Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 69,004 (bp)   Positions: 285
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.001
.396
.146
.001
.001
.0
1.0
.001
.059
.003
.035
.002
.146
.001
.002
.009
.005
.832
.0
.064
.031
.005
.079
.015
.317
.634
.003
.033
.002
.002
.0
.004
.002
.031
.065
.003
.0
.121
.001
.001
.001
.441
.01
.0
.0
.0
.0
.001
.001
.001
.001
.003
.003
.078
.044
.004
.049
.005
.004
.398
.002
.0
.003
.001
.0
.0
.0
.002
.003
.003
.04
.032
.0
.0
.0
.002
.0
.009
.0
.004
.012
.0
.001
.042
.176
.315
.437
.343
.044
.014
.0
.011
.0
.057
.071
.0
.004
.001
.014
.574
.988
.335
.0
.016
.554
.001
.008
.24
.594
.003
.0
.022
.0
.001
.0
.001
.003
.0
.001
.0
.0
.0
.128
.0
.0
.0
.002
.002
.0
.0
.001
.0
.003
.0
.0
.0
.0
.001
.009
.0
.007
.02
.001
.005
.001
.002
.005
.024
.0
.001
.001
.001
.013
.0
.002
.0
.0
.0
.013
.015
.0
.001
.008
.0
.019
.023
.0
.0
.004
.102
.0
.011
.002
.0
.0
.001
.002
.004
.001
.0
.001
.039
.0
.0
.0
.0
.117
.0
.011
.001
.004
.001
.029
.001
.004
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.012
.001
.014
.025
.002
.024
.016
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.025
.002
.013
.002
.001
.028
.001
.089
.114
.0
--
--
--
--
.001
.124
.122
.054
.002
.001
.0
.0
.0
.003
.002
.0
.0
.093
.0
.0
.037
.0
.002
.13
.005
.007
.0
.0
.0
.0
.0
.003
.096
.965
.017
.001
.0
.0
.001
.0
.0
.043
.002
.028
.0
.0
.0
.004
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Ntf3
Ntf3
Ntf3
Ntf3
Ntf3
Ntf3
Ntf3
Ntf3
Ntf3
Ntf3
Ntf3
Ntf3
Ntf3
Ntf3
Ntf3
Ntf3
Ntf3
Ntf3
Ntf3
Ntf3
Ntf3
Ntf3
Ntf3
Ntf3
Ntf3
Ntf3
Ntf3
Ntf3
Ntf3
C
G
A
A
G
T
A
A
G
G
G
T
G
T
A
A
G
A
T
4
-
A
-
5
C
28
C
G
A
A
T
8
A
T
G
7
C
G
G
A
A
C
C
-
G
C
G
C
A
A
A
A
A
G
G
G
T
T
T
A
C
A
A
C
A
T
A
A
A
G
T
G
A
T
A
A
C
2
T
A
3
T
-
-
G
A
C
C
G
G
5
C
A
G
T
G
T
-
A
A
A
C
A
A
A
A
T
-
T
T
C
-
12
9
-
A
G
G
A
A
G
G
-
-
A
G
-
A
C
G
G
C
-
G
G
G
-
-
G
-
G
C
T
-
2
A
T
C
C
G
T
G
G
T
A
T
C
T
C
G
-
T
C
T
C
G
G
G
T
T
A
A
-
C
T
C
G
A
T
A
A
T
-
G
G
C
A
T
A
T
A
A
C
T
-
C
T
G
A
G
C
C
4
G
G
G
G
T
G
C
T
G
A
C
A
A
G
G
T
A
A
C
G
T
A
C
T
T
T
G
T
C
C
2
C
G
-
C
-
-
T
T
13
G
-
C
C
T
T
G
T
C
G
A
G
C
T
T
A
A
C
12
G
T
A
3
-
G
-
C
-
C
C
-
A
C
T
A
C
C
A
G
A
A
A
  158,638,726
  158,639,552
  158,639,833
  158,641,585
  158,641,898
  158,642,920
  158,644,085
  158,644,303
  158,644,381
  158,644,565
  158,644,597
  158,644,611
  158,644,718
  158,644,764
  158,644,888
  158,644,996
  158,645,801
  158,645,880
  158,646,061
  158,646,174
  158,646,208
  158,646,240
  158,646,255
  158,646,272
  158,646,290
  158,646,300
  158,646,357
  158,646,505
  158,646,579
  158,646,656
  158,646,766
  158,646,883
  158,646,902
  158,646,909
  158,647,179
  158,647,253
  158,648,070
  158,648,143
  158,648,735
  158,648,800
  158,649,056
  158,649,303
  158,649,512
  158,649,826
  158,649,871
  158,649,897
  158,649,907
  158,650,020
  158,650,527
  158,650,529
  158,650,531
  158,650,533
  158,650,535
  158,651,293
  158,651,295
  158,651,337
  158,657,057
  158,657,831
  158,657,921
  158,658,442
  158,660,708
  158,661,748
  158,662,621
  158,663,990
  158,664,067
  158,664,069
  158,664,148
  158,665,689
  158,666,272
  158,666,371
  158,666,442
  158,666,443
  158,666,585
  158,666,737
  158,666,905
  158,666,960
  158,667,346
  158,667,897
  158,667,928
  158,667,997
  158,668,006
  158,668,072
  158,668,095
  158,668,114
  158,668,122
  158,668,149
  158,668,171
  158,668,188
  158,668,447
  158,668,507
  158,668,540
  158,668,578
  158,668,730
  158,668,840
  158,669,662
  158,669,749
  158,670,308
  158,670,451
  158,670,638
  158,671,253
  158,671,487
  158,671,507
  158,672,024
  158,672,205
  158,672,270
  158,672,569
  158,672,787
  158,672,984
  158,672,997
  158,673,238
  158,673,372
  158,673,502
  158,673,522
  158,673,559
  158,673,664
  158,673,724
  158,673,835
  158,673,837
  158,673,863
  158,673,879
  158,673,899
  158,673,930
  158,674,037
  158,674,053
  158,674,104
  158,674,107
  158,674,112
  158,674,136
  158,674,166
  158,674,170
  158,674,175
  158,674,183
  158,674,205
  158,674,241
  158,674,257
  158,674,258
  158,674,272
  158,674,307
  158,674,322
  158,674,369
  158,674,376
  158,674,377
  158,674,385
  158,674,395
  158,674,405
  158,674,481
  158,674,515
  158,674,903
  158,674,957
  158,675,097
  158,675,109
  158,675,111
  158,675,233
  158,675,267
  158,675,307
  158,675,602
  158,675,606
  158,675,954
  158,676,060
  158,676,483
  158,676,607
  158,676,645
  158,676,675
  158,677,109
  158,677,364
  158,677,513
  158,677,990
  158,678,489
  158,678,642
  158,678,824
  158,679,560
  158,679,567
  158,679,581
  158,679,648
  158,679,966
  158,680,280
  158,680,456
  158,681,071
  158,681,079
  158,681,250
  158,681,343
  158,681,351
  158,681,403
  158,681,652
  158,681,713
  158,681,718
  158,681,828
  158,682,025
  158,682,120
  158,682,196
  158,682,297
  158,682,299
  158,682,367
  158,682,396
  158,682,504
  158,682,719
  158,682,752
  158,682,793
  158,682,796
  158,682,806
  158,682,812
  158,682,813
  158,682,890
  158,682,954
  158,683,112
  158,683,501
  158,683,539
  158,683,571
  158,683,576
  158,683,579
  158,683,585
  158,683,592
  158,683,707
  158,683,949
  158,684,222
  158,684,229
  158,684,313
  158,684,324
  158,684,348
  158,684,507
  158,684,542
  158,684,656
  158,684,703
  158,684,745
  158,684,768
  158,685,096
  158,685,124
  158,685,132
  158,685,168
  158,685,367
  158,686,535
  158,686,960
  158,687,170
  158,687,224
  158,687,229
  158,687,617
  158,688,009
  158,688,011
  158,688,016
  158,688,182
  158,688,383
  158,688,952
  158,688,955
  158,689,030
  158,689,128
  158,689,129
  158,689,441
  158,689,469
  158,689,482
  158,690,491
  158,690,603
  158,690,683
  158,690,687
  158,691,338
  158,691,416
  158,692,011
  158,692,340
  158,692,790
  158,692,927
  158,693,047
  158,693,071
  158,693,131
  158,693,288
  158,694,531
  158,695,022
  158,695,066
  158,695,125
  158,695,578
  158,696,110
  158,698,908
  158,699,472
  158,699,756
  158,700,029
  158,700,032
  158,700,039
  158,700,213
  158,700,569
  158,701,027
  158,701,328
  158,701,398
  158,701,743
  158,701,752
  158,702,151
  158,702,831
  158,703,757
T
A
G
G
A
C
G
T
A
A
-
C
A
C
G
G
T
G
G
-
C
C
C
-
T
-
T
A
G
G
C
-
G
C
A
-
T
T
A
G
C
T
T
G
A
T
A
G
T
T
T
T
A/T
G/C
G/C
T
-
C
-
G
A
T
G
T
T
C
G
C
C
A
C
C
C
A
C
G
T
-
-
C
-
-
C
C
-
-
-
T
A
T
-
T
G
T
C
A
C
A
T
G
G
A
G
G
G
G
C
T
C
G
T
G
-
-
A
G
-
-
T
G
A
-
C
A
C
A
A
-
T
-
A
-
A
-
-
C
T
2
-
G
C
A
-
2
-
-
-
T
A
T
C
A
C
C
C
C
T
C
T
A
4
C
A
C
G
A
C
A
C
C
G
G
2
T
C
A
A
G
C
G
G
C
A
T
A
T
G
-
T
-
-
-
T
C
T
T
C
T
G
A
T
T
-
A
A
C
A
G
A
T
C
A
G
T
C
G
A
T
C
G
T
A
A
-
G
A
C
G
C
A
C
A
T
-
T
C
A
T
5
G
C
-
-
A
A
A
T
C
C
T
C
T
A
C
A
T
C
C
T
G
G
-
A
C
G
-
34
A
3
T
2
A
A
2
G
T
C
-
T
T
T
A
C
G
T