Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 250,025 (bp)   Positions: 355
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.147
.998
.0
.001
.005
--
.974
.0
--
.0
.001
.0
.0
.0
.005
.005
.001
.002
.002
.0
.001
.0
.048
.0
.03
.028
.002
.077
.0
.011
.001
.024
.002
.002
.007
.001
.003
.001
.0
.067
.002
.002
.001
.0
.793
.0
.002
.0
.0
.0
.001
.0
.011
.025
.042
.115
.0
.001
.015
.002
.011
.0
--
--
.008
.331
.13
.003
.001
.002
.951
.003
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.001
.0
.044
.115
.01
.032
.002
.0
.0
.0
.005
.006
.001
.003
.001
.003
.021
.308
.1
.0
.002
.028
.025
.001
.0
.002
.0
.001
.358
.001
.005
.04
.007
.001
.001
.973
.03
.005
.001
.0
.0
.0
.003
.027
.0
.001
.002
--
--
--
--
--
--
.003
.068
.003
.016
.069
.003
.003
.027
.275
.022
.004
.029
.0
.02
.0
.06
.001
.001
.001
.003
.005
.005
.0
.0
.022
.003
.0
.001
.002
.054
.022
.419
.007
.002
--
.004
.005
.0
.0
--
--
--
--
.112
.015
.172
.019
.024
.005
.003
.002
--
--
.019
.031
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.621
.119
.011
--
.076
--
.01
.0
.001
.0
.0
.045
.019
.0
.001
.001
.078
--
.03
.01
.214
.001
.479
.001
.028
.673
.001
.019
.002
--
.007
.0
.0
.004
.003
.001
.004
--
--
--
.004
.003
.0
.002
.0
.003
.003
.017
.006
.065
.014
.018
.0
.0
.231
.016
.002
.006
.031
--
.419
--
--
.005
.006
.002
.001
.008
.001
.0
.001
.006
.022
.004
--
.012
.018
.003
.0
.0
--
--
.0
.0
.002
.001
.269
.229
.0
.001
.0
.005
.004
.006
.0
.0
.218
.509
.0
.041
.007
.001
.009
--
--
.007
.0
.001
.125
.051
.006
.025
.0
.002
.0
.972
--
.001
.0
.001
.001
.001
.001
.01
.0
.014
.044
.0
.002
.043
.037
.013
.0
.003
.012
.001
.11
.006
.0
.011
.007
.016
.005
.001
--
.02
.91
.824
.688
.403
.638
.636
.124
.0
1.0
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
G
G
T
A
T
A
G
A
A
C
G
C
A
T
A
T
A
T
T
C
G
C
T
G
C
A
G
G
T
G
T
G
A
T
T
C
A
C
C
A
T
T
G
G
G
G
A
T
A
C
G
G
G
G
A
C
A
G
T
T
G
G
C
T
G
G
A
G
C
G
A
A
C
G
G
A
C
G
A
T
G
G
C
C
A
C
T
A
C
A
T
G
G
T
C
C
C
A
A
T
G
C
A
T
C
C
T
T
C
G
C
G
T
C
G
T
A
T
A
C
G
T
G
C
G
A
A
A
G
C
C
G
T
A
A
C
T
T
A
C
C
C
C
C
A
T
T
G
T
A
C
A
A
G
A
G
T
T
G
A
T
C
C
G
G
A
A
A
A
A
G
G
G
A
T
A
T
G
C
C
C
A
A
T
T
T
T
A
C
A
C
G
C
C
G
G
C
T
A
A
C
T
G
C
A
C
T
T
T
T
T
T
G
C
T
T
C
A
A
G
G
A
T
C
A
A
T
T
A
A
C
G
A
T
A
T
T
C
G
C
T
T
C
T
G
A
C
C
C
A
C
G
G
C
A
G
A
C
C
T
T
G
T
A
C
A
A
G
A
C
G
G
A
C
T
C
T
G
T
T
C
G
T
A
C
G
G
T
C
A
T
T
G
T
T
T
T
C
T
G
G
T
G
G
C
G
C
A
T
T
G
A
A
C
T
G
G
C
A
C
A
T
G
C
G
A
C
A
C
C
C
G
G
A
C
A
A
G
C
G
A
A
T
C
G
A
C
C
A
G
A
C
C
A
T
  31,569,474
  31,569,599
  31,569,994
  31,574,590
  31,574,779
  31,575,844
  31,577,323
  31,577,700
  31,580,916
  31,582,730
  31,583,582
  31,583,732
  31,583,758
  31,584,660
  31,584,833
  31,585,075
  31,587,234
  31,587,306
  31,589,204
  31,590,451
  31,590,516
  31,590,832
  31,593,094
  31,593,484
  31,594,632
  31,595,862
  31,596,226
  31,596,761
  31,598,221
  31,598,251
  31,598,362
  31,598,865
  31,599,188
  31,599,189
  31,599,551
  31,599,556
  31,599,722
  31,599,785
  31,599,821
  31,600,093
  31,600,113
  31,600,302
  31,600,999
  31,601,007
  31,601,241
  31,601,452
  31,601,938
  31,602,002
  31,602,760
  31,602,824
  31,603,155
  31,603,358
  31,603,430
  31,603,701
  31,603,884
  31,603,907
  31,604,298
  31,604,492
  31,604,658
  31,605,027
  31,605,326
  31,605,949
  31,606,212
  31,606,278
  31,606,511
  31,606,537
  31,606,673
  31,607,029
  31,607,480
  31,607,573
  31,607,672
  31,607,964
  31,608,295
  31,608,805
  31,608,808
  31,608,814
  31,608,871
  31,608,920
  31,608,928
  31,608,998
  31,609,105
  31,609,131
  31,609,381
  31,609,382
  31,609,412
  31,609,586
  31,609,599
  31,610,076
  31,610,082
  31,610,173
  31,610,214
  31,610,321
  31,610,329
  31,610,476
  31,610,519
  31,610,563
  31,610,567
  31,610,585
  31,611,048
  31,612,614
  31,612,897
  31,613,261
  31,613,294
  31,613,353
  31,613,407
  31,613,460
  31,615,105
  31,615,549
  31,615,581
  31,615,872
  31,616,255
  31,616,538
  31,616,701
  31,617,042
  31,618,139
  31,618,424
  31,619,221
  31,620,653
  31,621,646
  31,621,674
  31,621,784
  31,621,886
  31,622,706
  31,623,037
  31,624,482
  31,624,641
  31,624,804
  31,625,259
  31,625,483
  31,626,082
  31,627,702
  31,627,909
  31,628,396
  31,628,537
  31,628,648
  31,628,795
  31,629,276
  31,630,076
  31,630,172
  31,631,314
  31,631,485
  31,631,606
  31,632,020
  31,632,155
  31,632,356
  31,632,797
  31,632,904
  31,632,934
  31,632,980
  31,633,549
  31,633,714
  31,634,038
  31,634,124
  31,634,234
  31,634,277
  31,634,699
  31,634,737
  31,635,383
  31,635,860
  31,635,872
  31,635,890
  31,636,194
  31,636,241
  31,637,721
  31,638,230
  31,638,745
  31,642,874
  31,643,859
  31,644,029
  31,644,489
  31,646,413
  31,646,910
  31,655,122
  31,656,694
  31,657,779
  31,658,316
  31,658,684
  31,658,909
  31,659,335
  31,659,539
  31,659,603
  31,659,810
  31,659,968
  31,660,090
  31,660,310
  31,660,960
  31,660,964
  31,661,807
  31,661,846
  31,662,189
  31,662,325
  31,662,607
  31,662,721
  31,662,787
  31,662,845
  31,662,920
  31,662,974
  31,663,214
  31,663,313
  31,663,346
  31,663,480
  31,663,523
  31,664,309
  31,664,653
  31,665,141
  31,665,297
  31,665,636
  31,665,884
  31,667,084
  31,668,643
  31,668,869
  31,669,176
  31,669,412
  31,670,232
  31,670,965
  31,671,845
  31,672,330
  31,672,861
  31,673,509
  31,673,892
  31,674,156
  31,675,109
  31,675,764
  31,676,316
  31,677,500
  31,677,777
  31,678,160
  31,678,221
  31,678,329
  31,679,193
  31,681,423
  31,681,684
  31,681,969
  31,682,723
  31,682,791
  31,682,963
  31,683,021
  31,683,476
  31,684,193
  31,684,271
  31,684,751
  31,685,200
  31,685,220
  31,685,515
  31,685,567
  31,686,211
  31,686,222
  31,686,263
  31,686,317
  31,686,526
  31,686,560
  31,687,166
  31,687,298
  31,687,884
  31,688,140
  31,688,291
  31,688,426
  31,691,366
  31,692,513
  31,695,733
  31,716,976
  31,718,224
  31,718,584
  31,720,675
  31,720,676
  31,721,290
  31,723,130
  31,723,253
  31,723,898
  31,724,818
  31,725,709
  31,726,042
  31,726,141
  31,726,409
  31,727,968
  31,728,616
  31,728,634
  31,728,883
  31,730,186
  31,731,714
  31,732,237
  31,732,489
  31,733,284
  31,735,517
  31,736,456
  31,740,823
  31,744,373
  31,745,244
  31,747,297
  31,749,133
  31,753,016
  31,753,096
  31,753,136
  31,753,652
  31,754,468
  31,754,952
  31,755,165
  31,755,392
  31,755,487
  31,756,420
  31,758,431
  31,758,823
  31,758,843
  31,760,233
  31,760,767
  31,761,261
  31,762,005
  31,762,862
  31,763,349
  31,763,549
  31,763,849
  31,764,969
  31,765,293
  31,766,507
  31,768,349
  31,769,688
  31,771,596
  31,772,788
  31,772,802
  31,772,921
  31,773,021
  31,773,058
  31,773,394
  31,773,500
  31,773,751
  31,773,871
  31,774,954
  31,776,438
  31,776,640
  31,778,146
  31,778,163
  31,779,610
  31,780,437
  31,781,208
  31,782,088
  31,788,849
  31,790,375
  31,793,575
  31,797,161
  31,805,563
  31,805,564
  31,805,609
  31,805,623
  31,805,939
  31,807,953
  31,810,524
  31,812,193
  31,812,198
  31,812,206
  31,812,221
  31,812,225
  31,812,253
  31,812,255
  31,814,048
  31,818,184
A
C
C
C
C
C
T
G
G
T
A
T
G
G
G
A
C
C
C
T
A
T
C
A
T
G
C
A
A
T
A
T
G
G
C
T
G
T
A
G
C
C
T
T
A
A
T
C
G
T
A
T
T
A
G
A
C
A
C
C
A
T
T
A
A
A
G
A
T
A
G
C
T
T
T
T
T
T
G
C
C
A
T
G
T
G
C
T
T
T
G
T
T
C
T
T
G
G
C
C
T
T
T
A
A
A
A
C
T
A
T
A
G
G
C
G
C
G
G
A
A
A
T
T
C
T
G
G
A
T
A
A
G
G
T
T
C
C
T
T
T
A
T
T
C
C
G
A
C
G
T
G
G
C
C
T
C
C
A
G
C
T
T
T
T
C
G
G
G
T
C
A
A
G
A
G
G
A
T
T
A
T
G
A
G
C
C
G
T
G
A
A
T
A
T
A
A
C
G
C
A
G
A
T
A/T
C/T
G
G
C
C
C
C
A
T
A
G
T
G
G
A
A
G
C
T
G
G
C
C
T
T
G
A
G
C
G
C
G
T
A
T
C
C
T
C
T
C
A
T
T
G
T
A
A
T
T
A
G
A
T
C
C
A
A
C
A
T
A/G
A
G
T
A
A
G
T
C
T
C
A
G
C
T
A
C
T
A
A
A
C
T
T
C
G
A
G
C
C
G
G
G
A
T
C
T
A
T
T
G
G
G
C
A
G
G
T
C
A
T
T
C
T
T
C
A
T
C
T
T
G
C/G
A
T
T
C
G
T
C
G
A
A
A
G
T
G
T
A
G
C/T
C/T
A/C
G/T
A/G
C/A
C/T
T
A