Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 139,764 (bp)   Positions: 296
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.054
.0
.346
.038
.01
.021
.006
.023
.009
.002
.002
.011
.004
.004
.022
.007
.001
.005
.006
.002
.002
.002
.002
.004
.001
.002
.014
.014
.012
.013
.003
.002
.0
.004
.021
.001
.007
.002
.0
.018
.03
.029
.001
.001
.002
.002
.015
.0
.0
.0
.012
.0
.0
.001
.002
.0
.0
.0
.003
.015
.001
.005
.002
.837
.009
.0
.002
.04
.0
.412
.425
.004
.001
.006
.0
.0
.0
.033
.06
.019
.336
.068
.008
.907
.918
.083
.093
.003
.002
.0
.001
.026
.05
.063
.039
.029
.007
.005
.027
.012
--
.0
.001
.001
.0
.001
.919
.077
.0
--
.0
.297
.025
.001
.026
.003
.013
.0
.004
.004
.015
--
--
.007
.005
.006
.014
.025
--
--
--
--
--
--
--
.007
--
--
.199
--
--
--
--
--
--
--
--
.117
.225
.033
.002
1.0
.908
--
--
--
.0
.003
.011
.005
.007
.149
.0
.0
.002
.003
.18
--
--
--
--
--
--
--
.019
.009
.005
.141
.267
--
--
.139
.375
.398
.046
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.003
.006
--
--
--
--
--
--
.088
--
.106
.079
.003
.004
.033
.015
.079
.186
.17
.079
.054
.017
.004
.013
.006
.301
.049
.0
.359
.001
.006
.275
.271
.256
.239
.229
.012
.003
.003
.002
.077
.006
.001
.001
.173
.003
.102
.222
.365
.642
.316
.199
.0
.358
.54
.04
.012
.003
.007
.001
.011
.026
.001
.008
.038
.001
.0
.0
.022
.0
.0
.004
.004
.002
.003
.001
.009
.0
.0
.001
.001
.0
.016
.019
.119
.158
.008
.001
.001
.206
.001
.001
.004
.028
.0
.0
.001
.287
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Mccc1
Mccc1
Mccc1
Mccc1
Mccc1
Mccc1
Mccc1
Mccc1
Mccc1
Mccc1
Mccc1
Mccc1
Mccc1
Mccc1
Mccc1
Mccc1
Mccc1
Mccc1
Mccc1
Mccc1
Mccc1
Mccc1
Mccc1
Mccc1
Mccc1
Mccc1
Mccc1
Mccc1
Mccc1
Mccc1
T
T
C
A
-
6
-
-
C
-
G
T
G
-
-
G
G
-
A
-
T
-
T
G
C
A
3
C
-
G
T
G
A
C
T
-
-
-
-
T
G
A
-
G
G
G
-
T
A
-
-
G
-
2
-
-
A
G
C
C
G
-
T
C
C
G
C
C
C
-
-
G
-
C
A
C
-
A
-
C
-
A
T
T
T
T
C
C
-
A
A
A
C
A
G
G
G
G
G
-
-
T
T
-
G
G
C
T
G
-
T
-
T
T
T
T
T
G
T
-
T
A
T
10
A
G
C
6
-
-
4
-
T
C
T
T
A
43
A
C
C
C
A
A
-
3
C
A
G
A
T
C
A
C
C
T
A
T
T
C
G
T
C
C
C
A
A
G
G
A
C
C
A
A
-
C
C
C
A
G
-
T
C
C
G
-
-
-
-
G
-
G
C
2
-
G
T
T
C
G
C
C
G
G
T
G
G
A
-
T
G
C
A
T
T
-
G
C
G
T
A
G
G
G
A
G
G
T
C
-
-
C
C
-
-
C
G
G
A
A
-
3
A
A
T
A
T
5
T
G
G
A
C
G
C
C
C
A
C
-
T
T
G
A
G
G
G
T
G
G
G
C
T
A
T
C
A
A
C
A
T
C
T
G
-
T
A
A
C
T
-
A
A
A
G
C
  122,550,890
  122,551,379
  122,552,476
  122,553,583
  122,553,598
  122,553,606
  122,553,667
  122,553,672
  122,553,787
  122,553,797
  122,553,798
  122,553,812
  122,553,832
  122,553,845
  122,553,853
  122,553,878
  122,553,883
  122,553,893
  122,553,925
  122,553,942
  122,553,943
  122,553,949
  122,553,953
  122,553,960
  122,553,964
  122,553,966
  122,553,977
  122,553,981
  122,553,985
  122,553,988
  122,553,994
  122,553,995
  122,554,008
  122,554,012
  122,554,034
  122,554,042
  122,554,052
  122,554,059
  122,554,063
  122,554,071
  122,554,085
  122,554,097
  122,554,126
  122,554,127
  122,554,134
  122,554,144
  122,554,161
  122,554,165
  122,554,166
  122,554,177
  122,554,189
  122,554,232
  122,554,234
  122,554,241
  122,554,291
  122,554,298
  122,554,303
  122,554,318
  122,554,333
  122,554,338
  122,554,346
  122,554,354
  122,554,360
  122,555,243
  122,555,657
  122,555,682
  122,556,066
  122,556,083
  122,556,098
  122,556,335
  122,556,336
  122,556,357
  122,556,362
  122,556,402
  122,556,442
  122,556,455
  122,556,473
  122,556,490
  122,556,617
  122,556,665
  122,556,677
  122,559,292
  122,560,192
  122,560,401
  122,560,438
  122,560,500
  122,560,848
  122,561,375
  122,561,470
  122,561,597
  122,561,625
  122,561,659
  122,561,661
  122,561,671
  122,561,674
  122,561,676
  122,561,678
  122,561,681
  122,561,684
  122,561,694
  122,561,696
  122,561,782
  122,562,351
  122,563,699
  122,564,284
  122,564,647
  122,565,681
  122,565,705
  122,566,510
  122,566,868
  122,568,878
  122,569,016
  122,569,202
  122,569,211
  122,569,604
  122,569,637
  122,569,848
  122,569,911
  122,570,043
  122,570,169
  122,570,610
  122,573,031
  122,574,449
  122,574,534
  122,574,547
  122,574,548
  122,575,067
  122,575,086
  122,575,608
  122,575,612
  122,575,657
  122,575,709
  122,576,066
  122,576,304
  122,577,141
  122,578,613
  122,578,945
  122,579,058
  122,579,429
  122,580,115
  122,580,459
  122,580,460
  122,580,845
  122,581,276
  122,581,692
  122,581,747
  122,581,753
  122,583,576
  122,583,611
  122,599,205
  122,599,343
  122,599,824
  122,599,952
  122,610,771
  122,610,920
  122,610,999
  122,616,392
  122,616,414
  122,616,428
  122,616,493
  122,616,986
  122,618,351
  122,621,323
  122,624,529
  122,624,788
  122,650,732
  122,654,945
  122,655,582
  122,655,703
  122,655,714
  122,655,750
  122,655,752
  122,655,798
  122,655,799
  122,655,939
  122,655,940
  122,655,943
  122,655,981
  122,656,362
  122,661,131
  122,661,589
  122,662,011
  122,662,086
  122,662,115
  122,662,669
  122,662,684
  122,666,118
  122,666,166
  122,666,197
  122,666,235
  122,666,261
  122,666,300
  122,666,301
  122,666,547
  122,666,550
  122,666,740
  122,666,898
  122,667,215
  122,668,489
  122,668,535
  122,669,100
  122,669,128
  122,669,181
  122,669,374
  122,669,406
  122,669,485
  122,669,628
  122,670,562
  122,672,907
  122,673,492
  122,673,624
  122,673,625
  122,673,666
  122,673,669
  122,673,718
  122,673,731
  122,673,789
  122,673,810
  122,673,996
  122,674,018
  122,674,520
  122,674,780
  122,675,838
  122,676,831
  122,676,979
  122,677,068
  122,677,193
  122,678,722
  122,679,340
  122,679,491
  122,679,496
  122,679,510
  122,679,520
  122,679,525
  122,679,544
  122,679,561
  122,679,562
  122,679,566
  122,682,810
  122,684,308
  122,684,899
  122,684,946
  122,685,066
  122,686,048
  122,686,382
  122,686,451
  122,686,456
  122,686,458
  122,686,470
  122,686,475
  122,686,488
  122,686,497
  122,686,699
  122,686,724
  122,687,178
  122,687,261
  122,687,302
  122,687,496
  122,687,534
  122,687,625
  122,687,832
  122,688,012
  122,688,059
  122,688,106
  122,688,117
  122,688,145
  122,688,158
  122,688,259
  122,688,497
  122,688,558
  122,688,629
  122,688,819
  122,689,120
  122,689,122
  122,689,133
  122,689,166
  122,689,237
  122,689,244
  122,689,245
  122,689,256
  122,689,272
  122,689,293
  122,689,308
  122,689,459
  122,689,482
  122,689,487
  122,689,492
  122,689,541
  122,689,693
  122,689,751
  122,689,798
  122,690,203
  122,690,325
  122,690,365
  122,690,409
  122,690,523
C
C
T
G
A
-
A
C
-
T
A
-
A
T
C
-
-
G
-
C
A
A
C
-
A
T
-
G
C
-
C
T
C
-
-
A
A
3
G
A
C
-
2
T/A
-
T
G
A
C
A
A
A
A
-
A
G/G
G
-
A
-
-
A
C/A
T
T
A
T
T
-
G
12
-
C
-
-
-
4
-
A
-
C
T
C
G
C
C
T
T
2
G
-
G
-
-
-
A
A
A
-
16
5
C
G
A
C
A
T
C
A
3
C
-/14
-
A
C
G
C
C
C
4
C
C
C
-
T
A
T
-
A
C
-
A
C
T
C
C
G
-
T
T
T
A
G
G
2
-
-
G
A
G
A
T
G
A
A
C
T
G
C
T
G/A
C
A
A
A
G
C
T
A
T
A
A
A/T
A/T
9
G
G
T
G
T
T
A
T
T
C
A
C
C
C
-
A
T
T
-
2
C
C
C
A
A
C/T
C/T
A
G/A
T/C
A
A
A/T
C
T/C
G/A
C/G
A/C
T/C
C
-/A
G/A
C/T
A
C
G
A
A
A
T
A
A
C
T
A
T
-
-
A
C
A
C
-
G
G
4
-
G
G
C
G
C
-
C
A
A
T
T
A
T
T
T
T
T
T
C
A
A
G
A
T
A
C
A
A
A
T
C
G
C
T
G
G
T
G
C
G
C
C
4
G
G
-
T
G
3
G
G
G
A
T