Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 365,790 (bp)   Positions: 544
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.043
.0
.0
.975
.0
.188
.052
.01
.103
.324
.001
.013
.087
.003
.107
.001
.006
.998
.011
.0
.0
.981
.0
.0
.006
.001
.001
.02
.005
.001
.001
.002
.037
.0
.001
.0
.03
.0
.004
.182
.0
.0
.644
.979
.0
.0
.005
.0
.001
.002
.031
.0
.163
.004
.015
.0
.002
.0
.101
.0
.002
.002
.001
.0
.03
.001
.001
.0
.0
.002
.0
.002
.001
.0
.0
.003
.012
.001
.817
.021
.001
.0
.0
.0
.0
.001
.0
.0
.026
.001
.165
.182
.0
.033
.0
.0
.012
.001
.016
.003
.014
.033
.0
.0
.002
.0
.0
.019
.0
.0
.0
.012
.0
.0
.0
.0
.0
.019
.009
.001
.143
.015
.001
.002
.0
.001
.001
.003
.036
.106
.017
.0
.001
.003
.143
.007
.002
.005
.009
.036
.008
.065
.001
.039
.015
.02
.002
.004
.001
.004
.015
.135
.0
.006
.001
.845
.898
.0
.033
.0
.0
.0
.001
.005
.0
.0
.0
.026
.06
.004
.0
.378
.445
.02
.003
.0
.001
.856
.002
.002
.009
.001
.001
.0
.019
.012
.002
.867
.005
.931
--
.002
.0
--
--
--
--
--
.003
.013
.05
.434
.0
.055
.0
.001
.015
.0
.0
.0
.01
.011
.292
.0
.004
.002
.0
.071
.002
.0
.06
.001
.0
.0
.015
.003
.0
.0
.001
.0
.001
.005
.0
.001
.002
.002
.015
.458
.0
.019
.002
.004
.001
.012
.0
.0
.005
.0
.0
.008
.115
.001
.276
.0
.0
.003
.001
.001
.0
.005
.548
.011
.001
.006
.397
.178
.299
.195
.028
.309
.545
.22
.01
.001
.458
.001
.038
.01
.014
.018
.008
.0
.001
.006
.003
.0
.0
.0
.033
.0
.002
.559
.029
.245
.004
.0
.0
.03
--
--
--
--
--
.012
.925
.009
.003
.903
.0
.002
.0
.003
.0
.049
--
.0
.002
.0
.0
.002
.003
--
.051
.139
.109
.003
.37
.0
.005
.598
.007
.0
.0
.004
.076
.036
.0
.005
.0
.005
.069
.014
.0
--
.006
.008
.002
.0
.134
.003
.0
.001
.004
.006
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.015
.993
.012
.001
.0
.0
.004
.012
.005
.006
.06
.01
.001
.0
.001
.0
.001
.958
.004
.001
.0
.016
.006
.001
.052
.04
.001
.009
.001
.002
.029
.008
.001
.0
.004
.001
.001
.006
.012
.0
.002
.0
.01
.0
.002
.0
.011
.995
.004
.011
.0
.0
.001
.009
.022
.0
.001
.013
.001
.018
.005
.0
.0
.0
.0
.0
.001
.001
.012
.002
.004
.0
.0
.002
.001
.03
.004
.014
.018
.015
.01
.021
.503
.472
.535
.091
.032
.0
.033
.0
.001
.0
.0
.059
.011
.002
.006
.014
.006
.019
.001
.004
1.0
.0
.0
.0
.007
.011
.0
.0
.001
.01
.032
.0
1.0
.0
.001
.0
.006
.009
.004
.002
.077
.003
.002
.002
.004
.001
.001
.001
.006
.998
.0
.0
.0
.001
.0
.003
.0
.0
.787
.0
.0
.0
.0
.005
.0
.001
.001
.006
.0
.002
.0
.0
.0
.0
.001
.0
.0
.0
1.0
.989
.0
.002
.0
.0
.01
.004
.001
.023
.007
.0
.0
.0
.002
.007
.0
.283
.004
.997
.996
1.0
.745
Nav2
Nav2
Nav2
Nav2
Nav2
Nav2
Nav2
Nav2
Nav2
Nav2
Nav2
Nav2
Nav2
Nav2
Nav2
Nav2
Nav2
Nav2
Nav2
Nav2
Nav2
Nav2
Nav2
Nav2
Nav2
Nav2
Nav2
Nav2
Nav2
Nav2
Nav2
Nav2
Nav2
Nav2
Nav2
Nav2
Nav2
Nav2
Nav2
Nav2
Nav2
Nav2
Nav2
Nav2
Nav2
Nav2
Nav2
Nav2
Nav2
Nav2
Nav2
Nav2
Nav2
Nav2
Nav2
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
C
C
T
A
G
T
T
G
C
C
G
G
A
G
G
G
C
C
A
G
G
C
T
T
A
C
G
G
A
G
T
A
T
C
A
C
C
T
G
G
C
A
T
A
C
G
A
A
A
C
G
C
C
G
A
T
G
C
T
G
A
T
T
G
T
C
G
C
G
T
C
A
A
C
T
G
T
A
C
A
A
G
C
G
C
C
C
A
C
G
A
C
A
C
G
C
G
A
T
C
A
T
A
G
T
G
G
C
A
T
A
T
C
G
A
C
T
G
T
C
A
A
T
T
A
G
A
A
C
A
A
T
A
C
G
T
G
T
C
A
A
C
T
G
T
G
A
G
A
C
A
T
A
T
A
C
C
A
G
T
T
G
A
A
G
C
G
T
T
C
A
T
G
A
C
C
G
G
G
C
C
A
C
C
T
T
T
T
A
G
G
A
C
A
G
C
C
G
C
C
G
G
C
T
T
C
A
A
A
G
T
G
T
T
T
T
T
T
G
A
C
C
C
G
T
C
C
A
G
G
A
C
C
T
T
A
T
T
T
C
T
G
C
A
G
C
C
T
A
A
T
G
A
C
A
G
A
T
G
T
G
A
A
T
A
C
G
G
T
T
C
G
C
G
G
T
G
C
C
G
G
T
T
T
G
G
C
G
T
A
G
G
A
G
A
A
G
A
A
A
A
T
A
T
T
C
G
C
A
C
T
T
C
A
G
C
T
T
A
C
C
T
T
T
T
G
G
A
A
C
T
A
A
T
A
C
C
G
A
C
C
A
T
A
G
A
A
T
C
G
G
G
T
A
A
T
G
C
C
G
C
T
G
G
G
G
G
A
G
C
T
G
A
T
T
G
C
C
G
T
G
G
T
A
A
T
C
C
G
A
C
T
C
C
T
G
G
G
A
C
A
T
T
A
G
C
G
G
T
C
A
C
A
T
C
T
A
G
G
A
A
A
C
T
T
G
T
G
C
C
G
G
G
T
A
C
A
T
A
C
A
T
G
G
C
C
T
G
T
C
C
G
G
G
G
A
C
G
C
T
A
A
C
T
G
T
T
C
C
A
A
G
A
G
T
C
C
A
C
G
T
C
T
G
C
A
A
A
A
A
A
T
T
T
T
T
C
A
T
T
A
G
A
T
A
G
G
C
A
T
C
A
T
C
T
C
T
T
G
G
G
C
T
C
G
A
G
G
C
C
G
G
T
A
G
G
G
T
A
T
G
C
G
  104,579,491
  104,579,632
  104,580,582
  104,581,228
  104,583,012
  104,583,579
  104,583,690
  104,583,805
  104,584,086
  104,584,426
  104,584,945
  104,585,020
  104,585,100
  104,585,369
  104,585,564
  104,585,605
  104,585,623
  104,586,173
  104,586,229
  104,586,406
  104,587,427
  104,587,725
  104,588,531
  104,588,629
  104,588,923
  104,589,035
  104,589,040
  104,590,446
  104,590,535
  104,590,835
  104,590,846
  104,591,060
  104,591,088
  104,591,241
  104,591,281
  104,591,383
  104,591,519
  104,591,594
  104,591,607
  104,591,671
  104,591,746
  104,591,768
  104,591,902
  104,592,160
  104,592,221
  104,592,331
  104,592,381
  104,592,418
  104,592,477
  104,592,536
  104,592,567
  104,592,602
  104,592,636
  104,593,174
  104,593,178
  104,593,251
  104,593,255
  104,593,287
  104,593,357
  104,593,607
  104,593,756
  104,593,758
  104,593,785
  104,593,893
  104,593,938
  104,593,964
  104,593,984
  104,594,918
  104,595,820
  104,596,094
  104,596,099
  104,596,156
  104,596,282
  104,596,339
  104,597,090
  104,597,204
  104,597,325
  104,597,422
  104,597,903
  104,598,046
  104,598,095
  104,598,123
  104,598,161
  104,598,184
  104,598,192
  104,598,218
  104,598,245
  104,598,249
  104,598,306
  104,598,480
  104,598,786
  104,598,787
  104,598,812
  104,599,010
  104,599,446
  104,599,457
  104,599,885
  104,599,943
  104,600,009
  104,600,028
  104,600,229
  104,600,253
  104,600,362
  104,600,538
  104,600,585
  104,600,741
  104,600,811
  104,600,819
  104,600,958
  104,601,033
  104,601,188
  104,601,244
  104,601,257
  104,601,367
  104,602,244
  104,606,512
  104,607,374
  104,609,286
  104,609,962
  104,611,293
  104,611,938
  104,612,183
  104,612,347
  104,613,093
  104,614,148
  104,614,153
  104,614,437
  104,615,487
  104,617,444
  104,617,937
  104,617,948
  104,618,107
  104,618,323
  104,618,764
  104,618,869
  104,619,163
  104,619,490
  104,619,836
  104,620,641
  104,620,649
  104,620,990
  104,623,608
  104,626,719
  104,627,126
  104,627,168
  104,627,249
  104,627,464
  104,627,495
  104,627,717
  104,627,861
  104,628,426
  104,628,484
  104,628,968
  104,629,223
  104,629,266
  104,629,379
  104,629,853
  104,631,433
  104,632,188
  104,632,214
  104,632,389
  104,632,578
  104,632,821
  104,633,162
  104,633,612
  104,634,008
  104,635,275
  104,635,430
  104,635,474
  104,635,740
  104,635,819
  104,635,919
  104,636,243
  104,636,719
  104,636,901
  104,637,127
  104,638,136
  104,638,627
  104,639,006
  104,640,508
  104,640,629
  104,640,950
  104,641,457
  104,641,505
  104,641,576
  104,641,604
  104,644,540
  104,645,824
  104,646,713
  104,648,967
  104,649,241
  104,677,479
  104,683,272
  104,683,380
  104,683,422
  104,683,423
  104,683,450
  104,683,458
  104,696,592
  104,697,390
  104,701,165
  104,701,927
  104,703,390
  104,713,365
  104,717,017
  104,729,490
  104,729,850
  104,730,034
  104,731,669
  104,731,797
  104,733,323
  104,733,520
  104,734,335
  104,736,685
  104,737,056
  104,740,609
  104,741,611
  104,741,954
  104,743,117
  104,744,386
  104,744,637
  104,744,714
  104,745,169
  104,745,734
  104,745,769
  104,745,859
  104,745,977
  104,745,978
  104,746,564
  104,746,979
  104,746,987
  104,747,087
  104,747,380
  104,747,414
  104,747,889
  104,748,932
  104,749,509
  104,749,798
  104,751,060
  104,751,189
  104,751,255
  104,751,274
  104,751,287
  104,751,351
  104,751,674
  104,751,729
  104,751,760
  104,751,841
  104,751,870
  104,751,887
  104,752,192
  104,752,411
  104,752,954
  104,753,076
  104,753,113
  104,753,374
  104,753,564
  104,756,479
  104,761,473
  104,762,000
  104,762,234
  104,763,480
  104,763,665
  104,764,213
  104,765,575
  104,766,392
  104,766,663
  104,766,884
  104,767,203
  104,767,301
  104,767,715
  104,767,720
  104,767,749
  104,767,906
  104,768,233
  104,768,358
  104,768,449
  104,768,558
  104,768,853
  104,768,863
  104,769,134
  104,769,238
  104,770,120
  104,772,727
  104,773,272
  104,778,065
  104,778,110
  104,778,652
  104,780,003
  104,781,611
  104,781,753
  104,782,760
  104,783,281
  104,784,158
  104,784,283
  104,784,883
  104,787,199
  104,787,635
  104,787,675
  104,787,678
  104,787,694
  104,787,702
  104,787,722
  104,787,857
  104,788,687
  104,789,455
  104,791,411
  104,792,082
  104,793,542
  104,795,864
  104,796,048
  104,796,212
  104,796,513
  104,796,718
  104,796,881
  104,797,129
  104,798,075
  104,798,181
  104,798,494
  104,798,949
  104,799,377
  104,799,541
  104,799,790
  104,800,622
  104,800,741
  104,800,878
  104,800,904
  104,800,941
  104,801,190
  104,801,327
  104,801,831
  104,802,141
  104,802,290
  104,802,734
  104,802,884
  104,802,995
  104,805,135
  104,805,318
  104,805,344
  104,806,780
  104,807,016
  104,808,770
  104,810,522
  104,810,813
  104,811,379
  104,812,563
  104,855,644
  104,858,612
  104,860,343
  104,860,690
  104,863,245
  104,863,913
  104,866,739
  104,867,113
  104,869,477
  104,869,533
  104,870,353
  104,874,172
  104,875,122
  104,876,412
  104,878,625
  104,880,211
  104,881,539
  104,883,572
  104,883,576
  104,883,587
  104,883,590
  104,883,593
  104,883,597
  104,883,617
  104,885,740
  104,886,041
  104,888,562
  104,888,947
  104,889,084
  104,889,656
  104,889,769
  104,891,302
  104,892,508
  104,893,110
  104,893,271
  104,893,652
  104,893,660
  104,894,725
  104,894,893
  104,895,388
  104,895,860
  104,896,344
  104,897,232
  104,897,249
  104,898,131
  104,899,008
  104,899,084
  104,899,406
  104,899,711
  104,899,800
  104,899,943
  104,900,757
  104,901,753
  104,902,152
  104,903,298
  104,903,597
  104,903,623
  104,904,544
  104,904,626
  104,905,135
  104,905,398
  104,905,644
  104,905,760
  104,906,225
  104,906,526
  104,907,608
  104,907,839
  104,907,857
  104,907,915
  104,909,499
  104,909,653
  104,909,978
  104,910,043
  104,910,341
  104,910,715
  104,910,734
  104,910,926
  104,911,612
  104,911,617
  104,911,723
  104,911,724
  104,911,943
  104,912,242
  104,912,421
  104,912,542
  104,912,662
  104,912,830
  104,912,832
  104,913,168
  104,913,291
  104,913,509
  104,913,628
  104,913,716
  104,913,774
  104,913,985
  104,914,080
  104,914,226
  104,914,365
  104,914,367
  104,914,376
  104,914,431
  104,914,551
  104,914,761
  104,914,819
  104,914,849
  104,914,862
  104,914,963
  104,915,000
  104,915,194
  104,915,240
  104,915,287
  104,915,366
  104,915,581
  104,915,596
  104,915,601
  104,915,688
  104,915,740
  104,916,034
  104,916,120
  104,916,272
  104,916,283
  104,916,421
  104,916,431
  104,916,447
  104,916,525
  104,916,674
  104,916,868
  104,917,077
  104,917,086
  104,917,186
  104,918,028
  104,918,029
  104,919,171
  104,919,680
  104,919,814
  104,921,023
  104,921,331
  104,921,466
  104,923,298
  104,923,356
  104,924,510
  104,925,585
  104,925,597
  104,926,266
  104,926,840
  104,926,947
  104,928,569
  104,928,663
  104,928,679
  104,928,750
  104,928,783
  104,928,812
  104,929,825
  104,929,838
  104,929,997
  104,930,167
  104,930,271
  104,930,308
  104,930,365
  104,930,392
  104,931,188
  104,932,631
  104,934,293
  104,934,295
  104,934,349
  104,934,473
  104,934,560
  104,934,617
  104,934,618
  104,934,665
  104,934,950
  104,934,958
  104,935,143
  104,935,366
  104,935,474
  104,935,551
  104,935,596
  104,935,931
  104,936,274
  104,936,293
  104,936,358
  104,936,417
  104,936,750
  104,937,249
  104,937,587
  104,937,646
  104,937,772
  104,939,013
  104,939,173
  104,939,512
  104,939,580
  104,940,272
  104,940,441
  104,940,801
  104,940,876
  104,941,161
  104,941,209
  104,941,474
T
A
T
C
G
A
C
C
A
T
T
A
A
T
A
A
A
T
T
G
A
A
T
C
A
G
G
T
T
G
T
G
G
G
T
G
T
G
G
A
A
T
G
C
G
T
T
C
G
G
T
C
T
T
A
C
A
A
A
C
A
C
C
C
A
A
A
T
T
A
C
T
G
G
T
C
T
C
G
T
G
G
A
G
A
T
T
T
G
T
C
T
T
T
T
C
G
A
C
A
T
T
C
G
A
C
A
A
G
G
C
G
C
A
A
C
T
C
A
C
G
G
G
A
G
G
T
G
G
T
G
A/G
C
G
T
T
G
A
T/G
C/G
G
G
T
C
A
C
A
G
A
G
T
C
C
G
C
G
T
A
G
C
C
C
A
G
G
A
T
A
T/G
C
T
T
G
A
G
T
T
A
A
G/A
T
A
C
T
T
C
A
C
G
T
A
T
T
C/A
A/C
G/C
C/A
C/T
A
T
A
A
A
T
A
C
T
G
T
G
A
C
G/A
C
C
C
C
T/G
G
A
G
G
T
T
A
C
T
G
G
A
T
G
G
A
C
C
C
C
C
C
T
C
A
T
G
C
T
G
C
G
G
C
A
C
G
T
A
G
C
T
G
A
G
G
T/C
G
T
A
C
C
C
T
C
T
C
T
G
A
A
T
A
A
C
C
G
A
A
A
A
C
G
C
A
G
T
C
G
A
C
C
G
C
A
A/G
C
C
A
A
T
G
G
C
G
T
G
A
T
C
G
G
G
T
A
G
G
C
A
A
C
G
T
G
T
G
C
G
G
T
A
G
A
T
G
C
G
A
G
G
C
T
A
A
A
C
G
G
C
A
T
T
A
A
C
C
T
C
T
T
G
T
T
G
C
G
C
C
A
G
A
A
A
A
A
C
G
T
C
T
T
A
G
T
C
T
A
C
A
A
T
G
T
G
C
A
G
A
T
A
A
C
T
G
T
T
C
T
C
G
A
T
G
G
G
T
G
C
A
C
A
G
G
A
T
A
C
G
T
G
G
G
T
G
A
G/T
G/A
C/T
G
C
A
C
G
G
C
A
A
A
G
T
C
T
C
G
C
T
C
A
C
C
T
A
C
G
A
G
A
C
T
C/A
G
T
T
A
T
C
A
G
T
G
T
G
G
T
C
G
A
C
G
T
G
C
C
T
A
G
C
G
A
A
T
G
C
T
G
A
A
C
T
C
C
A
A
A
A
G
A
A
G
A
C
T
T
C
A
C
G
A
A
A
G
T
C
T
A
A