Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 849,835 (bp)   Positions: 329
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.018
.015
.001
.001
.003
.003
.001
.003
.004
.001
.001
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.012
.018
.651
.01
.016
.017
.007
.008
.01
.006
.015
.015
.017
.008
.0
.012
.083
.005
.005
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.002
.003
.006
.006
.183
.236
--
.001
.006
.002
.0
.001
.0
.282
.001
.002
.0
.0
.051
.001
.0
.0
.005
.017
.001
.02
.003
.0
.034
.022
.025
.05
.0
.009
.001
.002
.003
.0
.003
.0
.0
.013
.016
.001
.001
.002
.006
.0
.003
.002
.027
.02
.072
.072
.003
.005
.006
.0
.001
.001
.005
.002
.002
.001
.015
.0
.002
.055
.024
.002
.032
.006
.001
.0
.003
.001
.001
.004
.015
.033
.006
.001
.0
.001
.0
.0
.0
.001
.019
.023
.032
.005
.0
.001
.718
.605
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.012
.002
.005
.002
.012
.023
--
--
--
--
--
--
--
.0
.0
.001
.001
.0
.0
.0
.0
.0
.001
.005
.017
.021
.007
.002
.003
.0
.006
.002
.289
.022
.001
.002
.009
.002
.005
.002
.003
.003
--
.009
.0
.004
.003
.001
.001
.001
.002
.005
.004
.002
.062
.025
.281
.004
.0
.043
.001
.007
.006
.0
.0
.0
.001
.0
.0
.002
.0
.0
.0
.0
.001
.002
.083
.29
.011
.003
.003
.002
.001
.001
.003
--
--
--
.0
.0
.0
.001
.016
.032
.015
.011
.026
.011
.002
.002
.027
.036
.081
.09
.147
.359
.034
.017
.008
.002
.015
.001
.001
.002
.021
.014
.014
.015
.008
.01
.011
.014
.057
--
--
.003
--
.001
.044
--
--
.168
.0
.001
.005
.004
.006
.012
.009
.013
.012
.005
.008
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Mdga2
Mdga2
Mdga2
Mdga2
Mdga2
Mdga2
Mdga2
Mdga2
Mdga2
Mdga2
Mdga2
Mdga2
Mdga2
Mdga2
Mdga2
Mdga2
Mdga2
Mdga2
Mdga2
Mdga2
Mdga2
Mdga2
Mdga2
Mdga2
Mdga2
Mdga2
Mdga2
Mdga2
Mdga2
Mdga2
Mdga2
Mdga2
Mdga2
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
A
G
G
A
G
A
-
-
A
A
G
C
-
G
2
-
C
C
C
G
G
G
C
G
A
A
G
T
-
T
-
T
T
C
T
C
C
T
C
C
C
-
C
-
C
-
-
-
-
C
A
G
G
-
T
G
A
T
A
A
G
3
2
-
4
G
T
G
-
G
G
G
A
2
2
T
A
C
-
A
-
G
-
-
-
-
T
-
-
G
-
-
-
-
-
G
G
-
A
-
G
-
-
-
-
-
C
-
-
2
G
A
C
-
C
-
-
T
T
-
C
G
-
-
-
-
G
-
-
G
A
-
T
A
T
-
T
T
T
G
G
-
T
-
-
T
3
-
-
G
-
-
-
C
G
-
C
-
G
C
A
C
2
A
A
G
-
G
C
A
T
T
T
T
T
-
2
8
3
C
13
C
C
A
C
C
-
-
2
A
C
G
G
2
G
T
T
-
C
10
2
-
G
T
3
C
-
T
G
C
-
T
A
G
-
-
-
T
T
A
C
C
2
G
G
C
G
C
-
A
-
T
A
T
A
A
T
-
T
T
G
-
A
T
G
C
C
-
C
A
T
G
C
A
G
-
C
-
A
T
A
A
-
C
A
G
A
C
T
G
C
G
G
A
T
T
T
T
3
C
-
-
A
-
T
T
T
A
-
-
-
A
-
-
C
T
-
-
A
7
T
A
4
T
T
G
C
A
T
2
C
G
A
-
2
C
C
2
-
T
C
-
-
A
-
T
-
-
-
  88,465,953
  88,488,571
  88,488,580
  88,488,592
  88,488,593
  88,488,601
  88,488,607
  88,488,615
  88,488,623
  88,488,647
  88,488,654
  88,488,666
  88,508,665
  88,514,096
  88,521,496
  88,521,499
  88,521,516
  88,521,572
  88,521,583
  88,521,869
  88,521,875
  88,521,884
  88,521,946
  88,521,955
  88,521,970
  88,521,977
  88,521,979
  88,522,021
  88,578,378
  88,578,381
  88,582,747
  88,582,799
  88,582,805
  88,582,818
  88,582,820
  88,582,823
  88,582,837
  88,582,838
  88,582,843
  88,582,847
  88,582,850
  88,582,861
  88,582,864
  88,582,889
  88,582,937
  88,587,094
  88,603,376
  88,611,436
  88,611,456
  88,611,468
  88,611,487
  88,611,497
  88,611,507
  88,611,514
  88,611,515
  88,611,517
  88,611,524
  88,611,538
  88,611,539
  88,611,562
  88,611,568
  88,611,580
  88,611,585
  88,611,592
  88,611,594
  88,611,600
  88,611,608
  88,611,612
  88,611,629
  88,611,639
  88,611,644
  88,611,789
  88,611,794
  88,615,952
  88,616,000
  88,617,021
  88,617,984
  88,617,994
  88,618,097
  88,618,102
  88,618,126
  88,618,306
  88,618,357
  88,618,548
  88,618,701
  88,618,842
  88,619,001
  88,619,179
  88,619,196
  88,619,206
  88,619,221
  88,619,222
  88,619,231
  88,619,258
  88,619,261
  88,619,276
  88,619,282
  88,619,288
  88,619,295
  88,619,315
  88,619,325
  88,619,331
  88,619,342
  88,619,351
  88,619,386
  88,619,387
  88,619,401
  88,619,429
  88,619,434
  88,619,436
  88,619,443
  88,619,444
  88,619,450
  88,619,464
  88,619,471
  88,619,485
  88,619,499
  88,619,505
  88,619,543
  88,619,546
  88,619,552
  88,619,557
  88,619,570
  88,619,583
  88,619,589
  88,619,599
  88,619,610
  88,619,615
  88,619,622
  88,619,638
  88,619,640
  88,619,666
  88,619,675
  88,619,684
  88,619,697
  88,619,716
  88,619,727
  88,619,733
  88,619,740
  88,619,766
  88,619,792
  88,619,797
  88,619,810
  88,619,830
  88,619,839
  88,619,842
  88,619,862
  88,619,867
  88,619,887
  88,619,892
  88,619,897
  88,619,900
  88,619,905
  88,619,911
  88,619,916
  88,619,933
  88,619,938
  88,619,944
  88,619,961
  88,619,967
  88,619,973
  88,619,980
  88,619,983
  88,629,790
  88,629,793
  88,694,592
  88,725,574
  88,771,455
  88,771,739
  88,771,952
  88,772,125
  88,772,386
  88,772,420
  88,811,695
  88,814,847
  88,840,457
  88,840,460
  88,840,463
  88,840,474
  88,840,477
  88,840,481
  88,840,497
  88,840,498
  88,840,499
  88,840,504
  88,840,505
  88,866,235
  88,866,240
  88,866,243
  88,885,882
  88,887,590
  88,887,593
  88,890,158
  88,890,165
  88,890,201
  88,890,219
  88,890,256
  88,890,268
  88,890,287
  88,892,627
  88,892,650
  88,892,658
  88,892,663
  88,892,664
  88,892,668
  88,892,673
  88,892,675
  88,892,676
  88,892,778
  88,892,779
  88,892,781
  88,892,796
  88,892,800
  88,892,807
  88,892,811
  88,892,814
  88,892,821
  88,892,827
  88,892,855
  88,892,889
  88,892,899
  88,892,940
  88,892,949
  88,892,967
  88,893,002
  88,893,046
  88,893,089
  88,893,090
  88,896,367
  88,899,942
  88,899,951
  88,899,955
  88,899,956
  88,899,965
  88,899,967
  88,899,971
  88,900,018
  88,900,029
  88,900,072
  88,900,086
  88,900,096
  88,900,110
  88,900,252
  88,900,281
  88,900,330
  88,900,368
  88,900,425
  88,900,544
  88,900,591
  88,900,632
  88,900,652
  88,900,662
  88,900,663
  88,900,677
  88,900,682
  88,900,691
  88,900,710
  88,900,715
  88,900,720
  88,900,721
  88,900,733
  88,900,746
  88,900,810
  88,900,818
  88,900,825
  88,900,826
  88,900,833
  88,900,846
  88,900,892
  88,900,898
  88,900,907
  88,950,249
  88,950,264
  88,950,417
  88,962,382
  88,962,384
  88,962,385
  88,962,387
  88,962,461
  88,962,465
  88,967,467
  88,967,468
  88,967,547
  88,967,693
  88,967,701
  88,967,745
  88,967,808
  88,967,837
  88,967,879
  88,967,899
  88,967,902
  88,968,011
  88,968,054
  88,968,056
  89,006,032
  89,023,725
  89,044,447
  89,044,452
  89,044,453
  89,044,456
  89,044,466
  89,044,472
  89,044,474
  89,044,481
  89,044,489
  89,044,496
  89,044,499
  89,044,500
  89,044,505
  89,054,413
  89,054,534
  89,087,355
  89,140,749
  89,147,268
  89,149,690
  89,189,792
  89,189,796
  89,228,515
  89,235,629
  89,243,682
  89,243,704
  89,243,720
  89,243,724
  89,243,772
  89,243,779
  89,243,794
  89,243,847
  89,243,882
  89,243,914
C
T
T
G
T
-
T
A
T
-
T
-
T
-
2/-
-/2
C/A
C/A
C/A
G/T
G/A
G/T
C/A
G/A
A/G
A/T
G/C
T/C
T
-
4
G
G
G
G
G
G
G
G
G
T
21
T
2
-
5
2
T
T
T
G
C
T
A
C
A
C
C
T
C
-
-
-
A
-
C
G
-
2
-
-
A
G
2/-
2/-
-
G
-
C
-
G
-
C
C
A
A
-
A
2
C
G
A
T
A
A
A
-
T
G
T
-
2
A
A
A
A
-
A
2
-
A
G
T
C
-
C
A
-
A
T
G
A
C
C
T
A
-
T
A
-
C
A
-
-
-
C
-
-
-
-
-
2
G
G
2
-
-
A
T
A
A
A
A
A
-
C
-
A
A
-
-
A
-
-
C
G/C
41
G/A
C/G
A/G
T/C
T/C
T/C
G
T/A
-/8
2/-
8/-
3/-
C/A
13/-
C/T
C/A
A/T
T
A
2
G
-
-
T
A
-
-
-
-
-
A
A
-
-
A
-
C
-
A
4
-
C
T
T
-
-
-
G
2
C
-
-
-
A
-
-
-
-
-
A
G
2
-
A
A
T
-
G
-
-
T
-
-
-
T
-
-
-
A
-
A
-
-
-
A
G
-
-
A
-
T
G
A
-
-
A
-
G
C
-
-
-
T
-
-
-
T
A
A
G
G
-
A
G
G
-
C
-
-
A
-
T
C
T
T
2
2
-
-
2
2
C
-
C
G
-
C
G
A
A
T
A
-
A
C
G
T
2/-
C/T
C/T
2/-
12
A
-
T
A
-
C
-
T
T
C