Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 1,035,142 (bp)   Positions: 192
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
BN/NHsdMcwi (2020) 
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.04
--
--
--
--
--
.161
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.039
.003
--
.001
.087
.004
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.008
.006
.018
.006
.004
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.02
.031
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.006
.323
--
--
--
--
--
--
.001
.003
.005
.099
.003
1.0
--
--
--
.007
1.0
.156
.146
.149
.02
.022
.027
.021
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.004
--
--
--
--
.018
.008
.001
.001
.001
.0
.001
.015
.005
.002
.002
.002
.021
.004
.003
.005
.09
.03
.042
--
--
--
--
.034
--
--
--
--
--
.001
Ncam2
Ncam2
Ncam2
Ncam2
Ncam2
Ncam2
Ncam2
Ncam2
Ncam2
Ncam2
Ncam2
Ncam2
Ncam2
Ncam2
Ncam2
Ncam2
Ncam2
Ncam2
Ncam2
Ncam2
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
2
C
G
T
-
A
A
-
-
-
A
T
T
G
T
C
-
A
T
-
2
-
C
2
-
3
2
-
-
T
T
T
T
C
C
G
T
C
C
T
-
A
T
A
-
C
C
A
2
-
C
A
C
A
G
G
A
G
A
-
G
A
G
G
C
T
2
C
2
G
A
-
-
T
-
-
T
-
-
-
-
T
G
T
-
-
T
G
G
G
-
G
2
T
G
A
A
C
G
G
G
C
G
C
T
A
2
-
-
-
T
C
G
C
C
G
A
C
-
C
G
C
A
T
A
G
-
A
-
-
-
T
G
T
T
A
T
C
T
-
A
C
A
A
G
G
C
G
C
C
A
-
T
T
C
-
C
T
-
G
113
G
T
-
A
C
-
G
-
T
T
T
A
-
6
-
-
2
-
T
A
-
-
A
G
2
G
C
T
G
G
T
  19,698,799
  19,698,807
  19,698,830
  19,698,831
  19,699,414
  19,699,415
  19,699,442
  19,699,462
  19,699,481
  19,701,305
  19,719,026
  19,719,028
  19,719,032
  19,719,034
  19,719,041
  19,719,044
  19,720,923
  19,724,265
  19,724,314
  19,727,125
  19,727,133
  19,727,140
  19,727,156
  19,729,557
  19,731,729
  19,731,731
  19,731,735
  19,731,738
  19,771,501
  19,772,495
  19,772,557
  19,772,578
  19,772,604
  19,787,978
  19,787,983
  19,787,986
  19,788,006
  19,788,024
  19,788,038
  19,807,420
  19,807,423
  19,812,870
  19,819,207
  19,819,218
  19,819,283
  19,819,311
  19,819,662
  19,819,740
  19,830,685
  19,832,505
  19,832,575
  19,832,652
  19,834,788
  19,836,239
  19,836,250
  19,836,264
  19,836,318
  19,836,323
  19,836,324
  19,836,332
  19,913,884
  19,933,141
  19,933,152
  19,933,170
  19,933,202
  19,933,288
  19,933,316
  19,933,336
  19,949,879
  19,954,228
  19,954,408
  19,954,458
  19,954,472
  19,954,659
  19,954,854
  19,954,879
  19,954,929
  19,954,936
  19,954,943
  19,954,952
  19,954,968
  19,955,282
  19,955,283
  19,955,297
  19,955,485
  19,962,598
  19,977,473
  19,977,478
  19,977,485
  19,977,490
  19,984,231
  19,997,768
  19,998,910
  20,004,928
  20,006,270
  20,006,292
  20,006,295
  20,006,303
  20,006,307
  20,006,310
  20,006,313
  20,006,319
  20,006,321
  20,006,327
  20,006,328
  20,006,331
  20,051,402
  20,061,926
  20,064,285
  20,066,796
  20,082,518
  20,083,115
  20,083,151
  20,083,530
  20,084,521
  20,084,576
  20,084,586
  20,084,589
  20,107,805
  20,137,674
  20,137,701
  20,137,705
  20,137,706
  20,137,710
  20,137,711
  20,137,722
  20,141,910
  20,167,271
  20,199,930
  20,208,230
  20,210,856
  20,217,205
  20,285,792
  20,285,866
  20,285,868
  20,304,796
  20,308,556
  20,313,161
  20,313,170
  20,313,356
  20,318,547
  20,318,549
  20,318,551
  20,318,555
  20,318,582
  20,318,602
  20,318,646
  20,318,649
  20,318,665
  20,318,672
  20,318,677
  20,318,685
  20,318,688
  20,318,704
  20,318,715
  20,318,720
  20,318,724
  20,357,534
  20,357,555
  20,357,559
  20,357,572
  20,451,809
  20,510,804
  20,510,868
  20,510,891
  20,510,892
  20,510,913
  20,510,919
  20,510,926
  20,510,945
  20,510,975
  20,511,000
  20,511,003
  20,511,006
  20,511,030
  20,511,059
  20,511,066
  20,513,096
  20,519,722
  20,521,302
  20,614,844
  20,618,178
  20,618,405
  20,618,408
  20,622,258
  20,656,544
  20,677,316
  20,677,321
  20,677,337
  20,678,772
  20,678,790
  20,685,040
-
-
T
G
C
C
-
A
A
T
A/C
T/A
T/C
G/A
T/C
C/T
2
G
C
T
-
T
-
2/-
16
-
-
2
19
T/C
T/G
T/G
C
C/G
C/A
G/A
T/C
C/T
C/T
C
16
A/-
-
-
C
-
-
C
2/-
-/T
C/G
A/T
C/T
T
T
T
C
A
C
T
-
-
-
T
-
-
-
T
2/-
-
-
T
T
-
2
2
-
A
T
T
T
G
T
-
T
-/A
-
-
-
C/AC
3
C
2/-
T/A
C
T
G
T
A
A
T
G
A
T
A
T
-
3
2
T
T/G
C/A
G/A
C/A
A
T
G
A
180
T
A
T
G
C
C
A
C
-
C
G
2
-
C
A
A
-
T/-
-
-
50
T
T
T
T
A
C
T
T
T
T
C
5
C
A
T
C
T
-
A
-
-
T
-
2
C
A
T
A
T
-
-
-
-
A
-
C
4
2/-
-/A
T/-
T
G
T
-
A
2/-
T
T
A
-
A
-