Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 167,368 (bp)   Positions: 184
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.999
.005
.031
.012
.003
.0
.001
.001
.003
.019
.0
.111
.006
.001
.008
.722
.004
.009
.0
.075
.0
.041
.004
.002
--
--
--
--
--
--
--
.002
.261
.0
.0
.045
.037
.042
.042
.032
.201
.203
.275
.008
.001
.0
.014
.0
.0
.002
--
--
--
--
--
--
--
.005
1.0
.368
--
.384
.016
.383
1.0
.03
.478
.002
.062
.011
.001
.024
.002
.013
.106
.999
.0
.001
.229
.0
.001
.005
.099
.002
.298
.039
.001
--
.084
.007
.013
.115
.031
.013
.0
--
.035
.105
.014
.284
.001
.0
.113
.051
.0
.0
.0
--
--
--
--
--
--
.066
.052
.043
.001
--
.019
.025
.019
.029
.026
.007
.002
.001
.037
.009
.027
.113
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.008
.003
.001
.01
.01
.001
.002
.001
.19
.053
.343
.015
.095
.149
.08
.862
--
.074
.096
.001
.0
.005
.002
.016
.005
.021
.565
.027
.001
.061
.049
.056
.022
.022
.0
.018
.017
.195
.002
.003
.21
.0
.006
.076
.989
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Nipbl
Nipbl
Nipbl
Nipbl
Nipbl
Nipbl
Nipbl
Nipbl
Nipbl
Nipbl
Nipbl
Nipbl
Nipbl
Nipbl
Nipbl
Nipbl
Nipbl
Nipbl
Nipbl
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
A
G
T
G
A
3
G
C
G
C
-
C
T
2
-
-
C
T
-
T
A
C
T
T
3
T
T
T
T
T
G
C
-
C
T
T
T
A
T
T
A
C
4
G
-
A
-
C
2
-
-
A
A
-
-
-
T
A
T
C
C
T
2
A
C
-
A
C
C
4
-
-
G
T
T
A
A
C
G
T
T
T
G
G
A
G
T
A
T
G
T
-
G
4
-
C
T
G
-
-
T
C
T
T
C
G
4
T
C
G
G
G
T
T
-
A
-
C
C
T
C
C
A
G
T
-
C
C
C
C
T
T
G
G
C
A
T
C
C
C
T
T
-
C
T
G
A
G
C
T
C
A
C
A
-
T
G
T
T
A
C
C
A
4
G
G
-
T
C
T
A
C
-
110
T
A
G
G
A
G
-
-
-
  57,511,712
  57,512,741
  57,513,464
  57,513,514
  57,515,010
  57,515,384
  57,516,782
  57,517,234
  57,517,590
  57,519,139
  57,524,865
  57,528,403
  57,528,442
  57,529,740
  57,529,984
  57,530,843
  57,531,362
  57,531,850
  57,531,887
  57,533,247
  57,535,156
  57,535,180
  57,535,252
  57,536,854
  57,537,944
  57,537,947
  57,537,950
  57,537,953
  57,537,955
  57,537,957
  57,537,967
  57,538,759
  57,543,694
  57,544,143
  57,545,412
  57,546,972
  57,551,321
  57,551,458
  57,551,461
  57,551,571
  57,552,786
  57,552,787
  57,552,792
  57,554,099
  57,554,264
  57,554,350
  57,554,503
  57,554,641
  57,554,941
  57,556,151
  57,556,207
  57,556,212
  57,556,228
  57,556,236
  57,556,238
  57,556,264
  57,556,276
  57,556,514
  57,556,847
  57,557,233
  57,557,336
  57,557,757
  57,561,450
  57,561,727
  57,562,080
  57,567,410
  57,567,676
  57,567,992
  57,568,351
  57,568,602
  57,568,666
  57,568,752
  57,569,296
  57,571,704
  57,572,964
  57,575,291
  57,576,823
  57,577,958
  57,578,164
  57,578,450
  57,578,547
  57,579,220
  57,581,814
  57,584,629
  57,584,851
  57,585,034
  57,587,390
  57,589,199
  57,590,410
  57,590,697
  57,591,120
  57,592,499
  57,592,557
  57,593,241
  57,593,448
  57,594,631
  57,594,682
  57,595,359
  57,598,182
  57,599,278
  57,599,906
  57,599,979
  57,600,306
  57,602,193
  57,602,507
  57,604,891
  57,604,893
  57,607,432
  57,607,737
  57,610,240
  57,610,258
  57,610,294
  57,610,328
  57,611,376
  57,611,872
  57,612,241
  57,613,233
  57,615,990
  57,616,513
  57,618,751
  57,618,779
  57,618,782
  57,618,806
  57,623,687
  57,625,341
  57,625,602
  57,626,307
  57,626,339
  57,626,347
  57,627,725
  57,628,118
  57,628,119
  57,628,184
  57,628,185
  57,628,225
  57,628,373
  57,628,458
  57,629,025
  57,629,089
  57,632,697
  57,633,098
  57,635,623
  57,636,814
  57,636,915
  57,637,116
  57,638,135
  57,640,689
  57,640,911
  57,644,584
  57,645,880
  57,646,103
  57,647,404
  57,648,102
  57,648,114
  57,650,338
  57,651,108
  57,651,226
  57,651,229
  57,652,399
  57,652,948
  57,654,303
  57,654,891
  57,656,074
  57,656,413
  57,656,427
  57,656,530
  57,657,946
  57,658,845
  57,659,328
  57,660,463
  57,660,792
  57,661,299
  57,665,178
  57,665,197
  57,667,174
  57,667,744
  57,668,041
  57,668,310
  57,668,747
  57,671,055
  57,671,432
  57,672,203
  57,673,452
  57,675,817
T
C
A
A
A
G
-
T
T
A
T
T
T
C
-
6
A
A
C
2
-
T
T
A
C
-
C
C
C
C
-
A
T
4
T
C
C
C
T
C
G
T
T
-
T
A
G
4
T
-
2
24
G
G
2
2
4
A
G
C
G
T
C
-
G
T
A
C
T
T
-
4
3/A
A
A
C
G
C
-
A
C
-
C
C
A
G
C
C
G
C
A
C
A
C
-
C
T
A/A
A
A
A
C
T
C
C
T
T
-
G
C/T
G/A
G/A
G/T
C
A
4
T
6
T
-
A
T
T
C
A
A
A
A
A
T
T
C
C
A
T
A
T
C
T
T
T
C
C
5
A
C
A
-
A
T
C
A
C
A
T
25
-
A
C
-
A/-
T
T
T
-
A
A
G
C
A
G
G
T
A
-
C
T
A
A
G
T
2
2
9