Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 312,638 (bp)   Positions: 591
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.557
.0
.001
--
.002
.0
.002
.338
.262
.0
.295
.002
.005
.003
.0
.003
.006
.007
.003
.007
.0
.02
.002
.005
.737
.09
.0
.01
.016
.001
--
.033
.003
.002
.015
.01
.154
.0
.209
.08
.028
--
.0
.003
.021
.0
.0
.086
--
--
--
.009
.0
.001
.002
.02
.011
.011
.001
.004
.0
.0
.005
.002
.036
.034
.226
.214
.008
.369
.003
.045
.001
.003
.002
.002
.002
.009
.034
.0
.006
--
--
--
.499
.043
.003
.046
.006
.463
.032
.089
.001
.006
.138
.001
.0
.006
.001
.002
.003
.0
.009
.0
.001
.0
.023
.037
.0
.941
.003
.001
.0
.497
.917
.012
.003
.002
.001
.001
.001
.002
.119
.011
.024
.0
.002
.0
.001
.02
.001
.028
.003
.001
.002
.0
.003
.0
.0
.031
.002
.029
.001
.001
.001
.007
.001
.001
.0
.002
.001
.012
.001
.0
.0
.415
.04
.003
.003
.011
.0
.001
.047
.001
.001
.001
.005
.036
.019
.006
.001
.066
.001
.006
.02
.003
.004
.0
.007
.026
.001
.0
.0
.0
.993
.003
.028
.0
.005
.0
.237
.099
.065
.076
.007
.04
.451
.0
.0
.0
.0
.001
.001
.026
.993
.038
.368
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.354
.027
.002
.0
.0
.012
.004
.036
.0
.0
.032
.0
.01
.005
.0
.002
.013
.0
.001
.0
.0
.028
.001
.0
.026
.01
.004
.005
.0
.0
.001
.113
.006
.002
.0
.009
.0
.0
.0
.007
--
--
--
--
--
--
--
.309
.001
.0
--
.001
.387
.004
.002
.001
.0
.0
.0
.04
.001
.003
.001
.006
.0
.003
.0
.067
.464
.821
.838
.002
.0
.004
.017
.088
.025
.125
.0
.026
.005
.013
.092
.001
.068
.015
.003
.004
.002
.0
.003
.331
.03
.126
.002
.019
.077
.0
.0
.0
.015
.0
.0
--
.0
.007
.001
.01
.0
--
.004
.009
.0
--
--
--
.275
.001
.002
.0
.001
.01
.001
.025
.001
.0
.0
.0
.0
.0
.004
.001
.283
.282
.008
.001
.009
.007
.0
.208
.059
.0
.01
.003
.002
.0
.091
.001
.0
.0
.0
.007
.001
.0
.0
.007
.0
.001
.0
.001
.002
.018
.0
.109
.013
.0
.001
.0
.0
.032
.217
.105
.023
.0
.006
.0
.0
.006
.001
.008
.0
.001
.002
.004
.004
.0
.008
.114
.997
.031
.0
.0
.004
.003
.0
.006
.003
.001
.0
.0
.0
.0
.01
.0
.0
.001
.0
.0
.011
.001
.001
.003
.043
.001
.005
.101
.177
.048
.062
.001
.01
.09
.003
.002
.0
.023
.007
.002
.032
.031
.002
.007
.0
.001
.001
.0
.397
.007
.35
.004
.02
.02
.001
.015
.009
.0
.013
.006
.003
.0
.0
.0
.018
.0
.016
.002
.0
.0
.109
.998
.0
.009
.914
.0
.012
--
.003
.001
.0
.004
.003
.0
.008
.068
.008
.008
.0
.006
.16
.148
.128
.093
.01
--
.192
.552
.0
.346
.03
.003
.005
.155
.001
--
.013
.015
.022
.027
--
.002
.091
.005
.761
.006
.009
.0
.0
.729
.001
.001
.011
.003
.004
.036
.002
.0
.006
.012
.095
.003
--
.001
.054
.008
.038
.121
.11
.005
.003
.033
.004
.025
.259
.001
.0
.004
.007
.005
.005
.0
.006
.005
1.0
.0
.0
.001
.0
.303
.037
.084
.006
.058
.001
.011
.008
.022
.037
--
--
.001
.017
.018
.0
.0
.006
.002
.029
.351
.0
.0
.0
.05
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
T
A
A
C
G
T
G
A
A
G
G
G
A
A
T
T
C
T
T
C
G
A
T
A
A
A
A
C
A
C
C
T
T
T
G
A
G
G
T
A
T
T
T
A
G
A
A
A
C
C
G
T
G
A
A
C
G
G
G
A
G
T
G
G
T
C
C
C
C
G
C
G
A
A
C
G
A
A
C
T
T
A
G
G
T
G
C
T
T
A
A
C
T
A
C
T
T
A
A
A
T
C
T
G
G
T
T
C
A
A
T
T
T
C
A
C
C
G
A
T
A
A
A
T
G
C
T
A
A
T
A
C
G
T
C
T
A
T
C
T
C
T
A
A
G
T
A
T
C
T
C
A
T
T
T
G
G
C
C
T
C
A
C
T
G
C
T
A
A
G
G
T
A
G
C
T
C
G
A
G
A
T
T
T
T
T
A
C
A
T
A
C
C
C
T
G
C
A
G
G
T
G
G
C
C
T
T
A
T
C
G
G
A
T
T
A
C
A
C
A
C
C
C
A
A
G
G
T
T
T
T
G
C
G
A
G
A
T
G
G
G
A
A
C
C
C
C
A
A
A
T
T
T
G
T
A
A
G
T
A
G
T
A
C
C
C
G
G
G
C
G
G
A
T
G
A
C
T
T
C
T
C
G
G
T
G
T
T
C
C
C
A
T
C
T
T
G
T
A
A
T
G
C
C
G
C
G
A
A
T
G
A
A
A
G
C
C
C
A
T
T
A
C
T
G
G
T
G
A
C
A
T
T
A
A
G
T
C
C
C
A
T
T
C
G
A
A
G
G
C
T
C
A
C
T
A
C
A
T
G
T
A
G
T
A
A
G
T
T
T
T
T
G
G
C
T
C
T
G
C
G
T
A
T
G
A
T
C
C
G
T
A
T
T
G
C
G
T
G
C
G
T
G
G
T
G
A
C
T
G
T
T
A
C
C
C
A
T
A
C
G
T
A
G
C
T
G
T
G
C
T
A
G
A
T
A
T
T
T
T
G
G
C
A
C
A
T
C
C
A
A
A
A
G
A
A
T
G
C
C
T
T
A
C
T
A
A
C
C
A
A
A
A
A
C
G
G
T
T
C
T
T
T
T
A
T
C
T
T
T
G
T
G
G
T
A
A
C
G
T
A
T
G
G
G
T
T
C
C
A
G
A
A
C
C
C
G
C
T
A
C
C
C
T
A
A
G
G
G
T
A
C
G
C
T
T
T
G
A
C
A
G
T
T
C
A
T
A
T
G
T
A
G
T
A
A
A
G
C
C
T
G
T
A
A
T
C
G
C
A
C
C
A
T
G
T
C
G
T
A
A
G
G
G
G
A
A
C
C
C
G
  109,735,153
  109,737,250
  109,738,409
  109,739,172
  109,741,896
  109,743,742
  109,744,750
  109,746,023
  109,746,024
  109,751,898
  109,752,166
  109,754,243
  109,755,990
  109,756,748
  109,756,910
  109,761,438
  109,763,451
  109,764,380
  109,764,417
  109,775,749
  109,775,986
  109,776,861
  109,776,987
  109,776,988
  109,777,135
  109,777,953
  109,778,748
  109,779,317
  109,780,180
  109,780,605
  109,781,004
  109,781,314
  109,781,852
  109,783,031
  109,783,351
  109,785,607
  109,785,982
  109,786,092
  109,787,472
  109,787,939
  109,787,988
  109,788,101
  109,788,360
  109,788,474
  109,788,675
  109,789,348
  109,789,417
  109,789,844
  109,789,970
  109,790,411
  109,790,553
  109,790,676
  109,790,757
  109,790,868
  109,790,936
  109,791,679
  109,791,806
  109,791,807
  109,793,228
  109,793,336
  109,793,343
  109,793,458
  109,793,581
  109,794,140
  109,794,216
  109,794,975
  109,795,166
  109,795,226
  109,796,645
  109,796,716
  109,797,848
  109,798,215
  109,801,044
  109,803,741
  109,803,777
  109,804,116
  109,804,117
  109,804,846
  109,806,162
  109,806,686
  109,806,694
  109,807,184
  109,809,387
  109,809,450
  109,810,587
  109,810,884
  109,811,309
  109,811,647
  109,812,676
  109,812,918
  109,814,623
  109,814,708
  109,815,096
  109,815,442
  109,816,269
  109,816,519
  109,816,562
  109,816,609
  109,817,056
  109,818,786
  109,819,006
  109,819,268
  109,820,078
  109,820,273
  109,820,319
  109,821,138
  109,822,014
  109,822,340
  109,824,657
  109,825,824
  109,826,347
  109,826,667
  109,827,558
  109,827,839
  109,827,891
  109,828,014
  109,828,091
  109,828,619
  109,829,295
  109,829,390
  109,829,585
  109,829,587
  109,830,880
  109,831,311
  109,832,555
  109,834,527
  109,834,854
  109,835,970
  109,836,379
  109,836,817
  109,836,881
  109,836,966
  109,836,979
  109,837,041
  109,837,491
  109,837,695
  109,837,956
  109,838,018
  109,838,112
  109,838,639
  109,838,743
  109,838,766
  109,838,781
  109,838,816
  109,838,887
  109,838,981
  109,839,069
  109,839,656
  109,839,836
  109,840,509
  109,840,748
  109,841,290
  109,841,551
  109,842,639
  109,843,000
  109,843,681
  109,844,674
  109,844,740
  109,844,822
  109,844,880
  109,844,935
  109,845,282
  109,845,360
  109,845,385
  109,845,621
  109,846,030
  109,846,050
  109,846,157
  109,846,343
  109,846,501
  109,846,781
  109,846,816
  109,846,829
  109,846,885
  109,846,918
  109,847,037
  109,847,136
  109,847,188
  109,847,344
  109,847,575
  109,847,704
  109,847,740
  109,847,779
  109,848,604
  109,849,031
  109,849,138
  109,849,256
  109,849,352
  109,849,477
  109,849,546
  109,849,953
  109,849,956
  109,850,249
  109,850,252
  109,850,491
  109,850,721
  109,851,013
  109,851,511
  109,851,570
  109,851,572
  109,851,657
  109,851,677
  109,851,841
  109,852,366
  109,852,525
  109,852,709
  109,852,912
  109,852,966
  109,853,231
  109,853,452
  109,854,403
  109,855,396
  109,855,590
  109,855,666
  109,855,746
  109,855,773
  109,855,903
  109,855,946
  109,855,960
  109,856,102
  109,856,108
  109,856,177
  109,856,184
  109,856,185
  109,856,222
  109,856,249
  109,856,256
  109,856,341
  109,856,391
  109,856,415
  109,856,517
  109,856,609
  109,856,824
  109,856,990
  109,857,014
  109,857,178
  109,857,578
  109,857,599
  109,857,675
  109,857,899
  109,858,038
  109,858,235
  109,858,419
  109,862,048
  109,862,051
  109,862,107
  109,862,580
  109,862,706
  109,864,288
  109,864,476
  109,864,660
  109,864,684
  109,864,963
  109,865,116
  109,873,705
  109,876,692
  109,876,706
  109,877,479
  109,878,227
  109,880,009
  109,881,106
  109,881,726
  109,883,876
  109,884,219
  109,885,173
  109,886,500
  109,893,406
  109,893,571
  109,894,334
  109,898,154
  109,899,572
  109,899,825
  109,901,599
  109,904,152
  109,904,319
  109,904,572
  109,904,992
  109,905,328
  109,905,590
  109,905,600
  109,905,741
  109,906,149
  109,906,214
  109,906,683
  109,906,697
  109,906,819
  109,907,018
  109,907,322
  109,907,448
  109,907,554
  109,908,119
  109,908,964
  109,909,571
  109,909,795
  109,909,869
  109,910,116
  109,910,391
  109,910,596
  109,910,903
  109,912,009
  109,912,208
  109,913,055
  109,913,092
  109,913,107
  109,915,307
  109,915,754
  109,918,004
  109,918,005
  109,918,226
  109,918,748
  109,918,949
  109,919,044
  109,919,269
  109,919,304
  109,919,323
  109,919,414
  109,919,871
  109,920,074
  109,920,142
  109,936,957
  109,937,473
  109,938,593
  109,939,529
  109,942,699
  109,946,544
  109,948,248
  109,948,613
  109,949,222
  109,949,687
  109,949,927
  109,950,162
  109,952,702
  109,955,040
  109,955,074
  109,955,488
  109,956,394
  109,956,710
  109,957,513
  109,957,796
  109,958,860
  109,960,665
  109,961,151
  109,961,906
  109,961,957
  109,961,977
  109,961,981
  109,962,273
  109,962,378
  109,962,428
  109,962,554
  109,962,622
  109,962,710
  109,962,713
  109,962,792
  109,962,891
  109,962,904
  109,962,959
  109,963,108
  109,963,183
  109,963,465
  109,963,620
  109,963,644
  109,963,660
  109,963,672
  109,963,686
  109,963,747
  109,963,801
  109,963,802
  109,964,530
  109,964,531
  109,964,810
  109,965,358
  109,965,368
  109,965,372
  109,965,448
  109,965,470
  109,965,674
  109,965,716
  109,965,784
  109,965,851
  109,965,855
  109,966,042
  109,966,105
  109,966,114
  109,966,440
  109,966,441
  109,966,497
  109,966,519
  109,966,714
  109,966,906
  109,966,920
  109,966,984
  109,967,217
  109,967,228
  109,967,523
  109,967,539
  109,967,654
  109,967,786
  109,967,796
  109,967,880
  109,967,881
  109,967,943
  109,968,031
  109,968,039
  109,968,182
  109,968,258
  109,968,419
  109,968,556
  109,968,663
  109,968,954
  109,969,243
  109,969,410
  109,969,426
  109,969,487
  109,969,572
  109,969,596
  109,969,644
  109,969,761
  109,970,363
  109,970,530
  109,970,654
  109,970,675
  109,970,692
  109,970,756
  109,970,809
  109,970,873
  109,970,943
  109,971,029
  109,971,287
  109,971,288
  109,971,296
  109,971,341
  109,971,354
  109,971,482
  109,971,489
  109,971,515
  109,971,567
  109,971,935
  109,972,018
  109,972,322
  109,972,412
  109,972,562
  109,972,801
  109,972,884
  109,972,941
  109,973,068
  109,973,138
  109,973,247
  109,973,249
  109,973,265
  109,973,425
  109,973,434
  109,973,675
  109,973,762
  109,973,783
  109,973,815
  109,973,977
  109,975,166
  109,975,379
  109,975,493
  109,976,203
  109,976,863
  109,976,896
  109,977,400
  109,977,455
  109,977,729
  109,978,068
  109,979,784
  109,979,822
  109,980,121
  109,980,374
  109,980,574
  109,980,710
  109,980,722
  109,980,784
  109,981,234
  109,981,338
  109,981,819
  109,981,927
  109,982,901
  109,982,971
  109,983,349
  109,983,433
  109,985,370
  109,992,323
  109,998,418
  109,998,491
  109,998,839
  109,999,177
  109,999,852
  109,999,962
  110,000,134
  110,001,114
  110,002,224
  110,002,293
  110,002,342
  110,002,838
  110,003,274
  110,003,275
  110,003,337
  110,004,224
  110,004,438
  110,006,157
  110,006,929
  110,006,952
  110,008,537
  110,009,445
  110,009,749
  110,011,816
  110,012,226
  110,012,532
  110,012,879
  110,013,863
  110,014,732
  110,015,654
  110,016,009
  110,016,017
  110,017,761
  110,017,994
  110,018,362
  110,018,551
  110,019,193
  110,019,368
  110,019,639
  110,020,305
  110,020,306
  110,020,488
  110,021,279
  110,021,374
  110,021,394
  110,022,518
  110,023,237
  110,023,682
  110,024,261
  110,026,967
  110,027,003
  110,027,090
  110,027,211
  110,027,681
  110,028,484
  110,031,505
  110,031,542
  110,031,609
  110,031,644
  110,031,681
  110,031,690
  110,031,707
  110,031,998
  110,032,031
  110,032,046
  110,032,079
  110,032,114
  110,032,331
  110,032,676
  110,032,931
  110,033,764
  110,035,266
  110,035,435
  110,035,814
  110,036,157
  110,036,391
  110,036,875
  110,037,088
  110,037,337
  110,037,596
  110,037,832
  110,038,746
  110,039,515
  110,040,257
  110,040,653
  110,040,926
  110,041,651
  110,041,697
  110,041,706
  110,041,834
  110,042,218
  110,042,415
  110,042,611
  110,042,653
  110,043,007
  110,043,008
  110,044,259
  110,044,315
  110,044,370
  110,044,433
  110,044,490
  110,044,607
  110,045,241
  110,045,613
  110,046,083
  110,046,382
G
G
G
G
A
C
A
G
G
C
A
C
G
T
A
C
T
C
C
T
A
G
G
G
G
G
G
G
G
T
T
C
C
C
A
C
C
A
C
G
C
A
A
G
T
G
G
G
T
G
A
C
A
C
G
T
A
A
A
C
T
G
A
A
C
T
T
T
T
T
A
A
G
G
T
C
T
G
T
G
G
G
A
A
A
C
T
C
G
G
T
T
G
T
T
G
C
C
G
T
C
G
C
C
C
C
G
T
G
G
C
C
C
T
G
T
T
A
G
G
A/T
A/T
T
C
A
T
C
G
G
A
T
A
C
C
A
C
T
C
T
C
A
A
G
C
A
C
G
G
T
C
T
G
A
A
C
A
A
T
T
G
T
G
T
C
C
T
C
T
G
A
A
C
G
A
T
G
T
A
G
A
C
C
C
C
C
C
C
G
G
C
T
T
T
T
G
A
T
G
C
A
C
C
A
T
T
A
A
G
C
A
T
T
C
A
G
T
T
G
T
G
A
T
T
G
G
C
A
C
G
C
C
A
T
T
G
A
C
A
A
A
T
T
T
T
G
T
G
C
G
G
G
A
G
C
C
G
T
T
C
G
A
G
T
A
A
T
A
A
A
T
C
A
C
G
A
C
T
C
A
T
C
G
A
A
C
A
C
C
T
T
G
C
A
T
G
C
A
G
T
G
G
A
G
A
A
T
A
G
G
C
C
G
C
T
T
A
A
T
G
C
C
G
T
G
A
A
A
A
G
T
G
A
G
T
G
A
C
A
T
T
T
C
C
A
A
G
T
A
A
T
C
T
T
T
G
G
T
G
A
A
C
G
T
C
G
C
A
G
C
C
C
C
A
C
G
C
A
C
C
G
T
A
G
C
T
G
C
T
T
A
G
G
C
C
A
T
A
C
T
T
A
C
A
A
C
A
C
T
C
C
C
C
G
T
T
T
G
C
G
T
A
C
G
A
T
C
T
C
A
T
C
G
A
G
C
C
C
C
G
C
A
A
T
G
G
G
C
A
A
C
G
T
C
A
T
G
G
A
T
G
C
G
G
T
G
T
G
A
T
C
G
C
T
G
T
A
A
C
C
T
A
G
C
C
G
G
A
A
A
C
A
A
T
C
C
G
G
T
A
C
C
C
T
A
A
C
A
A
T
G
A
T
G
T
T
G
T
T
C
G
A
T
T
C
G
G
T
A
T
G
G
T
A
T
C
C
G
A
T
A
G
A
G
C
T
G
C
T
A
A
C
G
A
C
G
T
G
T
T
T
C
A
C
C
G
C
T
T
A
G
G
T
T
C
A
T/G
T
T
C
G
G
A
A
A
C
G
G
T
T
T
A