Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 327,324 (bp)   Positions: 444
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.08
.197
.0
.006
.005
.003
.0
.038
.015
.0
.001
.005
.011
.12
.003
.002
.006
.809
.0
.001
.0
.968
.003
.002
.002
.001
.004
.0
.055
.0
.007
.001
.0
.016
.0
.002
.161
.001
.005
.0
.008
.049
.001
.0
.196
.0
.009
.004
.001
.005
.033
.012
.014
.036
.691
.71
.71
.152
.024
.005
.011
.174
.054
.002
.006
.012
.032
.013
.001
.004
.008
.015
.002
.001
.058
.006
.0
.0
.0
.994
1.0
.0
.0
.0
.0
.001
.001
.128
.035
.0
.0
.012
.006
.0
.002
.0
.0
.027
.001
.061
.229
.053
.051
.205
.004
.002
.056
.0
.0
.002
.001
.008
.0
.0
.001
.0
.021
.0
.0
.0
--
.006
.002
--
.011
.015
.007
.037
.011
.001
.0
.006
.004
.001
.0
.0
.0
.001
.0
.0
.0
.039
.348
.026
--
--
--
.162
.0
.0
.0
.002
.036
.001
.004
.0
.0
.0
.017
.012
.009
.002
.002
.024
.031
.014
.002
.002
.029
.015
.015
.0
.0
.604
.151
.001
.001
.004
.004
.028
.004
.053
.003
.0
.005
.004
.02
.06
.071
.006
.076
.006
.004
.001
.001
.001
.0
.002
.03
.091
.0
.012
.0
.003
.0
.0
.0
.001
.001
.0
.059
.0
.0
.003
.004
.001
.001
.0
.022
.0
.055
.003
.002
.0
.051
.002
.001
.0
.0
.0
.001
.003
.003
.037
.004
.001
.005
.017
.021
.001
.033
.089
.0
.002
.0
.009
.0
.001
.107
.011
.028
.001
.001
.003
.002
.013
--
--
--
--
.003
.012
.003
.001
.001
.196
.001
.002
.0
.001
.001
.005
.021
.001
.0
.007
.0
.0
.006
.002
--
.003
.014
.003
.002
.0
.001
.15
.001
.019
.003
.017
.012
.005
.001
.005
.083
.005
.003
.0
.0
.175
.0
.001
.001
.001
.001
.135
.0
.0
.0
.0
.769
.722
.0
.046
.99
.876
.0
.001
.0
.003
.0
1.0
.0
.001
.0
.0
.054
.224
.011
.029
.016
.011
.002
.003
.026
.001
.069
.059
.019
.011
.0
.031
.001
.003
.0
.0
.04
.008
.0
.001
.019
.0
.0
.0
.003
.001
.002
.001
.187
.001
.015
--
.013
.984
.017
.0
.0
.002
.033
.001
.013
.127
.004
.024
.026
.054
.033
.002
.01
.007
.01
--
--
.003
.026
.015
.001
.002
.004
.107
.001
.26
.0
.36
.002
.623
.002
.046
.032
.013
.0
.0
.002
.01
.025
.012
.01
.005
.005
.002
.985
.195
.0
.033
.001
.0
.12
.001
.0
--
--
--
--
--
--
.002
.014
.005
.001
.038
.073
.003
.003
.001
.27
.023
.001
.0
.017
.005
.01
.33
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Nell2
Nell2
Nell2
Nell2
Nell2
Nell2
Nell2
Nell2
Nell2
Nell2
Nell2
Nell2
Nell2
Nell2
Nell2
Nell2
Nell2
Nell2
Nell2
Nell2
Nell2
Nell2
Nell2
Nell2
Nell2
Nell2
Nell2
Nell2
Nell2
Nell2
Nell2
Nell2
Nell2
Nell2
Nell2
Nell2
Nell2
Nell2
Nell2
Nell2
Nell2
Nell2
Nell2
Nell2
Nell2
G
A
G
A
C
A
A
C
A
G
A
T
A
G
A
C
G
T
A
G
A
G
C
A
T
C
A
A
T
C
C
G
T
G
C
C
A
G
C
T
G
A
C
A
T
C
A
C
C
T
G
C
T
A
T
A
A
C
T
T
T
G
A
T
G
G
C
T
G
C
C
G
A
G
G
C
C
C
A
T
G
C
C
T
A
C
C
A
C
C
A
C
C
A
C
C
A
A
T
G
G
G
C
C
T
A
C
C
T
G
A
C
T
T
G
T
A
T
T
G
A
T
A
T
T
C
C
G
G
A
C
G
G
T
A
A
G
A
T
G
A
C
C
C
T
A
C
T
A
C
T
A
T
A
C
T
A
A
A
C
C
G
G
C
A
T
C
A
G
G
C
A
T
T
T
T
C
G
T
G
G
G
T
C
C
C
A
T
A
G
G
C
T
A
G
T
G
T
A
C
T
A
G
A
T
T
G
C
T
T
T
C
A
G
A
G
T
G
G
T
C
G
C
C
A
C
A
C
G
C
A
A
C
G
T
T
C
C
G
A
C
G
G
C
C
A
G
T
C
T
A
A
G
C
G
C
G
G
G
A
T
A
G
C
T
G
A
G
A
T
A
A
A
G
A
C
T
A
C
C
G
G
C
A
T
G
C
A
G
C
C
T
T
A
A
T
A
G
A
G
C
A
C
A
T
C
G
G
C
G
G
T
A
G
T
T
C
A
G
G
C
C
A
G
G
G
T
C
C
T
C
G
C
A
C
C
A
C
A
A
C
A
T
C
T
A
A
C
T
G
A
A
C
T
T
A
C
C
C
G
C
G
T
C
C
G
G
A
A
G
C
A
C
C
A
A
C
A
A
A
T
C
C
T
A
G
A
A
G
C
G
G
T
T
A
A
C
C
A
T
C
A
G
C
A
A
T
T
C
G
C
G
T
A
T
G
G
T
A
T
C
T
A
C
C
T
T
G
T
G
T
C
G
T
T
A
A
C
G
T
G
G
A
T
  136,527,070
  136,527,449
  136,527,499
  136,527,655
  136,528,499
  136,528,734
  136,528,771
  136,528,942
  136,529,372
  136,530,260
  136,530,261
  136,530,388
  136,531,232
  136,531,479
  136,533,392
  136,535,380
  136,535,479
  136,536,200
  136,536,439
  136,536,584
  136,536,863
  136,536,993
  136,537,216
  136,537,806
  136,538,246
  136,538,765
  136,539,329
  136,539,413
  136,539,447
  136,540,217
  136,540,833
  136,540,967
  136,541,002
  136,541,391
  136,541,568
  136,541,710
  136,542,617
  136,548,861
  136,549,144
  136,549,228
  136,549,822
  136,549,962
  136,549,984
  136,550,066
  136,550,234
  136,550,529
  136,550,546
  136,550,606
  136,550,762
  136,550,776
  136,550,930
  136,551,050
  136,551,066
  136,551,212
  136,551,297
  136,551,306
  136,551,308
  136,551,497
  136,551,695
  136,551,723
  136,551,724
  136,551,742
  136,552,181
  136,552,240
  136,552,436
  136,552,491
  136,552,501
  136,552,514
  136,552,527
  136,552,531
  136,554,119
  136,554,120
  136,554,158
  136,554,171
  136,554,207
  136,554,266
  136,554,275
  136,554,391
  136,554,435
  136,554,589
  136,554,590
  136,556,940
  136,557,477
  136,558,308
  136,558,676
  136,568,465
  136,568,467
  136,568,809
  136,599,947
  136,600,197
  136,600,198
  136,602,443
  136,602,450
  136,602,468
  136,615,160
  136,629,055
  136,637,716
  136,637,746
  136,637,794
  136,638,053
  136,639,797
  136,639,819
  136,639,843
  136,640,130
  136,640,273
  136,640,375
  136,640,427
  136,640,615
  136,640,616
  136,640,620
  136,641,046
  136,641,227
  136,641,263
  136,641,388
  136,641,406
  136,641,690
  136,642,080
  136,642,089
  136,642,092
  136,642,147
  136,643,475
  136,643,867
  136,643,891
  136,643,969
  136,644,095
  136,644,256
  136,644,438
  136,644,913
  136,644,993
  136,645,302
  136,645,894
  136,645,931
  136,645,933
  136,646,331
  136,646,606
  136,646,623
  136,646,636
  136,646,682
  136,646,687
  136,646,689
  136,646,898
  136,647,166
  136,647,183
  136,647,668
  136,648,242
  136,649,919
  136,649,923
  136,652,030
  136,652,698
  136,652,820
  136,653,373
  136,653,706
  136,654,189
  136,654,607
  136,654,962
  136,655,127
  136,655,650
  136,655,678
  136,655,722
  136,655,888
  136,656,961
  136,656,965
  136,657,015
  136,657,085
  136,657,257
  136,657,310
  136,657,537
  136,657,661
  136,657,696
  136,657,767
  136,658,011
  136,658,020
  136,658,393
  136,658,667
  136,658,810
  136,659,010
  136,659,054
  136,659,067
  136,659,071
  136,659,101
  136,659,241
  136,659,282
  136,659,299
  136,659,387
  136,659,403
  136,659,404
  136,659,448
  136,659,451
  136,659,455
  136,659,468
  136,659,529
  136,659,622
  136,659,668
  136,659,725
  136,660,591
  136,660,689
  136,660,690
  136,660,810
  136,660,891
  136,661,351
  136,661,471
  136,661,574
  136,661,890
  136,661,922
  136,661,996
  136,661,997
  136,661,998
  136,662,000
  136,662,165
  136,662,184
  136,662,280
  136,662,399
  136,662,495
  136,662,593
  136,662,783
  136,663,095
  136,663,431
  136,663,740
  136,664,346
  136,664,411
  136,664,642
  136,664,968
  136,665,009
  136,666,041
  136,666,542
  136,666,762
  136,667,237
  136,667,403
  136,667,468
  136,667,523
  136,667,962
  136,668,259
  136,668,406
  136,671,661
  136,674,299
  136,675,038
  136,676,488
  136,676,703
  136,684,958
  136,685,766
  136,686,305
  136,686,435
  136,687,721
  136,690,548
  136,690,893
  136,692,241
  136,692,911
  136,693,711
  136,694,189
  136,695,320
  136,695,820
  136,697,437
  136,697,541
  136,699,719
  136,699,834
  136,700,051
  136,701,460
  136,701,474
  136,701,476
  136,701,478
  136,702,573
  136,703,006
  136,705,383
  136,707,618
  136,708,787
  136,710,265
  136,710,365
  136,711,400
  136,712,502
  136,713,012
  136,717,377
  136,718,970
  136,722,553
  136,722,609
  136,723,062
  136,723,651
  136,724,293
  136,725,270
  136,725,806
  136,725,931
  136,726,080
  136,726,448
  136,726,808
  136,727,425
  136,727,968
  136,727,989
  136,728,063
  136,729,492
  136,730,421
  136,731,820
  136,732,103
  136,732,348
  136,732,350
  136,733,097
  136,733,884
  136,733,941
  136,733,951
  136,734,951
  136,735,284
  136,736,462
  136,736,801
  136,737,479
  136,737,536
  136,737,545
  136,740,242
  136,740,244
  136,740,252
  136,740,431
  136,740,885
  136,741,265
  136,741,267
  136,741,471
  136,741,753
  136,741,768
  136,741,949
  136,742,505
  136,743,184
  136,745,297
  136,745,540
  136,745,718
  136,745,742
  136,746,238
  136,746,558
  136,747,032
  136,747,297
  136,749,142
  136,750,412
  136,750,537
  136,751,859
  136,751,970
  136,753,736
  136,755,359
  136,756,043
  136,757,153
  136,757,504
  136,757,939
  136,761,047
  136,761,066
  136,761,121
  136,762,179
  136,763,210
  136,766,339
  136,766,777
  136,768,263
  136,770,630
  136,770,865
  136,771,559
  136,771,816
  136,774,210
  136,774,997
  136,777,154
  136,777,163
  136,777,203
  136,783,125
  136,787,923
  136,790,106
  136,791,091
  136,792,721
  136,792,840
  136,793,821
  136,794,267
  136,794,920
  136,794,996
  136,795,532
  136,797,080
  136,797,721
  136,798,861
  136,799,351
  136,799,485
  136,801,487
  136,801,610
  136,801,657
  136,801,824
  136,801,867
  136,801,966
  136,802,069
  136,802,132
  136,802,140
  136,802,167
  136,802,197
  136,802,223
  136,803,587
  136,803,592
  136,803,695
  136,803,845
  136,804,308
  136,804,660
  136,804,712
  136,804,921
  136,804,922
  136,805,237
  136,805,271
  136,805,657
  136,808,643
  136,809,298
  136,811,573
  136,812,628
  136,813,340
  136,814,465
  136,816,207
  136,816,346
  136,818,290
  136,818,485
  136,818,518
  136,820,241
  136,820,678
  136,821,410
  136,821,645
  136,826,550
  136,826,936
  136,828,504
  136,828,606
  136,829,089
  136,829,489
  136,830,152
  136,830,672
  136,832,907
  136,832,958
  136,833,207
  136,834,156
  136,834,748
  136,836,813
  136,837,791
  136,837,792
  136,837,797
  136,838,424
  136,839,044
  136,840,541
  136,841,622
  136,842,108
  136,842,140
  136,842,591
  136,842,597
  136,843,512
  136,843,545
  136,845,491
  136,845,872
  136,849,075
  136,849,555
  136,849,972
  136,850,082
  136,850,576
  136,851,218
  136,852,706
C
T
A
G
T
G
G
T
T
C
T
C
G
A
G
A
A
C
G
A
C
A
T
C
C
T
C
G
C
T
T
T
C
A
T
G
G
A
G
C
A
G
G
G
C
T
T
T
T
G
A
T
A
G
G
G
C
T
C
G
G
A
G
G
T
T
G
C
C
A
T
T
T
A
A
T
T
T
G
C
A
T
T
C
G
A
A
G
G
A
C
A
A
T
T
A
G
G
C
A
C
T
G
T
A
G
T
T
C
T
G
T
G
C
T
A
T
G
G
C
G
G
G
C
G
G
T
A
T
G
T
A
A
C
G
G
T
G
C
A
T
T
T
T
G
T
T
C
T
A
G
G
A
G
T
C
G
G
C
T
G
A
A
G
G
G
T
G
C
A
T
C
C
C
C
G
G
C
C
A
A
T
C
T
T
A
G
C
G
A
A
T
C
G
C
C
A
G
T
T
A
G
C
G
A
A
A
A
A
C
C
T
G
A
G
A
C
A
A
C
G
C
T
T
G
G
G
A
T
G
G
G
G
A
C
C
G
T
A
C
T
T
A
T
T
G
A
A
A
C
G
G
A
T
A
T
C
A
C
G
A
C
A
T
C
A
G
A
C
C
G
G
G
A
G
T
G
T
T
T
T
A
A
G
C
T
T
G
A
T
A
A
C
G
G
C
G
C
T
C
G
G
T
T
G
T
T
A
T
C
A
C
G
T
C
C
T
G
A
A
A
T
G
A
T
A
G
T
T
A
T
A
T
C
T
T
C
A
T
G
T
G
C
T
C
G
C
T
G
C
G
G
T
C
C
G
T
G
T
T
G
A
C
G
T
T
A
T
G
T
A
C
G
T
G
G
T
T
G
G
C
T
T
C
G
A
G
T
A
T
A
C
C
A
G
G
A
T
G
C
T
G
A
T
C
G
C
G
A
A
T
A
G
G
C
C
A
C
G
C
T
G
C
A
A
C
C
C
G
A
G
T
C
G
C
G
G
T
A
A
A
A
G
A