Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 103,436 (bp)   Positions: 508
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.037
.141
.003
.009
.922
.0
.006
.0
.004
.0
.001
.0
.012
.012
.03
.003
.003
.006
.004
.829
.001
.0
.004
.001
.001
.033
.054
.004
.024
.034
.0
.014
.006
.002
.0
.001
.002
.001
.023
.01
.001
.007
.093
.01
.042
.005
.0
.054
.976
.901
.03
.955
.995
.994
.99
.269
.642
.018
.005
.044
.009
.15
.01
.0
.142
.998
.002
.047
.009
.005
.038
.013
.0
.001
.006
.005
.005
.823
.037
.002
.013
.025
.019
.053
.139
.176
.0
.0
.001
.003
--
--
--
--
--
--
--
.005
.01
.003
.004
.008
.181
.155
.011
.002
.004
.006
.01
.015
.052
.023
.009
.005
.004
.006
.002
.002
.137
.003
.003
.0
.005
.004
.002
.002
.0
.001
.001
.002
.001
.001
.0
.002
.001
.001
.059
.002
.0
.002
.014
.006
.017
.029
.031
.034
.014
.001
.016
.001
.009
.001
.0
.001
.001
.005
.0
.002
.189
.002
.018
.013
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.0
.0
.0
.0
.005
.0
.002
.037
.037
.032
.12
.017
.013
.004
.002
.001
.0
.0
.001
.003
.002
.001
.164
.998
.007
.013
.0
.001
.007
.0
.012
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.002
.0
.002
.067
.202
.0
.006
.003
.0
.001
.001
.0
.0
.006
.002
.002
.003
.001
.0
.0
.001
.0
.002
.109
.089
.061
.004
.004
.001
.002
.001
.219
.001
.002
.741
.0
.001
.049
.001
.02
.008
.093
.001
.012
.006
.281
.252
.001
.003
.063
.004
.0
.034
.0
.0
.005
.001
.0
.001
.002
.001
.576
.09
--
--
.002
.003
.093
.03
.001
.001
.002
.017
.0
.139
.002
.118
.056
.066
.012
.014
.107
.0
.001
.654
.009
.063
.0
.085
.022
.012
.002
.148
.146
.001
.002
.001
.009
.002
.002
.803
.215
.011
.026
.022
.003
.001
.467
.006
.003
.801
.026
.007
.042
.047
.028
.026
.035
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.069
.237
.284
.338
.047
.01
.007
.01
.002
.001
.001
.0
.028
.008
.013
.001
.044
.001
.001
.012
.007
.006
.002
.015
.008
.001
.001
.005
.022
.339
.01
.004
.077
.011
.039
.032
.023
.006
.07
.065
.003
.002
.076
.064
.016
.068
.099
.129
.018
.013
.021
.012
.0
.0
.006
.0
.0
.004
.01
.0
.002
.005
.011
.004
.008
.126
.007
.419
.001
.012
.041
.027
.033
.748
.755
.762
.501
.013
.001
.0
.011
.22
.001
.003
.002
.01
.004
.001
.856
.001
.001
.0
.105
.153
.216
.28
.109
.001
.0
.001
.002
.004
.001
.021
.3
.11
.031
.0
.0
.0
.139
.0
.0
.0
.016
.032
.143
.006
--
--
--
.074
.043
.015
.058
.994
.0
.001
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
G
G
C
C
T
C
C
T
C
C
C
T
C
23
T
G
3
C
G
C
C
T
G
-
T
A
G
C
-
G
C
C
G
G
-
2
A
C
-
A
C
C
-
G
C
T
C
-
C
A
-
2
T
A
-
C
T
-
A
G
9
T
T
C
C
G
T
C
G
A
C
C
-
T
T
A
T
G
C
A
C
G
G
-
G
-
-
A
T
T
-
-
C
A
2
T
C
C
3
G
G
G
-
A
-
C
-
C
A
A
A
T
G
G
G
G
G
G
T
A
G
T
A
T
G
G
T
A
T
G
-
A
A
C
-
T
T
C
T
T
T
T
C
A
C
A
A
T
G
2
C
T
T
C
G
C
A
T
C
-
G
-
-
C
-
-
A
A
-
-
A
G
-
3
C
C
A
T
G
-
C
A
-
T
C
C
A
T
G
A
T
-
T
T
T
G
G
G
C
A
A
G
4
-
-
-
-
C
C
-
-
G
T
C
A
-
3
-
C
G
G
C
3
C
C
C
A
5
T
A
A
C
A
C
G
-
2
G
G
T
C
C
A
T
G
C
C
T
G
A
A
-
C
A
C
G
A
A
A
C
C
G
C
T
C
T
A
T
C
A
-
3
C
-
C
G
A
G
T
G
T
A
A
T
T
T
-
G
A
C
C
T
T
G
A
T
A
A
A
4
C
A
C
G
-
T
11
C
A
A
G
G
C
A
C
G
C
A
G
-
C
T
3
T
T
T
T
C
C
T
T
T
A
T
C
-
G
-
C
T
T
T
-
A
G
G
T
T
C
A
-
-
A
G
T
2
T
T
T
4
C
T
A
C
C
G
T
C
C
C
T
A
T
T
G
T
A
C
A
2
T
G
2
G
A
C
-
T
A
A
T
C
C
G
C
G
G
A
T
T
C
C
G
A
G
T
T
T
G
T
C
T
T
A
G
T
A
G
T
T
T
C
A
T
2
G
-
C
A
4
-
-
C
T
-
T
-
G
C
G
G
G
G
T
C
T
A
C
A
T
A
A
G
C
C
-
A
C
T
G
T
T
T
G
-
G
G
T
C
T
C
A
T
T
G
G
T
-
C
A
T
A
T
C
C
G
C
-
T
G
A
C
A
-
C
A
C
T
T
T
-
T
G
G
2
A
C
C
  149,213,154
  149,213,167
  149,213,230
  149,213,745
  149,215,004
  149,215,613
  149,216,131
  149,217,661
  149,218,092
  149,218,467
  149,219,822
  149,220,240
  149,221,116
  149,221,249
  149,222,191
  149,222,502
  149,222,989
  149,223,508
  149,223,791
  149,224,039
  149,224,510
  149,225,334
  149,225,616
  149,225,666
  149,225,769
  149,226,054
  149,226,853
  149,226,977
  149,227,142
  149,227,410
  149,227,481
  149,227,492
  149,228,041
  149,228,232
  149,228,308
  149,228,467
  149,228,469
  149,228,555
  149,228,635
  149,228,647
  149,228,669
  149,228,675
  149,228,713
  149,228,730
  149,228,735
  149,228,823
  149,228,840
  149,228,858
  149,228,868
  149,228,875
  149,228,886
  149,229,169
  149,229,179
  149,229,180
  149,229,214
  149,229,224
  149,229,234
  149,229,322
  149,229,358
  149,229,363
  149,231,159
  149,231,243
  149,231,686
  149,232,863
  149,233,906
  149,233,980
  149,235,271
  149,235,301
  149,235,743
  149,236,095
  149,236,578
  149,236,732
  149,237,483
  149,237,568
  149,237,574
  149,238,214
  149,239,281
  149,240,271
  149,241,477
  149,242,231
  149,243,099
  149,243,363
  149,244,688
  149,245,465
  149,245,469
  149,245,476
  149,247,399
  149,248,772
  149,250,393
  149,251,646
  149,253,980
  149,253,991
  149,254,000
  149,254,008
  149,254,015
  149,254,221
  149,254,222
  149,255,787
  149,256,361
  149,256,366
  149,256,368
  149,256,371
  149,256,380
  149,256,402
  149,256,413
  149,256,432
  149,256,436
  149,256,444
  149,256,447
  149,256,448
  149,256,465
  149,256,472
  149,256,480
  149,256,483
  149,256,485
  149,256,486
  149,256,546
  149,256,550
  149,257,257
  149,257,401
  149,257,438
  149,258,146
  149,258,871
  149,258,880
  149,259,260
  149,259,385
  149,259,513
  149,259,642
  149,259,809
  149,259,933
  149,260,183
  149,260,764
  149,260,766
  149,261,271
  149,261,649
  149,262,175
  149,262,432
  149,263,758
  149,263,779
  149,263,847
  149,263,877
  149,264,863
  149,265,349
  149,265,945
  149,266,622
  149,266,641
  149,266,836
  149,266,848
  149,266,854
  149,266,962
  149,267,144
  149,267,358
  149,267,395
  149,267,464
  149,267,533
  149,267,551
  149,267,554
  149,267,733
  149,268,215
  149,268,244
  149,268,248
  149,268,299
  149,268,350
  149,268,354
  149,268,374
  149,268,403
  149,268,409
  149,268,415
  149,268,468
  149,268,492
  149,268,534
  149,268,718
  149,268,755
  149,268,757
  149,268,811
  149,268,822
  149,268,835
  149,268,886
  149,268,887
  149,268,910
  149,268,929
  149,268,939
  149,268,944
  149,269,265
  149,269,581
  149,269,782
  149,269,783
  149,269,787
  149,269,861
  149,269,912
  149,269,941
  149,270,295
  149,270,312
  149,270,411
  149,270,582
  149,270,594
  149,270,751
  149,270,822
  149,270,858
  149,271,161
  149,271,663
  149,271,913
  149,271,930
  149,271,975
  149,271,980
  149,271,997
  149,272,005
  149,272,043
  149,272,391
  149,272,588
  149,272,934
  149,273,458
  149,273,467
  149,273,787
  149,273,875
  149,273,963
  149,274,069
  149,274,096
  149,274,176
  149,274,194
  149,274,283
  149,274,314
  149,274,340
  149,274,346
  149,274,463
  149,275,755
  149,275,864
  149,275,960
  149,275,973
  149,276,006
  149,276,148
  149,276,370
  149,276,402
  149,276,624
  149,276,639
  149,276,851
  149,276,993
  149,277,078
  149,277,366
  149,277,369
  149,277,376
  149,277,380
  149,277,431
  149,277,492
  149,277,493
  149,278,041
  149,278,249
  149,278,667
  149,278,821
  149,278,893
  149,278,915
  149,279,524
  149,279,580
  149,279,699
  149,279,810
  149,279,985
  149,280,127
  149,280,591
  149,280,742
  149,281,085
  149,281,696
  149,282,289
  149,282,369
  149,282,648
  149,282,784
  149,282,804
  149,282,963
  149,283,349
  149,283,731
  149,283,894
  149,283,922
  149,284,351
  149,284,467
  149,284,553
  149,284,776
  149,284,886
  149,285,092
  149,285,178
  149,285,257
  149,285,358
  149,285,373
  149,285,386
  149,285,429
  149,285,570
  149,286,146
  149,286,491
  149,287,673
  149,288,024
  149,288,152
  149,288,479
  149,288,604
  149,289,075
  149,289,134
  149,289,212
  149,289,236
  149,289,307
  149,289,459
  149,289,500
  149,289,593
  149,289,637
  149,289,765
  149,290,242
  149,290,298
  149,290,330
  149,290,357
  149,290,502
  149,290,525
  149,290,590
  149,290,602
  149,290,634
  149,290,676
  149,290,706
  149,290,803
  149,290,944
  149,290,982
  149,290,990
  149,291,085
  149,291,304
  149,291,313
  149,291,347
  149,291,354
  149,291,477
  149,291,559
  149,291,567
  149,291,613
  149,291,724
  149,291,734
  149,291,857
  149,291,997
  149,292,036
  149,292,055
  149,292,059
  149,292,080
  149,292,152
  149,292,159
  149,292,223
  149,292,258
  149,292,275
  149,292,290
  149,292,292
  149,292,313
  149,292,342
  149,292,458
  149,292,507
  149,292,508
  149,292,520
  149,292,841
  149,292,851
  149,292,967
  149,292,973
  149,292,979
  149,292,982
  149,292,983
  149,292,986
  149,292,993
  149,293,019
  149,293,042
  149,293,044
  149,293,086
  149,293,154
  149,293,239
  149,293,257
  149,293,304
  149,293,311
  149,293,312
  149,293,345
  149,293,381
  149,293,389
  149,293,396
  149,296,349
  149,296,359
  149,297,858
  149,297,895
  149,300,440
  149,300,458
  149,300,507
  149,300,510
  149,300,535
  149,300,544
  149,300,594
  149,300,642
  149,300,724
  149,300,730
  149,300,751
  149,300,789
  149,300,873
  149,301,014
  149,301,025
  149,301,043
  149,301,057
  149,301,058
  149,301,076
  149,301,087
  149,301,148
  149,301,223
  149,301,236
  149,301,240
  149,301,323
  149,301,335
  149,301,339
  149,301,365
  149,301,367
  149,301,404
  149,301,436
  149,301,526
  149,301,538
  149,301,593
  149,301,617
  149,301,726
  149,301,753
  149,301,824
  149,301,850
  149,301,874
  149,301,898
  149,301,924
  149,301,938
  149,301,940
  149,301,949
  149,301,967
  149,302,038
  149,302,063
  149,302,065
  149,302,178
  149,302,182
  149,302,237
  149,302,273
  149,302,290
  149,303,257
  149,303,266
  149,303,532
  149,303,584
  149,304,648
  149,304,767
  149,305,461
  149,305,515
  149,305,519
  149,305,749
  149,305,934
  149,306,187
  149,306,251
  149,306,304
  149,306,361
  149,306,379
  149,306,403
  149,306,721
  149,306,746
  149,306,758
  149,306,926
  149,306,935
  149,307,305
  149,307,324
  149,307,393
  149,307,401
  149,307,696
  149,307,729
  149,307,784
  149,307,803
  149,307,911
  149,308,016
  149,308,027
  149,308,211
  149,308,370
  149,308,472
  149,308,538
  149,308,716
  149,308,750
  149,308,801
  149,308,890
  149,308,941
  149,309,108
  149,309,135
  149,309,497
  149,309,555
  149,309,568
  149,309,571
  149,309,581
  149,309,589
  149,309,647
  149,309,795
  149,309,852
  149,309,886
  149,309,991
  149,309,995
  149,310,003
  149,310,029
  149,310,138
  149,310,145
  149,310,175
  149,310,230
  149,310,263
  149,310,289
  149,310,307
  149,310,308
  149,310,371
  149,310,540
  149,310,545
  149,310,553
  149,310,617
  149,311,203
  149,311,220
  149,311,303
  149,311,549
  149,312,171
  149,312,392
  149,312,808
  149,313,066
  149,313,376
  149,313,423
C
C
-
T
C
T
T
C
T
A
-
A
G
-
C
A
-
-
A
T
T
C
A
A
A
G
C
G
4
A
T
T
A
A
9
-
T
-
C
-
-
-
A
-
-
C
A
T
G
-
G
-
A
T
G
-
A
A
-
-
-
C
C
-
T
A
G
T
A
G
G
T
3
-
C
-
C
A
T
C
-
T
A
4
A
2
-/A
G
C
G
T
4
-
-
-
C
T
T
-
T
C
T
A
-
A
-
T
G
G
G
G
C
C
A
C
T
A
T
G
G
T
C
C
C
C
A
C
T
C
A
A
-
-
G
C
C
G
A
-
A
C
C
A
G
T
G
G
C
C
-
T
C
G
T
A
-
G
C
G
5
-
T
G
-
A
G
-
T
C
G
G
C
G
-
T
T
-
G
T
2
-
-
G
C
T
T
G
G
A
G
G
G
C
C
C
A
C
A
T
C
T
A
-
A
T
T
T
T
A
14
T
T
-
T
-
C
-
G
-
-
-
-
-
-
T
T
G
-
G
T
G
T
G
T
-
T
-
T
A
C
T
T
-
C
A
G
A
G
A
C
-
3
T
G
A
A
G
-
C
T
T
A
A
C
T
C
G
C
T
G
4
-
T
2
T
A
T
A
C
C
-
C
G
C
C
C
2
A
G
T
T
C
A
A
G
C
T
G
G
-
G
-
T
C
A/A
A
-
T
C
G
A
A
T
G
T
A
T
G
A
A
T
-
-
G
C
C
-
A
T
C
C
C
G
C
T
T
T
4
T
G
C
C
A
G
A
A
C
C
T
G
3
3
C
T
G
-
A
A
C
-
T
G
T
T
G
C
C
T
A
A
C
A/C
T/A
G
A
C
G
T
T
-
G
A
-
A
T
T
G
C
G
G
A
T
T
A
-
A
C
G
G
C
A
T
A
T
A
C
C
C
A
G
T
C
A
G
C
C
T
A
C
C
C
T
G
G
-
A
T/T
T
G
-
T
T
T/T
C
3
C
2
A
T
A
A
T
A
-
T
G
G
T
G
C
C
T
A
T
T
4
T
T
C
A
-
C
-
A
3
T
T
A
G
C
G
C
G
G
T
T
C
2
G
G
C
C
C
T
A
T
T
4
C
C
G
T
G
T
T
C
-
G
A
C
A
A
T
-
-
G
G
G