Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 254,282 (bp)   Positions: 289
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.046
.041
.085
.0
.001
.008
.006
.001
.001
.011
.003
.048
.027
.029
.057
.021
.04
.048
.036
.008
.001
.002
.008
.006
.002
.002
.01
.01
.567
.701
--
.13
.001
.013
.003
.021
.0
.01
--
--
.002
.003
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.058
.002
.0
.0
.003
.055
--
--
--
--
--
.078
.044
.287
.21
.201
.722
.593
.553
.096
.025
.003
.002
.006
.086
.549
.531
.058
.123
.123
.02
.008
.015
.022
.002
.038
.009
.008
.007
.004
.002
.004
.0
.0
.001
.032
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.306
.025
.033
.088
.033
.073
.019
.011
.003
.006
.181
.327
.059
.076
.093
.157
.919
.825
.402
.129
.013
.288
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.261
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.175
.161
.06
.05
.019
.059
.12
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.033
.783
.0
.997
.998
.895
.854
.86
.908
.928
.944
.96
.969
.999
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Ncoa1
Ncoa1
Ncoa1
Ncoa1
Ncoa1
Ncoa1
Ncoa1
Ncoa1
Ncoa1
Ncoa1
Ncoa1
Ncoa1
Ncoa1
Ncoa1
Ncoa1
Ncoa1
Ncoa1
Ncoa1
Ncoa1
Ncoa1
Ncoa1
Ncoa1
Ncoa1
Ncoa1
Ncoa1
Ncoa1
Ncoa1
Ncoa1
Ncoa1
T
T
-
T
G
G
-
T
A
C
G
A
C
T
-
A
A
6
C
2
2
A
C
C
C
T
C
3
T
C
T
T
-
-
-
G
-
2
T
T
T
A
-
-
T
C
T
T
C
G
T
C
T
C
C
A
T
C
C
C
A
A
C
G
A
C
A
A
A
G
G
C
A
A
G
G
A
C
T
T
C
T
A
C
A
C
A
A
G
A
A
A
A
T
T
C
G
A
T
A
C
G
C
G
G
C
-
G
T
C
G
-
-
G
G
G
2
G
G
A
G
C
A
5
T
C
T
C
-
G
-
G
A
-
-
2
C
G
2
-
-
-
G
3
G
A
-
-
-
C
3
G
C
-
G
C
C
T
-
-
-
C
-
T
C
G
A
-
G
-
-
C
-
C
C
C
-
G
-
C
-
-
-
-
-
G
-
-
C
T
A
-
T
-
T
A
-
-
-
-
G
-
-
A
-
-
-
-
G
-
-
2
-
G
A
C
-
-
A
A
2
-
-
-
-
C
G
G
-
G
A
G
C
C
2
G
G
T
G
C
G
G
A
T
T
G
T
G
T
G
C
A
G
C
C
C
C
G
G
C
A
G
G
G
G
G
G
-
C
A
G
T
-
G
G
T
G
T
T
C
-
G
G
G
A
T
-
T
G
  28,687,599
  28,687,632
  28,687,676
  28,687,692
  28,687,693
  28,687,703
  28,687,707
  28,687,781
  28,687,782
  28,687,811
  28,687,816
  28,687,845
  28,687,866
  28,687,868
  28,687,883
  28,687,902
  28,687,936
  28,687,941
  28,687,953
  28,687,960
  28,687,966
  28,687,972
  28,687,982
  28,687,984
  28,687,988
  28,687,992
  28,688,012
  28,688,018
  28,688,032
  28,688,039
  28,726,261
  28,728,574
  28,734,907
  28,735,922
  28,735,927
  28,736,004
  28,736,040
  28,738,147
  28,740,113
  28,740,219
  28,754,507
  28,754,512
  28,760,166
  28,761,707
  28,761,726
  28,777,179
  28,777,195
  28,777,234
  28,777,250
  28,777,269
  28,777,463
  28,777,470
  28,777,482
  28,777,500
  28,777,510
  28,777,518
  28,777,532
  28,777,546
  28,777,561
  28,777,564
  28,777,569
  28,777,948
  28,777,975
  28,778,031
  28,778,033
  28,779,139
  28,780,755
  28,780,916
  28,781,198
  28,805,091
  28,805,121
  28,805,126
  28,805,127
  28,805,160
  28,805,498
  28,805,628
  28,805,838
  28,805,947
  28,806,002
  28,806,247
  28,806,351
  28,806,382
  28,806,385
  28,806,533
  28,806,543
  28,806,577
  28,806,691
  28,806,694
  28,806,705
  28,806,799
  28,806,951
  28,806,959
  28,807,523
  28,807,530
  28,808,067
  28,808,210
  28,808,645
  28,809,511
  28,809,630
  28,809,639
  28,809,640
  28,809,657
  28,809,659
  28,809,771
  28,809,869
  28,809,878
  28,809,895
  28,809,900
  28,809,966
  28,809,967
  28,810,326
  28,812,546
  28,812,554
  28,812,560
  28,812,564
  28,812,575
  28,823,663
  28,824,887
  28,827,040
  28,827,529
  28,827,539
  28,827,542
  28,833,821
  28,839,131
  28,839,139
  28,839,178
  28,839,179
  28,839,188
  28,839,207
  28,839,209
  28,839,214
  28,839,219
  28,839,221
  28,839,228
  28,839,231
  28,839,236
  28,839,245
  28,839,247
  28,839,251
  28,839,261
  28,839,264
  28,839,275
  28,839,277
  28,839,284
  28,839,293
  28,839,319
  28,839,336
  28,839,349
  28,839,350
  28,839,352
  28,839,359
  28,839,367
  28,839,373
  28,839,387
  28,839,392
  28,839,394
  28,874,454
  28,877,310
  28,878,705
  28,878,710
  28,878,714
  28,878,728
  28,878,733
  28,878,739
  28,878,740
  28,878,765
  28,878,772
  28,878,776
  28,878,789
  28,878,793
  28,878,794
  28,878,798
  28,878,803
  28,878,830
  28,878,838
  28,878,840
  28,878,845
  28,878,851
  28,878,857
  28,881,921
  28,881,924
  28,881,938
  28,881,971
  28,882,051
  28,882,055
  28,882,110
  28,882,132
  28,882,145
  28,882,155
  28,882,157
  28,882,163
  28,882,170
  28,882,191
  28,882,208
  28,882,259
  28,882,274
  28,882,282
  28,882,307
  28,882,375
  28,882,401
  28,882,444
  28,882,483
  28,882,498
  28,882,523
  28,882,623
  28,882,639
  28,882,661
  28,882,703
  28,882,829
  28,882,961
  28,882,997
  28,883,006
  28,883,026
  28,883,082
  28,883,083
  28,883,090
  28,883,201
  28,883,258
  28,883,260
  28,883,297
  28,883,304
  28,883,371
  28,883,396
  28,883,494
  28,883,554
  28,883,605
  28,883,613
  28,883,615
  28,883,656
  28,885,592
  28,885,594
  28,885,609
  28,885,612
  28,885,707
  28,885,734
  28,891,676
  28,892,215
  28,892,216
  28,892,387
  28,892,407
  28,893,323
  28,893,351
  28,893,674
  28,893,708
  28,893,746
  28,894,745
  28,894,757
  28,894,778
  28,894,786
  28,894,799
  28,894,800
  28,894,808
  28,894,810
  28,894,824
  28,894,948
  28,895,076
  28,895,086
  28,895,148
  28,895,159
  28,895,171
  28,895,173
  28,895,177
  28,895,232
  28,895,233
  28,895,347
  28,895,355
  28,895,385
  28,895,421
  28,895,559
  28,895,604
  28,895,741
  28,895,832
  28,895,877
  28,895,964
  28,895,982
  28,925,655
  28,929,995
  28,930,000
  28,930,017
  28,930,022
  28,930,025
  28,930,047
  28,930,060
  28,930,067
  28,930,069
  28,930,073
  28,930,077
  28,930,078
  28,930,182
-
-
A
C
T
-
C
A
C
-
-
-
-
-
C
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
C
A
G
G
G
-
T
-
G
-
-
-
13
8
G
T
T/-
T/A
C/A
G/T
T/G
C/T
T/C
C/A
C/T
A/G
T/C
C/G
C/T
C/T
A/C
A/C
C/T
G/T
A/C
T
A/G
A/G
C
G/A
G/A
C/T
A/G
A/G
G/C
G/A
A/G
C/G
T/C
T/C
C/T
T/C
A/C
C/T
A/C
C/T
A/C
A/T
G/A
A/G
A/G
A/C
A/G
T/C
T/C
C/T
G/C
A/G
T/C
A/G
C/T
G/A
C/T
G/A
G/A
C/T
-/2
G/A
T/G
C/T
G/C
T
C
-
T
T
2/-
G/A
G/T
A/T
G/C
C/A
A/-
-
-
T
C
-
2
T
T
-
T
A
T
-
-
A
-
T
T
A
T
-
T
-
C
A
A
A
-
-
-
A
-
-
G
-
T
T
T
T
T
G
T
-
-
T
T
T
T
-
T
-
-
T
C
-
3
-
2
A
A
G
G
-
2
T
T
C
-
C
-
G
A
-
A
A
A
A
-
A
G
-
T
T
C
C
-
T
T
-
G
T
G
-
2
A
-
-
-
T
C
G
G
-
-
A
G
-
G
T
-
-
-
G/C
C
C
G/A
C/T
G/T
G/T
A/T
T/A
T/C
G/A
T/A
G/T
T/G
G/A
C/T
A/G
G/A
C/A
C/G
C/A
C/A
G/A
G/A
C/G
A/G
G/A
G/A
G/A
T
T
G/C
-/2
C/G
A/T
G/C
T/A
-/4
G/A
G/T
A
A
-
A
A
G
T
-
-
-
-
G
A
T