Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 211,620 (bp)   Positions: 392
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.994
.001
.0
.036
.003
.0
.012
.0
.001
.001
.0
.0
.001
.003
.001
.162
.536
.0
.085
.008
.001
.001
.001
.007
.001
.047
.008
.004
.0
.017
.0
.0
.001
.001
.001
.0
.001
.001
.005
.0
.0
.008
.001
.02
.011
.514
.98
.997
.432
.219
.138
.19
.583
.944
.613
.139
.431
.827
.828
.097
.117
.0
.0
.001
.006
.002
.001
.001
.003
.002
.257
.181
.002
.0
.0
.006
.001
.077
.038
.0
.001
.025
.0
.002
.0
.001
.001
.0
.124
.104
.0
.005
.009
.006
.0
.0
.0
.0
.028
.0
.002
.003
.039
.005
.011
.005
.0
.0
.011
.001
.0
.007
.983
.229
.049
.0
.0
.005
.031
.105
.1
.609
.944
.005
.639
1.0
.997
.0
.0
.002
.0
.03
.003
.05
.204
.386
.009
.0
.068
.016
.012
.004
.0
.135
.005
.0
.001
.003
.003
.034
.0
.001
.008
.044
.241
.056
.004
.001
.006
.969
.0
.0
.0
.001
.089
.003
.002
.002
.0
.565
.0
.001
.0
.002
.073
.0
.677
.032
.971
1.0
1.0
.115
.02
.026
.001
.867
.03
.0
.008
.036
.001
.001
.0
.0
.001
.001
.0
.043
.703
.998
.967
.32
.048
.001
.0
.0
.967
.494
1.0
.005
.0
.113
.0
.028
.011
.001
.003
.004
.0
.201
.0
.0
.001
.004
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.104
.228
.721
.001
.099
.001
.0
.0
.0
.074
.126
.062
.092
.0
.005
.831
.01
.0
.994
.619
.314
.0
.0
.003
.0
.0
.0
.0
.245
.003
.0
.001
.0
--
--
--
--
.028
.019
--
--
.077
.839
.01
.0
.0
.01
.0
.001
.0
.008
.739
.984
.001
.0
.01
.79
.0
.001
.0
.004
.025
.178
.0
.006
.016
.0
.058
.027
.001
.0
.01
.895
1.0
.002
.367
.008
.001
.006
.0
.018
.046
.011
.002
.001
.0
.0
.0
.001
.002
.003
.012
.002
.002
.001
1.0
.001
.06
.0
.002
.006
.0
.0
.002
.861
1.0
.005
.0
.0
.001
.0
.5
.383
.001
.001
.03
.028
.001
.026
.006
.002
.062
.276
.009
.002
.234
.282
.19
.199
.159
.001
.0
.001
.006
.002
.0
.047
.0
.002
1.0
.011
.616
.985
.0
.003
.0
.056
.178
.977
.812
.989
.997
.996
.997
.998
.068
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Nfib
Nfib
Nfib
Nfib
Nfib
Nfib
Nfib
Nfib
Nfib
Nfib
Nfib
Nfib
Nfib
Nfib
Nfib
Nfib
Nfib
Nfib
Nfib
Nfib
Nfib
Nfib
Nfib
Nfib
Nfib
Nfib
Nfib
Nfib
Nfib
Nfib
Nfib
Nfib
Nfib
Nfib
Nfib
Nfib
Nfib
Nfib
Nfib
Nfib
C
A
A
T
T
T
T
-
C
2
3
2
C
-
3
C
-
G
-
C
-
-
T
-
A
-
-
-
-
-
-
-
-
-
A
-
-
-
A
-
T
-
C
T
-
A
G
A
A
G
G
G
A
A
A
G
T
T
G
2
2
G
A
A
-
G
-
-
T
-
T
4
A
G
G
G
C
T
A
A
T
A
T
C
G
C
C
A
G
16
G
T
G
T
T
T
G
2
T
C
G
A
G
C
A
A
A
C
G
G
C
A
-
-
G
C
A
C
G
T
C
G
6
C
T
G
T
A
T
A
-
A
6
A
C
A
A
G
T
G
G
A
-
C
8
T
A
A
G
C
T
C
A
T
A
G
5
T
C
G
G
6
-
C
G
A
G
A
-
C
C
A
G
2
T
A
G
A
A
T
C
-
G
A
A
G
T
G
T
G
T
T
G
A
T
T
A
A
T
T
T
A
C
C
T
C
T
A
G
C
C
C
C
12
G
A
-
T
C
T
A
C
C
A
C
C
A
2
8
-
-
G
-
T
T
A
C
C
A
C
G
G
T
A
A
G
-
T
A
A
A
C
G
A
-
T
A
T
T
G
T
G
C
G
-
C
C
C
T
A
12
T
T
A
A
G
-
T
T
A
A
T
C
A
G
A
T
C
C
G
T
-
C
-
-
-
-
-
-
T
C
-
C
C
G
C
C
T
C
A
C
T
C
C
2
A
G
G
T
2
-
-
A
A
T
G
A
T
4
-
T
A
A
-
T
G
6
C
T
-
T
T
G
A
G
C
G
G
A
C
G
G
3
G
G
G
G
C
2
T
A
G
2
G
C
C
-
C
-
-
-
A
G
A
C
-
A
-
A
C
C
C
5
-
G
A
-
G
-
-
-
-
  100,439,009
  100,448,558
  100,448,559
  100,471,008
  100,473,254
  100,473,257
  100,479,118
  100,482,180
  100,482,217
  100,482,228
  100,482,247
  100,482,260
  100,482,263
  100,486,564
  100,498,083
  100,498,104
  100,498,160
  100,499,700
  100,504,150
  100,504,216
  100,504,246
  100,504,275
  100,504,313
  100,504,319
  100,504,330
  100,504,341
  100,505,499
  100,505,502
  100,505,505
  100,505,517
  100,505,527
  100,505,530
  100,505,537
  100,505,566
  100,505,568
  100,505,572
  100,505,578
  100,505,589
  100,505,603
  100,505,610
  100,505,631
  100,505,674
  100,505,678
  100,505,695
  100,505,704
  100,505,755
  100,506,731
  100,506,737
  100,506,753
  100,506,758
  100,506,761
  100,506,764
  100,506,766
  100,506,770
  100,506,790
  100,506,796
  100,506,804
  100,506,810
  100,506,811
  100,506,842
  100,506,849
  100,506,868
  100,506,895
  100,507,115
  100,507,145
  100,507,158
  100,507,172
  100,507,174
  100,507,181
  100,507,206
  100,507,211
  100,507,216
  100,509,369
  100,509,389
  100,509,392
  100,510,063
  100,510,414
  100,510,492
  100,510,576
  100,510,784
  100,512,780
  100,512,791
  100,512,801
  100,512,830
  100,512,902
  100,513,026
  100,513,287
  100,513,940
  100,514,141
  100,514,270
  100,515,173
  100,515,304
  100,515,414
  100,515,567
  100,515,938
  100,516,144
  100,516,519
  100,516,522
  100,517,383
  100,517,555
  100,518,049
  100,518,333
  100,518,548
  100,518,590
  100,518,767
  100,518,849
  100,519,212
  100,519,475
  100,519,702
  100,519,815
  100,521,749
  100,523,432
  100,524,029
  100,525,284
  100,525,628
  100,526,698
  100,528,720
  100,528,947
  100,529,148
  100,531,174
  100,532,288
  100,532,360
  100,532,656
  100,532,677
  100,532,689
  100,532,695
  100,532,761
  100,533,128
  100,533,402
  100,533,416
  100,534,104
  100,534,223
  100,534,358
  100,534,829
  100,534,849
  100,534,880
  100,535,046
  100,535,167
  100,535,179
  100,535,262
  100,535,268
  100,536,051
  100,536,171
  100,536,222
  100,536,340
  100,536,729
  100,536,730
  100,537,719
  100,538,008
  100,538,061
  100,538,830
  100,538,885
  100,539,411
  100,539,541
  100,539,596
  100,539,658
  100,540,212
  100,541,058
  100,541,766
  100,542,033
  100,542,175
  100,542,191
  100,542,368
  100,542,390
  100,542,754
  100,543,062
  100,543,530
  100,543,734
  100,543,830
  100,543,856
  100,544,139
  100,544,145
  100,544,386
  100,544,662
  100,544,711
  100,545,008
  100,545,165
  100,545,193
  100,545,211
  100,545,414
  100,545,576
  100,545,649
  100,546,644
  100,546,646
  100,546,730
  100,547,040
  100,547,047
  100,547,476
  100,547,499
  100,547,748
  100,547,870
  100,547,914
  100,547,950
  100,547,952
  100,548,011
  100,548,034
  100,548,210
  100,548,224
  100,548,340
  100,548,520
  100,548,523
  100,548,570
  100,548,713
  100,548,728
  100,548,735
  100,549,218
  100,549,788
  100,549,800
  100,549,917
  100,550,500
  100,550,654
  100,551,193
  100,551,546
  100,551,570
  100,551,678
  100,551,741
  100,551,845
  100,551,846
  100,551,872
  100,552,215
  100,553,168
  100,553,426
  100,553,893
  100,553,942
  100,554,050
  100,554,058
  100,554,105
  100,554,136
  100,554,195
  100,554,252
  100,554,254
  100,554,266
  100,554,283
  100,554,296
  100,554,305
  100,554,309
  100,554,413
  100,554,419
  100,555,434
  100,555,479
  100,555,487
  100,555,645
  100,555,843
  100,555,850
  100,555,852
  100,556,014
  100,556,113
  100,556,126
  100,556,347
  100,556,978
  100,557,071
  100,557,465
  100,558,123
  100,558,313
  100,559,662
  100,560,344
  100,560,494
  100,560,772
  100,561,469
  100,561,936
  100,562,549
  100,562,599
  100,562,736
  100,563,470
  100,563,761
  100,564,080
  100,564,178
  100,564,679
  100,564,818
  100,565,220
  100,565,280
  100,565,306
  100,565,312
  100,565,375
  100,565,378
  100,565,482
  100,565,485
  100,565,535
  100,565,961
  100,566,776
  100,567,006
  100,567,245
  100,568,683
  100,569,378
  100,569,883
  100,570,132
  100,570,376
  100,570,518
  100,571,440
  100,572,025
  100,572,476
  100,575,289
  100,577,002
  100,579,325
  100,579,331
  100,579,357
  100,579,403
  100,579,415
  100,579,421
  100,584,743
  100,586,836
  100,587,001
  100,593,580
  100,596,144
  100,599,415
  100,603,831
  100,604,030
  100,604,672
  100,605,670
  100,608,155
  100,608,396
  100,609,433
  100,611,557
  100,612,009
  100,612,969
  100,612,992
  100,613,001
  100,613,005
  100,613,026
  100,613,037
  100,613,055
  100,613,070
  100,613,077
  100,613,080
  100,613,209
  100,613,224
  100,613,227
  100,613,233
  100,613,240
  100,613,248
  100,613,257
  100,614,985
  100,616,286
  100,618,341
  100,618,898
  100,622,467
  100,623,129
  100,623,138
  100,623,264
  100,624,020
  100,624,644
  100,626,938
  100,628,013
  100,628,034
  100,628,048
  100,628,050
  100,628,055
  100,628,069
  100,628,082
  100,628,095
  100,628,097
  100,628,103
  100,628,106
  100,628,117
  100,628,120
  100,628,122
  100,628,127
  100,628,131
  100,628,141
  100,628,156
  100,628,158
  100,628,163
  100,628,166
  100,628,175
  100,628,179
  100,628,198
  100,628,214
  100,628,221
  100,628,234
  100,628,296
  100,628,328
  100,628,361
  100,628,421
  100,630,849
  100,634,807
  100,637,390
  100,638,276
  100,638,283
  100,641,317
  100,642,168
  100,642,558
  100,646,469
  100,647,656
  100,647,680
  100,647,732
  100,647,747
  100,647,787
  100,647,848
  100,647,859
  100,647,895
  100,647,938
  100,647,961
A
G
C
T/-
C
C
C
T
-
-
-
-
A
12
3/-
-
10
-
A
-
A
G
-
4
G
C
2
C
G
A
G
G
G
2
G
2
G
G
T/G
C
A
A
T
-
A
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
C
A
T
-
-
-
-
-
C
-
A
C
-
C
-
-
G
A
A
A
T
C
G
G
G
G
C
T
A
A
A
G
A
-
A
G
A
C
C
C
A
-
C
T
A
-
T
T
T
T
T
A
T
-
T
T
A
10
A
A
G
T
C
C
-
-
-
G
C
A
C
G
C
G
T
G
-
G
G
G
G
A
-
A
A
C
9
T
-
C
T
G
A
T
C
T
-
C
T
A
-
A
T
T
C
-
A
-
A
C
T
G
C
T
T
G
C
-
G
G
T
G
T
-
T
C
A
G
G
A
C
C
A
A
G
C
T
C
G
C
C
G
C
C
C
C
T
T
C
T
C
G
A
T
T
T
T
-
A
G
3
A
T
G
C
T
T
G
G
G
-
-
-
C
C/C
T
4
C
C
C
G
G
T
T
A
A
G
G
G
A
2
C
G
T
G
T
C
G
2
C
G
C
G
A
C
C
T
A
A
-
T
T
C
G
-
A
A
T
T
A
2
G
C
G
G
C
G
G
A
C
C
G
T
C
C
-/C
T
T
C
A
A
C
A
C
G
A
A
T
T
T
T
C
T
T
T
C
T
A
-
C
-
-
-
-
A
G
G
-
-
-
-
-
-
2
C
G
-
A
C
A
-
A
C
40
C
C
-
T
C
T
-
-
-
A
C
T
-
-
-
-
C
-
-
-
-
-
-
T
-
-
A
A
G
T
G
-
-
-
A
T
-
59
G
T
T
T
-
C
-
-
G
-
C
C
G
G