Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 55,135 (bp)   Positions: 253
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.003
.35
.001
.209
.014
.005
.42
.009
.002
.002
.05
.003
.003
.0
.141
.056
.754
.001
.002
.0
.002
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.0
.001
.007
.349
.365
.005
.001
.489
.019
.001
.001
.049
.054
.052
.011
.002
.001
.001
.001
.0
.003
.001
.104
.002
.0
.0
.0
.0
.0
.004
.017
.0
.0
.0
.041
.039
.176
.074
.002
.003
.025
.001
.002
.004
.009
.361
.016
.001
.006
.001
.003
.002
.111
--
.004
.001
.0
.008
.006
.0
.012
.0
.0
.0
.003
.001
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.001
.0
.0
.0
.0
.028
.006
.0
.003
.006
.0
.0
.0
.008
.034
.0
.018
.001
.331
.005
.001
.0
.005
.001
.002
.001
.004
.022
.017
.01
.001
.002
.0
.0
.0
.0
.001
.0
.0
.001
.0
.0
.001
.0
.014
.0
.001
.001
.001
.001
.002
.001
.003
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.007
.0
.001
.002
.002
.001
.009
.0
.006
.009
.004
.154
.027
.016
.001
.008
.002
.017
.005
.006
.006
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Nlrp1a
Nlrp1a
Nlrp1a
Nlrp1a
Nlrp1a
Nlrp1a
Nlrp1a
Nlrp1a
Nlrp1a
Nlrp1a
Nlrp1a
Nlrp1a
Nlrp1a
Nlrp1a
Nlrp1a
Nlrp1a
Nlrp1a
Nlrp1a
Nlrp1a
Nlrp1a
Nlrp1a
Nlrp1a
Nlrp1a
Nlrp1a
Nlrp1a
Nlrp1a
C
T
-
G
T
C
G
T
G
-
T
3
C
G
-
C
-
A
A
C
C
A
T
C
C
T
C
G
C
-
A
G
T
G
2
C
A
C
C
T
-
-
A
-
G
C
G
4
-
C
C
-
G
C
G
T
T
T
C
T
T
C
G
G
G
C
C
C
C
A
T
T
G
A
T
T
4
T
G
-
2
A
A
2
G
4
G
G
T
T
C
T
C
T
-
C
T
G
C
G
C
-
-
2
G
A
G
A
A
A
C
T
G
G
A
G
G
3
C
C
A
A
C
C
T
T
C
T
G
A
T
-
C
G
C
G
C
C
G
G
-
G
-
-
T
6
T
T
16
A
-
C
A
-
A
G
T
A
C
C
T
-
C
A
C
T
T
T
A
A
G
C
C
C
A
C
A
C
G
C
A
T
A
G
C
T
G
A
A
A
T
-
T
C
C
G
T
T
G
T
A
G
G
T
T
T
T
G
C
A
C
A
A
C
A
C
A
T
A
A
A
2
T
-
A
C
A
G
T
C
T
A
C
A
A
A
C
A
T
A
C
A
A
G
G
A
C
T
T
C
T
C
C
  57,692,525
  57,692,594
  57,692,945
  57,693,445
  57,693,484
  57,693,501
  57,694,142
  57,694,656
  57,695,115
  57,695,122
  57,695,376
  57,695,410
  57,696,341
  57,696,815
  57,698,094
  57,698,791
  57,699,339
  57,699,371
  57,704,413
  57,704,872
  57,705,487
  57,706,357
  57,706,549
  57,707,499
  57,707,896
  57,711,236
  57,713,857
  57,713,954
  57,713,955
  57,715,365
  57,719,792
  57,720,644
  57,723,138
  57,724,123
  57,724,126
  57,724,820
  57,725,388
  57,725,499
  57,726,676
  57,726,808
  57,727,320
  57,727,853
  57,727,860
  57,727,863
  57,728,103
  57,728,107
  57,728,110
  57,728,112
  57,728,321
  57,728,745
  57,729,084
  57,729,260
  57,729,337
  57,729,707
  57,730,974
  57,731,262
  57,731,753
  57,731,761
  57,731,783
  57,731,941
  57,732,447
  57,732,473
  57,732,699
  57,732,700
  57,732,816
  57,733,222
  57,733,251
  57,733,463
  57,733,470
  57,733,472
  57,733,508
  57,733,566
  57,733,832
  57,733,873
  57,733,989
  57,734,185
  57,734,270
  57,734,334
  57,734,511
  57,734,924
  57,735,117
  57,735,221
  57,735,510
  57,737,224
  57,737,422
  57,737,602
  57,737,618
  57,737,677
  57,737,678
  57,737,792
  57,737,805
  57,737,860
  57,737,862
  57,737,866
  57,737,868
  57,737,932
  57,737,933
  57,737,934
  57,737,939
  57,737,958
  57,737,996
  57,738,002
  57,738,003
  57,738,005
  57,738,037
  57,738,058
  57,738,080
  57,738,098
  57,738,103
  57,738,144
  57,738,154
  57,738,255
  57,738,288
  57,738,328
  57,738,346
  57,738,347
  57,738,377
  57,738,387
  57,738,399
  57,738,412
  57,738,430
  57,738,444
  57,738,454
  57,738,477
  57,738,479
  57,738,494
  57,738,503
  57,738,506
  57,738,560
  57,738,567
  57,738,598
  57,738,642
  57,738,644
  57,738,662
  57,738,762
  57,738,905
  57,738,927
  57,738,928
  57,738,931
  57,738,932
  57,738,936
  57,738,937
  57,738,940
  57,738,941
  57,738,945
  57,738,947
  57,738,964
  57,739,063
  57,739,080
  57,739,117
  57,739,124
  57,739,129
  57,739,213
  57,739,293
  57,739,297
  57,739,307
  57,739,318
  57,740,318
  57,740,324
  57,740,349
  57,740,362
  57,740,389
  57,740,417
  57,740,422
  57,740,430
  57,740,449
  57,740,490
  57,740,543
  57,740,561
  57,740,578
  57,740,716
  57,740,722
  57,740,737
  57,740,744
  57,740,776
  57,740,786
  57,740,787
  57,740,810
  57,740,894
  57,740,905
  57,740,906
  57,740,908
  57,740,925
  57,740,930
  57,741,091
  57,741,342
  57,741,402
  57,741,446
  57,741,447
  57,741,449
  57,745,087
  57,745,105
  57,745,108
  57,745,113
  57,745,124
  57,745,130
  57,745,148
  57,745,160
  57,745,170
  57,745,173
  57,745,176
  57,745,178
  57,745,190
  57,745,195
  57,745,237
  57,745,347
  57,745,388
  57,745,419
  57,745,505
  57,745,506
  57,745,512
  57,745,655
  57,745,676
  57,745,716
  57,745,719
  57,745,725
  57,745,772
  57,745,863
  57,745,865
  57,745,945
  57,745,948
  57,746,117
  57,746,121
  57,746,134
  57,746,391
  57,746,401
  57,746,452
  57,746,501
  57,746,651
  57,746,767
  57,746,879
  57,746,922
  57,746,961
  57,746,966
  57,747,125
  57,747,126
  57,747,132
  57,747,140
  57,747,176
  57,747,235
  57,747,243
  57,747,264
  57,747,293
  57,747,382
  57,747,427
  57,747,477
  57,747,493
  57,747,503
  57,747,523
  57,747,552
  57,747,564
  57,747,572
  57,747,576
T
-
A
A
A
T
A
C
A
A
-
-
T
T
4
G
10
G
C
T
T
T
A
T
T
T/C
T
C
T
10
G
A
A
-
-
T
G
T
A
C
2
2
C
4
C
G
A
-
T
T
T
4
A
A
A
C
C
C
T
C
C
T
C
A
T
T
T
G
T
C
G
G
T
T
C
C
-
C
A
12
-
G
G
-
T
-
A
A
C
C
T
C
G
G
2
A
G
A
T
C
T
G
G
-
A
T
A
C
G
G
G
C
T
A
T
A
C
-
T
T
T
G
G
T
C
G
G
C
C
G
A
C
T
A
T
T
T
A
-
A
A
T
T
5
G
-
C
C
-
C
9
T
C
9
G
C
C
G
A
T
G
A
A
G
G
C
C
G
G
G
-
T
A
T
C
T
G
T
A
T
C
C
G
A
T
T/G
G/C
A/T
A/G
A/G
A
4
G
T
G
-
C
C
T
C
G
A
A
C
A
C
G
A
A
G
T
G
C
T
T
A
G
C
G
G
C
-
C
2
C
A
G
C
C
G
C
G
T
G
T
T
T
T
C
C
T
G
C
A
T
T
G
A
A
T
C
T
G