Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 179,828 (bp)   Positions: 435
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.0
.0
.185
.009
1.0
.001
.0
.022
.021
.014
.006
.004
.001
.009
.468
.733
.795
.0
.006
.0
.002
.001
.004
.0
.011
.024
.293
.117
.002
.123
.014
.003
.01
.008
.003
.003
.0
.002
.0
.006
.001
.002
.003
.0
.0
.069
.003
.018
.017
.003
.017
.002
.384
.422
.992
.0
.001
.006
.001
.048
.005
.011
.054
.063
.033
.014
.226
.147
.32
.494
.001
.0
.143
.001
.004
.049
.079
.084
.045
.006
.02
.001
.0
.007
.186
.045
.041
.022
.023
.053
.036
.005
.0
.012
.001
.002
.002
.002
.0
.002
.0
.002
.97
.003
.003
.213
.029
.035
.015
.018
.003
.019
.002
.0
.0
.001
.001
.005
.019
.006
.003
.001
.001
.007
.011
.009
.002
.002
.015
.004
.008
.0
.016
.002
.016
.011
.005
.007
.257
.178
--
--
--
.003
.012
.004
.005
.003
.009
.001
.06
.07
.008
.031
.071
.093
.006
.017
.043
.057
.0
.008
.003
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.009
.089
.002
.012
.022
.003
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.626
.662
.0
.0
.013
.001
.0
.026
.006
--
--
--
--
--
--
.001
.003
.017
.2
.007
.007
.001
.137
.034
.002
.025
.007
.293
.003
.006
.016
.046
.022
.032
.037
.041
.001
.0
.001
.0
.003
--
--
--
.002
.07
.029
.002
.976
.474
.002
.0
.0
.013
.001
.0
.027
.012
.178
.022
.035
.023
.246
.031
.0
.0
.004
.0
.173
.0
.001
.001
.494
.001
.0
.006
.002
.004
.002
.073
.012
.01
--
.006
.113
.015
.004
.001
.008
.003
.001
.001
.089
.051
.113
.149
.055
.045
.066
.004
.001
.002
.005
.024
.036
.037
.026
.001
.0
.111
.004
.357
.254
.458
.379
.141
.031
.034
.008
.008
.01
.067
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.072
.085
.007
.004
.008
.597
.013
.017
.164
.013
.006
.0
.07
.001
.001
.005
.244
.386
.002
.001
.011
.01
.0
.001
.025
.004
.024
.023
.0
.003
.0
.0
.004
.016
.001
.014
.003
.011
.003
.03
.108
.05
.026
.065
.048
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.026
.033
--
.001
--
--
--
.008
.0
.01
.005
.627
.0
.0
.002
.001
.0
.011
.0
.051
--
--
.075
.055
.004
.001
.001
.002
.001
.002
.157
.01
.132
.0
.506
--
--
--
--
--
.0
.004
.002
.0
.081
Nox4
Nox4
Nox4
Nox4
Nox4
Nox4
Nox4
Nox4
Nox4
Nox4
Nox4
Nox4
Nox4
Nox4
Nox4
Nox4
Nox4
Nox4
Nox4
Nox4
Nox4
Nox4
Nox4
Nox4
Nox4
Nox4
Nox4
Nox4
Nox4
Nox4
Nox4
Nox4
Nox4
Nox4
Nox4
Nox4
Nox4
Nox4
Nox4
Nox4
Nox4
Nox4
Nox4
Nox4
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
T
G
T
C
-
-
C
A
A
A
C
C
G
C
T
-
5
T
G
-
-
A
-
G
A
T
A
T
G
A
T
A
T
C
A
T
G
C
C
T
A
G
T
A
G
G
2
G
-
-
T
A
A
G
-
C
T
A
G
T
C
-
A
-
T
T
A
T
T
T
T
-
T
C
C
T
-
-
A
T
T
T
A
-
G
C
-
-
C
-
-
C
G
-
G
T
C
C
C
C
-
T
C
A
-
-
3
4
3
7
G
G
T
G
A
T
T
T
T
-
C
C
C
C
-
-
G
T
A
-
A
G
T
T
-
C
T
G
G
G
G
C
C
G
G
-
C
A
G
C
-
A
C
T
-
G
-
3
A
A
T
T
T
A
A
5
G
T
-
T
G
G
-
T
G
C
G
C
G
C
C
-
A
A
T
C
T
T
A
A
-
T
C
G
A
T
G
-
-
-
13
T
G
G
C
C
A
T
-
A
A
T
A
G
-
A
G
C
T
A
G
-
C
C
T
C
C
-
A
A
2
C
C
C
2
T
T
G
C
A
-
-
G
-
12
4
T
-
4
T
C
C
T
T
23
T
-
C
C
G
A
A
A
C
A
T
T
-
C
T
C
A
G
G
G
T
C
-
-
A
-
A
T
A
-
G
A
A
G
A
C
3
-
-
A
C
T
3
C
C
G
C
C
A
T
-
T
-
T
2
-
-
-
T
-
-
C
A
A
A
C
T
C
G
C
C
A
T
A
G
-
C
G
T
G
C
C
C
G
G
5
10
G
G
C
A
C
C
G
A
A
C
A
G
G
C
T
-
G
-
T
A
A
A
C
A
A
G
A
G
G
A
T
-
T
T
T
G
C
G
C
T
G
-
G
A
C
T
A
A
A
-
A
T
12
T
A
G
G
C
T
C
T
T
T
G
T
T
A
G
T
G
A
C
G
T
-
G
A
A
T
-
24
G
C
A
A
A
A
A
A
C
A
C
A
  150,797,102
  150,797,507
  150,797,510
  150,800,622
  150,802,425
  150,802,816
  150,802,825
  150,804,209
  150,804,211
  150,804,213
  150,804,232
  150,805,642
  150,806,407
  150,806,673
  150,806,851
  150,806,873
  150,806,877
  150,807,042
  150,807,072
  150,807,772
  150,807,989
  150,808,186
  150,808,241
  150,808,299
  150,809,171
  150,809,239
  150,811,049
  150,811,404
  150,811,759
  150,812,075
  150,812,178
  150,812,383
  150,812,497
  150,812,508
  150,812,552
  150,812,603
  150,812,708
  150,812,797
  150,812,820
  150,812,847
  150,813,286
  150,813,323
  150,813,743
  150,813,817
  150,813,897
  150,814,050
  150,814,194
  150,814,210
  150,814,212
  150,814,218
  150,814,380
  150,815,082
  150,815,310
  150,815,313
  150,815,372
  150,815,411
  150,815,431
  150,815,842
  150,815,884
  150,816,403
  150,816,465
  150,816,583
  150,816,775
  150,816,865
  150,816,869
  150,816,872
  150,816,943
  150,817,090
  150,817,093
  150,817,126
  150,817,503
  150,817,518
  150,817,547
  150,817,579
  150,818,420
  150,818,669
  150,818,672
  150,818,673
  150,818,919
  150,818,999
  150,819,272
  150,819,354
  150,819,535
  150,819,603
  150,819,671
  150,819,762
  150,819,765
  150,819,772
  150,819,912
  150,819,921
  150,819,970
  150,819,985
  150,819,993
  150,819,997
  150,820,011
  150,820,023
  150,820,028
  150,820,029
  150,820,034
  150,820,038
  150,820,044
  150,820,154
  150,820,291
  150,820,631
  150,820,675
  150,820,688
  150,820,927
  150,820,932
  150,820,937
  150,820,942
  150,821,125
  150,821,262
  150,821,281
  150,821,364
  150,821,412
  150,822,034
  150,822,052
  150,822,277
  150,822,321
  150,822,340
  150,822,713
  150,822,724
  150,822,866
  150,823,008
  150,823,050
  150,823,202
  150,823,443
  150,823,506
  150,823,542
  150,823,687
  150,823,692
  150,824,237
  150,824,317
  150,824,381
  150,824,493
  150,825,055
  150,825,707
  150,825,708
  150,825,935
  150,825,938
  150,826,482
  150,826,737
  150,826,861
  150,826,972
  150,827,124
  150,827,301
  150,827,541
  150,827,655
  150,827,790
  150,827,806
  150,828,090
  150,828,386
  150,828,508
  150,828,552
  150,828,572
  150,829,245
  150,829,719
  150,829,870
  150,829,876
  150,829,882
  150,830,554
  150,831,806
  150,832,474
  150,834,244
  150,834,544
  150,835,009
  150,836,699
  150,837,318
  150,838,232
  150,838,709
  150,839,713
  150,839,915
  150,840,498
  150,840,644
  150,841,116
  150,841,139
  150,841,534
  150,841,764
  150,842,648
  150,843,013
  150,845,295
  150,845,402
  150,846,505
  150,848,733
  150,850,302
  150,850,406
  150,850,882
  150,851,008
  150,851,044
  150,851,086
  150,851,194
  150,851,209
  150,851,267
  150,851,491
  150,851,657
  150,851,966
  150,851,998
  150,852,025
  150,852,455
  150,852,458
  150,852,507
  150,853,050
  150,853,067
  150,853,194
  150,853,439
  150,854,865
  150,855,418
  150,855,492
  150,855,747
  150,856,857
  150,857,284
  150,858,170
  150,858,987
  150,860,035
  150,860,124
  150,860,231
  150,861,300
  150,861,453
  150,861,454
  150,862,528
  150,862,730
  150,863,164
  150,863,427
  150,864,195
  150,864,273
  150,864,407
  150,864,591
  150,865,111
  150,865,330
  150,865,894
  150,866,342
  150,866,345
  150,866,347
  150,866,349
  150,867,016
  150,867,205
  150,867,517
  150,867,786
  150,868,747
  150,869,848
  150,869,885
  150,869,961
  150,870,059
  150,870,334
  150,870,430
  150,870,464
  150,870,682
  150,870,804
  150,871,685
  150,874,939
  150,875,145
  150,875,445
  150,876,330
  150,876,357
  150,876,655
  150,876,886
  150,877,401
  150,877,605
  150,877,717
  150,877,876
  150,878,089
  150,878,284
  150,878,937
  150,878,991
  150,879,416
  150,879,652
  150,879,746
  150,879,829
  150,879,949
  150,880,363
  150,880,383
  150,880,503
  150,880,703
  150,880,785
  150,881,548
  150,881,549
  150,882,196
  150,888,477
  150,888,486
  150,888,615
  150,890,535
  150,890,550
  150,890,571
  150,890,630
  150,890,692
  150,890,700
  150,890,736
  150,890,787
  150,890,799
  150,890,800
  150,890,887
  150,890,892
  150,890,937
  150,891,000
  150,891,019
  150,891,039
  150,891,051
  150,891,082
  150,891,117
  150,891,122
  150,891,139
  150,891,147
  150,891,153
  150,891,157
  150,891,164
  150,891,768
  150,891,838
  150,906,379
  150,907,207
  150,907,544
  150,907,558
  150,907,570
  150,907,583
  150,907,591
  150,907,598
  150,907,601
  150,907,620
  150,907,621
  150,910,091
  150,910,353
  150,921,835
  150,921,876
  150,921,938
  150,922,364
  150,922,561
  150,922,625
  150,922,654
  150,922,845
  150,922,886
  150,923,163
  150,924,057
  150,924,724
  150,925,067
  150,925,304
  150,926,082
  150,926,732
  150,928,435
  150,928,436
  150,929,594
  150,929,734
  150,930,477
  150,931,252
  150,933,272
  150,933,401
  150,933,960
  150,934,348
  150,934,491
  150,934,501
  150,934,684
  150,934,849
  150,935,221
  150,935,302
  150,935,319
  150,935,339
  150,935,826
  150,935,902
  150,935,914
  150,935,927
  150,936,167
  150,936,212
  150,936,216
  150,936,632
  150,936,679
  150,936,804
  150,937,492
  150,937,596
  150,938,067
  150,938,283
  150,938,367
  150,938,391
  150,939,151
  150,939,788
  150,940,395
  150,940,553
  150,940,734
  150,940,736
  150,940,987
  150,941,539
  150,941,806
  150,941,915
  150,942,036
  150,942,174
  150,942,484
  150,942,514
  150,943,242
  150,943,508
  150,947,834
  150,947,841
  150,947,872
  150,947,884
  150,948,526
  150,948,713
  150,949,756
  150,950,682
  150,952,017
  150,952,265
  150,952,269
  150,952,420
  150,953,942
  150,954,622
  150,954,649
  150,955,254
  150,955,397
  150,957,408
  150,958,570
  150,959,328
  150,960,269
  150,960,638
  150,961,070
  150,962,506
  150,963,121
  150,963,576
  150,964,752
  150,964,941
  150,965,184
  150,965,731
  150,965,829
  150,966,607
  150,966,664
  150,967,541
  150,967,902
  150,968,475
  150,968,902
  150,970,274
  150,970,731
  150,970,966
  150,970,970
  150,970,974
  150,970,978
  150,970,998
  150,973,470
  150,973,476
  150,973,543
  150,975,549
  150,975,658
C
C
C
T
G
T
-
A/T
A/T
A/T
C/T
T
A
T
C
-/T
5/-
C
A
3
T
G
8
T
C
C
G
-
T
G
A
G
G
T
C
C
A
A
T
C
G
A
C
G
A
T
-
T
4
17
C
C
G
A
A
G
-
G
A
C
A
A
G
G
C
A
-
C
-
A
C
13
C
G
T
A
8
3
T
C
-
C
G
A
-
T
3
C
-
A
A
-
-
T
-
-
T
T
-
-
T
A
G
G
G
T/G
-
-
-
-
A
A
G
A
T
-
G
-
C
50
A
T
T
A
T
T
A
C
G
3
-
A
C
C
T
A
C
C
-
C
A
T
A
A
A
2
T
G
A
T
G
T
T
C
A
A
A
-
G
-
C
A
-
C
G
5/-
T
G
G
G
A
T
A
G
T
G
A
T
C
A
T
A
C
C
C
T
C
C
T
T
T
C
A
C
G
G
A
G
A
A
-
G
A
A
G
T
T
C
8
G
C
C
G
C
T
T
A
T
G
G
C
-/A
T
A
G
T
T
9
C
-
-
T
T
T
-
C
A
C
T
G
2
2
C
2
-
-
C
A
-
C
A
T
-
C
-
C
T
T
T
A
G
-
G
G
C
-
C/A
8
T
C
T/G
G
C
A
A
C
T
A
A
-
T
-
-
C
C
-
-
-
A
G
T
-
A
A
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
G
T
C
3
G
-
C/C
T
G
-
T
A
A
C
C
-
-
C
T
A
A
G
C
G
G
C
A
A
A
C
A
G
A
G
A
T
-
10/-
C
C
T
G
A
T
C
C
G
T
G
T
A
T
A
A
A
A
A
T
C
C
T
G
T
A
G
A
T
C
T/A
-/T
T/C
A
T/C
C
C/A
G/T
C/G
G
G/C
A
G/A
T
-
C
-
-
G
4
C
A
-
-
C
A
A
T
C
T
G
C
C
T
A
C
G
A
C
A
G
T
T
A
4
A
G
T
A
C
-
A
T
G
G
G
G
G
G
T
G
T
C