Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 101,822 (bp)   Positions: 573
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.002
.0
.0
.003
.001
.004
.194
.721
.011
.001
.96
.0
.001
.0
.003
.001
.0
.126
.003
.025
.018
.001
.027
.002
.001
.005
.015
.038
.001
.001
.0
.0
.002
.013
.613
.001
.0
.001
.031
.001
.04
.005
.002
.001
.113
.224
--
--
--
--
--
--
--
--
.004
.016
.021
.04
.001
.0
.0
.001
.005
.002
.004
.003
.006
.032
.393
.81
.603
.079
.031
.0
.0
.0
.0
.001
.0
.018
.001
.006
.002
.169
.167
.0
.002
.0
.008
.0
.002
.001
.0
.0
.002
.003
.0
.001
.013
.0
.0
.019
.007
.384
.0
.0
.006
.0
.0
.02
.0
.011
.072
.0
.134
.008
--
--
.051
.003
.014
.005
.026
.011
.285
.302
.001
.0
.001
.0
.002
.017
.002
.016
.0
.003
.013
.005
.002
.002
.011
.999
.996
1.0
.996
.546
.01
.009
.018
.001
.003
.0
.002
.002
.007
.0
.003
.007
.001
.003
.0
.0
.001
.002
.002
.002
.001
.001
.001
.025
.033
.001
.051
.006
.004
.016
.038
.03
--
--
--
--
.01
.001
.0
.004
.164
.018
.05
.029
.0
.0
.024
.021
.001
.0
.04
--
--
--
--
.779
.02
.037
.0
.0
.123
.002
.008
.017
.156
.15
.131
.583
.065
.041
.009
.029
.596
--
--
.005
.116
.002
.006
.0
.979
.893
.001
.02
.002
.001
.0
.003
.001
.044
.011
.015
.0
.018
.0
.0
.065
.0
.005
.0
.0
.01
.016
.003
.008
.002
.001
.002
.001
.001
.003
.001
.0
.0
.002
.0
.0
.0
.082
.011
.025
.001
.011
.0
.0
.0
.081
.007
.025
.031
.04
.082
.001
.001
.009
.017
.004
.002
.002
.0
.0
.05
.001
.0
.0
.001
.0
.0
.001
.0
.001
.0
.001
.01
.002
.002
.0
.0
.034
.077
.005
.002
.007
.0
.041
.108
.007
.0
.32
1.0
.453
.0
.004
.0
.003
.0
.006
.002
.0
.0
.0
.024
.006
.017
.005
.015
.084
.01
--
.095
.055
.45
.069
.082
--
--
.12
.001
.0
.0
.0
.0
.105
.001
.017
.0
.003
.0
.288
.01
.07
.024
.021
.01
.003
.088
--
.074
.035
.049
.336
.815
.318
.291
.001
.001
.003
.023
.026
.092
.062
.492
1.0
1.0
.987
.007
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.487
.008
.044
.538
.551
.371
.513
.1
.08
.037
.134
.002
.277
.478
.029
--
.025
.018
.01
.039
.022
.01
.005
.045
.037
.001
.021
.001
.001
.001
.001
.0
.0
.0
.019
.01
.01
.011
.005
.012
.005
.006
.006
.011
.018
.015
.013
.006
.006
.002
.004
.002
.002
.072
.041
.046
.235
.13
.023
.016
--
--
--
.001
.002
.02
.079
.003
.001
.001
.007
.012
.012
.042
.015
.031
.1
.244
.102
.006
.002
.003
.052
.184
.188
.069
.019
.001
.007
.01
.001
.001
.0
.135
.037
.012
.044
.075
.001
.017
.019
.001
.001
.017
.0
.003
.001
.011
.063
.037
.04
.005
.034
.1
.01
.011
.001
.001
.007
.005
.005
.001
.013
.029
.221
.12
.023
--
--
--
.523
.371
.175
.02
.032
.001
.001
.023
.03
.029
.014
.039
.007
.005
.006
.0
.22
.091
.015
.017
.0
.0
.002
.003
.285
.019
.002
.006
.069
.007
.108
.161
.055
.001
.0
.0
.01
.0
.077
.042
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
LOC108348891
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
T
A
-
A
T
T
T
T
A
A
A
T
A
T
T
C
T
-
-
T
C
-
G
C
-
-
-
C
-
A
A
T
A
G
A
A
C
-
G
C
G
4
G
G
4
C
A
A
T
C
T
G
A
T
T
T
G
C
A
G
G
T
T
A
C
-
G
T
2
-
A
-
-
A
T
G
A
A
-
-
G
G
C
C
T
G
G
A
C
G
T
G
G
-
T
G
T
C
G
-
A
T
G
-
C
T
C
T
C
-
C
C
C
-
C
C
G
C
-
A
-
A
-
G
G
T
-
T
C
-
A
-
G
C
T
T
T
C
A
C
-
G
A
-
2
T
C
A
A
T
-
-
G
C
T
-
-
-
-
C
C
C
C
G
T
A
A
A
2
G
4
G
G
C
C
C
-
C
-
G
8
56
A
T
G
A
T
-
T
C
C
T
G
G
G
G
A
6
C
C
C
G
T
T
A
G
A
A
G
-
T
C
G
-
T
-
2
-
T
-
-
A
A
A
C
A
30
G
T
T
G
C
C
A
C
-
T
G
C
-
T
T
A
A
A
T
C
G
A
G
A
A
C
C
G
T
C
G
T
C
G
T
A
G
T
G
-
A
A
C
C
T
G
-
-
A
G
-
A
G
-
-
A
G
A
T
C
C
G
C
10
C
G
C
A
C
C
C
C
3
C
A
C
G
C
C
-
G
-
C
G
G
T
A
C
C
G
T
C
T
G
C
C
G
C
T
3
G
G
C
C
C
G
A
-
C
C
G
C
T
-
G
A
T
T
G
T
T
4
A
A
C
A
A
A
A
-
A
-
T
G
A
12
C
C
G
G
G
-
A
3
2
C
A
G
T
T
G
T
T
T
T
C
T
T
A
T
T
G
T
A
A
G
T
T
G
C
G
2
6
T
G
C
G
T
-
-
-
12
T
-
-
-
T
G
A
A
G
T
C
-
A
G
A
5
C
-
A
T
A
A
T
G
C
T
G
G
G
T
G
A
C
6
G
A
A
2
-
2
C
C
G
-
A
C
C
-
C
C
A
C
T
A
-
C
C
-
-
-
C
C
G
C
A
C
C
-
2
C
C
2
2
C
C
A
C
C
G
G
A
C
C
T
A
G
-
-
-
T
C
C
C
-
-
G
G
G
T
A
C
G
-
-
-
T
-
-
-
C
-
C
C
T
C
3
2
2
G
T
2
4
-
-
-
-
T
T
-
A
T
T
A
-
A
-
G
T
A
C
C
-
T
T
-
3
A
T
-
A
T
-
-
A
2
-
G
G
A
-
C
A
A
A
  10,904,468
  10,904,725
  10,904,789
  10,904,883
  10,905,020
  10,905,031
  10,905,220
  10,906,139
  10,906,323
  10,906,500
  10,906,547
  10,906,784
  10,908,891
  10,909,256
  10,909,597
  10,909,642
  10,909,664
  10,909,716
  10,909,730
  10,909,748
  10,909,776
  10,910,132
  10,910,184
  10,910,204
  10,910,250
  10,910,256
  10,910,272
  10,910,328
  10,911,572
  10,911,854
  10,911,904
  10,912,056
  10,912,212
  10,912,255
  10,912,369
  10,913,032
  10,913,545
  10,913,582
  10,913,968
  10,917,874
  10,919,159
  10,919,311
  10,919,348
  10,919,352
  10,919,380
  10,919,518
  10,919,716
  10,920,111
  10,920,337
  10,920,612
  10,920,755
  10,920,816
  10,920,933
  10,920,941
  10,921,706
  10,923,134
  10,923,255
  10,923,471
  10,923,543
  10,923,599
  10,924,314
  10,924,724
  10,924,956
  10,925,135
  10,925,156
  10,925,177
  10,925,183
  10,925,247
  10,925,288
  10,925,292
  10,925,336
  10,925,364
  10,925,367
  10,925,370
  10,925,395
  10,925,615
  10,925,621
  10,925,630
  10,925,633
  10,925,642
  10,925,652
  10,925,663
  10,925,750
  10,925,764
  10,925,765
  10,925,778
  10,925,782
  10,925,793
  10,925,811
  10,925,833
  10,925,864
  10,925,871
  10,925,912
  10,925,936
  10,925,953
  10,925,979
  10,925,994
  10,926,046
  10,926,061
  10,926,072
  10,926,074
  10,926,092
  10,926,110
  10,926,196
  10,926,389
  10,926,424
  10,926,678
  10,926,822
  10,926,885
  10,926,943
  10,926,973
  10,927,145
  10,927,213
  10,927,529
  10,927,697
  10,932,021
  10,932,239
  10,932,242
  10,934,237
  10,934,264
  10,934,268
  10,934,281
  10,934,318
  10,934,362
  10,934,415
  10,934,416
  10,934,461
  10,934,470
  10,934,473
  10,934,480
  10,934,494
  10,934,508
  10,934,514
  10,934,522
  10,935,130
  10,935,140
  10,935,161
  10,935,164
  10,935,173
  10,935,175
  10,935,179
  10,936,354
  10,936,370
  10,936,383
  10,936,401
  10,936,413
  10,936,427
  10,936,430
  10,936,434
  10,936,438
  10,936,442
  10,936,447
  10,936,451
  10,936,461
  10,936,465
  10,936,498
  10,936,501
  10,936,506
  10,936,519
  10,936,531
  10,936,553
  10,936,555
  10,936,562
  10,936,568
  10,936,576
  10,936,580
  10,936,582
  10,936,594
  10,936,601
  10,938,113
  10,938,251
  10,938,327
  10,938,376
  10,938,475
  10,938,508
  10,938,516
  10,938,669
  10,938,703
  10,939,116
  10,939,159
  10,939,640
  10,939,688
  10,939,777
  10,940,043
  10,940,345
  10,940,526
  10,940,658
  10,940,749
  10,940,769
  10,940,777
  10,941,496
  10,941,512
  10,942,012
  10,942,019
  10,942,105
  10,942,261
  10,942,475
  10,942,738
  10,942,843
  10,942,845
  10,942,847
  10,942,944
  10,943,197
  10,943,383
  10,943,860
  10,943,898
  10,944,089
  10,944,467
  10,944,516
  10,944,559
  10,944,574
  10,944,614
  10,944,621
  10,944,646
  10,944,687
  10,944,702
  10,944,796
  10,944,811
  10,944,866
  10,944,923
  10,944,951
  10,946,002
  10,946,014
  10,946,556
  10,946,952
  10,947,209
  10,947,588
  10,947,768
  10,948,871
  10,949,101
  10,949,107
  10,949,109
  10,949,151
  10,949,187
  10,949,197
  10,949,268
  10,949,312
  10,949,761
  10,950,269
  10,950,784
  10,950,811
  10,950,905
  10,951,240
  10,951,784
  10,951,895
  10,952,001
  10,952,973
  10,953,203
  10,953,228
  10,954,046
  10,954,428
  10,954,489
  10,954,500
  10,954,509
  10,954,526
  10,954,545
  10,955,194
  10,962,547
  10,962,911
  10,962,989
  10,963,190
  10,963,513
  10,963,599
  10,963,603
  10,963,725
  10,963,728
  10,963,789
  10,963,875
  10,964,084
  10,964,111
  10,964,180
  10,964,207
  10,964,367
  10,964,389
  10,964,414
  10,964,507
  10,964,617
  10,964,660
  10,964,691
  10,964,692
  10,964,705
  10,964,795
  10,964,821
  10,964,860
  10,964,924
  10,965,037
  10,965,546
  10,965,625
  10,965,639
  10,965,665
  10,965,668
  10,965,679
  10,965,687
  10,965,697
  10,965,699
  10,965,702
  10,965,704
  10,965,834
  10,965,938
  10,965,987
  10,966,015
  10,966,029
  10,966,043
  10,966,133
  10,966,412
  10,966,476
  10,970,845
  10,970,985
  10,971,111
  10,971,131
  10,971,252
  10,971,324
  10,971,631
  10,971,673
  10,973,436
  10,973,547
  10,973,933
  10,973,944
  10,973,971
  10,974,086
  10,974,091
  10,974,117
  10,974,568
  10,974,589
  10,974,648
  10,974,718
  10,974,723
  10,974,743
  10,975,056
  10,976,273
  10,977,089
  10,977,409
  10,977,653
  10,977,739
  10,977,788
  10,977,894
  10,977,927
  10,978,433
  10,978,486
  10,978,696
  10,978,864
  10,978,891
  10,979,014
  10,979,911
  10,980,064
  10,980,065
  10,980,089
  10,980,300
  10,980,350
  10,980,439
  10,980,452
  10,980,640
  10,980,885
  10,981,035
  10,981,262
  10,981,438
  10,981,585
  10,981,970
  10,982,229
  10,982,307
  10,982,395
  10,982,498
  10,982,617
  10,982,905
  10,982,990
  10,983,117
  10,983,260
  10,983,290
  10,983,447
  10,983,451
  10,983,498
  10,983,504
  10,983,506
  10,983,575
  10,983,791
  10,983,850
  10,983,920
  10,983,967
  10,984,253
  10,984,258
  10,984,287
  10,984,583
  10,984,701
  10,984,702
  10,984,752
  10,984,756
  10,984,775
  10,984,881
  10,985,015
  10,985,061
  10,985,191
  10,985,203
  10,985,416
  10,985,646
  10,986,018
  10,986,193
  10,987,196
  10,987,311
  10,988,033
  10,988,036
  10,988,231
  10,988,302
  10,988,375
  10,989,199
  10,989,252
  10,989,280
  10,989,335
  10,989,338
  10,989,374
  10,989,389
  10,989,419
  10,989,421
  10,989,427
  10,989,483
  10,989,643
  10,989,743
  10,990,080
  10,990,239
  10,990,878
  10,990,947
  10,990,950
  10,991,128
  10,991,446
  10,991,795
  10,991,912
  10,992,059
  10,992,207
  10,992,366
  10,992,610
  10,993,982
  10,994,315
  10,994,521
  10,995,065
  10,995,163
  10,995,267
  10,995,461
  10,995,548
  10,995,578
  10,995,581
  10,995,582
  10,995,583
  10,995,634
  10,995,725
  10,995,772
  10,995,778
  10,995,784
  10,995,801
  10,995,815
  10,995,820
  10,995,830
  10,995,836
  10,995,851
  10,995,856
  10,995,859
  10,995,873
  10,995,885
  10,995,903
  10,995,916
  10,995,943
  10,995,991
  10,996,008
  10,996,014
  10,996,015
  10,996,075
  10,996,083
  10,996,088
  10,996,093
  10,996,104
  10,996,115
  10,996,123
  10,996,146
  10,996,154
  10,996,156
  10,996,165
  10,996,171
  10,996,172
  10,996,183
  10,996,195
  10,996,204
  10,996,211
  10,996,225
  10,996,234
  10,996,240
  10,996,247
  10,996,248
  10,996,260
  10,996,265
  10,996,284
  10,996,306
  10,996,331
  10,996,341
  10,996,352
  10,996,368
  10,996,376
  10,996,377
  10,996,382
  10,996,398
  10,996,406
  10,996,426
  10,996,433
  10,996,453
  10,996,462
  10,996,466
  10,996,476
  10,996,499
  10,996,515
  10,996,527
  10,996,532
  10,996,541
  10,996,553
  10,996,556
  10,996,562
  10,996,582
  10,996,584
  10,996,597
  10,996,608
  10,996,614
  10,996,628
  10,996,644
  10,996,654
  10,996,656
  10,996,676
  10,996,684
  10,996,685
  10,996,697
  10,996,705
  10,996,708
  10,996,717
  10,996,742
  10,996,749
  10,999,492
  10,999,500
  10,999,515
  10,999,565
  10,999,582
  10,999,622
  10,999,676
  10,999,689
  10,999,702
  10,999,703
  10,999,722
  10,999,740
  10,999,757
  10,999,765
  10,999,787
  10,999,794
  10,999,795
  10,999,920
  10,999,940
  10,999,955
  10,999,965
  10,999,969
  10,999,972
  10,999,984
  10,999,985
  10,999,995
  10,999,996
  11,000,020
  11,000,030
  11,000,035
  11,000,042
  11,000,080
  11,000,086
  11,000,112
  11,000,152
  11,000,177
  11,003,039
  11,003,063
  11,003,259
  11,005,175
  11,005,186
  11,005,587
  11,006,038
C
T
C
G
C
-
C
C
G
C
G
A
G
C
C
-
-
G
G
-
T/A
A
-
A
A
G
A
-
G
G
G
C
G
C
G
G
T
C
A
A
A
-
A
T
-
T
G
A/C
T/C
A
C
-
T
C
-
C
A
T
G
-
A
C
C
-
-
C
-
-
-
A
-
A
A
G
-
-
-
-
T
A
A
-
-
T
C
-
-
-
T
A
-
-
A
G
-
-
-
-
-
C
C
-
-
C
-
G
-
-
-
2
-
T
A
8
T
T
G/T
C/T
A
-
G
-
A
-
T
G
G
G
-
C
-
A
C
G
C
-
-
-
G
A
T
-
-
T
-
C
T
C
-
A
C
T
-
-
-
G
C
G
2
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
A
-
C
T
T
-
A
C
T
12
C
-
-
G
C
A
-
C
5
-
C/-
T
C
A
A
A
A
T
-
C/G
G
G
C
C
C
G
A
G
-
-
C
-
-
-
G
-
2
-
G
-
G
T
G
-
G
T
C
-
A
C
G
T
T
G
G
T
T
C
A
A
4
C
C
G
T
G
C
G
T
G
A
G
G
A
T
A
C
T
A
C
T
A
C
G
A
A
T
4
G
G
T
T
G
-
T
C
-
-
G
C
A
T
A
-
T
-
C
T
A
A
A
-
G
-
A
-
A
A
T
T
-
T
T
G
C
T
T
C
A
A
-
-
-
C
C
T
A
A
C
T
C
A
T
-
A
T
C
-
A
A
G
T
T
A
G
A
T
T
C
T
C
3
A
C
C
C
C
C
C
-
G
G
T
-
G
G
G
T
G
G
C
A
G
-
G
T
A
C
A
A
G
-
-
T
T
A
C
C
C
C
G
C
C
T
C
C
G
C
C
A
C
G
G
T
C
C
A
T
A
-
-
C
A
T
A
G
C
G
16
-
C
G
C
5
-
-
G
T
A
C
T
C
T
T
G
-
T
8
G
A
G
C
C
A
T
C
A
A
T
C
A
C
T
-
-
-
-
-
T
-
-
-
-
G
-
-
-
C
-
-
-
-
A
T
11
-
-
5
G
2
-
-
T
-
-
-
G
T
-
-
G
-
-
-
A
T
A
-
-
-
-
-
-
-
G
A
2
A
3
-
A
-
G
2
A
-
-
-
-
-
A
-
2
2
A
G
2
A
A
-
A
-
-
A
T
-
-
-
-
-
-
-
A
C
C
G
-
-
T
G
A
-
-
G
-
T
T
G
-
-
-
G
-
-
3
-
T
G
G
-
-
G
A
T
-
A
-
-
-
G
T
G
G
C