
.007
.002
.112
.006
.004
.0
.002
.144
.074
.002
.001
.002
.006
.001
.0
.013
.0
.001
.0
.004
.005
.001
.0
.0
.0
.0
.003
.983
.944
.0
.002
.0
.114
.003
.0
.008
.056
.009
.0
.0
.0
.001
.0
.142
.176
.154
.001
.0
.005
.01
.003
.216
.228
.013
.0
.001
.0
.083
.003
.004
.002
.001
.002
.001
.0
.031
.0
.049
.003
.001
.021
.003
.092
.029
.0
.029
.001
.007
1.0
.001
.602
.001
.001
.03
.001
.377
.0
.0
.0
.006
.021
.002
.062
.552
.004
.109
.072
.976
.0
.0
.001
.001
.0
.0
.002
.0
.0
.011
.011
.0
.001
.06
.017
.005
.208
.098
.027
.042
.005
.0
.008
.004
.0
.055
.007
.0
.001
.0
.78
.002
.001
.005
.001
.0
.033
.061
.002
.016
.0
.003
.001
.007
.001
.001
.0
.001
.003
.013
.0
.006
.009
.001
.019
.932
.011
.422
--
.002
.41
.002
.063
.872
.939
.0
.0
.0
.031
.084
.002
.009
.0
.0
.001
.0
.01
.003
.0
.013
.0
.0
.001
.0
.021
.94
.004
.0
.0
.0
.049
.0
.186
.018
.007
.001
.008
.0
.0
.0
.005
.003
.0
.014
.007
.002
.021
.018
.007
.0
.0
.002
.002
.0
.0
.0
.002
.786
.009
.001
.0
.0
.0
.0
.036
.007
.927
Pam
Pam
Pam
Pam
Pam
Pam
Pam
Pam
Pam
Pam
Pam
Pam
Pam
Pam
Pam
Pam
Pam
Pam
Pam
Pam
Pam
Pam
Pam
Pam
Pam
Pam
Pam
Pam
Pam
Pam
Pam
Pam
Pam
Pam
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
T
A
T
A
A
A
T
C
T
T
T
T
T
A
G
G
A
A
T
C
T
C
C
G
A
G
A
C
T
G
T
T
G
G
C
A
A
G
T
A
T
A
A
G
A
G
T
T
A
G
G
C
A
C
G
T
G
T
A
C
T
G
A
G
C
T
G
A
G
G
G
A
A
T
T
G
A
T
C
C
A
T
C
C
A
G
C
A
C
G
A
A
T
C
G
T
A
G
G
C
G
T
T
A
C
G
C
C
G
T
G
T
T
G
C
A
G
A
A
C
G
T
C
A
G
G
C
G
T
A
C
T
G
T
G
G
A
G
G
G
G
C
A
C
G
G
A
A
T
G
G
G
G
A
C
G
G
C
C
A
T
T
C
T
G
G
T
G
C
C
G
G
C
G
T
T
C
G
C
T
T
G
A
T
G
A
A
T
C
A
A
T
A
T
G
A
T
G
T
A
T
A
T
A
G
G
C
T
C
A
G
T
G
G
C
C
C
C
A
G
C
G
T
G
C
T
A
G
G
C
T
G
T
C
G
G
A
C
T
A
C
T
A
A
G
G
A
A
G
T
A
C
C
C
C
A
C
A
T
C
C
C
G
A
T
C
A
G
T
A
T
C
A
G
T
A
A
C
A
T
C
A
A
C
C
G
G
T
A
C
A
A
T
T
G
G
T
A
T
T
A
T
G
G
A
G
T
G
C
T
A
T
A
A
A
T
G
G
A
G
C
T
G
C
C
T
A
T
G
G
C
C
A
C
C
C
  111,030,579
  111,036,573
  111,036,594
  111,036,633
  111,036,818
  111,036,868
  111,036,885
  111,036,903
  111,036,913
  111,036,939
  111,037,004
  111,037,041
  111,037,103
  111,037,137
  111,037,166
  111,037,440
  111,037,467
  111,037,509
  111,037,659
  111,037,718
  111,037,740
  111,037,855
  111,038,498
  111,038,534
  111,038,574
  111,038,867
  111,038,901
  111,039,462
  111,039,718
  111,039,820
  111,040,375
  111,040,684
  111,040,807
  111,041,825
  111,041,986
  111,042,236
  111,042,250
  111,042,286
  111,042,879
  111,042,935
  111,043,013
  111,043,245
  111,043,728
  111,044,033
  111,044,275
  111,044,343
  111,044,588
  111,044,613
  111,045,776
  111,046,063
  111,046,116
  111,046,123
  111,046,633
  111,047,286
  111,047,848
  111,049,084
  111,049,374
  111,050,293
  111,050,537
  111,050,550
  111,050,824
  111,051,429
  111,051,760
  111,052,021
  111,052,461
  111,052,473
  111,052,505
  111,052,662
  111,052,910
  111,053,086
  111,053,428
  111,054,305
  111,054,574
  111,054,785
  111,054,829
  111,055,178
  111,055,232
  111,055,377
  111,055,835
  111,055,921
  111,056,143
  111,056,200
  111,056,230
  111,056,352
  111,057,752
  111,058,628
  111,058,731
  111,059,417
  111,059,868
  111,062,029
  111,062,070
  111,063,159
  111,063,627
  111,066,768
  111,066,996
  111,067,063
  111,071,375
  111,071,643
  111,072,228
  111,073,296
  111,073,351
  111,074,042
  111,074,169
  111,074,369
  111,074,673
  111,075,339
  111,075,620
  111,075,837
  111,077,260
  111,077,467
  111,077,699
  111,078,947
  111,081,468
  111,082,646
  111,083,330
  111,083,563
  111,083,571
  111,084,302
  111,084,363
  111,084,429
  111,084,855
  111,085,113
  111,085,124
  111,085,510
  111,085,525
  111,085,707
  111,086,020
  111,086,358
  111,086,619
  111,086,799
  111,086,809
  111,087,368
  111,089,010
  111,089,066
  111,089,119
  111,090,593
  111,090,809
  111,092,695
  111,093,215
  111,095,004
  111,095,482
  111,097,069
  111,097,183
  111,097,611
  111,098,691
  111,098,833
  111,100,150
  111,100,223
  111,100,534
  111,103,479
  111,103,501
  111,104,214
  111,104,243
  111,104,514
  111,105,219
  111,105,244
  111,105,376
  111,105,593
  111,106,422
  111,107,054
  111,107,288
  111,107,821
  111,109,123
  111,110,604
  111,112,127
  111,112,352
  111,112,621
  111,112,624
  111,113,275
  111,113,995
  111,114,041
  111,115,401
  111,116,469
  111,117,542
  111,117,592
  111,118,161
  111,118,677
  111,119,248
  111,120,301
  111,122,951
  111,124,505
  111,125,552
  111,126,836
  111,127,324
  111,127,391
  111,127,590
  111,128,690
  111,129,090
  111,130,777
  111,132,525
  111,132,543
  111,132,558
  111,132,894
  111,133,577
  111,133,599
  111,134,247
  111,134,453
  111,134,628
  111,134,757
  111,135,013
  111,135,813
  111,135,921
  111,136,104
  111,136,380
  111,136,459
  111,136,618
  111,137,180
  111,137,232
  111,137,694
  111,137,970
  111,138,079
  111,138,395
  111,138,934
  111,139,414
  111,140,409
  111,140,729
  111,140,861
  111,141,802
  111,141,818
  111,142,225
  111,142,315
  111,142,577
  111,142,851
  111,142,971
  111,143,908
  111,143,924
  111,143,950
  111,143,991
  111,143,992
  111,144,138
  111,144,793
  111,145,097
  111,145,148
  111,145,377
  111,145,918
  111,145,938
  111,146,227
  111,146,238
  111,146,491
  111,146,895
  111,147,936
  111,148,387
  111,149,265
  111,150,464
  111,151,466
  111,152,493
  111,153,828
  111,154,011
  111,154,238
  111,154,822
  111,156,301
  111,156,612
  111,157,048
  111,157,379
  111,158,638
  111,158,790
  111,159,366
  111,159,407
  111,159,788
  111,160,090
  111,160,543
  111,160,722
  111,160,749
  111,161,126
  111,161,775
  111,163,501
  111,164,668
  111,165,110
  111,166,132
  111,166,838
  111,167,109
  111,167,362
  111,167,791
  111,167,816
  111,168,618
  111,169,945
  111,170,058
  111,171,672
  111,172,084
  111,172,214
  111,172,255
  111,172,576
  111,172,614
  111,172,637
  111,172,644
  111,172,656
  111,172,687
  111,172,816
  111,172,820
  111,172,878
  111,172,886
  111,172,891
  111,172,924
  111,173,052
  111,173,341
  111,173,467
  111,173,593
  111,173,615
  111,173,631
  111,173,657
  111,173,672
  111,173,794
  111,173,795
  111,173,813
  111,173,815
  111,173,824
  111,173,884
  111,173,887
  111,173,895
  111,173,976
  111,174,026
  111,174,132
  111,174,428
  111,174,468
  111,174,519
  111,174,568
  111,174,569
  111,174,626
  111,174,716
  111,174,793
  111,174,962
  111,175,126
  111,175,440
  111,175,639
  111,175,661
  111,175,935
  111,175,982
  111,176,212
  111,176,242
  111,176,248
  111,176,259
  111,176,318
  111,176,567
  111,176,730
  111,176,734
  111,176,865
C
G
G
G
G
G
C
A
C
C
C
G
C
G
A
A
G
G
C
T
G
T
T
A
G
A
G
T
C
T
C
C
A
A
T
G
G
C
C
G
C
T
G
A
C
A
C
C
G
T
A
T
G
T
A
C
A
C
T
T
C
A
G
A
T
C
T
G
A
A
A
G
G
C
A
C
G
A
A
T
C
C
T
T
G
A
G
T
T
A
C
G
C
T
T
C
G
A
A
T
A
C
C
G
T
A
T
T
A
C
A
C
A
A
G
G
A
G
G
T
A
C
T
G
A
A
A
A
G
G
G
C
A
A
A
A
G
G/A
A
A
A
G
G
T
T
C
G
G
C
C
A
A
A
G
T
A
T
G
G
T
A
G
T
C
A
T
C
T
T
T
A
A
T
A
C
C
A
A
T
G
G
A
C
C
A
G
C
C
T
G
G
G
G
G
A
C
A
A
C
G
C
G
C
G
A
A
G
C
T
G
A
C
A
A
T
T
T
T
G
A
T
C
C
A
T
C
C
C
T
A
G
A
C
G
A
A
G
T
C
G
T
C
G
T
C
A
T
G
A
A
T
T
T
T
T
G
T
G
C
T
G
T
A
T
A
A
T
A
C
T
C
T
T
A
C
C
C
T
G
C
T
G
G
G
T
A
C
C
G
G
G
G
C
G
C
A
A
C
C
A
G
C
A
A
G
A
G
A
G
C
C
C
C
C
G
C
A
C
G
A
T
C
T
T
T
C
T
C
T
T
A
T
G
T
T
G