Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 328,487 (bp)   Positions: 506
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.0
.0
.0
.003
.001
.0
.438
.0
.025
.037
.069
.094
.0
.006
.0
.0
.043
.001
.001
.0
.019
.094
.012
.002
.0
.0
.001
.005
.206
.999
1.0
.991
.859
.361
.005
.11
.002
.0
.053
.936
.952
.0
.006
.072
.0
.003
.027
.951
.0
.363
.0
.002
.001
.0
.0
.0
.005
.013
1.0
.065
1.0
.073
.01
.001
.001
--
1.0
.005
.004
.0
.839
.984
.038
.0
.0
.159
.007
.007
.005
.011
.915
.003
.01
.008
.0
.0
.039
.255
.0
.94
.004
.988
.0
.786
.002
.929
.0
.061
.0
.004
.658
1.0
.019
.195
.0
.782
.339
.011
.0
.409
.0
.006
.001
.871
.0
.0
.004
.0
.004
.163
.997
.079
.003
.832
.0
.105
.01
.001
.002
.023
.149
.0
.079
.015
.0
1.0
.0
.966
.003
.856
.023
.0
.0
.0
.005
.845
.263
.005
.007
.0
.033
.002
.998
.08
.965
.999
.991
.004
.004
.061
1.0
.009
.003
.0
.001
.001
.001
.0
.001
.176
.0
.001
.007
.025
.992
.84
.0
.004
.0
.007
.001
.001
.004
.0
1.0
.999
.956
.001
.002
.303
.332
.0
.031
.001
.0
.0
.005
.565
.978
.663
.0
.0
.746
.041
.032
.002
.002
1.0
.006
.991
.312
.099
.002
.001
.017
.0
.0
.0
.203
.009
.904
.001
.006
.001
.701
.593
.0
.006
.024
.011
.002
.041
.036
.004
.0
.011
.0
.158
.003
.0
.018
.0
--
--
--
.002
.012
.006
.999
.045
.006
.007
.001
.001
.0
.104
.004
.708
.324
.001
.001
.002
.0
.0
.275
.002
.014
.0
.002
.001
.008
.002
.0
.0
.003
.979
.0
.0
.001
.0
.002
.0
.0
.003
.0
.717
.996
.0
.635
.001
.001
.0
.014
.001
.0
.0
.023
.001
.003
.005
.0
.0
.033
.0
.03
.003
.002
.149
.146
.088
.002
.0
.001
.025
.0
.0
.244
.001
.0
.043
.003
.0
.043
.0
.018
1.0
.004
.006
.003
.0
.006
.002
.0
.001
.001
.438
.074
.122
.967
.004
.001
.225
.111
.003
.003
1.0
.011
.061
.0
.016
.0
.003
.002
.026
.44
.009
.002
.001
.0
.947
.688
.017
.001
.0
.001
.296
.003
.986
.002
.003
.0
.0
.0
.002
.001
.004
.002
.0
.0
.0
.002
.001
.002
.03
.805
.048
.002
.0
.0
.001
.001
.001
--
.921
.011
.003
.997
.24
.036
.372
.002
.001
.001
.004
.0
.001
.0
.003
.002
.022
.002
.001
.001
.0
.986
.0
.005
.203
.067
.037
.0
.001
.0
.001
.0
.0
.223
.997
.001
.0
.0
.001
.011
.001
.0
.01
.002
.001
.006
.004
.036
.0
.0
.001
.0
.016
.0
.0
.044
.011
.003
.013
.016
.0
1.0
.942
.014
.003
.046
.0
.0
.005
.0
.0
.002
.009
.005
.016
.161
.0
--
.009
.003
.1
.145
.0
.001
.006
.013
.001
.005
.962
.0
.003
.002
.04
.0
.0
.055
.896
.0
.564
.005
.0
.0
.128
.433
1.0
.934
.0
.01
.0
.0
.0
.0
.015
Nfia
Nfia
Nfia
Nfia
Nfia
Nfia
Nfia
Nfia
Nfia
Nfia
Nfia
Nfia
Nfia
Nfia
Nfia
Nfia
Nfia
Nfia
Nfia
Nfia
Nfia
Nfia
Nfia
Nfia
Nfia
Nfia
Nfia
Nfia
Nfia
Nfia
Nfia
Nfia
Nfia
Nfia
Nfia
Nfia
Nfia
Nfia
Nfia
Nfia
Nfia
Nfia
Nfia
Nfia
Nfia
Nfia
Nfia
Nfia
Nfia
Nfia
Nfia
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
T
A
A
G
T
T
C
T
T
T
T
T
A
C
A
A
C
C
T
G
A
G
C
C
C
G
G
A
C
A
A
A
C
A
C
A
T
G
C
G
G
G
G
A
C
T
G
A
T
T
G
T
T
G
A
T
G
G
A
G
G
A
A
C
A
A
T
G
C
G
G
G
C
G
C
C
C
C
T
T
G
T
G
T
A
C
T
C
A
C
C
A
A
T
C
G
T
A
A
A
A
T
C
T
T
A
C
G
C
T
T
G
G
A
G
G
C
G
G
C
T
C
G
G
T
T
T
T
C
C
T
C
C
T
C
A
C
G
C
C
A
G
C
A
G
G
T
C
G
A
T
G
A
G
T
T
G
A
G
C
T
G
C
G
G
C
G
G
A
G
A
T
G
C
T
C
G
T
T
C
C
A
T
A
C
T
T
T
T
A
T
T
A
T
T
G
T
T
T
A
C
T
A
C
C
C
C
A
A
C
T
G
A
C
C
A
C
A
G
A
G
C
G
T
T
G
C
C
G
T
G
G
T
T
T
C
G
G
T
G
C
C
T
A
A
C
T
G
T
G
T
A
T
C
A
A
C
C
G
G
A
A
G
G
C
T
A
T
T
G
C
C
G
C
G
T
A
C
A
A
C
T
C
T
C
G
T
C
A
T
T
C
C
G
T
G
T
T
C
G
T
A
G
A
A
C
G
T
G
G
A
C
T
T
T
G
A
T
A
A
G
A
C
G
C
G
A
T
T
G
A
T
T
C
C
T
A
T
T
A
A
C
A
G
C
T
G
G
T
T
A
A
C
T
A
G
C
G
A
C
G
A
C
C
A
T
G
G
A
A
A
A
G
A
C
T
C
G
C
A
A
A
A
G
T
A
T
G
G
G
C
C
G
C
A
T
C
C
C
T
C
A
A
T
C
G
T
G
A
A
A
G
A
T
T
T
C
A
G
G
C
C
G
T
T
C
A
G
T
A
A
C
C
G
G
T
T
G
G
C
C
C
C
G
A
A
C
T
T
T
G
T
G
T
T
A
G
A
T
G
T
T
T
A
A
G
C
G
A
T
G
T
A
G
A
G
T
C
C
G
T
A
T
G
G
T
G
A
A
T
G
G
T
A
C
C
C
A
A
T
G
C
A
T
G
T
  116,424,768
  116,426,840
  116,428,396
  116,428,494
  116,429,123
  116,430,359
  116,431,666
  116,433,964
  116,434,243
  116,434,247
  116,434,251
  116,434,255
  116,435,615
  116,435,708
  116,436,755
  116,436,968
  116,437,035
  116,438,319
  116,438,801
  116,439,043
  116,439,405
  116,439,560
  116,439,789
  116,440,420
  116,440,908
  116,441,078
  116,441,252
  116,441,812
  116,442,020
  116,442,287
  116,443,113
  116,444,990
  116,445,083
  116,445,856
  116,445,910
  116,448,206
  116,448,399
  116,448,840
  116,449,864
  116,450,003
  116,450,187
  116,450,300
  116,450,854
  116,454,034
  116,454,067
  116,454,580
  116,456,427
  116,456,979
  116,458,129
  116,458,348
  116,458,457
  116,458,517
  116,459,286
  116,459,287
  116,459,340
  116,459,412
  116,459,541
  116,461,590
  116,462,000
  116,462,429
  116,462,561
  116,462,697
  116,462,721
  116,463,176
  116,463,630
  116,466,728
  116,466,869
  116,467,345
  116,467,374
  116,470,316
  116,471,016
  116,471,864
  116,473,597
  116,474,269
  116,477,893
  116,478,037
  116,479,300
  116,480,429
  116,480,722
  116,481,969
  116,484,151
  116,486,750
  116,487,019
  116,489,733
  116,490,081
  116,490,511
  116,490,657
  116,490,792
  116,490,991
  116,492,383
  116,493,010
  116,493,380
  116,495,012
  116,495,660
  116,496,035
  116,497,383
  116,497,769
  116,499,127
  116,499,194
  116,500,848
  116,500,936
  116,501,009
  116,501,301
  116,501,503
  116,502,661
  116,503,089
  116,505,593
  116,506,262
  116,506,530
  116,506,891
  116,507,214
  116,509,032
  116,511,071
  116,516,748
  116,516,998
  116,519,322
  116,520,109
  116,520,624
  116,520,830
  116,521,553
  116,522,048
  116,522,368
  116,522,906
  116,523,222
  116,524,051
  116,525,559
  116,527,400
  116,527,966
  116,535,155
  116,535,219
  116,537,043
  116,538,930
  116,539,580
  116,541,097
  116,542,073
  116,542,365
  116,546,922
  116,547,545
  116,547,972
  116,548,830
  116,550,004
  116,550,345
  116,550,975
  116,551,256
  116,552,013
  116,553,569
  116,554,217
  116,555,459
  116,555,530
  116,555,781
  116,556,700
  116,557,946
  116,559,665
  116,559,909
  116,560,939
  116,562,599
  116,562,637
  116,563,185
  116,564,204
  116,564,730
  116,566,515
  116,566,639
  116,567,302
  116,567,336
  116,567,430
  116,567,481
  116,567,624
  116,567,759
  116,568,276
  116,568,436
  116,569,090
  116,569,541
  116,569,737
  116,569,785
  116,570,064
  116,570,188
  116,570,461
  116,570,947
  116,571,330
  116,572,488
  116,572,899
  116,573,562
  116,574,245
  116,574,448
  116,574,886
  116,574,925
  116,575,010
  116,575,332
  116,575,571
  116,575,784
  116,575,886
  116,576,478
  116,576,603
  116,578,163
  116,580,995
  116,582,084
  116,583,038
  116,583,112
  116,583,830
  116,583,862
  116,584,310
  116,584,968
  116,586,518
  116,588,772
  116,589,131
  116,589,421
  116,590,006
  116,590,390
  116,590,780
  116,590,955
  116,591,120
  116,591,170
  116,591,679
  116,591,689
  116,592,073
  116,593,243
  116,593,323
  116,593,999
  116,594,858
  116,596,770
  116,597,722
  116,601,028
  116,602,402
  116,602,613
  116,602,685
  116,604,601
  116,605,556
  116,605,565
  116,605,639
  116,605,935
  116,606,039
  116,606,059
  116,606,290
  116,606,675
  116,606,822
  116,606,898
  116,607,042
  116,607,088
  116,608,230
  116,608,286
  116,609,052
  116,609,378
  116,609,805
  116,609,902
  116,609,986
  116,610,455
  116,610,680
  116,610,749
  116,610,901
  116,612,224
  116,613,084
  116,613,377
  116,613,460
  116,613,485
  116,613,662
  116,613,949
  116,614,147
  116,614,235
  116,614,402
  116,614,824
  116,614,975
  116,615,034
  116,615,038
  116,615,039
  116,615,633
  116,616,550
  116,616,693
  116,616,754
  116,616,938
  116,617,103
  116,617,192
  116,617,219
  116,617,902
  116,618,265
  116,618,400
  116,618,710
  116,619,101
  116,619,125
  116,619,148
  116,619,416
  116,619,547
  116,619,553
  116,619,629
  116,620,093
  116,620,252
  116,620,386
  116,620,400
  116,620,417
  116,620,715
  116,620,976
  116,621,039
  116,621,118
  116,621,133
  116,621,404
  116,621,588
  116,622,085
  116,622,234
  116,622,390
  116,622,436
  116,622,497
  116,622,921
  116,624,031
  116,624,837
  116,624,923
  116,625,076
  116,625,635
  116,625,999
  116,626,023
  116,626,137
  116,626,141
  116,626,421
  116,626,456
  116,626,512
  116,626,523
  116,626,667
  116,627,346
  116,627,371
  116,627,631
  116,627,669
  116,627,789
  116,627,818
  116,627,889
  116,628,582
  116,628,613
  116,628,769
  116,629,046
  116,629,410
  116,629,970
  116,630,098
  116,630,420
  116,630,812
  116,631,329
  116,631,525
  116,631,534
  116,632,159
  116,638,717
  116,638,786
  116,639,416
  116,639,717
  116,640,413
  116,640,439
  116,640,930
  116,641,115
  116,641,701
  116,641,781
  116,642,837
  116,643,432
  116,644,621
  116,646,244
  116,646,391
  116,646,826
  116,650,319
  116,650,587
  116,651,311
  116,651,348
  116,652,228
  116,652,611
  116,652,886
  116,653,177
  116,653,378
  116,653,997
  116,654,085
  116,655,408
  116,655,693
  116,656,006
  116,656,938
  116,657,960
  116,658,381
  116,658,572
  116,658,780
  116,658,989
  116,660,284
  116,660,292
  116,661,004
  116,661,070
  116,661,729
  116,662,584
  116,663,493
  116,664,002
  116,664,028
  116,664,208
  116,664,224
  116,664,239
  116,664,472
  116,665,981
  116,666,410
  116,666,435
  116,666,743
  116,667,057
  116,667,147
  116,668,138
  116,669,144
  116,669,527
  116,669,945
  116,670,241
  116,670,460
  116,671,206
  116,672,635
  116,674,543
  116,675,299
  116,675,995
  116,677,331
  116,677,367
  116,677,374
  116,677,701
  116,677,752
  116,678,196
  116,678,671
  116,679,216
  116,680,135
  116,680,136
  116,680,412
  116,680,496
  116,680,548
  116,680,787
  116,681,232
  116,682,073
  116,682,527
  116,685,794
  116,686,251
  116,688,777
  116,688,781
  116,689,388
  116,689,511
  116,689,701
  116,689,766
  116,690,487
  116,690,550
  116,691,605
  116,691,953
  116,691,972
  116,692,520
  116,693,404
  116,693,521
  116,693,721
  116,693,916
  116,694,086
  116,694,672
  116,694,929
  116,694,932
  116,695,007
  116,695,413
  116,695,522
  116,695,693
  116,695,734
  116,696,008
  116,696,549
  116,696,573
  116,697,686
  116,697,690
  116,698,036
  116,699,010
  116,700,873
  116,701,865
  116,703,178
  116,703,750
  116,704,181
  116,705,702
  116,705,977
  116,706,314
  116,706,347
  116,706,953
  116,707,476
  116,707,897
  116,707,998
  116,708,200
  116,709,805
  116,710,437
  116,710,567
  116,713,124
  116,714,516
  116,720,064
  116,722,832
  116,723,043
  116,725,889
  116,731,713
  116,732,243
  116,732,258
  116,733,134
  116,733,919
  116,738,350
  116,738,771
  116,739,176
  116,739,286
  116,739,550
  116,739,822
  116,740,059
  116,740,115
  116,740,770
  116,741,075
  116,741,722
  116,741,807
  116,742,820
  116,742,873
  116,743,474
  116,743,717
  116,744,061
  116,744,201
  116,744,269
  116,744,491
  116,744,842
  116,744,864
  116,745,049
  116,745,347
  116,746,726
  116,749,270
C
C
G
A
C
C
T
C
A
A
A
A
T
T
G
G
T
G
C
C
G
A
G
T
T
A
A
G
A
G
G
G
T
G
T
G
C
A
T
A
A
A
A
T
T
C
A
G
C
C
A
C
C
C
G
C
A
A
T
A
C
G
G
G
A/G
A/T
T/C
G/A
A
A
T
C
T
A
G
T
T
T
A
C
T
A
A
G
G
T
T/G
T
G
T
A
G
C
C
T
A
C
G
G
G
G
C
T
C
C
G
T
T
T
C
C
C
A
G
C
A
A
A
C
T
C
T
A
A
C
C
C
A
T
T
A
T
T
C
G
G
A
A
T
T
G
A
G
G
A
T
C
T
A
C
C
G/C
G
A
C
C
A
G
A
T
C
C
T
T
T
T
A
T
G
A
T
C
A
G
C
T
A
G
G
T
T
C
C
G
A
C
C
C
G
T
G
C
G
C
G
T
C
C
G
G
T
C
G
A
T
T
T
T
C
T
C
C
C
T
T
G
T
C
T
G
T
A
A
G
G
A
T
T
A
G
A
A
A
A
C
T
C
T
C
A
G
G
C
G
T
A
C
A
G
C
C
C
C
T
G
G
G
T
A
A
A/G
A/G
G/A
G/A
T
C
G
C
C
C
A
T
T
T
T
C
G
A
G
G
T
A
T
C
T
A
C
T
G
C
A
T
T
C
C
A
C
C
G
A
A
T
A
G
G
G
C
C
A
A
C
T
G
C
C
A
G
C
C
G
C
G
G
A
T
C
G
G
G
T
G
G
C
T
T
G
G
C
C
G
C
T
C
T
A
C
A
A
C
A
G
G
T
G
G
A
T
A
G
A
A
A/T
A
T
G
C
A
A
G
T
G
G
T
G
T
C
T
A
T
A/C
G
G
G
A
C
G
C
A
A
A
T
T
A
A
G
C
T
T
T
C
T
C
G
A
T
A
C
A
G
T
C
A
G
C
C
A
T
G
A
A
G
A
A
C
G
A
G
A
C
G
C
T
G
A
A
C
C
A
A
T
G
T
T
A
G
G
T
A
G
G
A
C
T
C
C
G
A
T
C
A
C
A
C
G
C
A
T
T
G
C
G/A
C
G
A
G
A
C
T
A
A
G
G
C
T
A
G
A
G
G
C
A
A
G
G
T
A
T
G
G
C
A
A
G
G
A
C