Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 325,464 (bp)   Positions: 420
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.0
.001
.003
.002
.003
.001
.022
.0
.0
.025
.001
.002
.036
--
.288
.299
.009
.007
.007
.003
.032
.008
.009
.028
.034
--
--
--
--
.022
.013
.539
.071
--
.005
.001
.001
.041
.0
.175
.002
.0
.001
.0
.0
.029
.0
.006
.001
.0
.0
.001
.001
.837
.272
.0
.0
.006
.003
.001
.003
.001
.001
.001
.002
.01
.168
.01
.071
.009
.022
.02
.02
.002
.017
.093
.129
.44
.132
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.075
.01
.01
--
--
.012
.005
.002
.0
.003
.023
.13
.025
.018
.483
.117
.0
.0
.881
.0
.0
.048
.001
.002
.396
--
.003
.007
.0
.019
.085
--
--
.003
.0
.002
.0
.024
.004
.006
.032
.019
--
.02
.002
--
.001
.005
.001
.543
.042
.037
.1
.0
.0
.0
--
--
.095
.181
.038
.004
.014
.009
.131
.021
.023
.106
.031
.031
.49
.034
.006
.037
.001
.138
.004
.027
.006
.0
.013
.161
.0
.017
.12
--
.997
.133
.192
.086
.016
.012
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.026
.006
.05
.0
.009
.002
.003
.001
.002
.0
.001
.051
.014
.002
.006
.0
.064
.004
.002
--
.016
.152
.0
.001
.001
.104
.001
.02
.364
.365
.091
.026
.063
.002
.011
.001
.004
--
--
--
.032
--
--
.197
.009
.027
.006
.001
.006
.001
.001
.061
.038
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.068
.041
.142
.07
.087
.309
.26
.148
.166
.466
.019
.001
.001
.006
.002
.001
.015
.001
.011
.001
.162
.111
.128
.077
.091
.174
.046
--
--
--
.092
.139
.124
.052
.005
.001
.016
.001
.002
.001
.003
.003
.612
.488
.049
.037
.001
.01
.001
.001
.0
.01
.003
.132
.028
.027
.28
.029
.017
.048
.011
.008
.0
.0
.0
.01
.001
.006
.022
.051
.016
.034
.164
.281
.01
.005
.04
.004
.004
.012
.0
.032
.014
.245
.108
.069
.0
.173
.078
.007
.001
.01
.051
.113
.001
.0
.001
.001
.366
.032
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.133
.013
.016
.314
.003
.011
.293
.01
.039
.025
.036
.005
.009
--
--
--
--
.013
.001
.005
.01
--
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
G
G
A
C
G
G
G
C
G
G
G
C
G
G
A
A
A
A
C
G
G
C
T
T
A
G
C
C
A
T
T
C
T
T
G
C
G
G
C
C
G
C
G
G
C
T
A
A
T
C
T
C
T
C
G
T
T
G
T
G
G
C
G
G
G
C
G
A
G
C
G
A
C
T
C
A
T
A
C
G
C
T
T
T
C
G
G
A
G
C
A
C
G
G
G
G
C
G
C
A
T
A
G
C
C
T
A
A
T
A
A
C
A
A
A
T
C
T
G
G
A
T
C
C
T
C
A
A
A
C
T
T
T
T
T
A
G
A
T
C
A
T
G
A
T
C
C
C
C
C
C
G
C
C
G
T
C
T
C
C
C
C
C
G
C
T
A
A
A
A
G
A
T
T
G
C
C
T
T
T
C
T
T
G
A
T
A
T
G
A
T
G
G
C
G
A
G
T
A
A
C
C
T
T
A
G
C
G
C
G
G
A
C
C
T
A
G
C
C
C
C
G
C
A
A
A
T
T
G
T
A
C
C
T
G
A
C
A
T
A
C
C
C
A
A
A
T
C
C
T
A
C
C
T
G
G
A
G
A
T
G
A
A
A
A
C
C
A
C
A
A
T
T
A
C
T
C
A
G
C
T
T
C
G
T
C
C
T
G
A
T
T
C
G
C
A
A
T
A
G
G
C
G
A
C
A
T
A
T
C
T
C
T
A
C
T
C
C
A
G
T
A
T
T
G
A
T
T
T
A
T
T
T
G
T
A
C
T
C
A
T
C
G
T
C
T
C
T
T
C
G
C
T
C
T
C
T
A
A
T
A
G
C
A
A
T
G
A
G
A
C
C
T
T
A
T
T
T
T
A
T
G
G
G
T
G
G
A
T
A
A
C
T
G
C
T
T
A
A
T
A
A
C
C
G
T
C
G
G
C
A
T
G
C
G
A
C
T
A
A
  114,662,540
  114,663,110
  114,663,457
  114,664,096
  114,664,581
  114,665,629
  114,666,203
  114,667,032
  114,667,071
  114,667,717
  114,668,206
  114,677,583
  114,678,390
  114,685,156
  114,686,828
  114,686,836
  114,686,892
  114,686,898
  114,686,902
  114,686,911
  114,686,933
  114,686,948
  114,686,950
  114,688,700
  114,688,701
  114,692,047
  114,692,204
  114,692,206
  114,692,760
  114,693,525
  114,694,436
  114,694,479
  114,694,628
  114,700,501
  114,718,693
  114,719,808
  114,720,231
  114,723,440
  114,723,466
  114,724,995
  114,725,496
  114,726,296
  114,726,316
  114,726,619
  114,726,872
  114,727,833
  114,727,949
  114,728,196
  114,728,346
  114,728,448
  114,729,110
  114,729,613
  114,730,094
  114,731,582
  114,731,607
  114,731,902
  114,732,016
  114,734,023
  114,734,026
  114,734,492
  114,735,602
  114,735,990
  114,736,416
  114,736,573
  114,737,291
  114,737,890
  114,738,670
  114,738,966
  114,740,349
  114,741,231
  114,741,251
  114,741,254
  114,741,293
  114,741,469
  114,741,738
  114,741,832
  114,742,185
  114,742,238
  114,742,420
  114,742,812
  114,742,881
  114,742,937
  114,743,076
  114,743,077
  114,743,117
  114,743,169
  114,743,250
  114,743,872
  114,744,134
  114,745,200
  114,745,309
  114,746,155
  114,746,351
  114,746,583
  114,746,757
  114,747,346
  114,747,450
  114,747,710
  114,748,321
  114,749,218
  114,753,529
  114,753,577
  114,753,873
  114,755,863
  114,757,009
  114,760,127
  114,760,898
  114,761,067
  114,761,698
  114,762,741
  114,765,500
  114,765,936
  114,769,233
  114,769,790
  114,772,375
  114,772,397
  114,772,879
  114,778,211
  114,778,358
  114,779,262
  114,780,029
  114,780,804
  114,781,137
  114,781,301
  114,781,448
  114,781,989
  114,782,789
  114,783,813
  114,783,821
  114,784,012
  114,784,987
  114,785,429
  114,785,440
  114,786,059
  114,791,863
  114,791,964
  114,793,022
  114,793,995
  114,794,701
  114,795,467
  114,795,547
  114,797,934
  114,798,102
  114,798,192
  114,801,990
  114,802,760
  114,803,797
  114,804,109
  114,804,240
  114,804,367
  114,804,380
  114,804,386
  114,804,422
  114,804,575
  114,805,093
  114,805,139
  114,808,315
  114,825,677
  114,827,346
  114,827,647
  114,829,790
  114,839,894
  114,851,967
  114,856,800
  114,861,286
  114,863,432
  114,872,789
  114,879,509
  114,879,923
  114,884,422
  114,887,372
  114,888,254
  114,888,760
  114,897,613
  114,898,533
  114,901,828
  114,902,070
  114,902,095
  114,902,566
  114,902,801
  114,903,506
  114,903,591
  114,903,601
  114,904,266
  114,904,339
  114,904,962
  114,905,073
  114,905,105
  114,905,159
  114,905,248
  114,905,266
  114,905,310
  114,905,322
  114,905,367
  114,905,446
  114,905,491
  114,905,671
  114,905,685
  114,906,175
  114,906,301
  114,906,424
  114,906,587
  114,906,694
  114,906,925
  114,907,257
  114,907,612
  114,907,797
  114,908,289
  114,908,388
  114,908,454
  114,908,518
  114,909,073
  114,909,581
  114,910,669
  114,910,676
  114,911,986
  114,912,324
  114,912,530
  114,912,574
  114,912,610
  114,912,801
  114,912,808
  114,913,067
  114,915,124
  114,916,057
  114,916,080
  114,916,823
  114,917,606
  114,918,020
  114,919,167
  114,919,246
  114,919,599
  114,919,847
  114,920,550
  114,920,670
  114,920,712
  114,921,176
  114,924,238
  114,924,573
  114,924,892
  114,925,258
  114,927,632
  114,927,639
  114,927,685
  114,927,961
  114,928,618
  114,930,270
  114,932,462
  114,932,641
  114,932,693
  114,932,721
  114,937,978
  114,938,214
  114,938,731
  114,938,818
  114,940,166
  114,940,217
  114,940,336
  114,940,338
  114,940,424
  114,940,800
  114,940,833
  114,941,091
  114,941,854
  114,941,882
  114,943,394
  114,943,542
  114,943,581
  114,943,653
  114,943,848
  114,944,281
  114,944,658
  114,944,804
  114,944,997
  114,945,116
  114,945,127
  114,945,188
  114,946,048
  114,946,202
  114,946,265
  114,946,744
  114,946,839
  114,946,918
  114,947,271
  114,947,580
  114,948,023
  114,948,501
  114,948,560
  114,948,658
  114,948,850
  114,949,302
  114,949,382
  114,949,495
  114,949,636
  114,949,887
  114,949,892
  114,949,897
  114,950,042
  114,950,091
  114,950,252
  114,950,312
  114,950,436
  114,950,547
  114,950,576
  114,950,711
  114,950,755
  114,950,791
  114,950,826
  114,950,964
  114,950,993
  114,951,095
  114,951,103
  114,951,119
  114,951,143
  114,951,202
  114,951,426
  114,952,205
  114,952,286
  114,952,415
  114,952,746
  114,952,911
  114,952,912
  114,952,939
  114,953,032
  114,953,151
  114,953,254
  114,953,299
  114,953,359
  114,953,565
  114,954,046
  114,954,217
  114,955,091
  114,955,124
  114,955,367
  114,955,672
  114,955,705
  114,956,544
  114,957,414
  114,957,421
  114,957,643
  114,958,175
  114,958,196
  114,958,430
  114,958,496
  114,958,710
  114,958,883
  114,958,928
  114,958,976
  114,959,574
  114,959,656
  114,959,695
  114,960,364
  114,960,678
  114,960,680
  114,960,996
  114,961,033
  114,961,041
  114,961,260
  114,961,490
  114,961,590
  114,961,824
  114,961,997
  114,962,222
  114,962,423
  114,962,527
  114,962,854
  114,963,273
  114,963,288
  114,963,649
  114,963,871
  114,964,331
  114,964,943
  114,964,957
  114,965,213
  114,965,969
  114,966,400
  114,966,564
  114,966,718
  114,966,758
  114,967,183
  114,967,240
  114,967,242
  114,967,243
  114,967,282
  114,967,351
  114,967,654
  114,968,391
  114,970,267
  114,971,042
  114,971,805
  114,972,141
  114,972,178
  114,972,356
  114,972,376
  114,972,636
  114,972,657
  114,972,932
  114,972,955
  114,974,707
  114,974,776
  114,975,359
  114,975,498
  114,975,758
  114,976,080
  114,976,532
  114,977,234
  114,977,806
  114,978,204
  114,978,278
  114,978,300
  114,979,112
  114,982,584
  114,982,863
  114,982,973
  114,983,353
  114,984,343
  114,985,302
  114,985,495
  114,985,868
  114,986,714
A
T
C
T
A
A
A
T
G/T
A
T
A
A
C
T
T
G
G
G
T
C
A
G
C
T
G/A
C/T
C/A
G
G
C
T
C
C
C
T
A
A
T
T
C
T
A
A
T
G
T
G
C
T
C
T
C
T
A
C
C
A
C
A
A
T
A
T
A
T
A
C
A
T
C
T
A
G
T
C
C
G
A
A
T
C
C
A
G
A
A
A/T
T
C/T
G
T
C
T
A
A
G
C
T
G
C
C
T
T
T
A
C
G
C
C
G
G
G
T
T
C
T
C
T
A
G
C
G
A
C
G
G
T
G
T
C
A
C
C
C
T
A
T
C
T
G
A
A
T
C
A
T
T
G
T
G
T
G
T
T
C
T
C
T
T
T
T
T
A
T
T/A
G
G
G
C
T
C
C
C
T
T
A
C
C
C
T
C
C
A
T
C
G
C
T
C
C
A
A
T
A
G
A
G
G
T
T
T
C
A
G
A
T
A
T
A
A
T
T
A
C
T
A
A
T
G
A
A
T
T
G
G
C
C
A
C
T
G
T
C
A
G
T
G
C
C
T
T
T
C
G
G
C
A
A
C
G
T
T
C
A
A
G
A
T
A
A
G
G
T
G
A
T
G
G
G
G
G
G
C
T
C
T
T
C
T
C
C
T
A
G
T
T
C
T
G
C
G
G
A
T
C
C
C
T
A
A
T
A
G
A
G
C
T
C
T
C
A
C
C
T
G
T
T
C
A
G
G
C
C
A
G
A
C
C
T
G
C
G
A
C
C
T
C
T
G
A
G
A
A
T
C
G
C
G
T
T
T
G
T
C
T
G
C
G
C
G
A
T
G
G
C
A
G
A
G
A
T
A
G
G
C
G
G
G
G
G
A
A
T
C
A
A
G
C
C
G
T
C
A
G
C
C
G
G
C
C
C
T
T
A
C
T
A
C
T
T
A
C
G
A
G
T
C
C
G