Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 311,128 (bp)   Positions: 512
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.959
.0
.051
.001
.003
.002
.322
.005
.189
.069
.013
.007
.001
.046
.028
.733
.0
.002
.008
.0
.016
.0
.0
.0
.276
.0
.001
.001
.001
.0
.001
.022
.002
.0
.006
.852
.001
.0
.001
.095
.813
--
--
--
.001
.002
.067
.006
.116
.037
.004
.046
.001
.0
.0
.0
.788
.0
.0
.004
.0
.25
.148
.0
.384
.001
.0
.633
.02
.001
.0
.0
.002
.001
.0
.0
.004
.0
.023
.0
.009
.037
.001
.05
.014
.002
.0
.0
.01
.544
.978
.136
.008
.004
.001
.002
.159
.0
.001
.005
.0
.619
.0
.001
.0
.0
.004
.09
.0
.015
1.0
.793
.667
.0
.024
.002
.0
.001
.002
.001
.006
.002
--
.0
.0
.001
.713
.0
.0
.006
.0
.002
.0
.0
.0
.028
.0
.001
.012
.026
.0
.002
.003
.002
.004
.001
.001
.017
.052
.001
.003
.001
.006
.101
.0
.0
.004
.0
--
.03
.005
.0
.496
.002
.0
.002
.004
.001
.004
.026
.002
.003
.01
.001
.01
.027
.024
.04
.003
.044
.003
.001
.003
.057
.001
.003
.115
.0
.001
.001
.002
.007
.028
.031
--
.11
.003
.007
.003
.064
.032
--
--
--
.064
.004
.0
.132
.0
.0
.001
.056
.0
.009
.448
.899
.892
.001
.0
.0
.02
.021
.001
.001
--
.015
.972
.0
.0
.025
.008
.006
.006
.0
.0
.084
.0
.003
.001
.001
.005
.007
.004
.001
.002
.002
.001
.002
.03
.236
.002
.001
.053
.0
.001
.001
.005
.774
.0
.0
.005
.0
.174
.0
.001
.605
.002
.0
.007
.001
.018
.016
.0
.003
.385
.549
.012
.0
.004
.004
.0
.007
.0
.001
.037
.0
.005
.0
.005
.799
.039
.013
.005
.01
.002
1.0
.996
.998
.008
.002
.003
.006
.002
.0
.0
.0
.001
.0
.002
.0
.002
.002
.0
.134
.145
.003
.0
.0
.002
.0
.0
.008
.007
.021
.237
.003
--
.0
.0
.0
.004
.004
.01
.01
.021
.002
.051
.538
.151
.005
.0
.001
.01
.022
.014
.001
.584
.006
.001
.0
.001
.002
.008
.004
.005
.001
.011
.004
.0
.001
.0
.002
.0
.0
.805
.009
.002
.0
.888
.001
.001
.015
.901
--
.966
.001
.004
.417
.004
.001
.036
.019
.0
.002
.0
.387
.0
.043
.0
.008
.006
.001
.001
.026
.002
.004
.017
.071
.0
.0
.009
.0
.0
.001
.0
.0
.0
.061
.083
.106
.002
.001
.002
.01
.026
.993
.001
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.006
.003
.0
.001
.0
.007
.0
.002
.169
.009
.001
.004
.04
.055
.195
.045
.011
.001
.0
.001
.002
.0
.001
.019
.018
.003
.04
.143
.147
.0
.998
.0
.004
.001
.0
.826
.003
.004
.0
.0
.001
.0
.001
.124
.0
.008
.008
.001
.001
.0
.001
.093
.003
.0
.04
.0
.007
.0
.004
.011
.0
.002
.0
.004
.064
.001
.0
.006
.0
.001
.02
.023
.189
.03
.02
.001
.005
.008
.002
.93
.002
.0
.0
.001
.0
.005
.0
.001
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
LOC108353117
LOC108353117
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Ntrk2
Ntrk2
Ntrk2
Ntrk2
Ntrk2
Ntrk2
Ntrk2
Ntrk2
Ntrk2
Ntrk2
Ntrk2
Ntrk2
Ntrk2
Ntrk2
Ntrk2
Ntrk2
Ntrk2
Ntrk2
Ntrk2
Ntrk2
Ntrk2
Ntrk2
Ntrk2
Ntrk2
Ntrk2
Ntrk2
Ntrk2
Ntrk2
Ntrk2
Ntrk2
Ntrk2
Ntrk2
Ntrk2
Ntrk2
Ntrk2
Ntrk2
Ntrk2
Ntrk2
Ntrk2
Ntrk2
Ntrk2
Ntrk2
Ntrk2
Ntrk2
Ntrk2
Ntrk2
Ntrk2
Ntrk2
Ntrk2
Ntrk2
Ntrk2
Ntrk2
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
T
G
C
A
G
G
T
G
A
C
T
G
A
T
A
C
A
A
A
A
C
T
T
C
T
A
T
A
C
C
C
G
T
C
C
G
T
T
A
C
G
T
T
G
G
T
G
A
C
T
C
A
G
C
G
T
G
T
A
G
T
T
T
G
A
T
T
G
G
T
C
T
C
A
G
C
C
C
A
C
T
G
T
T
C
T
C
T
T
C
C
C
A
C
C
A
T
G
T
A
A
C
G
T
A
T
T
T
A
A
G
G
G
G
C
A
T
A
T
A
T
G
C
G
C
T
G
G
A
G
A
A
C
C
T
T
T
G
G
A
C
C
A
C
C
C
A
C
T
G
G
G
C
A
G
T
C
T
A
T
G
G
T
A
T
A
G
A
C
T
C
G
G
T
T
T
C
A
C
C
G
C
G
A
A
A
A
C
C
A
G
C
T
G
G
A
C
T
C
G
T
G
T
C
T
C
G
T
A
A
A
G
G
C
G
A
A
G
C
C
A
C
C
A
A
G
A
C
T
G
T
A
G
A
A
C
C
G
T
C
A
G
T
A
T
C
T
A
A
G
A
T
G
A
T
C
A
C
C
A
T
A
G
G
T
C
T
T
C
T
T
C
G
G
T
A
T
T
C
C
C
G
A
T
C
C
T
C
A
C
A
T
T
G
C
C
T
A
T
G
C
T
C
C
T
G
G
A
T
C
C
G
C
C
G
T
G
C
C
T
T
C
C
C
T
A
C
G
A
T
C
A
A
G
A
T
A
C
C
C
C
A
A
A
C
A
T
A
A
T
T
C
G
T
T
G
G
A
C
C
C
T
C
T
C
G
G
G
T
G
G
T
A
C
C
C
T
G
G
G
G
C
C
C
A
C
A
A
T
T
C
G
A
A
C
C
C
C
T
A
A
A
C
G
T
G
C
A
T
A
G
G
G
T
C
G
C
A
T
C
A
A
A
C
T
T
T
T
A
G
C
A
C
C
T
G
T
C
T
G
G
G
A
C
C
G
A
A
C
C
C
G
T
A
T
T
C
A
T
C
C
C
C
G
G
G
T
G
A
T
T
C
T
G
A
G
G
A
T
C
T
G
T
A
T
A
A
G
A
A
G
A
G
T
A
T
T
T
A
C
T
G
C
G
C
C
A
C
G
C
C
C
  5,935,602
  5,936,819
  5,937,077
  5,937,609
  5,939,234
  5,940,063
  5,943,978
  5,946,188
  5,946,878
  5,947,294
  5,947,673
  5,948,154
  5,948,993
  5,951,242
  5,952,358
  5,952,576
  5,954,526
  5,956,340
  5,956,823
  5,957,541
  5,958,221
  5,961,788
  5,962,720
  5,962,724
  5,962,796
  5,962,889
  5,962,940
  5,963,159
  5,963,398
  5,963,579
  5,963,904
  5,964,055
  5,964,950
  5,965,006
  5,965,683
  5,966,307
  5,966,357
  5,966,921
  5,967,032
  5,967,571
  5,967,625
  5,967,851
  5,967,918
  5,967,961
  5,968,480
  5,968,568
  5,969,076
  5,969,264
  5,969,329
  5,969,439
  5,969,944
  5,969,995
  5,970,031
  5,970,354
  5,970,524
  5,970,725
  5,971,703
  5,972,447
  5,974,492
  5,975,553
  5,976,518
  5,977,626
  5,977,637
  5,978,392
  5,979,198
  5,980,163
  5,980,232
  5,980,632
  5,981,064
  5,981,218
  5,981,251
  5,981,601
  5,981,785
  5,981,786
  5,982,200
  5,982,995
  5,982,997
  5,983,123
  5,983,146
  5,984,476
  5,985,015
  5,985,072
  5,985,447
  5,985,487
  5,985,675
  5,985,696
  5,985,744
  5,985,983
  5,986,051
  5,986,806
  5,986,934
  5,986,967
  5,988,604
  5,988,837
  5,990,015
  5,990,040
  5,990,669
  5,991,026
  5,992,353
  5,992,615
  5,992,712
  5,993,464
  5,994,131
  5,994,500
  5,995,704
  5,995,809
  5,995,843
  5,995,898
  5,996,004
  5,996,085
  5,996,959
  5,997,032
  5,997,138
  5,997,245
  5,997,365
  5,997,457
  5,997,815
  5,997,856
  5,998,020
  5,998,022
  5,998,124
  5,999,889
  6,000,332
  6,000,721
  6,000,923
  6,001,357
  6,003,972
  6,004,398
  6,004,574
  6,005,094
  6,008,592
  6,011,574
  6,012,030
  6,012,193
  6,012,198
  6,012,262
  6,014,577
  6,015,023
  6,016,110
  6,016,900
  6,017,247
  6,018,846
  6,020,636
  6,020,810
  6,021,753
  6,022,666
  6,022,791
  6,023,486
  6,023,565
  6,023,717
  6,024,347
  6,024,366
  6,024,718
  6,024,742
  6,024,855
  6,025,044
  6,025,148
  6,026,130
  6,026,900
  6,028,927
  6,029,098
  6,029,480
  6,029,648
  6,029,709
  6,029,917
  6,030,491
  6,030,517
  6,030,682
  6,031,024
  6,031,497
  6,031,666
  6,031,757
  6,031,908
  6,031,960
  6,032,127
  6,032,277
  6,032,569
  6,032,614
  6,032,691
  6,032,982
  6,033,102
  6,033,565
  6,033,707
  6,034,028
  6,034,051
  6,034,053
  6,034,112
  6,034,325
  6,034,570
  6,034,571
  6,034,583
  6,034,995
  6,035,008
  6,035,009
  6,035,168
  6,035,408
  6,035,945
  6,036,207
  6,036,880
  6,036,980
  6,037,335
  6,038,070
  6,038,107
  6,038,341
  6,039,690
  6,040,490
  6,040,826
  6,041,169
  6,041,961
  6,042,268
  6,042,318
  6,042,498
  6,042,718
  6,042,898
  6,044,178
  6,044,320
  6,044,327
  6,045,086
  6,045,330
  6,047,292
  6,048,235
  6,048,439
  6,049,542
  6,050,138
  6,050,622
  6,051,349
  6,051,917
  6,052,335
  6,052,485
  6,052,821
  6,052,963
  6,053,149
  6,053,156
  6,053,421
  6,053,497
  6,054,308
  6,054,554
  6,054,854
  6,054,973
  6,055,175
  6,055,502
  6,055,516
  6,055,629
  6,056,360
  6,056,364
  6,056,638
  6,056,749
  6,056,989
  6,057,242
  6,057,317
  6,057,519
  6,057,921
  6,058,114
  6,058,364
  6,058,634
  6,058,695
  6,059,248
  6,059,777
  6,059,812
  6,059,829
  6,059,838
  6,059,910
  6,060,030
  6,060,114
  6,060,239
  6,060,595
  6,060,740
  6,060,924
  6,061,155
  6,061,249
  6,061,294
  6,061,323
  6,061,419
  6,061,821
  6,062,020
  6,062,024
  6,062,127
  6,062,531
  6,062,674
  6,062,716
  6,062,756
  6,062,826
  6,062,896
  6,063,047
  6,063,226
  6,063,361
  6,063,629
  6,063,692
  6,064,124
  6,064,592
  6,065,453
  6,065,535
  6,065,576
  6,065,701
  6,065,706
  6,066,047
  6,066,265
  6,066,409
  6,067,655
  6,068,305
  6,068,371
  6,069,070
  6,069,238
  6,070,238
  6,070,837
  6,071,224
  6,073,115
  6,077,749
  6,077,753
  6,077,864
  6,078,317
  6,078,770
  6,078,909
  6,079,040
  6,079,049
  6,079,258
  6,079,575
  6,080,193
  6,080,373
  6,080,515
  6,080,527
  6,081,088
  6,081,528
  6,082,392
  6,083,755
  6,083,889
  6,084,154
  6,084,805
  6,085,903
  6,086,592
  6,086,595
  6,088,232
  6,088,668
  6,089,103
  6,089,516
  6,089,806
  6,090,424
  6,091,028
  6,096,940
  6,097,376
  6,098,619
  6,099,331
  6,100,819
  6,100,821
  6,101,468
  6,101,472
  6,102,403
  6,103,038
  6,104,881
  6,106,088
  6,106,158
  6,106,354
  6,106,884
  6,106,945
  6,107,353
  6,107,989
  6,108,256
  6,108,511
  6,110,013
  6,112,802
  6,112,992
  6,113,044
  6,113,721
  6,113,722
  6,114,764
  6,115,340
  6,115,585
  6,115,854
  6,117,266
  6,118,441
  6,119,825
  6,120,880
  6,121,106
  6,121,681
  6,122,715
  6,123,261
  6,123,525
  6,126,867
  6,127,139
  6,127,159
  6,127,187
  6,128,385
  6,134,097
  6,134,107
  6,134,292
  6,135,683
  6,136,055
  6,137,615
  6,140,985
  6,142,283
  6,142,302
  6,142,332
  6,142,333
  6,151,027
  6,155,315
  6,161,202
  6,161,713
  6,162,105
  6,166,245
  6,166,632
  6,168,030
  6,168,201
  6,168,414
  6,168,420
  6,168,463
  6,168,477
  6,168,481
  6,168,624
  6,168,633
  6,168,638
  6,168,711
  6,168,980
  6,169,020
  6,169,315
  6,169,704
  6,169,908
  6,169,936
  6,169,977
  6,169,982
  6,170,019
  6,170,038
  6,170,093
  6,170,096
  6,170,141
  6,170,156
  6,170,161
  6,170,254
  6,170,362
  6,170,489
  6,170,533
  6,170,610
  6,170,679
  6,170,697
  6,170,728
  6,171,078
  6,171,130
  6,171,207
  6,171,209
  6,171,367
  6,171,410
  6,171,424
  6,171,426
  6,171,458
  6,171,554
  6,171,753
  6,171,983
  6,171,997
  6,172,014
  6,173,859
  6,173,923
  6,174,398
  6,174,426
  6,181,108
  6,188,334
  6,194,871
  6,200,884
  6,207,366
  6,209,148
  6,210,067
  6,212,709
  6,214,632
  6,214,684
  6,214,686
  6,214,994
  6,215,398
  6,215,699
  6,215,854
  6,215,946
  6,216,725
  6,216,742
  6,217,750
  6,217,833
  6,218,052
  6,218,175
  6,218,242
  6,218,268
  6,218,427
  6,218,760
  6,218,851
  6,219,901
  6,220,875
  6,220,966
  6,221,826
  6,223,033
  6,223,171
  6,225,895
  6,226,695
  6,227,497
  6,227,593
  6,227,931
  6,229,354
  6,229,563
  6,230,815
  6,231,149
  6,232,120
  6,232,199
  6,233,123
  6,233,251
  6,233,428
  6,233,435
  6,233,621
  6,234,083
  6,239,551
  6,239,684
  6,240,242
  6,240,607
  6,240,717
  6,241,629
  6,242,821
  6,243,030
  6,243,221
  6,243,262
C
A
T
G
A
T
G
A
T
T
C
T
G
C
G
T
G
G
G
G
G
C
C
T
C
G
G
G
T
T
T
A
C
G
G
A
A
A
C
T
T
C
G
A
A
C
A
T
T
C
T
C
A
T
A
C
T
C
A/C
A
C
G
G
A
G
G
G
T
A
C
T
C
T
G
T
A
T
T
G
T
C
A
G
A
T
C
T
C
C
T
T
T
G
A
T
G
C
A
C
G
G
T
A
C
G
C
C
C
G
C
A
A
C
A
T
G
G
C
C
G
C
A
T
A
T
C
A
A
G
A
G
C
T
T
C
C
A
A
A
G
T
G
G
T
T
G
G
T
C
T
A
A
T
G
A
C
T
C
G
C
A
A
C
G
C
G
T
G
T
C
T
A
A
G
C
A
G
G
T
T
A
T
C
G
G
G
G
T
T
G
T
T
C
A
A
G
G
A
A
C
G
A
C
T
C
G
A
C
G
G
C
A
T
A
A
G
G
A
T
G
G
T
T
G
G
C
G
T
C
A
C
G
A
G
G
T
T
A
C
T
T
C
G
G
C
T
C
G
C
T
G
C
C
C
C
T
T
T
T
G
C
G
A
A
C
T
C
C
T
C
C
T
T
A
C
G
C
C
A
T
T
C
G
C
A
T
C
T
G
T
G
C
C
C
T
T
C
G
C
A
T
C
T
A
G
A
A
G
G
T
T
T
T
T
A
C
A
C/A
T
G
A
T
C/T
T
C
C
A
A
C
C
T
G
T
T
T
C
G
A
T
T
T
G
G
G
T
G
C
G
G
C
C
T
T
C
G
A
A
C
T
T
A
G
G
G
A
A
A
A
G
C
A
A
C
T
T
A
G
A
A
A
A
T
T
T
T
A
C
T
G
C
A
C
G
G
T
T
A
T
A
G
G
G
G
A
C
A
T
G
C
G
A
A
A
G
T
A
A
G
C
T
G
G
G
T
C
A
C
C
G
A
T
G
T
G
C
A
C
T
G
A
T
C
G
T
T
A
G
G
T
T
T
A
C
G
C
A
C/A
C
C
T
T
T
T
A
T
A
C
A
G
C
C
A
A
A
G
A
A
G
C
T
C
A
C
G
C
G
C
A
G
G
A
G
A
C
G
C
C
C
G
T
C
A
G
C
T
T
G
T
A
G
G
T