Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 101,822 (bp)   Positions: 434
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.002
.026
.0
.0
.003
.001
.004
.194
.0
.001
.007
.96
.0
.0
.001
.0
.003
.001
.0
.126
.003
.025
.018
.001
.027
.001
.005
.015
.038
.001
.001
.0
.038
.036
.623
.001
.04
--
--
--
--
--
.013
.014
.358
.173
.024
.054
.061
.793
.001
.001
.0
.005
.002
.004
.003
.006
.032
.393
.81
.603
.079
.031
.0
.0
.002
.002
.169
.167
.0
.002
.0
.008
.0
.0
.002
.001
.0
.0
.002
.003
.004
.0
.001
.013
.0
.0
.019
.007
.384
.0
.0
.0
.0
.0
.001
.0
.0
.0
.003
.021
.016
.01
.002
.001
.012
.006
.0
.0
.02
.0
.039
.153
.0
.008
--
.003
.014
.005
.026
.011
.285
.302
.001
.0
.001
.0
.002
.017
.002
.016
.003
.013
.005
.002
.002
.011
.999
.996
1.0
.996
.546
.01
.009
.018
.001
.003
.0
.002
.002
.007
.0
.003
.007
.001
.003
.0
.0
.001
.002
.002
.002
.001
--
--
--
--
.033
.004
--
.001
.001
.004
.011
.133
.003
.019
.0
.001
.011
.004
.391
--
--
--
--
--
--
--
.0
.02
.037
.013
.001
.0
.123
.002
.005
.008
.017
.156
.15
.131
.5
.583
.065
.041
.286
.009
.029
.596
.596
--
--
.005
.093
.011
.002
.181
.057
.001
.08
.0
.001
.02
.003
.001
.044
.011
.006
.007
.004
.001
.001
.0
.004
.018
.0
.002
.0
.0
.0
.0
.0
.065
.002
.066
.057
.003
.0
.0
.0
.0
.003
.002
.003
.0
.001
.013
.001
.0
.0
.0
.01
.016
.001
.006
.0
.087
.001
.0
.07
.003
.001
.0
.001
.178
.342
.095
.006
.008
.0
.001
.009
.007
--
.0
.0
.0
.025
.001
.004
.0
.0
.081
.007
.025
.04
.082
.001
.001
.009
.017
.004
.002
.002
.0
.05
.001
.002
.0
.001
.0
.0
.001
.0
.001
.005
.007
.0
.041
.108
.001
.0
.006
.002
.006
.12
.013
.041
.052
--
--
--
.487
.044
.271
.1
.08
.037
.001
.012
.005
.006
.006
.011
.018
.015
.013
.006
.006
.002
.004
.002
.002
.072
.041
.046
.235
.13
.023
.016
.069
.016
.019
.001
.007
.01
.001
.001
.0
.135
.037
.012
.044
.075
.001
.017
.019
.001
.001
.017
.0
.003
.001
.011
.063
.037
.04
.005
.034
.1
.01
.011
.001
.001
.007
.005
.005
.001
.013
.029
.221
.12
.023
.008
.013
.01
.009
.008
.009
.007
.006
.0
.22
.091
.015
.017
.0
.0
.002
.003
.285
.019
.002
.006
.069
.007
.108
.161
.017
.005
.077
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
Nlrc5
T
G
A
-
A
T
T
T
C
A
-
A
T
A
A
T
T
C
T
-
-
T
C
-
G
-
-
-
C
A
-
T
A
A
A
C
G
A
A
G
T
G
A
C
G
G
T
A
A
C
A
T
G
T
A
C
-
G
T
2
-
A
-
-
A
T
-
C
C
T
G
G
A
C
G
T
T
G
G
-
T
G
G
T
C
G
-
A
T
G
-
C
T
C
A
A
C
A
G
A
-
G
G
G
-
A
C
C
T
C
-
C
C
G
-
C
G
A
-
A
-
G
G
T
-
T
C
-
A
-
G
C
T
T
C
A
C
-
G
A
-
2
T
C
A
A
T
-
-
G
C
T
-
-
-
-
C
C
C
C
G
T
A
A
2
-
-
5
4
C
-
C
T
A
-
C
C
G
C
G
G
G
G
2
C
C
C
C
C
C
T
T
T
T
T
A
A
A
C
G
-
T
C
G
C
-
T
-
T
2
-
T
T
-
-
A
A
G
A
2
-
T
C
A
T
T
A
C
-
T
T
G
C
-
T
T
A
-
-
4
7
T
A
C
A
A
T
T
A
G
T
G
G
G
-
G
T
G
T
G
C
A
2
T
-
A
A
A
A
-
A
C
A
C
T
T
3
4
G
G
-
A
A
A
T
G
24
C
T
C
-
A
C
C
T
G
-
-
G
-
A
G
-
-
A
G
A
T
C
G
A
C
C
G
C
A
C
C
-
-
C
G
G
A
T
C
G
G
A
A
T
T
3
G
C
G
-
-
-
-
-
A
6
G
A
A
2
-
2
C
C
G
-
A
C
C
-
C
C
A
C
T
A
G
C
A
C
C
T
A
G
-
-
-
T
C
C
C
-
-
G
G
G
T
A
C
G
-
-
-
T
-
-
-
C
-
C
C
T
C
3
2
2
G
T
2
C
2
G
A
2
5
2
A
C
C
-
T
T
-
3
A
T
-
A
T
-
-
A
2
-
4
A
A
  10,904,468
  10,904,648
  10,904,725
  10,904,789
  10,904,883
  10,905,020
  10,905,031
  10,905,220
  10,906,299
  10,906,500
  10,906,512
  10,906,547
  10,906,784
  10,906,919
  10,908,891
  10,909,256
  10,909,597
  10,909,642
  10,909,664
  10,909,716
  10,909,730
  10,909,748
  10,909,776
  10,910,132
  10,910,184
  10,910,250
  10,910,256
  10,910,272
  10,910,328
  10,913,032
  10,913,582
  10,914,211
  10,914,921
  10,917,248
  10,917,432
  10,917,874
  10,919,159
  10,919,609
  10,919,611
  10,919,613
  10,920,755
  10,920,816
  10,921,456
  10,922,110
  10,922,345
  10,922,467
  10,922,586
  10,922,595
  10,922,597
  10,923,094
  10,923,543
  10,924,724
  10,924,781
  10,924,956
  10,925,135
  10,925,156
  10,925,177
  10,925,183
  10,925,247
  10,925,288
  10,925,292
  10,925,336
  10,925,364
  10,925,367
  10,925,370
  10,925,395
  10,925,713
  10,925,750
  10,925,764
  10,925,765
  10,925,778
  10,925,782
  10,925,793
  10,925,811
  10,925,833
  10,925,846
  10,925,864
  10,925,871
  10,925,912
  10,925,936
  10,925,953
  10,925,979
  10,925,988
  10,925,994
  10,926,046
  10,926,061
  10,926,072
  10,926,074
  10,926,092
  10,926,110
  10,926,196
  10,926,389
  10,926,424
  10,926,436
  10,926,437
  10,926,475
  10,926,476
  10,926,481
  10,926,482
  10,926,524
  10,926,544
  10,926,559
  10,926,562
  10,926,589
  10,926,595
  10,926,604
  10,926,610
  10,926,678
  10,926,822
  10,926,885
  10,926,943
  10,926,973
  10,927,188
  10,927,372
  10,927,529
  10,932,021
  10,932,278
  10,934,264
  10,934,268
  10,934,281
  10,934,318
  10,934,362
  10,934,415
  10,934,416
  10,934,461
  10,934,470
  10,934,473
  10,934,480
  10,934,494
  10,934,508
  10,934,514
  10,934,522
  10,935,140
  10,935,161
  10,935,164
  10,935,173
  10,935,175
  10,935,179
  10,936,354
  10,936,370
  10,936,383
  10,936,401
  10,936,413
  10,936,427
  10,936,430
  10,936,434
  10,936,438
  10,936,442
  10,936,447
  10,936,451
  10,936,461
  10,936,465
  10,936,498
  10,936,501
  10,936,506
  10,936,519
  10,936,531
  10,936,553
  10,936,555
  10,936,562
  10,936,568
  10,936,576
  10,936,580
  10,936,582
  10,937,985
  10,937,993
  10,937,997
  10,938,015
  10,938,251
  10,938,508
  10,939,060
  10,939,935
  10,940,043
  10,940,526
  10,940,740
  10,940,842
  10,940,908
  10,941,072
  10,941,611
  10,942,105
  10,942,175
  10,942,552
  10,942,725
  10,942,787
  10,942,837
  10,942,839
  10,942,841
  10,942,843
  10,942,845
  10,942,847
  10,942,878
  10,943,197
  10,943,383
  10,943,490
  10,943,529
  10,943,860
  10,944,089
  10,944,467
  10,944,472
  10,944,516
  10,944,559
  10,944,574
  10,944,614
  10,944,621
  10,944,642
  10,944,646
  10,944,687
  10,944,702
  10,944,729
  10,944,796
  10,944,811
  10,944,866
  10,944,867
  10,944,923
  10,944,951
  10,946,002
  10,946,315
  10,946,472
  10,946,556
  10,946,690
  10,946,737
  10,946,821
  10,947,122
  10,947,209
  10,948,871
  10,949,101
  10,949,187
  10,949,197
  10,949,268
  10,949,312
  10,949,454
  10,949,724
  10,949,729
  10,949,890
  10,949,999
  10,950,108
  10,950,237
  10,950,784
  10,950,807
  10,950,834
  10,950,875
  10,950,905
  10,951,183
  10,951,207
  10,951,211
  10,951,240
  10,951,332
  10,951,373
  10,951,376
  10,951,445
  10,951,572
  10,951,621
  10,951,648
  10,951,803
  10,951,874
  10,952,225
  10,952,304
  10,952,489
  10,952,779
  10,952,815
  10,952,977
  10,953,102
  10,953,144
  10,953,187
  10,953,203
  10,953,228
  10,953,248
  10,953,289
  10,953,405
  10,953,426
  10,953,465
  10,953,476
  10,953,507
  10,953,673
  10,953,861
  10,953,872
  10,954,083
  10,954,097
  10,954,166
  10,954,251
  10,954,370
  10,954,428
  10,954,609
  10,955,041
  10,955,186
  10,955,187
  10,962,392
  10,962,546
  10,962,911
  10,962,989
  10,963,789
  10,963,875
  10,963,963
  10,964,180
  10,964,207
  10,964,367
  10,964,389
  10,964,414
  10,964,617
  10,964,660
  10,964,691
  10,964,692
  10,964,705
  10,964,795
  10,964,821
  10,964,860
  10,964,924
  10,965,037
  10,965,625
  10,965,639
  10,965,651
  10,965,665
  10,965,679
  10,965,687
  10,965,697
  10,965,699
  10,965,702
  10,965,704
  10,970,845
  10,971,111
  10,971,131
  10,971,252
  10,971,324
  10,971,781
  10,974,432
  10,974,568
  10,974,589
  10,975,056
  10,979,014
  10,982,769
  10,982,771
  10,983,841
  10,986,526
  10,986,910
  10,988,375
  10,989,199
  10,989,280
  10,989,334
  10,989,419
  10,989,421
  10,989,427
  10,994,315
  10,995,725
  10,995,772
  10,995,778
  10,995,784
  10,995,801
  10,995,815
  10,995,820
  10,995,830
  10,995,836
  10,995,851
  10,995,856
  10,995,859
  10,995,873
  10,995,885
  10,995,903
  10,995,916
  10,995,943
  10,995,991
  10,996,008
  10,996,014
  10,996,015
  10,996,306
  10,996,320
  10,996,331
  10,996,341
  10,996,352
  10,996,368
  10,996,376
  10,996,377
  10,996,382
  10,996,398
  10,996,406
  10,996,426
  10,996,433
  10,996,453
  10,996,462
  10,996,466
  10,996,476
  10,996,499
  10,996,515
  10,996,527
  10,996,532
  10,996,541
  10,996,553
  10,996,556
  10,996,562
  10,996,582
  10,996,584
  10,996,597
  10,996,608
  10,996,614
  10,996,628
  10,996,644
  10,996,654
  10,996,656
  10,996,676
  10,996,684
  10,996,685
  10,996,697
  10,996,705
  10,996,708
  10,996,717
  10,996,742
  10,996,749
  10,996,763
  10,996,766
  10,996,773
  10,996,774
  10,996,778
  10,996,785
  10,996,795
  10,999,920
  10,999,940
  10,999,955
  10,999,965
  10,999,969
  10,999,972
  10,999,984
  10,999,985
  10,999,995
  10,999,996
  11,000,020
  11,000,030
  11,000,035
  11,000,042
  11,000,080
  11,000,086
  11,000,112
  11,000,152
  11,000,170
  11,002,160
  11,005,587
C
T
T
C
G
C
-
C
T
C
4
G
A
G
G
C
C
-
-
G
G
-
T/A
A
-
A
G
A
-
G
C
C
T
C
-
A
A
T
T
T
C
-
G
T
A
A
G
T
G
T
G
C
T
C
-
-
C
-
-
-
A
-
A
A
G
-
24
-
T
C
-
-
-
T
A
A
-
-
A
G
-
-
A
-
-
-
C
C
-
-
C
-
G
A
C
C
A
G
A
C
A
-
A
-
C
C
-
-
-
-
2
-
T
A
8
T
A
-
G
-
A
-
T
G
G
G
-
C
-
A
C
G
-
-
-
G
A
T
-
-
T
-
C
T
C
-
A
C
T
-
-
-
G
C
G
2
-
-
-
-
-
-
-
-
-
5
T
-
-
-
8
G
C
-
3
T
T
A
T
A
A
A
C
-
G
G
G
G
G
G
A
C
C
A
C
G
G
-
T
-
C
-
-
-
T
G
-
2
C
-
G
-
C
G
T
G
T
C
G
-
6
C
T
C
C
G
G
T
T
C
C
A
T
C
A
C
G
4
C
-
-
C
G
T
G
G
C
C
G
C
C
A
A
A
74
A
C
A
C
A
A
-
-
C
G
G
G
C
G
4
G
T
C
T
-
C
3/-
4/-
A
A
12
G
G
C
C
A
-
T
C
T
4
G
T
T
G
-
T
C
-
G
C
A
T
A
-
T
-
C
A
A
T
A
G
-
A
-
A
A
C
A
-
-
-
T
C
-
A
A
C
A/T
T/C
C
-
T
T
A
C
2
G
C
5
C
-
-
-
-
-
T
-
-
-
-
G
-
-
-
C
-
-
-
-
A
T
-
T
-
-
-
-
G
A
2
A
3
-
A
-
G
2
A
-
-
-
-
-
A
-
2
2
A
G
2
A
A
-
A
-
-
A
T
-
-
-
-
-
-
-
-
A
C
-
-
-
-
-
-
G
-
-
3
-
T
G
G
-
-
G
A
T
-
A
-
G
G