Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 157,991 (bp)   Positions: 339
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.61
.0
.028
.012
.001
.0
.0
.12
.004
.003
.0
.002
.004
.007
.0
.0
.02
.002
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.367
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.443
.003
.259
.001
.0
.005
.059
.01
.088
.008
.008
.034
.002
.007
.003
.006
.009
.008
.001
.0
.001
.001
.001
.001
.007
.009
.154
--
.002
--
.462
.84
.764
.001
.001
.429
.029
.0
.005
.002
.02
.001
1.0
--
--
--
.003
.001
.0
.029
.001
.0
.0
.005
.985
.003
.148
.119
--
.048
.001
.008
.002
.009
.002
.741
.001
.0
.004
.024
.347
.001
.038
.933
.009
.045
.128
.001
.667
.286
.143
.003
.351
.028
.001
.009
.0
.077
.03
.001
.23
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
.011
.212
.0
.0
.154
.013
.001
.001
.042
.018
.001
.175
.165
.017
.013
.039
.009
.005
.015
.006
.002
.002
.002
.001
.004
.01
.004
.009
.011
.024
.037
.107
.078
.005
.008
.003
.005
.328
.31
.316
.324
.361
.308
.0
.0
.0
.0
.001
.009
.021
.083
.339
.538
.508
.005
.004
.005
.002
.001
.002
.011
.013
.015
.012
.008
.016
.019
.038
.049
.051
.007
.006
.002
.587
.008
.01
.068
.008
.002
.001
.016
.098
.034
.083
.194
.006
.03
.029
.028
.026
.006
.021
.005
.0
.0
.003
.008
.033
.058
.001
.007
.066
.168
.178
.194
.199
.192
.283
.085
.015
.009
.001
.004
.038
.03
.015
.05
.063
.004
.015
.009
.036
.05
.12
.053
.015
.016
.008
.011
.023
.013
.011
.021
.01
.007
.013
.033
.013
.0
.002
.001
.0
.003
.004
.008
.017
.087
.111
.134
.101
.103
.156
.142
.111
.086
.046
.013
.006
.017
.041
.14
.335
.484
.096
.049
.04
--
--
--
--
.003
.086
.004
.0
.001
.004
.0
.0
.001
.001
.074
.668
.498
.0
.007
.142
.808
1.0
Mnat1
Mnat1
Mnat1
Mnat1
Mnat1
Mnat1
Mnat1
Mnat1
Mnat1
Mnat1
Mnat1
Mnat1
Mnat1
Mnat1
Mnat1
Mnat1
Mnat1
Mnat1
Mnat1
Mnat1
Mnat1
Mnat1
Mnat1
Mnat1
Mnat1
Mnat1
Mnat1
Mnat1
Mnat1
Mnat1
Mnat1
Mnat1
Mnat1
Mnat1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
C
A
-
G
T
C
-
A
T
T
G
C
3
T
T
4
6
A
T
T
G
T
T
G
G
C
A
A
8
G
7
T
T
5
C
G
A
G
G
-
G
-
A
A
G
-
C
2
A
C
4
T
G
C
C
G
G
-
T
T
C
-
G
G
-
C
C
-
C
C
G
C
C
C
C
G
C
T
A
-
A
A
T
-
T
2
G
A
3
T
A
C
T
C
-
-
-
C
G
A
A
C
A
T
A
-
-
T
C
G
T
4
2
-
A
C
C
5
C
A
-
T
G
4
A
A
A
T
4
T
G
T
C
-
C
T
T
A
A
A
G
-
A
-
C
C
C
C
C
C
C
4
C
G
T
-
C
A
A
-
3
C
A
G
G
G
T
C
C
-
C
A
C
G
C
-
3
C
A
C
-
-
C
C
-
C
-
G
C
-
2
C
2
-
-
-
-
-
-
-
G
-
T
-
T
C
-
3
C
C
T
T
A
T
T
2
C
-
G
C
-
-
-
-
-
A
C
T
G
A
G
-
-
-
G
C
2
2
A
5
A
7
-
A
2
-
G
A
-
A
T
-
T
C
G
-
-
A
-
-
G
-
C
C
2
T
2
4
-
A
T
T
G
G
-
-
C
-
G
A
-
G
C
C
-
C
A
G
C
G
G
G
-
G
C
5
-
C
3
A
A
T
G
5
T
A
2
G
T
G
T
T
T
T
C
A
T
T
T
T
T
3
C
C
-
T
T
C
G
T
T
G
G
A
C
G
C
C
  96,000,515
  96,002,010
  96,002,876
  96,003,838
  96,003,857
  96,003,861
  96,003,864
  96,004,280
  96,004,333
  96,004,413
  96,004,453
  96,004,483
  96,008,970
  96,008,978
  96,010,261
  96,010,303
  96,012,888
  96,013,231
  96,014,394
  96,014,686
  96,014,710
  96,014,714
  96,014,721
  96,014,726
  96,014,770
  96,014,835
  96,015,277
  96,016,219
  96,018,350
  96,026,225
  96,026,237
  96,026,240
  96,026,252
  96,026,257
  96,026,264
  96,026,275
  96,026,312
  96,026,342
  96,026,349
  96,026,356
  96,026,380
  96,026,387
  96,026,391
  96,026,393
  96,026,402
  96,026,467
  96,026,479
  96,026,483
  96,026,523
  96,026,529
  96,026,530
  96,033,292
  96,034,803
  96,034,915
  96,037,194
  96,037,196
  96,037,198
  96,037,207
  96,037,477
  96,038,569
  96,041,143
  96,041,172
  96,041,335
  96,041,513
  96,041,542
  96,041,546
  96,041,571
  96,041,572
  96,041,578
  96,041,596
  96,041,600
  96,041,605
  96,041,619
  96,041,625
  96,041,631
  96,041,646
  96,041,698
  96,041,705
  96,044,144
  96,045,665
  96,047,829
  96,049,285
  96,049,782
  96,053,514
  96,054,328
  96,055,439
  96,058,480
  96,059,224
  96,068,637
  96,071,856
  96,074,718
  96,075,930
  96,077,622
  96,079,157
  96,089,716
  96,090,178
  96,090,185
  96,090,923
  96,091,640
  96,093,987
  96,094,043
  96,096,388
  96,096,812
  96,097,404
  96,097,411
  96,097,774
  96,103,701
  96,104,041
  96,104,306
  96,105,259
  96,106,256
  96,108,729
  96,109,612
  96,109,824
  96,109,827
  96,110,370
  96,111,236
  96,111,362
  96,111,364
  96,112,146
  96,114,139
  96,114,351
  96,115,768
  96,115,977
  96,117,789
  96,118,020
  96,119,630
  96,119,876
  96,121,109
  96,121,421
  96,122,633
  96,122,937
  96,123,022
  96,123,296
  96,124,387
  96,126,715
  96,126,920
  96,127,166
  96,127,285
  96,128,916
  96,129,361
  96,130,917
  96,131,497
  96,131,541
  96,131,634
  96,131,727
  96,131,730
  96,131,746
  96,131,748
  96,131,751
  96,131,755
  96,132,785
  96,135,151
  96,135,183
  96,135,184
  96,135,213
  96,135,219
  96,135,236
  96,135,237
  96,135,259
  96,135,270
  96,135,275
  96,135,321
  96,135,322
  96,135,348
  96,135,379
  96,135,417
  96,135,433
  96,135,436
  96,135,445
  96,135,479
  96,135,495
  96,135,501
  96,135,502
  96,135,507
  96,135,525
  96,135,541
  96,135,543
  96,135,556
  96,135,557
  96,135,561
  96,135,563
  96,135,581
  96,135,590
  96,135,606
  96,135,624
  96,135,655
  96,135,658
  96,135,679
  96,135,680
  96,135,688
  96,135,689
  96,135,695
  96,135,699
  96,135,751
  96,135,753
  96,135,755
  96,135,756
  96,135,770
  96,135,774
  96,135,775
  96,135,780
  96,135,794
  96,135,809
  96,135,824
  96,135,890
  96,135,891
  96,135,900
  96,135,905
  96,135,909
  96,135,915
  96,135,925
  96,135,928
  96,135,930
  96,135,935
  96,135,952
  96,135,967
  96,135,971
  96,135,974
  96,135,985
  96,135,986
  96,136,002
  96,136,041
  96,136,049
  96,136,158
  96,136,241
  96,136,277
  96,136,313
  96,136,317
  96,136,450
  96,136,652
  96,136,751
  96,136,757
  96,136,813
  96,136,903
  96,136,918
  96,136,983
  96,137,023
  96,137,028
  96,137,031
  96,137,033
  96,137,041
  96,137,047
  96,137,061
  96,137,066
  96,137,069
  96,137,073
  96,137,076
  96,137,085
  96,137,089
  96,137,114
  96,137,124
  96,137,167
  96,137,191
  96,137,195
  96,137,205
  96,137,215
  96,137,226
  96,137,297
  96,137,329
  96,137,350
  96,137,374
  96,137,382
  96,137,385
  96,137,434
  96,137,436
  96,137,440
  96,137,447
  96,137,453
  96,137,469
  96,137,493
  96,137,495
  96,137,515
  96,137,517
  96,137,538
  96,137,542
  96,137,549
  96,137,574
  96,137,579
  96,137,581
  96,137,603
  96,137,612
  96,137,625
  96,137,632
  96,137,643
  96,137,649
  96,137,656
  96,137,668
  96,137,685
  96,137,692
  96,137,697
  96,137,705
  96,137,707
  96,137,715
  96,137,718
  96,137,720
  96,137,722
  96,137,737
  96,137,751
  96,137,766
  96,137,770
  96,137,772
  96,137,779
  96,137,786
  96,137,790
  96,137,796
  96,137,802
  96,137,806
  96,137,811
  96,137,816
  96,139,173
  96,139,661
  96,140,084
  96,140,369
  96,140,457
  96,141,458
  96,141,890
  96,144,320
  96,144,322
  96,144,324
  96,144,326
  96,145,912
  96,145,976
  96,146,770
  96,147,653
  96,147,900
  96,147,935
  96,147,981
  96,148,084
  96,148,087
  96,148,094
  96,148,106
  96,148,123
  96,148,148
  96,148,550
  96,149,601
  96,151,031
  96,153,163
  96,153,309
T
G
G
G
-
-
A
A
-
-
-
-
-
-
C
G
-
-
G
T/A
T/G
G/T
T/C
T/G
T
C
G
T
C
-
A
-
-
-
-
-
-
-
-
-
C
-
T
G
-
-
C
-
-
C
T
-
C
A
A
-
-
-
T
C
C
T
2
A
A
4
T
T
2
A
G
A
G
T
G
T
T
T
-
G
4
C
G
C
5
A
-
A
G
-
C
T
T
C
-
G
G
G
T
T
G
G
T
C
C
G
A
T
C
T
T
G
-
-
2
G
T
C/-
5/-
T
T
A
C
T
-
T
T
C
C
-
C
C
C
T
-/A
T
C
G
G
G
G
T
12
-
G
-
A
-
A
A
A
T
-
G
C
-
G
A
C
-
T
-
-
G
-
T
-
-
G
-
T
A
T
A
-
-
T
-
A
G
T
T
T
A
-
T
-
G
-
A
G
-
A
-
G
A
C
T
T
G
T
-
T
-
G
G
T
2
-
-
-
-
A
-
-
-
-
-
G
-
A
T
A
2
T
2
-
-
-
-
G
-
2
2
C
-
-
-
-
-
-
-
-
G
-
-
G
T/5
-
2
-
-
3
-
T
-
C
2
-
G
A
-
T
-
-
-
A
-
-
G
T
-
G
C
-
G
A
-
T
-
-
A
-
-
-
A
-
-
-
-
-
-
-
T
A
T
-
T
-
-
C
T
-
-
-
G
-
-
-
-
A
-
A
C
G
T
C
T/A
T/A
T/A
T/A
-
-
G
G
A
A
C
-
T
-
C
-
-
G
T
T
T
A