Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 101,822 (bp)   Positions: 287
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.002
.0
.003
.001
.194
.721
.011
.96
.0
.0
.001
.0
.003
.016
.021
.002
.001
.0
.005
.0
.0
.013
.005
--
.001
.0
.031
.001
.04
.002
.001
.224
--
--
--
.016
.021
.04
.001
.0
.001
.005
.0
.009
.001
.008
.0
.0
.0
.0
.0
.001
.011
.072
.134
.008
--
.002
.0
.546
.025
.001
.051
.006
.03
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.002
.01
.001
.0
.164
.0
.0
.024
.021
.001
.0
.04
.779
.02
.001
.037
.0
.0
.123
.005
.002
.009
.006
.0
.893
.024
.001
.0
.02
.011
.006
.003
.007
.004
.001
.009
.001
.0
.004
.0
.0
.145
.0
.0
.061
.065
.066
.057
.003
.0
.005
.0
.0
.01
.016
.003
.008
.001
.002
.001
.001
.003
.0
.001
.0
.0
.002
.0
.0
.0
.0
.082
.001
.011
.0
.0
.0
.002
.002
.05
.001
.0
.001
.0
.0
.0
.024
.006
.017
.005
.015
.084
.01
.095
.055
.45
.069
.082
--
.004
.001
.0
.0
.0
.0
.001
.017
.0
.0
.288
.01
.024
.01
.003
.088
.005
.008
.074
.035
.049
.336
.815
.291
.023
.026
.092
.062
.492
1.0
1.0
.987
.004
.009
.016
.02
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.734
.487
.045
.008
.277
.478
.029
--
.025
.01
.039
.022
.005
.037
.001
.178
.021
.048
.001
.001
.001
.001
.0
.0
.005
.1
.052
.044
.001
.001
.005
.007
.01
.0
.009
.077
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
LOC108348891
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
T
A
A
T
T
T
A
A
T
G
A
T
T
A
T
C
A
A
A
T
G
G
G
A
A
C
G
C
G
G
G
C
T
A
T
T
G
C
A
G
T
T
A
T
G
C
G
G
A
T
A
A
C
C
C
C
G
G
T
T
G
G
G
C
C
G
G
C
C
C
C
G
G
G
C
C
G
G
G
C
G
C
C
C
C
A
G
G
A
C
C
G
G
T
A
T
G
T
C
T
G
G
G
G
A
G
T
G
T
A
G
A
A
A
G
C
A
G
C
T
A
T
T
T
G
G
C
C
G
T
T
A
T
T
C
A
A
C
A
T
A
G
A
A
T
C
G
A
G
A
C
C
G
T
C
C
G
T
C
G
C
T
A
G
T
A
A
C
C
T
T
G
C
G
C
C
T
C
T
G
G
C
C
C
G
A
C
C
G
C
T
G
T
T
T
G
T
T
A
A
C
A
A
A
A
T
G
A
C
C
C
C
G
G
G
A
A
G
T
T
G
T
T
T
C
C
C
C
T
A
T
T
C
G
T
A
A
G
T
T
G
C
G
T
G
C
A
C
T
G
C
T
G
T
T
A
A
G
T
C
A
G
A
C
A
T
G
A
T
A
T
G
C
T
G
C
C
C
C
C
C
T
A
C
A
G
A
  10,904,468
  10,904,725
  10,904,883
  10,905,020
  10,905,220
  10,906,139
  10,906,323
  10,906,547
  10,906,784
  10,908,682
  10,908,891
  10,909,256
  10,909,597
  10,909,847
  10,909,852
  10,910,204
  10,911,854
  10,911,904
  10,911,970
  10,912,056
  10,912,143
  10,912,255
  10,912,576
  10,912,735
  10,913,032
  10,913,545
  10,913,968
  10,917,874
  10,919,159
  10,919,348
  10,919,352
  10,919,518
  10,920,563
  10,920,933
  10,920,941
  10,923,134
  10,923,255
  10,923,471
  10,923,543
  10,924,314
  10,924,724
  10,924,956
  10,925,370
  10,925,483
  10,925,652
  10,925,811
  10,925,833
  10,925,912
  10,926,073
  10,926,424
  10,926,524
  10,926,604
  10,927,145
  10,927,213
  10,927,697
  10,932,021
  10,932,278
  10,934,514
  10,935,130
  10,936,413
  10,938,113
  10,938,327
  10,938,376
  10,938,475
  10,938,703
  10,939,123
  10,939,159
  10,939,191
  10,939,207
  10,939,211
  10,939,215
  10,939,259
  10,939,363
  10,939,375
  10,939,412
  10,939,415
  10,939,431
  10,939,443
  10,939,467
  10,939,487
  10,939,523
  10,939,527
  10,939,567
  10,939,579
  10,939,583
  10,939,615
  10,939,659
  10,939,671
  10,939,683
  10,939,703
  10,939,711
  10,939,715
  10,939,739
  10,939,743
  10,939,777
  10,940,043
  10,940,345
  10,940,658
  10,941,496
  10,941,512
  10,942,012
  10,942,019
  10,942,105
  10,942,261
  10,942,475
  10,942,944
  10,943,197
  10,943,239
  10,943,383
  10,943,860
  10,943,898
  10,944,089
  10,946,002
  10,946,556
  10,946,762
  10,946,952
  10,947,209
  10,947,768
  10,948,677
  10,948,871
  10,948,939
  10,949,101
  10,949,312
  10,949,454
  10,949,708
  10,949,724
  10,949,729
  10,949,966
  10,949,976
  10,949,999
  10,950,108
  10,950,237
  10,950,807
  10,950,905
  10,951,168
  10,951,183
  10,951,211
  10,951,239
  10,951,240
  10,951,373
  10,951,376
  10,951,445
  10,951,784
  10,951,895
  10,952,001
  10,952,973
  10,953,203
  10,953,228
  10,954,046
  10,954,428
  10,954,500
  10,954,509
  10,954,526
  10,954,545
  10,955,194
  10,955,298
  10,962,547
  10,962,911
  10,962,989
  10,963,190
  10,963,371
  10,963,513
  10,963,599
  10,963,603
  10,963,725
  10,963,875
  10,964,084
  10,964,111
  10,964,180
  10,964,207
  10,964,289
  10,964,860
  10,965,625
  10,965,639
  10,965,665
  10,965,679
  10,973,997
  10,974,648
  10,974,718
  10,974,743
  10,975,056
  10,976,273
  10,977,089
  10,977,409
  10,977,653
  10,977,739
  10,977,894
  10,977,927
  10,978,433
  10,978,486
  10,978,696
  10,978,891
  10,979,292
  10,979,911
  10,980,064
  10,980,065
  10,980,089
  10,980,300
  10,980,439
  10,980,452
  10,980,640
  10,981,035
  10,981,262
  10,981,438
  10,981,970
  10,982,307
  10,982,395
  10,982,498
  10,982,765
  10,982,768
  10,982,905
  10,982,990
  10,983,117
  10,983,260
  10,983,290
  10,983,451
  10,983,575
  10,983,791
  10,983,850
  10,983,920
  10,983,967
  10,984,253
  10,984,258
  10,984,287
  10,984,571
  10,984,577
  10,984,589
  10,984,623
  10,984,752
  10,984,756
  10,984,775
  10,984,881
  10,984,895
  10,985,015
  10,985,061
  10,985,191
  10,985,203
  10,985,416
  10,985,646
  10,986,018
  10,986,193
  10,987,196
  10,987,311
  10,988,231
  10,988,302
  10,988,375
  10,988,428
  10,988,449
  10,988,471
  10,988,474
  10,988,683
  10,989,186
  10,989,199
  10,989,225
  10,989,252
  10,989,743
  10,990,080
  10,990,239
  10,990,878
  10,990,947
  10,991,128
  10,991,446
  10,991,795
  10,992,059
  10,992,366
  10,992,610
  10,993,553
  10,993,982
  10,994,179
  10,994,315
  10,994,521
  10,995,065
  10,995,163
  10,995,267
  10,995,548
  10,995,634
  10,996,211
  10,996,260
  10,996,433
  10,996,462
  10,996,553
  10,996,597
  11,000,086
  11,005,175
  11,005,186
  11,005,406
  11,005,587
C
T
G
C
C
C
G
G
A
A
G
C
C
C
C
A
G
G
T
C
A
C
A
G
G
T
A
A
A
A
T
T
T/A
T
T/C
C
A
T
A/G
A
C
C
G
G
A
T
A
A
A/C
G
C
C
T
A
T
T
A
C
T/C
C
A
C
T
T
T
C
G/C
C/G
C/G
C/G
C/G
G/C
G/C
G/C
C/T
G
G/C
G/C
G/C
C/G
G/C
C/A
C/G
G
G
A/G
G/C
G/A
A/G
G
C/G
G/C
A
C
G
C
A
C
T
C
A
A
A
A
T
C
C
A
C
G
A
G
G
G
A
T
C
A
G
C
G
G
C
C
A
A
T
T
A
A
C
G
C
C
T
G
G
T
G
C
G
C
T
G
C
G
T
G
A
G
A
T
A
C
T
A
A
C
T
A
T
C
G
A
A
G
G
T
T
G
T/G
T
A
A
A
G
A
T
C
A
A
G
T
T
A
G
T
T
C
T
C
A
G
C
C
C
C
C
G
G
T
G
G
G
G
C
A
G
T
T
G
T
A
C
A
G
T
A
C
C
C
C
G
C
C/T
C/T
C/T
C/T
C
G
C
C
G
A
C
G
G
T
C
C
A
T
A
C
A
T
A/C
C/T
T/A
G/C
C/T
C
A
C
G
G
T
A
C
T
T
T
G
T
G
A
G/A
G
C
C
C
A
T
C
A
T
G
A
A
G
A
G
T
T
G
A
G