Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 870,394 (bp)   Positions: 502
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.536
.219
.294
.246
.465
.427
--
.109
.836
.214
.694
.001
.0
.086
.0
.0
.0
.0
1.0
.002
.004
.0
.0
.001
.004
.021
.013
.004
.024
.001
.007
.01
.006
.005
.006
.016
.017
.009
.004
.004
.003
.003
.004
.02
.02
.001
.0
.002
.002
.007
.001
.003
.013
.0
.001
.003
.0
.0
.0
.005
.018
.069
.033
.04
.194
.412
.093
.055
.002
.001
.003
.002
.001
.0
.019
.063
.519
.613
--
--
--
.072
.017
.021
.258
.563
.09
.013
.018
.026
.007
.037
.027
.147
.117
.452
.346
.279
.164
.089
.001
.002
.0
.003
.382
.007
.007
.023
.025
.026
.0
.012
.119
.134
.096
.0
.0
.033
.037
.006
.007
.008
.003
.001
.0
.001
.003
.006
.0
.0
.003
.007
.026
.003
.009
.004
.002
.0
.002
.003
--
--
--
--
--
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.007
.003
.006
.008
--
--
--
--
--
.005
.016
.088
.012
.011
.003
.064
.003
.044
.01
.002
.003
.088
.002
.007
.158
.057
.28
.017
.006
.082
.004
.002
.003
.001
.001
.003
.003
.021
.094
.003
.005
.358
.34
.001
.011
.016
.033
.001
.002
--
--
--
.01
.001
.001
.013
.516
.004
.0
.0
.004
.0
.002
.182
.186
.183
.001
1.0
.0
.001
.003
.0
.002
.006
.048
.0
.008
.0
.001
.007
.011
.0
.675
.0
.002
.003
.0
.029
.774
.0
.002
.529
.003
.428
.038
.007
.012
--
--
--
.0
.0
.01
.023
.059
.005
.006
.336
.0
.027
.024
.001
.057
.008
.006
.004
.0
.003
.0
.001
.039
.0
.0
.013
.002
.003
.014
.029
.001
.0
.001
.836
.208
.002
.002
.006
.002
.001
.016
.018
.068
.005
.035
.007
.001
.088
.003
.005
.009
.012
.068
.019
.015
.002
.0
.017
.003
.003
.001
.002
.037
.007
.004
.039
.001
.002
.004
.0
.0
.005
.038
.051
.258
.01
.016
.004
.045
.004
.009
.004
.0
.001
.003
.003
.002
.008
.0
.0
.003
.001
.304
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.008
--
--
--
.02
.012
.002
.002
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.009
.007
.004
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.023
.041
.001
.003
.0
.0
.001
.011
.002
.001
.002
.001
.001
.003
.001
.003
.001
.0
.001
.026
.03
.029
.439
.79
.292
.256
.819
.046
.038
.039
.228
.42
.203
.003
--
--
--
.114
.002
.229
.397
.197
.468
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.014
.116
.081
.02
.007
.02
.013
.029
.007
.093
.003
.021
.014
.012
.009
.002
.007
.015
.07
.003
--
.001
.008
.008
.008
.002
.018
.0
.016
.0
.092
.547
.004
.001
.0
.02
.0
.0
.0
Nell1
Nell1
Nell1
Nell1
Nell1
Nell1
Nell1
Nell1
Nell1
Nell1
Nell1
Nell1
Nell1
Nell1
Nell1
Nell1
Nell1
Nell1
Nell1
Nell1
Nell1
Nell1
Nell1
Nell1
Nell1
Nell1
Nell1
Nell1
Nell1
Nell1
Nell1
Nell1
Nell1
Nell1
Nell1
Nell1
Nell1
Nell1
Nell1
Nell1
Nell1
Nell1
Nell1
Nell1
Nell1
Nell1
Nell1
Nell1
Nell1
Nell1
Nell1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
A
G
G
G
G
T
2
-
-
-
-
A
2
-
-
-
-
-
A
-
-
G
-
A
-
C
T
-
-
T
C
-
-
T
-
-
-
-
-
3
A
G
-
G
G
2
A
2
-
-
-
2
2
T
-
-
-
-
G
G
-
T
T
G
C
G
C
C
-
A
-
C
C
G
G
T
2
A
C
A
G
A
T
A
T
-
G
A
-
-
T
T
-
T
T
T
G
3
2
G
G
A
A
A
T
-
-
2
9
A
T
-
T
A
T
T
-
-
G
G
C
-
-
G
-
-
-
-
A
T
G
-
3
-
C
-
G
-
-
-
A
C
C
T
C
G
A
A
T
A
A
T
A
G
A
A
A
T
A
C
T
A
T
C
T
G
-
-
-
-
-
T
A
2
A
-
C
A
T
-
-
-
T
-
C
A
G
8
G
G
4
2
G
G
-
T
T
A
T
G
C
G
T
C
G
T
C
C
A
A
A
C
A
C
T
C
T
A
-
A
C
-
G
G
C
C
T
G
T
G
T
T
A
A
T
T
-
T
G
-
A
C
C
C
C
T
G
C
G
T
T
G
C
G
G
G
G
A
A
A
10
T
G
A
A
A
G
T
C
T
A
C
A
A
C
G
C
A
-
T
T
C
C
A
C
C
A
T
T
T
-
A
6
C
3
C
C
G
A
G
A
G
G
G
G
A
T
G
-
C
G
-
C
A
-
3
-
G
T
-
G
-
T
C
-
-
2
3
-
T
T
G
T
-
2
-
G
C
A
G
A
-
2
-
-
-
-
A
G
A
G
-
C
T
2
-
-
6
A
A
G
C
T
-
C
C
-
4
T
A
-
-
-
-
G
C
A
6
C
C
T
C
-
C
A
A
C
A
G
G
G
C
T
C
C
C
A
G
C
-
T
G
C
T
G
G
C
G
C
G
-
A
-
-
-
T
A
-
T
C
C
A
-
-
G
4
-
G
-
-
-
-
C
-
-
T
A
C
T
C
G
-
-
-
-
G
G
G
G
-
-
-
-
6
C
C
4
C
C
C
C
C
A
G
A
A
-
A
G
-
G
G
-
T
-
-
-
-
T
C
A
T
-
-
-
T
G
A
-
-
-
T
T
-
T
-
A
C
-
G
G
-
  105,400,792
  105,400,847
  105,400,887
  105,400,907
  105,400,949
  105,401,058
  105,429,899
  105,437,773
  105,437,777
  105,437,798
  105,437,844
  105,437,864
  105,437,871
  105,437,876
  105,437,895
  105,437,913
  105,437,919
  105,437,922
  105,438,028
  105,438,136
  105,438,139
  105,438,143
  105,438,147
  105,438,150
  105,440,311
  105,444,019
  105,444,020
  105,444,025
  105,444,030
  105,444,040
  105,444,047
  105,444,050
  105,444,058
  105,444,061
  105,444,064
  105,444,067
  105,444,074
  105,444,081
  105,444,092
  105,444,093
  105,444,102
  105,444,108
  105,444,114
  105,444,123
  105,444,141
  105,444,144
  105,444,148
  105,444,151
  105,444,155
  105,444,159
  105,444,163
  105,444,168
  105,444,176
  105,444,188
  105,444,193
  105,444,196
  105,444,202
  105,444,207
  105,444,208
  105,444,213
  105,444,220
  105,444,232
  105,444,242
  105,444,248
  105,444,253
  105,444,266
  105,444,271
  105,444,272
  105,444,287
  105,444,294
  105,444,310
  105,444,331
  105,444,341
  105,444,346
  105,444,352
  105,444,354
  105,444,361
  105,444,367
  105,452,006
  105,452,083
  105,452,120
  105,452,177
  105,452,267
  105,452,268
  105,452,309
  105,452,328
  105,452,356
  105,452,372
  105,452,375
  105,452,450
  105,452,535
  105,452,605
  105,452,624
  105,452,792
  105,452,854
  105,452,868
  105,454,853
  105,454,857
  105,454,870
  105,454,878
  105,455,404
  105,455,406
  105,455,415
  105,455,417
  105,463,369
  105,463,402
  105,463,411
  105,463,417
  105,463,423
  105,463,493
  105,463,506
  105,463,517
  105,463,535
  105,463,537
  105,463,547
  105,463,561
  105,463,566
  105,463,592
  105,463,644
  105,463,651
  105,463,658
  105,463,676
  105,463,691
  105,463,704
  105,463,711
  105,463,714
  105,463,729
  105,463,744
  105,463,764
  105,463,788
  105,463,795
  105,463,807
  105,463,814
  105,463,826
  105,463,832
  105,463,836
  105,463,837
  105,463,850
  105,463,854
  105,468,943
  105,483,869
  105,483,916
  105,483,929
  105,483,935
  105,483,947
  105,504,390
  105,515,447
  105,515,512
  105,515,537
  105,515,617
  105,515,626
  105,515,912
  105,533,263
  105,534,416
  105,534,474
  105,535,088
  105,535,542
  105,535,566
  105,535,600
  105,535,708
  105,535,792
  105,535,989
  105,536,029
  105,536,052
  105,536,059
  105,536,487
  105,543,017
  105,543,042
  105,543,050
  105,543,057
  105,543,152
  105,543,192
  105,543,209
  105,543,427
  105,543,430
  105,543,454
  105,543,458
  105,543,475
  105,543,491
  105,543,512
  105,543,538
  105,543,608
  105,548,007
  105,548,506
  105,548,520
  105,548,553
  105,548,554
  105,548,695
  105,548,717
  105,549,115
  105,549,853
  105,549,885
  105,550,154
  105,551,066
  105,551,236
  105,551,794
  105,552,822
  105,553,170
  105,553,196
  105,553,441
  105,557,790
  105,558,054
  105,558,057
  105,558,136
  105,558,383
  105,558,482
  105,558,499
  105,558,638
  105,558,641
  105,559,470
  105,559,535
  105,559,977
  105,560,571
  105,560,614
  105,560,776
  105,567,080
  105,568,915
  105,569,597
  105,582,981
  105,585,442
  105,585,450
  105,585,777
  105,585,952
  105,585,976
  105,586,175
  105,586,177
  105,586,451
  105,586,455
  105,586,767
  105,587,180
  105,587,185
  105,587,198
  105,588,372
  105,588,724
  105,589,038
  105,589,235
  105,589,539
  105,589,664
  105,589,684
  105,589,710
  105,589,994
  105,590,261
  105,590,509
  105,590,690
  105,590,886
  105,590,899
  105,591,147
  105,592,281
  105,592,452
  105,592,514
  105,592,646
  105,592,778
  105,592,870
  105,593,660
  105,593,764
  105,594,041
  105,594,193
  105,594,524
  105,594,783
  105,596,136
  105,597,284
  105,597,312
  105,600,235
  105,602,052
  105,602,054
  105,602,118
  105,602,575
  105,603,262
  105,605,041
  105,605,077
  105,605,237
  105,605,632
  105,605,857
  105,605,906
  105,606,249
  105,606,803
  105,607,130
  105,607,191
  105,607,945
  105,608,022
  105,608,282
  105,608,342
  105,608,681
  105,609,621
  105,609,682
  105,609,683
  105,609,686
  105,610,433
  105,610,471
  105,610,665
  105,611,352
  105,611,898
  105,612,487
  105,612,511
  105,612,529
  105,612,734
  105,614,287
  105,614,355
  105,614,538
  105,614,985
  105,615,026
  105,615,101
  105,615,434
  105,615,532
  105,638,461
  105,638,462
  105,663,159
  105,663,182
  105,663,207
  105,663,222
  105,663,261
  105,663,294
  105,663,317
  105,663,360
  105,663,386
  105,663,388
  105,663,435
  105,663,455
  105,663,464
  105,663,559
  105,663,565
  105,663,572
  105,663,579
  105,663,580
  105,663,607
  105,663,614
  105,664,113
  105,664,117
  105,687,993
  105,688,058
  105,702,405
  105,702,406
  105,702,411
  105,702,421
  105,702,428
  105,702,447
  105,702,454
  105,702,459
  105,702,465
  105,702,484
  105,702,489
  105,702,523
  105,702,528
  105,702,548
  105,702,550
  105,702,560
  105,702,562
  105,702,567
  105,702,576
  105,702,579
  105,702,588
  105,702,597
  105,702,601
  105,702,602
  105,702,624
  105,702,634
  105,730,661
  105,748,647
  105,750,484
  105,750,507
  105,750,521
  105,750,529
  105,750,531
  105,750,537
  105,750,544
  105,750,550
  105,750,666
  105,751,843
  105,751,873
  105,751,894
  105,751,946
  105,752,024
  105,752,062
  105,776,704
  105,776,711
  105,776,712
  105,776,781
  105,795,609
  105,807,916
  105,807,918
  105,807,991
  105,853,905
  105,855,336
  105,867,947
  105,867,958
  105,872,964
  105,876,989
  105,877,003
  105,877,017
  105,877,023
  105,879,057
  105,879,067
  105,879,072
  105,879,082
  105,879,095
  105,879,123
  105,879,132
  105,879,136
  105,966,709
  105,966,758
  105,976,095
  106,007,143
  106,007,165
  106,007,835
  106,007,984
  106,008,237
  106,008,393
  106,008,402
  106,008,417
  106,008,429
  106,020,752
  106,038,737
  106,038,765
  106,038,787
  106,038,805
  106,038,817
  106,038,908
  106,038,923
  106,038,999
  106,039,012
  106,039,026
  106,039,123
  106,039,158
  106,039,169
  106,039,245
  106,039,263
  106,039,283
  106,039,315
  106,039,319
  106,039,354
  106,039,410
  106,039,414
  106,039,418
  106,039,469
  106,039,473
  106,039,477
  106,039,526
  106,039,533
  106,039,556
  106,039,557
  106,039,560
  106,039,566
  106,039,614
  106,039,628
  106,045,597
  106,052,996
  106,053,214
  106,061,608
  106,061,623
  106,063,302
  106,063,312
  106,064,817
  106,064,820
  106,072,076
  106,072,091
  106,072,097
  106,072,102
  106,072,110
  106,072,115
  106,072,125
  106,072,133
  106,072,138
  106,072,155
  106,072,160
  106,072,167
  106,072,186
  106,072,191
  106,072,194
  106,072,204
  106,072,208
  106,072,214
  106,090,219
  106,090,572
  106,095,095
  106,106,534
  106,108,491
  106,108,492
  106,108,493
  106,150,987
  106,150,999
  106,151,004
  106,151,018
  106,159,700
  106,160,250
  106,165,533
  106,165,573
  106,165,574
  106,176,702
  106,176,744
  106,176,779
  106,176,806
  106,176,905
  106,176,999
  106,177,036
  106,177,082
  106,177,142
  106,177,506
  106,177,520
  106,191,947
  106,191,987
  106,191,991
  106,206,563
A/G
G/C
G/T
G/T
G/T
T/C
2/-
T
G
T
G
-
-
2
2
T
T
C
G
2
A
T
T
T
T
T
C
A
C
-
-
A
T
C
C
T
2
C
2
-
-
-
T
C
-
-
-
-
A
C
A
-
-
-
T
A
T
C
C
-
C
-
A
T
T
-
-
A
C
-
4
-
-
A
C
G
-
-
-
-
-
-
A
T
-
G
-
-
T
A
-
-
T
-
G
-
-
-
-
A
A
G
-
-
-
2
G
-
-
-
-
G
A
-
-
G
G
T
-
-
-
T
T
-
T
T
G
C
T
-
-
T
-
3
-
T
T
T
T
A
G
T
-
A
-
G/-
A/C
A/T
T/C
-
G
T/A
A/C
G/T
A/G
A/T
A/G
T/A
A/T
C/T
T/A
A/C
T/G
C/A
T/A
G/A
G
G
G
G
G
-
-
-
T
C
-
-
-
G
G
T
A
A
G
G
A
-
T
A
-
-
A
T
A
C
A
G
C
A
T
C
C
T
A
C
T
A
C
T
G
T
T
T
C
A
T/G
A/T
25
G
T
4
A
A
C/-
C/-
C
A
C
-
-
-
T
G
C
C
T
C
A
T
G
T
T
T
T
C
T
T
A
G
C
A
T
A
C
T
A
G
-
G
-
C
-
C
C
-
A
C
T
C
G
T
T
G
T
A
T
G
T
A
A
T
T
G
G
T
G
C
C
C
A
-
-
-
-
T
T
A
G
T
G
-
A
A
C
T
-
-
T
T
-
2
-
-
2
-
T
T
-
A
-
2
C
T
T
4
-
-
T
-
G
A
A
A
-
A
-
-
-
T
-
C
-
A
A
A
A
-
-
-
-
A
T
C
-
T
T
-
G
-
-
-
G
G
G
-
T
-
A
-
G
G
A
C
C
T
-
-
C/A
C/T
T/A
T
25
C/G
A/G
-
C/T
A/T
G/A
G/A
-
-
-
-
-
-
-
A
T
A
-
G/T
C/A
T/C
G/T
G/A
C/A
G/C
C/G
G/A
T
C
T
C
C
-
-
T
-
-
-
-
C
A
T
-
C
A
G
A
G
G
-
2
C
-
-
-
C
T
C
G
G
A
19
-
-
-
-
T
T
G
160
-
-
-
-
-
-
A
-
-
-
C
-
-
T
-
-
A
-
-
-/T
T/-
4
4
7
3
A
T
C
-
C
7
T
G
A
G
G
T
A
-
-
A
-
T
T
T
G
T
C
T