Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 93,573 (bp)   Positions: 287
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.009
.026
.0
.0
.0
1.0
.013
.015
.0
.281
.009
.067
.005
--
.072
.067
.028
.0
.62
.003
.0
.002
.002
.018
.002
.134
.024
.075
.08
.001
.029
.0
.019
.194
.005
.0
.608
.314
.006
.001
.003
.003
.002
.028
.023
.011
.079
.273
.223
.205
.397
.29
.26
.167
.087
.079
.048
.041
.0
.023
.002
.003
.24
.001
.002
.82
.799
.039
.995
.0
.001
.013
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.016
.001
.003
.0
.0
.006
.731
.006
.003
.001
--
.015
.0
.001
.001
.002
.043
.187
.011
.002
.003
.001
.004
.002
.164
.564
.045
.9
1.0
.991
.073
.007
.107
.002
.004
.005
.003
.001
.001
.0
.0
.009
1.0
.522
.0
.981
.992
.995
.0
.979
.857
.0
.002
.001
.002
.0
.194
.072
.002
.0
.004
.0
.07
.043
.001
.003
.001
.001
.005
--
.0
.015
.003
.06
.079
.145
.182
.172
.133
.024
.026
.369
.645
.624
.127
.009
.002
.001
.003
.036
.005
.133
.054
.074
.034
.0
.0
.001
.001
.144
.001
.0
.229
.001
.704
.015
.002
.003
.001
.002
.202
.007
.004
.002
.0
.0
.0
.001
.075
.0
.011
.053
.0
.004
.168
.336
.01
.043
.0
.001
.001
.0
.0
.0
.001
.003
.004
.089
.45
.0
.006
.005
.046
.158
.0
.013
.013
.08
.039
.018
.0
.004
.0
.0
.028
1.0
.001
.0
.003
.22
.005
.046
.002
.001
.603
1.0
.003
.001
.004
.001
.066
.065
.0
.001
.008
.37
.0
.0
.006
.155
.22
.001
.035
.0
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Nnt
Nnt
Nnt
Nnt
Nnt
Nnt
Nnt
Nnt
Nnt
Nnt
Nnt
Nnt
Nnt
Nnt
Nnt
Nnt
Nnt
Nnt
Nnt
Nnt
Nnt
Nnt
Nnt
Nnt
Nnt
Nnt
Nnt
Nnt
Nnt
A
A
A
C
T
G
C
T
A
A
A
C
A
C
T
G
C
-
T
A
T
2
C
A
C
T
G
-
C
C
-
A
C
T
T
A
T
-
A
A
G
C
C
G
4
C
-
T
A
-
T
C
-
-
-
-
C
2
2
3
A
C
2
C
C
C
C
G
G
G
C
G
G
A
G
T
2
-
G
G
3
G
3
-
T
G
A
G
A
G
-
G
T
-
-
-
-
T
C
-
G
A
-
C
T
A
T
T
G
C
G
T
4
A
-
4
A
T
G
T
G
C
A
T
T
A
C
4
C
A
C
A
G
G
G
C
T
C
A
A
G
T
G
C
G
-
T
T
A
A
G
G
T
T
G
G
-
-
-
G
-
C
-
A
G
-
-
C
-
C
-
C
A
A
-
A
-
-
-
-
-
T
A
T
C
T
A
G
-
C
T
C
T
-
A
T
T
G
C
G
C
T
T
A
G
A
T
G
A
G
G
T
G
A
T
A
C
T
C
C
A
G
G
A
G
G
A
T
C
-
T
T
-
A
A
A
G
C
A
A
G
-
G
2
A
G
A
A
G
T
G
T
A
C
C
A
G
A
A
-
T
T
C
-
T
A
C
9
A
C
3
-
G
G
21
A
C
-
A
-
A
-
T
C
G
T
T
  52,189,908
  52,190,028
  52,190,945
  52,191,055
  52,191,250
  52,192,418
  52,193,082
  52,193,254
  52,193,638
  52,198,144
  52,199,558
  52,199,753
  52,202,700
  52,202,963
  52,203,327
  52,203,379
  52,206,560
  52,206,585
  52,206,976
  52,208,414
  52,208,602
  52,210,754
  52,210,832
  52,211,140
  52,211,150
  52,211,252
  52,211,488
  52,211,625
  52,211,722
  52,211,959
  52,211,985
  52,212,360
  52,212,880
  52,213,131
  52,213,604
  52,213,774
  52,214,974
  52,216,223
  52,217,561
  52,217,722
  52,218,222
  52,218,305
  52,220,577
  52,220,805
  52,220,818
  52,220,826
  52,220,838
  52,220,863
  52,220,870
  52,220,931
  52,220,939
  52,221,003
  52,221,013
  52,221,037
  52,221,048
  52,221,060
  52,221,075
  52,221,078
  52,221,154
  52,221,205
  52,221,231
  52,221,428
  52,222,137
  52,223,851
  52,224,241
  52,224,633
  52,224,634
  52,224,735
  52,225,257
  52,225,585
  52,225,790
  52,226,639
  52,226,834
  52,226,836
  52,226,840
  52,226,848
  52,226,855
  52,226,872
  52,226,874
  52,226,876
  52,226,898
  52,226,902
  52,226,908
  52,226,921
  52,226,926
  52,226,932
  52,226,934
  52,226,935
  52,226,947
  52,227,393
  52,227,397
  52,227,413
  52,227,426
  52,227,433
  52,227,435
  52,227,441
  52,227,466
  52,227,470
  52,227,473
  52,227,477
  52,227,482
  52,227,484
  52,227,507
  52,227,640
  52,228,354
  52,228,411
  52,228,470
  52,229,265
  52,229,942
  52,229,960
  52,230,273
  52,230,726
  52,230,795
  52,231,847
  52,231,982
  52,232,064
  52,232,069
  52,232,090
  52,232,399
  52,232,434
  52,232,520
  52,232,577
  52,232,635
  52,232,667
  52,232,673
  52,232,889
  52,232,937
  52,233,096
  52,233,235
  52,233,306
  52,233,554
  52,233,577
  52,233,671
  52,233,753
  52,233,908
  52,233,972
  52,233,991
  52,234,019
  52,234,220
  52,234,279
  52,234,359
  52,234,442
  52,234,526
  52,234,554
  52,234,849
  52,234,952
  52,235,152
  52,236,310
  52,236,352
  52,236,379
  52,237,047
  52,237,604
  52,237,731
  52,238,242
  52,238,261
  52,238,688
  52,238,834
  52,238,839
  52,238,936
  52,238,939
  52,238,970
  52,238,976
  52,238,984
  52,238,993
  52,239,012
  52,239,040
  52,239,047
  52,239,064
  52,239,078
  52,239,084
  52,239,106
  52,241,612
  52,243,397
  52,245,619
  52,246,600
  52,246,620
  52,246,623
  52,246,637
  52,246,666
  52,246,674
  52,246,688
  52,246,707
  52,246,708
  52,246,746
  52,246,755
  52,246,798
  52,246,835
  52,246,871
  52,246,875
  52,247,557
  52,249,430
  52,250,995
  52,251,847
  52,252,689
  52,253,868
  52,254,211
  52,254,277
  52,254,879
  52,254,915
  52,254,987
  52,255,038
  52,255,079
  52,255,418
  52,255,515
  52,255,833
  52,256,215
  52,256,769
  52,256,870
  52,257,130
  52,257,284
  52,257,297
  52,257,664
  52,257,842
  52,257,856
  52,258,035
  52,258,531
  52,258,975
  52,259,007
  52,259,097
  52,259,140
  52,259,359
  52,259,524
  52,259,594
  52,259,926
  52,260,556
  52,260,700
  52,260,797
  52,260,818
  52,261,971
  52,262,829
  52,262,867
  52,263,332
  52,263,445
  52,263,676
  52,263,767
  52,264,316
  52,264,507
  52,265,026
  52,265,119
  52,265,549
  52,265,715
  52,265,737
  52,265,743
  52,265,748
  52,265,990
  52,266,273
  52,266,601
  52,266,651
  52,266,838
  52,267,054
  52,267,622
  52,267,819
  52,268,125
  52,269,355
  52,269,431
  52,269,453
  52,270,506
  52,270,535
  52,270,741
  52,271,600
  52,272,011
  52,272,595
  52,274,346
  52,274,351
  52,274,593
  52,274,747
  52,275,037
  52,275,685
  52,276,437
  52,277,262
  52,277,910
  52,278,018
  52,278,977
  52,278,978
  52,279,194
  52,279,332
  52,279,462
  52,279,606
  52,279,741
  52,279,815
  52,279,881
  52,280,157
  52,280,548
  52,280,650
  52,282,057
  52,282,380
  52,282,664
G
G
G
T
G
A
C/-
C
G
G
G
G
G
T
G
T
A
2
A
G
C
-
G
G
G
C
A
T
T
-
4
G
G
C
C
T
G
A
-
G
A
T
T
-
-
G
A
-
-
T
-
-
2
C
C
C
-
-
-
-
-
T
-
T
G
A
A
A
A
A
T
A
-
T
-
-
-
A
-
A
-
C
-
A
-
-
-
T
-
-
T
T
-
G
T
T
2
-
-
G
A
G
T
A
C
C
C
C
A
T
A
C
-
C
2
-
C
C
A
C
A
T
G
C
C
T
T
-
A
C
G
G
A
A
A
-
C
T
G
C
A
C
A
T
A
A
C
C
G
C
C
A
-
C
A
A
T
T
G
A
T
-
T
-
C
G
2
-
G
-
T
T
G
-
2
-
4
G
G
2
A
A
T
-
-
C
-
-
G
T
C
T
C
17
G
C
A
T
A
A
-
C
C
G
A
G
C
A
G
A
A
C
A
G
C
T
-
C
T
T
G
G/C
A
G
T
C
G
A
T
C
G
C
T
G
C
G
A
T
G
G
-
2
-
-
T
C
G
G
A
C
A
C
G
A
T
T
A
-
T
2
C
C
-
5
C
G
T
-
G
A
-
3
A
A
-
C
G
A
-
2
C
5
C
T
A
C
C