Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 254,282 (bp)   Positions: 259
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.046
.041
.085
.0
.001
.008
.006
.001
.001
.011
.003
.048
.027
.029
.057
.021
.04
.048
.036
.008
.001
.002
.008
.006
.002
.002
.01
.01
.567
.701
.13
.001
.013
.003
.021
.0
.01
--
--
.002
.003
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.058
.002
.0
.0
.003
.055
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.21
.201
.722
.593
.553
.096
.025
.003
.002
.006
.086
.549
.531
.058
.123
.123
.02
.008
.015
.022
.001
.029
.153
.045
.013
.178
.083
.078
.005
.001
.019
.011
.001
.055
.001
.0
.003
.045
.44
.768
.568
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.306
.025
.033
.088
.033
.073
.019
.011
.003
.006
.181
.327
.059
.076
.093
.157
.919
.825
.402
.129
.013
.288
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.261
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.175
.161
.06
.05
.019
.059
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.033
.783
.0
.997
.998
.895
.854
.86
.908
.928
.944
.96
.969
.999
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Ncoa1
Ncoa1
Ncoa1
Ncoa1
Ncoa1
Ncoa1
Ncoa1
Ncoa1
Ncoa1
Ncoa1
Ncoa1
Ncoa1
Ncoa1
Ncoa1
Ncoa1
Ncoa1
Ncoa1
Ncoa1
Ncoa1
Ncoa1
Ncoa1
Ncoa1
Ncoa1
Ncoa1
Ncoa1
Ncoa1
T
T
-
T
G
G
-
T
A
C
G
A
C
T
-
A
A
6
C
2
2
A
C
C
C
T
C
3
T
C
T
-
-
-
G
-
2
T
T
T
A
-
-
T
T
G
A
A
A
3
-
G
A
A
G
G
A
C
3
T
C
T
C
A
4
A
G
C
T
A
C
G
C
G
G
C
-
G
T
C
G
-
-
G
G
G
2
G
T
A
C
G
G
G
T
A
C
T
A
A
A
A
T
A
C
T
C
-
G
-
G
A
-
-
2
C
G
2
-
-
-
G
3
G
C
C
3
2
C
C
-
C
C
C
T
A
T
G
-
C
C
-
-
C
2
T
-
-
-
C
-
T
C
G
A
-
G
-
-
C
-
C
C
C
-
G
-
-
C
-
-
-
-
-
G
-
-
C
T
A
-
T
-
T
A
-
-
-
-
G
-
-
A
-
-
-
-
G
-
-
2
-
G
A
C
-
-
A
A
2
-
-
-
-
C
G
G
-
2
G
A
G
C
C
2
G
G
C
A
C
C
G
G
T
C
A
G
G
G
-
C
A
G
T
-
T
G
T
T
C
-
G
G
G
A
T
-
T
G
  28,687,599
  28,687,632
  28,687,676
  28,687,692
  28,687,693
  28,687,703
  28,687,707
  28,687,781
  28,687,782
  28,687,811
  28,687,816
  28,687,845
  28,687,866
  28,687,868
  28,687,883
  28,687,902
  28,687,936
  28,687,941
  28,687,953
  28,687,960
  28,687,966
  28,687,972
  28,687,982
  28,687,984
  28,687,988
  28,687,992
  28,688,012
  28,688,018
  28,688,032
  28,688,039
  28,728,574
  28,734,907
  28,735,922
  28,735,927
  28,736,004
  28,736,040
  28,738,147
  28,740,113
  28,740,219
  28,754,507
  28,754,512
  28,760,166
  28,761,707
  28,761,726
  28,776,789
  28,778,031
  28,778,033
  28,780,916
  28,781,198
  28,781,464
  28,781,468
  28,805,091
  28,805,160
  28,805,214
  28,805,628
  28,805,833
  28,805,838
  28,805,947
  28,805,956
  28,806,002
  28,806,351
  28,806,382
  28,806,383
  28,806,385
  28,806,391
  28,806,399
  28,807,961
  28,808,241
  28,809,630
  28,809,639
  28,809,640
  28,809,657
  28,809,659
  28,809,771
  28,809,869
  28,809,878
  28,809,895
  28,809,900
  28,809,966
  28,809,967
  28,810,326
  28,812,546
  28,812,554
  28,812,560
  28,812,564
  28,812,575
  28,823,663
  28,824,992
  28,824,993
  28,825,954
  28,826,959
  28,826,965
  28,826,973
  28,827,040
  28,827,588
  28,827,590
  28,827,600
  28,827,601
  28,827,609
  28,827,618
  28,827,619
  28,827,620
  28,827,633
  28,827,636
  28,839,178
  28,839,179
  28,839,188
  28,839,207
  28,839,209
  28,839,214
  28,839,219
  28,839,221
  28,839,228
  28,839,231
  28,839,236
  28,839,245
  28,839,247
  28,839,251
  28,839,261
  28,839,264
  28,839,275
  28,839,277
  28,839,284
  28,839,293
  28,839,420
  28,839,424
  28,839,431
  28,839,444
  28,839,448
  28,839,460
  28,839,465
  28,839,467
  28,839,477
  28,839,486
  28,839,493
  28,839,495
  28,839,502
  28,839,518
  28,839,527
  28,839,528
  28,839,529
  28,839,534
  28,839,547
  28,839,567
  28,839,581
  28,877,310
  28,878,705
  28,878,710
  28,878,714
  28,878,728
  28,878,733
  28,878,739
  28,878,740
  28,878,765
  28,878,772
  28,878,776
  28,878,789
  28,878,793
  28,878,794
  28,878,798
  28,878,803
  28,878,830
  28,878,838
  28,878,840
  28,878,845
  28,878,851
  28,878,857
  28,881,913
  28,881,921
  28,881,924
  28,881,938
  28,881,971
  28,882,051
  28,882,055
  28,882,110
  28,882,132
  28,882,145
  28,882,155
  28,882,157
  28,882,163
  28,882,170
  28,882,191
  28,882,208
  28,882,259
  28,882,274
  28,882,282
  28,882,307
  28,882,375
  28,882,401
  28,882,444
  28,882,483
  28,882,498
  28,882,523
  28,882,623
  28,882,639
  28,882,661
  28,882,703
  28,882,829
  28,882,961
  28,882,997
  28,883,006
  28,883,026
  28,883,082
  28,883,083
  28,883,090
  28,883,201
  28,883,258
  28,883,260
  28,883,297
  28,883,304
  28,883,371
  28,883,396
  28,883,494
  28,883,554
  28,883,605
  28,883,613
  28,883,615
  28,883,656
  28,883,741
  28,885,592
  28,885,594
  28,885,609
  28,885,612
  28,885,707
  28,885,734
  28,892,387
  28,894,012
  28,894,328
  28,894,796
  28,894,832
  28,895,076
  28,895,107
  28,895,136
  28,895,161
  28,895,171
  28,895,173
  28,895,177
  28,895,347
  28,895,355
  28,895,421
  28,895,559
  28,895,604
  28,895,741
  28,895,832
  28,895,877
  28,925,655
  28,929,995
  28,930,000
  28,930,017
  28,930,022
  28,930,025
  28,930,047
  28,930,060
  28,930,067
  28,930,069
  28,930,073
  28,930,077
  28,930,078
  28,930,182
-
-
A
C
T
-
C
A
C
-
-
-
-
-
C
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
A
G
G
G
-
T
-
G
-
-
-
13
8
G
C
G/T
A/C
A/G
C
3/-
-/G
G/A
A/G
A/C
G/A
G/C
A/G
C/G
3/-
T/C
C/T
T/C
C/T
A/C
4/-
A/G
G/A
C/T
T/C
A/G
C/T
G/A
C/T
G/A
G/A
C/T
-/2
G/A
T/G
C/T
G/C
T
C
-
T
T
2/-
G/T
T/C
A/C
C/G
G/A
G/A
G/T
T/C
A/G
C/G
T/G
A/G
A/G
A/G
A/G
T/C
A/G
T
C
-
2
T
T
-
T
A
T
-
-
A
-
T
T
A
T
-
T
-
-
-
-
T
-
T
T
A
-
A
T
-
-
6
A
T
A
T
-
-
-
T
T
T
T
T
G
T
-
-
T
T
T
T
-
T
-
-
T
C
-
3
A
-
2
A
A
G
G
-
2
T
T
C
-
C
-
G
A
-
A
A
A
A
-
A
G
-
T
T
C
C
-
T
T
-
G
T
G
-
2
A
-
-
-
T
C
G
G
-
-
A
G
-
-
G
T
-
-
-
G/A
A
C/T
A/G
C/T
C/A
G/A
G/T
T/C
C/G
A/G
G/A
T
T
-/2
C/G
A/T
G/C
T/A
-/4
A
A
-
A
A
G
T
-
-
-
-
G
A
T