Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 136,002 (bp)   Positions: 327
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.002
1.0
.0
.0
.0
.0
.0
.023
.005
.998
.001
--
--
.006
.0
.0
.001
.035
.008
.0
.038
.114
.002
.0
.015
.323
.015
--
.034
.0
.024
.016
.002
.001
.0
.005
.003
.001
.012
.004
.094
.001
.0
.001
.004
.007
.008
.099
.043
--
--
--
--
--
--
--
--
.021
.518
.993
.01
.001
.01
.363
.004
.052
.028
.005
.263
.333
--
--
--
--
--
--
.005
.005
.001
.041
.014
.001
.006
.007
.0
.003
.0
.0
.0
.003
.119
.105
.089
.023
.001
.008
.003
.0
.005
.001
.016
.0
.004
.0
.0
.006
.001
.007
.285
.366
.209
.004
.0
.005
.002
.193
.037
.553
.635
.0
.0
.002
.003
.002
.001
.183
.0
.014
.047
.296
.0
.003
.025
.011
.149
.106
.035
.042
.001
.001
.001
.001
.001
.006
.0
.021
.004
.002
.013
.022
.003
.004
.001
.001
.019
.001
.001
.0
.009
.033
.032
.002
.006
.106
.083
.0
.011
.005
.005
.006
.116
.037
.044
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.006
.065
.259
.26
.016
.122
.363
.421
.498
.438
.092
.041
--
--
.036
.847
.01
.001
.294
.297
.133
.138
.202
.055
--
.304
.047
.042
.014
.007
.005
--
.083
.557
.28
.001
.007
.001
.029
.11
.109
.106
.006
.996
.004
.039
--
.332
--
--
--
--
.029
.001
.011
.008
.019
.018
.039
.006
.004
.019
.046
.016
.005
.004
.002
--
.043
.013
.019
.277
.002
.001
--
--
.103
.001
.001
.062
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.0
.001
.805
.365
.006
.287
--
--
--
--
--
--
--
--
.015
.248
--
--
.072
.076
.075
.844
.39
.184
.028
.001
.0
.075
.8
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Mast2
Mast2
Mast2
Mast2
Mast2
Mast2
Mast2
Mast2
Mast2
Mast2
Mast2
Mast2
Mast2
Mast2
Mast2
Mast2
Mast2
Mast2
Mast2
Mast2
Mast2
Mast2
Mast2
Mast2
Mast2
Mast2
Mast2
Mast2
Mast2
Mast2
Mast2
Mast2
Mast2
-
G
C
T
A
T
-
C
C
T
G
-
G
A
G
C
G
-
T
T
A
-
G
T
T
T
G
-
C
C
G
A
C
C
C
A
G
A
G
A
6
G
-
4
T
G
G
T
T
G
-
T
2
C
-
C
-
A
G
C
G
A
-
-
T
T
C
C
-
T
A
A
T
C
C
-
T
T
C
C
2
T
C
G
A
-
C
-
-
-
-
C
A
C
A
-
T
-
C
G
T
-
-
A
A
C
G
G
-
-
A
T
G
T
C
-
G
T
T
C
C
T
G
G
-
T
G
-
C
A
T
T
T
G
T
T
C
T
A
C
C
A
G
G
T
C
C
G
A
T
T
C
G
A
C
G
-
3
-
A
A
C
T
G
C
-
C
G
G
G
-
G
2
G
T
-
T
-
2
-
T
G
A
G
C
A
C
C
C
C
C
-
T
-
T
-
-
C
2
T
C
C
T
14
A
A
C
C
G
2
T
C
-
-
C
C
-
C
T
G
A
G
T
G
G
C
T
G
C
A
T
C
A
-
A
C
-
-
T
C
G
G
C
C
T
T
G
C
T
G
T
-
C
-
A
G
-
-
C
-
A
T
G
T
2
G
2
C
-
-
G
G
G
G
G
G
A
G
G
-
G
A
C
A
T
A
T
G
A
C
T
G
G
C
-
A
T
C
T
G
T
T
A
T
G
T
A
A
A
A
T
8
C
G
-
A
-
-
-
C
-
T
A
A
5
4
T
  135,152,288
  135,152,526
  135,152,758
  135,153,853
  135,153,862
  135,155,458
  135,156,737
  135,157,163
  135,158,208
  135,158,670
  135,160,133
  135,161,522
  135,161,973
  135,164,421
  135,166,376
  135,166,451
  135,166,576
  135,173,777
  135,176,796
  135,177,021
  135,178,459
  135,179,439
  135,182,067
  135,182,079
  135,188,267
  135,188,353
  135,188,599
  135,189,391
  135,190,790
  135,191,158
  135,193,106
  135,193,399
  135,193,471
  135,193,790
  135,193,817
  135,194,245
  135,195,097
  135,195,239
  135,195,528
  135,196,518
  135,196,527
  135,197,125
  135,198,054
  135,198,056
  135,198,181
  135,198,902
  135,198,924
  135,199,048
  135,199,374
  135,199,948
  135,199,989
  135,201,299
  135,201,998
  135,202,001
  135,202,003
  135,202,008
  135,202,017
  135,202,307
  135,202,701
  135,202,772
  135,203,052
  135,203,054
  135,203,297
  135,205,147
  135,205,574
  135,205,583
  135,205,972
  135,206,006
  135,206,171
  135,206,364
  135,206,823
  135,206,925
  135,207,004
  135,207,063
  135,207,322
  135,207,758
  135,212,912
  135,212,919
  135,212,920
  135,212,939
  135,212,943
  135,212,953
  135,212,973
  135,213,177
  135,214,163
  135,218,112
  135,218,124
  135,218,157
  135,218,161
  135,218,172
  135,218,186
  135,218,197
  135,218,218
  135,218,229
  135,218,236
  135,218,242
  135,218,257
  135,218,268
  135,218,300
  135,218,304
  135,218,335
  135,218,340
  135,218,344
  135,218,362
  135,218,384
  135,218,405
  135,218,432
  135,218,437
  135,218,451
  135,218,454
  135,218,488
  135,218,509
  135,218,513
  135,218,518
  135,218,531
  135,218,568
  135,218,573
  135,218,599
  135,218,604
  135,218,630
  135,218,639
  135,218,662
  135,218,669
  135,218,674
  135,218,678
  135,218,692
  135,218,697
  135,218,713
  135,218,724
  135,218,725
  135,218,735
  135,218,738
  135,218,742
  135,218,775
  135,218,787
  135,218,792
  135,218,797
  135,218,842
  135,218,862
  135,218,875
  135,218,878
  135,218,879
  135,218,889
  135,218,894
  135,218,913
  135,218,929
  135,218,938
  135,218,942
  135,218,945
  135,218,951
  135,218,957
  135,218,985
  135,218,987
  135,219,007
  135,219,011
  135,219,022
  135,219,036
  135,219,043
  135,219,056
  135,219,061
  135,219,081
  135,219,088
  135,219,097
  135,219,106
  135,219,129
  135,219,136
  135,219,193
  135,219,213
  135,219,228
  135,219,232
  135,219,243
  135,219,250
  135,219,254
  135,219,264
  135,219,273
  135,219,288
  135,219,294
  135,219,328
  135,219,336
  135,219,340
  135,219,347
  135,219,349
  135,219,359
  135,219,379
  135,219,402
  135,219,404
  135,219,405
  135,219,408
  135,219,412
  135,219,437
  135,219,438
  135,219,466
  135,219,555
  135,219,560
  135,219,594
  135,219,610
  135,219,630
  135,219,679
  135,219,746
  135,219,760
  135,220,591
  135,220,598
  135,220,603
  135,220,617
  135,220,642
  135,220,670
  135,220,696
  135,220,744
  135,220,800
  135,220,849
  135,220,861
  135,220,882
  135,220,892
  135,220,893
  135,221,061
  135,221,079
  135,221,943
  135,222,535
  135,223,471
  135,223,673
  135,224,434
  135,224,439
  135,225,056
  135,225,057
  135,227,552
  135,227,849
  135,228,024
  135,230,116
  135,236,200
  135,236,201
  135,236,214
  135,236,220
  135,236,223
  135,236,649
  135,238,497
  135,241,211
  135,241,793
  135,241,814
  135,241,818
  135,241,847
  135,241,850
  135,242,077
  135,242,080
  135,242,083
  135,242,124
  135,242,546
  135,245,031
  135,245,230
  135,247,125
  135,247,876
  135,249,234
  135,250,936
  135,250,950
  135,251,878
  135,251,969
  135,251,985
  135,252,079
  135,252,082
  135,252,110
  135,252,164
  135,252,170
  135,252,197
  135,252,229
  135,252,236
  135,252,285
  135,252,315
  135,252,326
  135,252,364
  135,252,368
  135,252,412
  135,252,617
  135,252,629
  135,252,645
  135,252,666
  135,252,723
  135,252,731
  135,253,156
  135,253,280
  135,255,131
  135,257,187
  135,257,898
  135,259,058
  135,260,930
  135,260,948
  135,260,992
  135,261,072
  135,261,123
  135,261,148
  135,261,174
  135,261,193
  135,261,218
  135,261,303
  135,261,326
  135,261,331
  135,261,334
  135,261,335
  135,261,873
  135,262,565
  135,263,973
  135,265,217
  135,265,997
  135,266,979
  135,267,653
  135,267,969
  135,269,848
  135,269,854
  135,269,857
  135,269,887
  135,269,893
  135,269,910
  135,269,916
  135,269,925
  135,270,595
  135,270,935
  135,273,590
  135,274,252
  135,277,492
  135,277,501
  135,277,502
  135,278,291
  135,278,367
  135,278,682
  135,280,039
  135,280,706
  135,283,323
  135,283,476
  135,284,613
T
A
T
C
G
C
A
A
T
C
C
-/T
A
G
T
T
A
T
C
A
G
A
-
-
C
A
A
12
T
T
A
G
T
-
-
G
A
C
A
C
-
A
C
-
G
A
A
G
C
A
A
-
-
A
2
T
G
T
A
T
A
G
-/A
A
G
C
T
T
3
A
T
A/G
T/C
T
C/G
T
T/C
T/C
C/G
C/T
2/-
T/G
C/A
T
G
G
-
C
C
T
T
-
T
-
-
A
-
A
-
-
-
G
T
-
-
-
-
-
C
A
-
-
-
-
-
A
-
C
-
G
-
-
-
-
G
-
-
C
A
T
-
G
-
-
C
-
-
-
-
-
A
G
-
-
C
-
-
A
C
-
-
-
-
C
-
-
A
-
T
-
-
-
-
-
-
A
-
-
-
-
A
-
-
-
-
G
-
A
-
T
-
-
-
-
-
C
A
G
-
T
A
T
-
C
-
T
T
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
G
A
-
-
-
G
A
G
T
C
T
C
A
T
A
C
C
A
T
C
A
A
C
A
A
T
G
G
T
A
T
A
A
A
G/A
C/T
C/G
T/A
G
A
T
A
-
A
G
A
A
G
-
T
A
-
C
-
-
-
G
-
-
-
-
A
2
-
-
-
-
-
-
G
A
A
6
A
G
C/G
A/T
T/C
G
T/C
G/A
A/G
C/T
T/A
G/T
G/T
C/T
-/C
A/T
C
C/A
G
A
A
A
G
T/-
-
-
-
-
-
-
-
-
T
-
G
-
-/9
-/8
-/7
T
G/G
-
G
G
-
-
C