Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 250,025 (bp)   Positions: 591
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.003
.571
.0
.025
.981
.876
.999
.014
.006
.011
.008
.003
.001
.014
.001
1.0
.001
.005
.536
--
.376
.023
.7
.974
.0
.002
.0
.0
.001
.001
.001
.001
.0
.036
.002
.015
--
--
.002
.007
.021
.004
.136
.105
.017
.002
.0
.0
.003
.001
.106
.0
.004
.0
.0
.004
.005
.0
.002
.001
.0
.001
.001
.0
.001
.0
.0
.0
.0
.02
.0
.001
.001
.02
.004
.019
.0
.048
.001
.471
.0
.001
.0
.006
.038
.002
.001
.003
.005
.001
.008
.007
.068
.003
.03
.018
.007
.028
.002
.055
.418
.077
.0
.011
.001
.024
.0
.002
.002
.007
.001
.003
.001
.0
.067
.002
.002
.001
.0
.793
.0
.002
.0
.0
.0
.0
.011
.025
.042
.115
.006
.001
.0
.001
.015
.002
.011
.0
--
--
.008
.331
.13
.003
.001
.002
.951
.003
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.001
.0
.044
.115
.01
.032
.002
.0
.0
.0
.005
.006
.001
.003
.001
.003
.021
.308
.1
.0
.002
.028
.025
.001
.0
.002
.0
.001
.358
.001
.005
.001
.04
.007
.001
.0
.001
.973
.03
.005
.001
.0
.0
.0
.003
.027
.0
.001
.002
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.003
.001
.068
.003
.01
.016
.069
.003
.003
.027
.275
.022
.004
.029
.0
.02
.0
.06
.001
.001
.003
.005
.005
.092
.0
.0
.022
.024
.003
.0
.001
.002
.005
.054
.057
.002
.022
.419
.007
.002
--
--
.037
.005
.0
.0
--
--
--
.112
.015
.172
.019
.024
.005
.003
.002
--
--
.019
.031
--
--
--
--
--
--
--
--
.621
.119
--
.011
--
.076
--
--
.01
.001
.0
.0
.045
.019
.0
.001
.001
.013
.078
--
.03
.214
.001
.479
.001
.099
.049
.673
.001
.019
.002
--
--
.007
.0
.0
.004
.003
.001
.004
--
--
--
.004
.003
.0
.002
.0
.003
.003
.017
.006
.065
.014
.003
.018
.0
.231
.002
.386
.0
--
--
--
.006
.055
.0
.085
.213
.003
.001
.183
--
--
.003
.0
.008
.006
.001
.036
.0
.0
.001
.004
.0
.0
.046
.005
.0
.053
.049
.0
.008
.0
.004
.004
.01
.0
.0
.023
.012
.004
.0
--
--
--
--
--
--
--
.553
.032
.047
.005
.007
.013
.0
.0
.057
.572
.904
--
--
--
--
--
--
--
--
.028
.004
.001
.035
.04
.019
.033
.045
.001
.015
.41
.002
.0
.0
.0
.007
.066
.009
.015
.01
.017
.009
.415
.198
.42
.007
--
--
--
.022
.005
.002
.005
.006
.002
.002
.0
.0
.013
.003
.013
.0
.001
.262
.001
.0
.0
.0
.0
.001
.02
.001
.022
.0
.229
.001
.004
--
.003
.0
.006
.965
.992
--
--
--
.0
.0
.019
.0
.0
.06
.001
.006
.0
.002
.004
.001
.016
.997
.0
.067
.0
.001
.044
.008
.14
.008
.007
.001
.001
.229
.054
.046
.0
--
--
--
.001
.0
.005
.001
.0
.509
.001
.198
.001
.002
.001
.007
.054
.001
.125
.051
.011
.006
.025
.002
.0
.005
.0
.972
--
.0
.016
.0
.003
.0
--
--
--
--
--
--
.002
.0
.002
.143
.11
--
--
.16
.03
.0
--
.0
.0
.0
.0
.01
.001
.082
.067
.0
.0
.002
--
--
--
.006
.0
.001
.011
.007
.016
.005
.001
.002
1.0
.003
.0
.0
.484
.123
1.0
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
Mmp16
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
A
A
A
G
A
T
A
T
C
C
T
T
T
G
C
A
T
C
A
T
T
A
G
A
C
C
T
G
C
C
C
T
A
A
G
T
A
T
C
A
C
C
G
A
C
A
T
C
G
C
A
T
G
G
G
A
C
C
A
C
G
T
C
T
A
T
G
A
C
C
A
A
G
A
C
G
T
A
C
G
A
A
C
C
C
C
A
G
G
G
A
C
A
C
A
G
A
G
A
G
G
T
G
T
G
A
A
T
T
C
A
C
C
A
T
T
G
G
G
G
A
T
A
C
G
G
G
A
C
T
T
A
G
T
T
G
G
A
T
G
G
A
G
C
G
A
A
C
G
C
G
A
T
G
G
T
C
C
A
C
T
A
C
A
T
G
G
T
C
C
C
A
A
T
G
C
A
T
C
C
T
T
C
G
C
G
T
C
A
G
T
A
T
T
A
C
G
T
G
T
G
A
A
A
G
C
T
A
C
G
C
C
G
T
A
A
C
T
G
T
A
C
C
C
C
C
C
A
T
T
G
T
A
C
A
A
G
G
T
T
A
G
A
T
G
C
C
G
G
C
A
C
C
A
A
A
A
G
A
C
G
A
T
T
G
C
C
C
A
A
T
T
T
T
A
C
A
C
G
C
G
G
C
T
A
A
C
T
C
G
C
A
A
C
T
T
T
T
T
G
C
T
T
C
C
A
A
G
A
T
C
C
T
A
T
T
A
T
A
C
G
A
T
A
T
T
C
G
C
T
T
C
T
G
A
C
C
C
A
C
C
G
C
A
A
A
C
A
A
T
C
A
A
C
G
G
A
T
T
T
T
A
G
C
G
A
A
C
T
C
T
C
G
T
G
T
G
G
C
T
T
A
C
A
G
A
C
G
A
C
C
G
C
T
T
G
A
G
A
T
G
T
G
G
G
C
T
A
T
C
T
A
T
G
T
A
C
A
G
C
T
C
T
T
C
G
A
A
A
A
C
G
G
G
C
A
C
T
C
A
T
G
A
A
G
A
A
A
C
T
C
G
A
T
C
C
A
T
C
G
T
C
C
C
G
T
G
A
T
T
C
C
A
G
C
A
A
T
C
T
T
T
A
T
G
A
T
A
A
G
T
C
C
G
G
C
T
T
G
T
T
A
A
T
A
T
T
T
A
C
A
A
G
A
T
T
A
T
C
C
G
T
A
C
G
T
A
T
T
T
G
A
A
A
A
T
G
G
G
C
C
A
G
C
A
T
T
A
A
C
A
A
A
A
C
A
A
T
T
G
G
G
G
A
A
G
T
T
C
G
G
T
C
C
T
A
C
G
A
A
T
C
G
G
T
T
A
G
A
T
  31,568,364
  31,569,167
  31,569,226
  31,569,232
  31,569,390
  31,569,533
  31,569,737
  31,570,200
  31,570,782
  31,571,123
  31,571,135
  31,571,137
  31,571,181
  31,573,033
  31,573,503
  31,574,073
  31,574,590
  31,574,779
  31,575,448
  31,576,184
  31,576,998
  31,577,120
  31,577,320
  31,577,323
  31,577,700
  31,577,931
  31,578,038
  31,578,256
  31,578,298
  31,578,472
  31,578,513
  31,578,607
  31,579,669
  31,579,734
  31,580,521
  31,580,547
  31,580,850
  31,580,916
  31,581,124
  31,581,500
  31,581,663
  31,581,807
  31,581,846
  31,582,546
  31,582,975
  31,583,298
  31,583,372
  31,583,438
  31,583,565
  31,583,582
  31,583,628
  31,583,758
  31,583,842
  31,583,874
  31,583,996
  31,584,173
  31,584,833
  31,584,909
  31,585,197
  31,587,234
  31,590,451
  31,590,516
  31,590,756
  31,590,832
  31,591,008
  31,591,026
  31,591,094
  31,591,147
  31,591,156
  31,591,332
  31,591,538
  31,591,546
  31,591,647
  31,592,294
  31,592,326
  31,592,827
  31,593,042
  31,593,094
  31,593,130
  31,593,318
  31,593,484
  31,593,551
  31,593,652
  31,593,854
  31,593,954
  31,594,026
  31,594,157
  31,594,197
  31,594,330
  31,594,380
  31,594,444
  31,594,445
  31,594,451
  31,594,562
  31,594,632
  31,594,692
  31,594,992
  31,595,862
  31,596,226
  31,596,363
  31,596,423
  31,596,761
  31,598,221
  31,598,251
  31,598,362
  31,598,865
  31,598,941
  31,599,188
  31,599,189
  31,599,551
  31,599,556
  31,599,722
  31,599,785
  31,599,821
  31,600,093
  31,600,113
  31,600,302
  31,600,999
  31,601,007
  31,601,241
  31,601,452
  31,601,938
  31,602,002
  31,602,760
  31,602,824
  31,603,358
  31,603,430
  31,603,701
  31,603,884
  31,603,907
  31,603,944
  31,604,040
  31,604,298
  31,604,492
  31,604,658
  31,605,027
  31,605,326
  31,605,949
  31,606,104
  31,606,278
  31,606,511
  31,606,537
  31,606,673
  31,607,029
  31,607,480
  31,607,573
  31,607,672
  31,607,964
  31,608,295
  31,608,805
  31,608,871
  31,608,920
  31,608,928
  31,608,998
  31,609,105
  31,609,131
  31,609,159
  31,609,381
  31,609,382
  31,609,412
  31,609,586
  31,609,599
  31,610,076
  31,610,082
  31,610,173
  31,610,214
  31,610,321
  31,610,329
  31,610,476
  31,610,519
  31,610,563
  31,610,567
  31,610,585
  31,611,048
  31,612,614
  31,612,897
  31,613,261
  31,613,294
  31,613,353
  31,613,407
  31,613,460
  31,615,105
  31,615,549
  31,615,581
  31,615,872
  31,616,255
  31,616,538
  31,616,701
  31,617,042
  31,617,678
  31,618,139
  31,618,424
  31,619,221
  31,619,429
  31,620,653
  31,621,646
  31,621,674
  31,621,784
  31,621,886
  31,622,706
  31,622,991
  31,624,482
  31,624,641
  31,624,804
  31,625,259
  31,625,483
  31,626,082
  31,627,480
  31,627,516
  31,627,702
  31,627,752
  31,627,830
  31,627,849
  31,627,909
  31,628,396
  31,628,537
  31,628,648
  31,628,795
  31,629,276
  31,629,665
  31,630,076
  31,630,172
  31,631,258
  31,631,314
  31,631,485
  31,631,606
  31,632,020
  31,632,155
  31,632,356
  31,632,797
  31,632,904
  31,632,934
  31,632,980
  31,633,549
  31,633,714
  31,634,038
  31,634,124
  31,634,234
  31,634,699
  31,634,737
  31,635,383
  31,635,640
  31,635,860
  31,635,872
  31,635,890
  31,635,891
  31,636,194
  31,636,241
  31,637,721
  31,638,230
  31,638,627
  31,638,745
  31,639,741
  31,640,756
  31,642,874
  31,643,859
  31,644,029
  31,644,489
  31,646,413
  31,646,617
  31,646,815
  31,655,122
  31,656,694
  31,657,779
  31,658,170
  31,658,909
  31,659,335
  31,659,539
  31,659,603
  31,659,810
  31,659,968
  31,660,090
  31,660,310
  31,660,960
  31,660,964
  31,661,807
  31,661,846
  31,662,189
  31,662,325
  31,662,607
  31,662,787
  31,662,845
  31,662,920
  31,662,974
  31,663,214
  31,663,313
  31,663,346
  31,663,480
  31,663,523
  31,664,017
  31,664,309
  31,664,653
  31,665,141
  31,665,181
  31,665,198
  31,665,636
  31,667,084
  31,668,643
  31,668,869
  31,669,176
  31,669,412
  31,670,232
  31,670,965
  31,671,845
  31,672,113
  31,672,330
  31,672,861
  31,673,509
  31,674,156
  31,675,109
  31,675,764
  31,676,316
  31,677,004
  31,677,713
  31,677,777
  31,678,160
  31,678,221
  31,678,329
  31,678,914
  31,679,193
  31,681,423
  31,681,684
  31,681,969
  31,682,723
  31,682,791
  31,682,963
  31,683,021
  31,683,476
  31,684,193
  31,684,271
  31,684,751
  31,685,200
  31,685,220
  31,685,515
  31,685,567
  31,686,211
  31,686,222
  31,686,263
  31,686,317
  31,686,526
  31,686,560
  31,686,880
  31,687,166
  31,687,884
  31,688,140
  31,688,426
  31,689,689
  31,690,438
  31,690,523
  31,690,971
  31,691,033
  31,691,366
  31,691,563
  31,691,687
  31,692,454
  31,692,572
  31,692,779
  31,692,788
  31,693,985
  31,694,738
  31,695,733
  31,697,241
  31,699,252
  31,701,797
  31,701,832
  31,701,935
  31,702,091
  31,702,144
  31,702,171
  31,702,264
  31,702,284
  31,702,291
  31,702,407
  31,702,711
  31,703,074
  31,704,017
  31,704,027
  31,704,028
  31,704,181
  31,704,431
  31,704,459
  31,704,575
  31,704,697
  31,704,780
  31,704,821
  31,705,094
  31,705,414
  31,706,263
  31,706,532
  31,706,870
  31,707,075
  31,707,115
  31,707,163
  31,707,326
  31,707,628
  31,707,640
  31,707,807
  31,708,198
  31,708,206
  31,708,417
  31,708,436
  31,708,437
  31,708,523
  31,709,038
  31,709,061
  31,709,390
  31,709,420
  31,709,727
  31,709,823
  31,710,014
  31,710,133
  31,710,245
  31,710,412
  31,710,552
  31,711,521
  31,711,819
  31,712,422
  31,712,545
  31,712,614
  31,713,005
  31,713,043
  31,713,116
  31,713,657
  31,714,233
  31,714,623
  31,714,840
  31,715,119
  31,715,231
  31,715,494
  31,715,495
  31,715,496
  31,715,576
  31,715,969
  31,716,109
  31,716,372
  31,716,373
  31,716,526
  31,716,530
  31,716,838
  31,716,878
  31,716,977
  31,717,477
  31,718,224
  31,718,702
  31,718,719
  31,720,211
  31,720,389
  31,720,399
  31,720,675
  31,720,676
  31,721,292
  31,721,328
  31,721,543
  31,721,892
  31,721,969
  31,722,318
  31,722,367
  31,722,465
  31,722,532
  31,722,632
  31,722,838
  31,723,078
  31,723,186
  31,723,648
  31,723,649
  31,724,378
  31,725,267
  31,725,709
  31,726,141
  31,726,202
  31,726,918
  31,727,063
  31,727,385
  31,727,970
  31,728,883
  31,729,143
  31,729,699
  31,730,512
  31,730,700
  31,732,237
  31,732,488
  31,732,549
  31,733,284
  31,733,321
  31,733,911
  31,735,132
  31,735,517
  31,735,529
  31,735,956
  31,736,033
  31,736,190
  31,736,560
  31,736,565
  31,736,991
  31,737,406
  31,738,441
  31,740,169
  31,740,277
  31,740,709
  31,740,823
  31,741,111
  31,742,476
  31,742,989
  31,743,267
  31,743,879
  31,744,441
  31,744,743
  31,745,244
  31,746,006
  31,746,704
  31,747,297
  31,747,706
  31,747,900
  31,748,725
  31,749,133
  31,753,016
  31,753,096
  31,753,319
  31,754,952
  31,755,392
  31,756,715
  31,757,666
  31,758,823
  31,759,708
  31,759,730
  31,761,261
  31,762,823
  31,762,862
  31,763,349
  31,763,549
  31,763,800
  31,763,849
  31,764,969
  31,765,203
  31,765,293
  31,765,898
  31,768,349
  31,769,688
  31,771,596
  31,773,751
  31,779,982
  31,780,798
  31,781,208
  31,783,040
  31,783,789
  31,783,861
  31,784,236
  31,784,371
  31,785,190
  31,785,390
  31,787,944
  31,788,075
  31,788,267
  31,790,266
  31,790,375
  31,791,223
  31,791,321
  31,791,564
  31,791,572
  31,791,986
  31,792,472
  31,793,067
  31,793,818
  31,793,927
  31,794,043
  31,794,203
  31,795,345
  31,795,786
  31,795,890
  31,797,161
  31,797,208
  31,797,955
  31,798,547
  31,799,172
  31,800,066
  31,801,288
  31,804,090
  31,804,226
  31,805,563
  31,805,564
  31,805,609
  31,805,623
  31,805,939
  31,805,957
  31,809,389
  31,813,743
  31,813,933
  31,814,048
  31,816,643
  31,817,477
  31,817,961
T
C
T
G
A
G
G
G
C
T
T
C
A
C
A
T
C
C
T
G
C
C
G
T
G
T
G
G
A
T
T
T
A
G
C
A
C
G
A
T
T
T
T
A
G
G
T
C
A
A
T
G
C
A
A
C
G
A
G
C
T
A
G
T
C
G
A
A
T
T
A
G
G
A
C
T
A
C
T
T
A
G
C
A
A
T
A
G
A
A
T
G
T
T
T
C
T
G
C
T
T
A
A
T
A
T
G
G
G
C
T
G
T
A
G
C
C
T
T
A
A
T
C
G
T
T
T
A
G
A
C
C
C
A
C
C
A
T
G
A
A
A
G
A
T
A
G
C
T
T
T
T
G
C
C
A
A
T
G
T
G
C
T
T
T
G
T
T
C
T
T
G
G
C
C
T
T
T
A
A
A
A
C
T
A
T
A
G
G
C
C
G
C
C
G
G
A
A
A
T
A
C
T
G
G
A
T
G
G
A
A
T
A
A
G
G
T
T
C
C
C
T
T
T
T
A
T
T
C
C
G
A
C
G
T
G
G
C
T
C
C
C
A
G
C
T
T
T
T
T
T
C
T
T
G
G
G
T
C
G
T
A
G
A
C
A
T
T
A
T
G
A
G
C
C
G
T
G
A
A
A
T
A
A
C
G
C
A
G
T
A
T
A/T
A/T
C/A
G
C
C
C
C
A
T
A
G
A
T
G
G
A
G
C
T
G
C
G
C
C
T
C
T
G
A
G
C
G
C
G
T
A
T
C
C
T
C
T
C
A
T
T
G
T
T
A
T
T
G
C
G
G
G
C
A
G
C
G
T
A
G
C
C
C
A
G
C
T
A
C
G
T
A
A
C
G
A
C
A
C
A
T
T
C
C
G
T
G
A
G
A
A
T
T
A
A
T
A
C
T
T
A
T
C
A
A
T
A
A
T
C
C
A
T
C
G
C
A
C
G
A
T
A
T
C
A
C
C
G
A
G
C
T
G
T
A
T
A
G
C
T
A
T
C
C
A
C
G
A
C
G
C
A
G
T
C
C
C
T
G
T
C
T
A
C
T
T
T
T
C
A
G
C
C
T
T
T
A
T
C
G
C
T
C
G
C
C
A
C
T
G
G
G
A
G
G
A
C
T
T
C
G
A
C
G
G
G
C
G
C
C
G
C
T
G
G
C
T
C
G
G
C
G
T
C
C
G
T
T
C
G
G
C
C
A
G
G
G
C
C
A
T
C
A
T
G
T
T
C
C
C
G
G
A
T
C
G
G
G
G
G
C
G
A
A
C
A
G
G
A
G
C
A
A
A
A
T
A
G
G
T
A
G
T
G
T
A
A
C
C
T
A
C
G