Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 197,126 (bp)   Positions: 367
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.0
.005
.011
.001
1.0
.01
.037
.004
.235
.002
.001
.705
.001
.036
.222
.045
.144
.015
.008
.009
.004
.001
.07
.007
1.0
.011
.0
.0
.022
.002
.007
.004
.112
.054
.055
.039
.002
.026
--
.065
.663
.0
.0
.0
.0
.07
.001
.005
.004
.005
.048
.008
.008
.024
.008
.001
.0
.037
.0
.035
.0
.001
.0
.0
.001
.068
1.0
.0
.001
.033
.005
.01
.392
.014
.238
.549
.007
.0
.001
.002
.018
.022
--
.018
.004
.038
.024
.0
.095
.001
.005
.0
.591
.002
.0
.001
.002
.0
.804
.082
.0
.0
.0
.001
.315
.0
.208
.027
.002
.0
.007
.023
.001
.0
.002
.016
.0
.019
.016
.084
.02
.002
--
--
.0
.002
.0
.0
.0
.0
.0
.07
.005
--
--
--
.001
.0
.001
.015
.0
.004
.003
.004
.0
.0
.002
.002
.147
.971
.0
.0
.0
.0
.998
.0
.007
.021
.002
.139
.003
.004
.002
.003
.001
.001
.001
.0
.002
.001
.046
.07
.076
.04
.0
.001
.001
.0
.001
.0
.0
.006
.139
.012
.001
.181
.027
.01
.229
.0
.013
.0
.01
.006
.001
.0
.003
.556
.003
.001
.003
.0
.0
.001
.001
.001
.0
.001
.0
.0
.001
.0
.0
.0
.038
.0
.004
.677
.0
.0
.36
.0
.024
.005
.001
.11
.003
.0
.0
.001
.002
.005
.0
.0
.001
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.009
.001
.001
.001
.0
.005
.081
.001
.118
.002
.224
.096
.047
.0
.001
.012
.008
.005
.167
.013
.001
.822
.461
.0
.001
.003
.0
.14
.102
.442
.005
.001
.005
.126
.86
.92
.002
.0
.002
.0
.002
.001
.004
.001
.0
.0
.003
.001
.019
.001
.228
.004
.02
.01
.289
.141
.002
.067
.495
.482
.017
.0
.0
.007
.0
.014
.05
.001
.004
.008
.003
.0
.002
.54
.164
.026
.009
.02
.041
.011
1.0
.003
.001
--
--
--
.032
.003
.007
.003
.008
.001
.001
.001
.255
.0
.0
.453
.0
.15
.007
.044
.028
--
.035
.0
.228
.001
.041
.001
.001
.064
1.0
.0
.0
.002
.002
.001
.014
.049
--
.142
.065
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
LOC102546723
LOC102546723
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
G
G
G
G
A
C
T
T
A
T
T
G
T
T
A
A
T
T
A
G
C
A
C
T
G
A
C
G
G
C
A
G
G
G
G
G
T
C
T
C
C
T
G
G
C
C
G
G
T
A
T
C
A
G
C
A
T
A
G
A
A
A
A
A
T
G
A
G
C
C
A
T
T
G
T
C
A
C
G
A
G
T
T
T
G
A
G
C
A
G
C
C
G
A
G
G
A
T
T
G
G
G
T
C
C
A
A
T
A
A
A
G
G
C
G
A
G
G
G
A
A
T
G
A
C
T
A
C
G
T
G
T
T
A
T
A
G
C
G
A
T
A
A
T
G
T
T
G
C
C
G
G
A
G
G
G
G
C
T
G
A
T
G
A
G
A
G
A
G
C
C
A
G
T
G
A
T
T
C
A
G
A
C
A
T
A
G
C
C
A
A
A
C
C
T
C
C
G
G
T
G
G
A
T
A
G
C
A
A
T
G
C
T
C
A
G
A
T
G
A
T
G
A
C
C
G
A
T
C
G
A
A
T
T
G
A
C
T
G
C
C
G
G
A
T
A
A
A
C
T
A
A
G
A
G
T
A
T
A
G
C
A
G
A
C
C
A
C
A
G
T
T
T
T
A
T
A
G
T
T
G
G
T
C
C
A
A
T
A
A
T
T
G
A
A
C
G
G
A
G
C
T
T
T
T
A
C
C
A
A
T
G
C
G
C
C
A
T
A
C
T
A
G
G
A
G
T
C
A
A
C
T
A
A
G
C
A
G
G
C
G
G
C
C
G
A
C
T
T
A
T
A
T
T
C
A
T
T
C
G
T
A
C
G
C
C
A
  4,097,314
  4,097,951
  4,098,431
  4,098,763
  4,098,901
  4,099,469
  4,100,074
  4,100,439
  4,101,281
  4,101,412
  4,102,318
  4,104,077
  4,104,796
  4,106,959
  4,107,288
  4,109,290
  4,109,616
  4,109,910
  4,110,036
  4,110,037
  4,110,082
  4,110,154
  4,110,647
  4,110,661
  4,111,235
  4,111,805
  4,111,853
  4,112,046
  4,112,251
  4,113,023
  4,113,998
  4,114,007
  4,115,327
  4,115,570
  4,115,988
  4,115,990
  4,117,197
  4,117,455
  4,118,123
  4,120,361
  4,120,541
  4,121,067
  4,121,268
  4,121,448
  4,121,492
  4,121,543
  4,121,796
  4,121,867
  4,121,928
  4,121,994
  4,122,060
  4,122,134
  4,122,648
  4,122,812
  4,123,021
  4,123,785
  4,124,011
  4,124,070
  4,124,079
  4,124,156
  4,124,190
  4,125,548
  4,126,251
  4,126,551
  4,126,791
  4,126,877
  4,129,218
  4,131,866
  4,133,052
  4,134,463
  4,134,981
  4,135,113
  4,135,251
  4,135,567
  4,135,993
  4,136,048
  4,138,720
  4,140,477
  4,140,861
  4,141,485
  4,141,574
  4,141,790
  4,144,547
  4,145,734
  4,151,213
  4,151,272
  4,151,273
  4,152,059
  4,152,365
  4,153,160
  4,154,715
  4,155,143
  4,155,413
  4,155,712
  4,155,912
  4,155,925
  4,157,632
  4,159,828
  4,160,423
  4,160,742
  4,161,920
  4,162,327
  4,163,805
  4,164,657
  4,164,717
  4,164,837
  4,165,596
  4,165,719
  4,165,945
  4,165,972
  4,167,786
  4,168,117
  4,168,681
  4,168,926
  4,169,196
  4,169,277
  4,169,308
  4,169,508
  4,169,519
  4,170,877
  4,171,549
  4,172,391
  4,173,426
  4,174,160
  4,174,567
  4,174,603
  4,176,091
  4,176,096
  4,176,100
  4,176,236
  4,176,302
  4,177,022
  4,177,169
  4,178,466
  4,178,849
  4,179,130
  4,183,259
  4,183,327
  4,183,328
  4,183,699
  4,183,989
  4,184,294
  4,184,945
  4,185,054
  4,185,389
  4,185,839
  4,185,893
  4,185,923
  4,186,538
  4,186,827
  4,187,940
  4,188,281
  4,188,452
  4,188,455
  4,189,377
  4,190,146
  4,190,911
  4,190,985
  4,191,246
  4,191,315
  4,191,464
  4,191,468
  4,191,667
  4,191,668
  4,191,692
  4,191,693
  4,191,715
  4,191,717
  4,192,107
  4,192,471
  4,192,826
  4,192,906
  4,193,132
  4,193,530
  4,194,061
  4,194,101
  4,194,146
  4,194,251
  4,194,342
  4,194,493
  4,194,841
  4,194,864
  4,195,036
  4,195,414
  4,196,783
  4,197,058
  4,197,085
  4,199,564
  4,200,921
  4,201,351
  4,201,458
  4,201,628
  4,201,756
  4,201,795
  4,202,136
  4,202,430
  4,202,483
  4,203,202
  4,203,292
  4,203,805
  4,204,350
  4,204,412
  4,204,490
  4,204,780
  4,204,841
  4,204,862
  4,204,882
  4,204,931
  4,206,176
  4,206,181
  4,206,288
  4,206,322
  4,206,383
  4,206,541
  4,206,644
  4,206,688
  4,206,725
  4,206,897
  4,207,045
  4,207,265
  4,207,657
  4,207,897
  4,207,963
  4,208,676
  4,209,452
  4,209,463
  4,209,578
  4,209,829
  4,209,876
  4,210,131
  4,210,204
  4,210,293
  4,210,358
  4,210,430
  4,210,692
  4,210,705
  4,210,710
  4,210,716
  4,211,685
  4,211,768
  4,212,183
  4,212,193
  4,212,195
  4,213,003
  4,213,144
  4,213,278
  4,213,287
  4,213,380
  4,213,491
  4,213,601
  4,213,850
  4,213,998
  4,214,309
  4,214,359
  4,214,362
  4,214,376
  4,214,412
  4,214,414
  4,214,435
  4,214,564
  4,214,565
  4,214,661
  4,214,700
  4,217,196
  4,217,441
  4,217,499
  4,217,848
  4,217,938
  4,218,025
  4,218,311
  4,218,441
  4,218,458
  4,218,568
  4,218,809
  4,218,955
  4,219,191
  4,219,237
  4,219,403
  4,219,469
  4,219,527
  4,219,585
  4,219,595
  4,219,626
  4,219,821
  4,219,830
  4,220,369
  4,220,556
  4,220,587
  4,220,666
  4,220,697
  4,220,826
  4,220,916
  4,221,023
  4,226,689
  4,226,916
  4,227,302
  4,227,373
  4,227,519
  4,227,551
  4,227,848
  4,228,142
  4,228,723
  4,228,724
  4,228,956
  4,229,718
  4,229,735
  4,233,431
  4,234,825
  4,235,223
  4,235,638
  4,235,869
  4,235,933
  4,235,958
  4,236,168
  4,236,311
  4,236,694
  4,236,970
  4,238,008
  4,238,572
  4,238,658
  4,238,805
  4,238,889
  4,239,234
  4,240,040
  4,240,496
  4,244,570
  4,245,713
  4,245,831
  4,246,086
  4,246,424
  4,246,598
  4,247,597
  4,250,733
  4,254,092
  4,255,183
  4,255,216
  4,255,916
  4,256,421
  4,256,640
  4,256,690
  4,257,904
  4,258,667
  4,259,980
  4,260,051
  4,260,483
  4,261,257
  4,261,667
  4,265,708
  4,266,349
  4,269,846
  4,270,249
  4,272,852
  4,277,763
  4,277,764
  4,278,063
  4,279,398
  4,280,426
  4,283,009
  4,283,218
  4,283,344
  4,283,627
  4,284,367
  4,287,385
  4,288,317
  4,291,149
  4,293,245
  4,293,716
A
A
A
A
C
T
C
A
G
G
C
A
C
G
C
G
C
C
G
A
A
T
G
C
A
C
T
A
C
A
G
T
T
A
T
T
C
A
G
T
T
A
T
A
A
T
A
A
G
G
C
T
T
A
T
T
C
G
C
G
T
G
G
G
C
A
G
A
A
T
G
C
C
A
C
T
T
A
A
G
A
C
C
C
A
G
C
T
T
A
T
T
A
G
A
A
G
G
C
A
A
T
C
T
T
G
G
C
G
G
G
A
A
A
A
G
A
A
A
G
T
G
C
G
T
A
G
T
A
G
A
C
C
G
C
G
T
G
C
G
A
G
C
C
A
C
G
A
A
T
A
A
G
A
A
T
C
T
C
A
C
C
A
T
A
C
A
G
T
T
G
G
A
C
T
G
C
C
T
T
A
G
T
C
C
T
A
T
T
T
G
T
T
T
C
T
T
A
A
C
A
C
G
C
T
A
T
G
C
C
A
T
C
G
G
A
G
C
C
C
C
A
G
T
A
A
G
C
T
C
G
G
C
C
A
G
T
C
A
T
G
A
C
G
A
G
G
G
G
C
G
G
C
G
C
G
T
C
T
T
G
G
A
C
A
T
G
T
G
C
C
C
A
C
G
C
G
A
C
A
A
A
C
A
T
T
C
C
G
G
C
A
T
C
G
G
A
A
G
A
A
C
C
A
G
G
G
G
G
G
C
A
T
A
T
A
G
C
G
A
A
G
A
A
G
A
C
T
G
C
T
C
G
C
C
T
G
T
A
T
T
C
A
T
A
C
G
C
C
G
C
G
A
C
T
T
C
C
A
A
A
G
T
T
A
T
G