Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 59,983 (bp)   Positions: 364
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.881
.048
.003
.0
.004
.003
.002
.0
.998
.999
.0
.0
.024
.028
.011
.046
.064
.006
.015
.063
.009
.011
.015
.858
--
--
--
--
--
--
--
--
.241
.007
.0
.402
.039
.769
.852
.841
.569
.006
.01
.328
.27
.05
--
.155
.001
.013
.067
.176
.0
.002
.005
.072
.003
.996
.019
.012
.001
.002
.006
.157
.099
.123
.212
.004
.002
.005
.009
.017
.301
.002
.01
.0
.001
.0
.085
.007
.001
.009
.002
.008
.361
1.0
1.0
.999
1.0
1.0
.998
1.0
.992
1.0
1.0
1.0
1.0
.991
.045
.002
.0
.037
.013
.0
.002
.001
.006
.0
.001
.005
.467
.017
.004
.011
.03
.033
.037
.001
.002
.0
.001
.037
.015
.003
.002
.676
.509
.56
.581
.0
.0
.004
.001
.003
.048
.01
.009
.004
.03
.039
.53
.025
.029
.009
.002
.0
.001
.728
.243
.778
.226
.003
--
.082
.07
.037
.107
.068
.017
--
.243
.35
.392
.039
.716
.207
.032
--
.179
.011
.052
.04
.706
.016
.002
.008
.474
.729
.012
.031
.001
.033
.029
.001
.034
.039
.005
--
.025
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.453
--
--
.497
.187
.001
.726
.171
.365
.053
.045
.344
.025
.131
.116
.028
.033
.02
.222
.289
.281
.041
.303
.652
.022
.046
.03
.02
.014
.006
.007
.024
.09
.308
.317
.011
.042
.006
.13
.019
.006
.003
.021
.244
.702
.455
.042
.013
.156
.727
.985
.027
.016
.025
.906
.083
.003
.012
.056
.18
.741
.315
.155
.164
.04
.011
.027
.007
--
--
--
.002
.007
.326
.208
.203
.232
.222
.211
.109
.106
.037
.002
.003
.009
.008
.007
.034
.541
.218
.007
--
.785
.535
.888
.034
.066
.344
.16
.16
.625
.099
.048
.001
.0
.0
.023
.003
.015
.0
.0
.001
.0
.009
.006
.044
.007
.0
.036
.112
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Nck1
Nck1
Nck1
Nck1
Nck1
Nck1
Nck1
Nck1
Nck1
Nck1
Nck1
Nck1
Nck1
Nck1
Nck1
Nck1
Nck1
Nck1
Nck1
Nck1
Nck1
Nck1
Nck1
Nck1
Nck1
Nck1
Nck1
Nck1
Nck1
Nck1
Nck1
Nck1
Nck1
Nck1
Nck1
Nck1
Nck1
C
T
T
A
-
C
T
-
C
G
T
T
G
A
T
C
G
2
A
T
T
G
A
G
A
G
T
A
T
T
G
T
A
C
C
-
T
-
A
A
-
T
G
4
-
-
A
T
G
G
T
-
A
G
T
A
T
T
A
A
C
A
T
A
C
C
A
-
T
3
-
G
T
-
T
-
2
G
-
T
T
T
2
G
G
-
-
C
T
-
T
-
T
-
-
C
2
-
3
A
C
C
-
-
-
-
-
3
C
-
A
T
C
G
-
-
A
-
-
G
-
-
T
C
-
-
-
-
T
-
-
-
A
T
-
-
G
T
T
A
2
T
C
-
2
-
T
G
-
A
C
A
A
-
-
8
5
8
9
G
-
G
-
T
-
G
C
-
C
A
-
A
A
C
-
39
-
-
-
T
G
T
A
C
C
C
-
4
-
-
G
A
G
C
C
G
G
C
A
T
A
C
T
C
G
C
T
A
G
-
G
75
A
-
-
A
5
A
C
-
C
C
-
G
T
A
A
A
T
T
G
G
C
A
T
-
T
T
T
A
G
T
A
A
A
C
A
C
C
T
G
A
-
T
G
T
A
A
A
T
T
A
G
A
A
T
G
A
-
A
C
T
T
-
-
A
-
T
-
T
G
C
-
C
-
-
-
A
-
-
-
T
-
-
-
-
-
-
-
T
T
-
A
A
A
A
-
C
T
7
119
G
G
T
C
G
C
-
A
A
G
-
A
A
T
A
G
G
A
A
G
-
T
A
A
A
T
G
A
G
G
G
G
A
T
G
C
T
C
G
-
C
A
G
G
T
C
A
4
-
8
T
T
T
  108,788,213
  108,789,221
  108,789,486
  108,790,027
  108,790,195
  108,790,252
  108,790,313
  108,790,519
  108,790,971
  108,791,124
  108,791,579
  108,791,752
  108,792,059
  108,792,092
  108,792,176
  108,792,192
  108,792,226
  108,792,701
  108,792,800
  108,792,861
  108,792,904
  108,792,905
  108,792,988
  108,793,210
  108,793,486
  108,793,582
  108,793,610
  108,793,612
  108,793,621
  108,793,648
  108,793,829
  108,793,832
  108,793,990
  108,794,588
  108,794,601
  108,794,755
  108,794,946
  108,795,249
  108,795,274
  108,795,275
  108,795,298
  108,795,466
  108,795,491
  108,795,550
  108,795,599
  108,795,639
  108,796,004
  108,796,207
  108,796,910
  108,797,245
  108,797,341
  108,797,369
  108,797,899
  108,798,692
  108,798,746
  108,798,823
  108,799,249
  108,799,501
  108,799,562
  108,799,564
  108,799,652
  108,799,937
  108,800,677
  108,801,025
  108,801,034
  108,801,041
  108,801,053
  108,801,083
  108,801,085
  108,801,091
  108,801,097
  108,801,111
  108,801,129
  108,801,166
  108,801,179
  108,801,184
  108,801,208
  108,801,231
  108,801,273
  108,801,279
  108,801,283
  108,801,285
  108,801,329
  108,801,332
  108,801,338
  108,801,342
  108,801,359
  108,801,399
  108,801,402
  108,801,416
  108,801,450
  108,801,454
  108,801,476
  108,801,489
  108,801,490
  108,801,496
  108,801,518
  108,801,586
  108,801,646
  108,801,693
  108,801,697
  108,801,722
  108,801,738
  108,801,746
  108,801,834
  108,801,844
  108,801,857
  108,801,864
  108,801,890
  108,801,904
  108,801,951
  108,801,969
  108,801,972
  108,802,011
  108,802,019
  108,802,020
  108,802,048
  108,802,082
  108,802,138
  108,802,149
  108,802,155
  108,802,170
  108,802,185
  108,802,204
  108,802,208
  108,802,247
  108,802,256
  108,802,261
  108,802,263
  108,802,303
  108,802,393
  108,802,400
  108,802,459
  108,802,629
  108,802,676
  108,802,708
  108,802,710
  108,802,714
  108,802,753
  108,802,755
  108,802,771
  108,802,783
  108,802,808
  108,802,816
  108,802,825
  108,802,830
  108,802,842
  108,802,899
  108,803,330
  108,803,744
  108,803,883
  108,804,245
  108,804,698
  108,805,287
  108,805,289
  108,805,294
  108,805,305
  108,805,312
  108,805,324
  108,806,367
  108,806,928
  108,806,950
  108,806,960
  108,807,412
  108,807,478
  108,807,707
  108,807,759
  108,808,805
  108,808,976
  108,809,143
  108,809,181
  108,809,194
  108,809,398
  108,809,528
  108,810,317
  108,810,568
  108,810,849
  108,811,504
  108,811,779
  108,811,872
  108,811,978
  108,812,005
  108,812,082
  108,812,133
  108,812,535
  108,812,536
  108,813,090
  108,813,310
  108,813,320
  108,813,427
  108,813,575
  108,813,590
  108,813,783
  108,813,818
  108,814,182
  108,814,251
  108,814,318
  108,814,450
  108,814,861
  108,814,886
  108,815,152
  108,815,418
  108,815,513
  108,815,520
  108,815,525
  108,815,639
  108,815,739
  108,815,788
  108,816,017
  108,816,097
  108,816,263
  108,816,397
  108,816,924
  108,817,016
  108,817,136
  108,817,137
  108,817,184
  108,817,278
  108,817,552
  108,817,636
  108,817,732
  108,818,143
  108,818,561
  108,818,569
  108,818,768
  108,819,036
  108,819,142
  108,819,171
  108,819,324
  108,819,363
  108,819,470
  108,819,858
  108,819,880
  108,819,884
  108,820,366
  108,820,671
  108,820,712
  108,820,902
  108,821,678
  108,821,829
  108,822,503
  108,823,087
  108,823,390
  108,823,423
  108,824,726
  108,825,155
  108,825,499
  108,825,928
  108,826,291
  108,826,431
  108,826,510
  108,826,780
  108,826,901
  108,826,944
  108,826,972
  108,827,423
  108,827,487
  108,827,739
  108,828,202
  108,828,973
  108,829,155
  108,829,518
  108,829,957
  108,830,025
  108,830,026
  108,830,098
  108,830,197
  108,830,443
  108,830,946
  108,831,171
  108,831,176
  108,831,179
  108,831,182
  108,831,187
  108,831,191
  108,831,196
  108,831,207
  108,831,220
  108,831,226
  108,831,243
  108,831,256
  108,831,309
  108,831,434
  108,831,452
  108,831,455
  108,831,459
  108,831,478
  108,831,569
  108,831,675
  108,831,799
  108,831,883
  108,832,047
  108,832,055
  108,832,149
  108,832,189
  108,832,281
  108,832,330
  108,832,331
  108,832,354
  108,832,614
  108,832,675
  108,832,959
  108,833,087
  108,833,279
  108,833,784
  108,833,957
  108,834,034
  108,834,047
  108,834,328
  108,834,578
  108,834,586
  108,834,704
  108,835,233
  108,835,350
  108,835,496
  108,835,801
  108,835,899
  108,836,603
  108,836,622
  108,836,623
  108,836,631
  108,836,633
  108,836,636
  108,836,650
  108,836,651
  108,836,658
  108,836,670
  108,836,671
  108,836,676
  108,836,679
  108,836,693
  108,838,579
  108,838,826
  108,838,891
  108,839,148
  108,840,807
  108,841,254
  108,841,287
  108,841,320
  108,841,515
  108,841,521
  108,841,603
  108,841,623
  108,841,635
  108,842,036
  108,842,498
  108,842,812
  108,842,924
  108,843,149
  108,843,340
  108,843,590
  108,843,704
  108,843,898
  108,844,130
  108,844,551
  108,844,622
  108,845,045
  108,845,191
  108,845,196
  108,845,369
  108,845,750
  108,846,248
  108,846,289
  108,847,008
T
C
C
T
A
T
A
4
T
A
G
C
T
C
C
G
C
-
G
A
C
A
G
C
G
A
A
G
G
-
A
C
T
T
G
2
C
G
-
G
A
C
A
-
12
6
G
C
A
A
C
2
G
A
A
C
C
C
T
G
T
G
C
A/G
C/A
C/T
A/G
-/A
T/C
3/-
-/2
-
-
A
-
C
-
-
A
-
-
-
-
A
-
C
C
T
C
G
-
C
G
C
C
-
-
C
-
-
-
-
T
T
A
G
T
-
A
A
-
-
-
-
G
A
-
T
G
-
C
A
A
-
2
A
C
T
A
C
C
A
-
G
C
2
C
C
A
T
-
-
-
C
-
A
-
C
-/T
C
T
G
G
6
12
-
-
-
-
A
T
A
4
C
A
A
G
A
G
G
A
-
G
T
A
39/-
T
2
3
C
-
A
T
T
G
G
4
-
2
2
T
G
C
A
G
A
A
T
G
C
C
T
A
A
A
A
C
G
C
C
G/T
-
G
A
3
C
-
G
T
A
T
A
2
A
C
T
G
G
C
C
T
A
T
G
G
G
C
C
C
G
-
A
T
-
C
T
C
T
T
C
A
C
5
C
A
C
G
C
G
C
G
T
A
T
G
C
A
G
6
-
-
G
G
T
C
-
T
-
C
G
-
A
T
-
A
C
T
-
A
C
T
C
T
C
A
T
T
C
A
C
C
T
G
T
C
G
T
T
C
-
119/-
C
A
G
T
A
A
A
G
T
C
G
C
C
A
G
A
C
G
T
A
2
C
C
C
G
C
A
G
C
C
A
A
G
C
A
T
G
T
T
5
T
G
-
A
-
A
G
-
2
-
A
-
C