Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 193,967 (bp)   Positions: 416
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.005
.0
.0
.35
.065
.056
.002
.939
.017
.0
.023
.065
.727
.958
.001
.969
.001
.001
.001
.001
.004
.195
.008
.025
.009
.001
.034
.01
.157
.0
.0
.0
.001
.0
.98
.202
.007
.819
.003
.003
.001
.331
.064
.036
.847
.033
.001
1.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.0
.054
.001
--
--
.013
.021
.009
.006
.001
.006
.024
.0
.0
.25
--
--
--
--
--
--
--
--
.01
.004
.032
.973
.0
.0
.0
.004
.0
.002
.01
.037
.872
.171
.003
.048
.448
.005
.225
.058
.047
.123
.094
.079
.058
.194
.192
.301
.053
.377
--
.115
.0
.979
.039
.0
.075
.002
.023
--
--
--
--
--
--
.0
.002
.015
.0
.013
.056
.036
.0
.003
.003
.027
.002
.001
.0
.0
.001
.001
.0
.0
.293
.004
.068
.105
.008
.005
.001
.0
.032
.031
.003
.04
.0
.001
.0
.0
.038
.0
.002
.017
.001
.0
.001
.0
.001
.013
.004
.035
.046
.139
.001
.0
.151
.065
.053
.002
.002
.0
.017
.002
.003
.014
.0
.0
.002
.001
.197
.859
.419
.901
.0
.004
.715
.001
.002
.002
.0
.643
.002
.002
.349
.019
.198
--
.031
.001
.0
.0
.007
.02
.107
.003
.01
.01
.0
.001
.001
.003
.001
.002
.486
.002
.006
.07
.958
.597
.648
.7
.754
.002
.0
.0
.001
.0
.012
.0
.005
.06
.023
.006
.007
.035
.06
.984
.005
--
.012
.008
.011
.934
.019
.0
.0
.047
.057
.006
.189
.198
.207
.002
.001
.078
.978
.001
.009
.103
.004
.045
.032
.006
.007
.007
.025
.001
.521
.001
.003
.0
.0
.001
.0
.001
.414
.01
.035
.05
.006
.28
.007
.002
.047
.005
.001
.001
.024
.002
.011
.001
.0
.376
.243
.009
.0
.02
.0
.477
.272
.263
.056
--
.038
.395
.031
.273
.108
--
--
.018
.03
.025
.816
.067
.219
.153
.003
.006
.007
.067
.228
.215
.009
.008
.008
.0
.0
.0
.001
.038
.085
.41
.062
.008
.04
.03
.001
.006
--
.014
.015
.007
--
--
.014
.035
.019
.47
.222
.027
.003
.209
.007
.004
.007
.004
.0
.0
.0
.068
.0
.003
.036
.001
.005
--
--
--
--
.031
.033
.055
.008
.0
.597
.241
.003
.012
.061
.039
.605
.132
.987
.001
.0
.006
.984
.008
.002
.0
.002
.143
.014
.001
.164
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Map3k13
Map3k13
Map3k13
Map3k13
Map3k13
Map3k13
Map3k13
Map3k13
Map3k13
Map3k13
Map3k13
Map3k13
Map3k13
Map3k13
Map3k13
Map3k13
Map3k13
Map3k13
Map3k13
Map3k13
Map3k13
Map3k13
Map3k13
Map3k13
Map3k13
Map3k13
Map3k13
Map3k13
Map3k13
Map3k13
Map3k13
Map3k13
Map3k13
Map3k13
Map3k13
Map3k13
Map3k13
Map3k13
Map3k13
Map3k13
Map3k13
Map3k13
-
-
C
T
A
T
T
C
A
C
A
G
G
G
C
G
G
G
-
A
T
G
G
G
A
A
A
G
G
A
T
G
T
C
G
15
A
A
C
G
C
-
C
T
10
-
A
T
2
A
-
-
A
-
-
-
A
-
G
T
G
G
-
-
T
A
T
4
C
G
T
G
C
C
-
T
C
C
T
T
3
4
A
C
T
G
T
T
T
C
A
-
C
C
A
A
A
G
C
T
T
A
T
T
C
C
A
C
C
T
-
-
3
C
C
A
A
C
-
A
G
C
C
A
T
T
A
C
T
C
T
G
3
C
A
C
T
-
T
A
G
A
A
G
C
C
T
A
C
A
C
C
-
G
T
A
G
T
A
A
G
A
C
G
-
T
T
C
A
T
A
C
T
T
T
T
G
T
A
T
G
C
C
A
T
T
G
G
G
G
C
G
C
G
G
C
C
G
A
A
G
C
T
A
T
2
T
T
A
A
-
C
35
3
G
2
C
G
A
G
T
-
-
G
G
G
A
-
C
2
A
C
8
C
G
C
A
C
C
C
C
C
-
A
A
T
T
A
-
G
C
T
T
A
-
-
-
C
A
C
G
-
-
-
-
G
G
C
T
T
T
G
T
A
T
T
G
C
G
C
C
T
G
A
G
T
C
A
C
6
T
A
A
C
A
G
G
C
T
T
A
C
T
T
C
G
G
T
A
C
C
G
-
A
C
-
A
A
A
A
6
C
C
C
A
C
A
A
G
C
A
C
-
C
G
A
C
-
4
C
G
A
C
-
4
G
10
C
A
G
C
2
2
G
T
-
4
G
A
C
A
G
A
G
G
G
G
T
G
A
G
A
A
T
T
T
G
-
T
G
G
A
G
T
A
C
C
G
G
2
-
5
A
C
A
C
T
G
C
C
G
G
-
G
G
A
A
T
A
-
G
3
-
A
T
A
  82,744,855
  82,744,965
  82,745,283
  82,745,525
  82,745,594
  82,745,628
  82,745,655
  82,746,206
  82,746,292
  82,746,322
  82,746,886
  82,747,366
  82,747,746
  82,747,809
  82,748,342
  82,749,121
  82,750,159
  82,750,210
  82,750,228
  82,750,270
  82,750,292
  82,750,348
  82,750,639
  82,751,112
  82,751,310
  82,751,517
  82,751,560
  82,751,572
  82,751,824
  82,752,164
  82,752,325
  82,752,352
  82,752,499
  82,752,522
  82,753,367
  82,758,698
  82,758,763
  82,759,512
  82,760,180
  82,760,185
  82,760,203
  82,762,749
  82,764,852
  82,766,566
  82,766,915
  82,767,381
  82,768,519
  82,769,410
  82,770,770
  82,770,832
  82,770,870
  82,770,873
  82,770,882
  82,770,940
  82,770,961
  82,770,964
  82,770,979
  82,770,982
  82,771,008
  82,771,018
  82,771,024
  82,771,037
  82,771,057
  82,771,067
  82,771,720
  82,772,491
  82,774,857
  82,775,001
  82,775,501
  82,775,579
  82,776,254
  82,776,302
  82,776,392
  82,776,455
  82,776,563
  82,776,780
  82,776,784
  82,777,423
  82,777,469
  82,777,805
  82,778,000
  82,778,012
  82,778,024
  82,778,064
  82,778,067
  82,778,069
  82,778,079
  82,778,082
  82,778,523
  82,778,919
  82,779,260
  82,779,672
  82,779,839
  82,779,840
  82,780,089
  82,780,497
  82,780,538
  82,781,544
  82,781,548
  82,781,768
  82,783,049
  82,783,126
  82,783,938
  82,784,084
  82,785,502
  82,785,773
  82,786,354
  82,786,996
  82,787,625
  82,787,680
  82,788,059
  82,788,061
  82,788,063
  82,788,141
  82,788,142
  82,788,203
  82,788,965
  82,789,063
  82,789,431
  82,790,232
  82,793,910
  82,794,118
  82,795,898
  82,796,604
  82,797,206
  82,797,241
  82,797,251
  82,798,481
  82,798,502
  82,798,652
  82,798,801
  82,798,817
  82,798,822
  82,799,440
  82,799,506
  82,800,905
  82,801,104
  82,801,833
  82,804,613
  82,804,939
  82,808,028
  82,808,171
  82,808,179
  82,809,160
  82,809,177
  82,809,960
  82,810,367
  82,811,816
  82,811,984
  82,811,990
  82,811,992
  82,811,995
  82,813,289
  82,814,213
  82,815,219
  82,817,097
  82,817,509
  82,818,611
  82,818,738
  82,819,690
  82,826,806
  82,826,908
  82,827,010
  82,827,393
  82,827,904
  82,827,980
  82,827,997
  82,827,998
  82,828,278
  82,829,141
  82,829,482
  82,829,587
  82,829,858
  82,829,960
  82,830,270
  82,830,297
  82,830,311
  82,830,423
  82,830,430
  82,830,465
  82,830,467
  82,830,484
  82,830,534
  82,830,539
  82,830,551
  82,830,611
  82,830,612
  82,830,635
  82,830,677
  82,830,680
  82,830,702
  82,830,715
  82,830,722
  82,830,735
  82,830,891
  82,830,988
  82,830,996
  82,831,002
  82,831,027
  82,831,051
  82,831,072
  82,831,128
  82,831,166
  82,831,201
  82,831,599
  82,831,950
  82,831,953
  82,831,954
  82,832,348
  82,832,564
  82,832,921
  82,832,922
  82,833,728
  82,833,766
  82,834,052
  82,836,420
  82,836,552
  82,836,723
  82,836,751
  82,836,752
  82,836,773
  82,836,784
  82,837,026
  82,837,088
  82,837,239
  82,837,572
  82,837,818
  82,837,825
  82,837,954
  82,837,956
  82,838,036
  82,839,338
  82,839,500
  82,839,612
  82,839,834
  82,839,856
  82,840,523
  82,840,678
  82,840,680
  82,840,682
  82,840,684
  82,841,956
  82,842,090
  82,842,100
  82,842,462
  82,842,690
  82,843,081
  82,843,474
  82,843,607
  82,843,642
  82,843,653
  82,843,716
  82,843,717
  82,843,724
  82,843,747
  82,843,825
  82,844,000
  82,844,090
  82,844,122
  82,844,658
  82,844,660
  82,844,696
  82,844,721
  82,844,748
  82,844,784
  82,844,812
  82,906,377
  82,907,219
  82,907,360
  82,907,362
  82,907,364
  82,907,489
  82,907,828
  82,908,217
  82,908,225
  82,908,562
  82,909,343
  82,909,594
  82,909,674
  82,909,942
  82,910,009
  82,910,540
  82,910,549
  82,910,730
  82,910,899
  82,912,195
  82,912,631
  82,913,318
  82,914,188
  82,914,306
  82,914,315
  82,915,142
  82,915,143
  82,915,166
  82,915,318
  82,916,184
  82,916,430
  82,916,496
  82,917,054
  82,917,230
  82,917,306
  82,917,868
  82,918,327
  82,918,413
  82,918,439
  82,918,469
  82,918,693
  82,918,979
  82,919,191
  82,919,241
  82,919,663
  82,919,938
  82,919,986
  82,920,641
  82,920,688
  82,920,936
  82,921,602
  82,922,231
  82,922,271
  82,922,273
  82,922,402
  82,923,260
  82,923,846
  82,923,911
  82,924,126
  82,924,159
  82,924,200
  82,924,478
  82,924,558
  82,924,759
  82,924,777
  82,924,784
  82,925,081
  82,925,406
  82,925,503
  82,925,509
  82,925,520
  82,925,522
  82,925,523
  82,926,441
  82,926,538
  82,926,544
  82,926,555
  82,926,557
  82,926,558
  82,927,043
  82,927,174
  82,927,419
  82,927,586
  82,927,849
  82,927,917
  82,928,121
  82,928,180
  82,928,425
  82,928,454
  82,928,474
  82,928,770
  82,928,917
  82,929,098
  82,929,573
  82,929,577
  82,929,580
  82,929,581
  82,929,583
  82,930,344
  82,930,433
  82,931,016
  82,931,251
  82,931,564
  82,931,595
  82,931,599
  82,931,625
  82,931,741
  82,931,793
  82,931,794
  82,931,878
  82,932,017
  82,932,304
  82,932,307
  82,932,861
  82,933,208
  82,933,286
  82,933,730
  82,933,787
  82,933,997
  82,934,003
  82,934,028
  82,934,038
  82,934,039
  82,934,084
  82,934,089
  82,934,125
  82,934,140
  82,934,308
  82,934,693
  82,935,564
  82,935,579
  82,935,580
  82,935,588
  82,935,613
  82,935,700
  82,935,855
  82,935,902
  82,935,993
  82,935,996
  82,936,343
  82,936,844
  82,936,910
  82,937,109
  82,937,235
  82,937,368
  82,937,554
  82,937,584
  82,937,666
  82,938,266
  82,938,313
C
T
A
A
G
G
C
T
G
A
G
A
A
A
T
A
C
T
8
C
C
A
A
A
G
G
G
A
A
T
C
A
C
T
A
-
A/-
G
-
-
-
G
T
-
-
16
T
C
-
-
G
2
-
G
T
T
G
T
-
-
-
-
G
2
G
G
-
-
T
A
C
C
T
T
10
G
T
T
C
A
-
4/-
G
T
C
C
C
C
G
T
C
A
A
T
G
G
G
A
T
C
C
G
C
C
T
A
C
T
T
C
A
2
-
G
T
G
G
T
4
G
A
T
A/TG
T
G
-
-
G
A
G
C
T
-
A
C
T
G
4
C
T
A
T
T
C
G
T
-
C
A
G
A
G
32
T
A
C
A
G
G
G
A
G
A
T
2
C
C
T
C
C
T
A
A
G
C
C
A
C
G
A
A
-
T
G
A
C
A
A
A
A
T
A
T
T
A
T
T
A
G
T
A
T
C
C
C
-
-
G
G
G
T
T
-
-
A
-
T
T
G
T
C
2
A
C
A
T
G
8
T
-
G
A
-
T
T
T
C
C/G
C/G
C/G
C/G
T
C
G
G
C
C
G
T
A
-
-
G
-
G
A
A
-
G
G
-
C
C
C
2
-
C
T
A
A
A
A
C
G
G
-
A
T
A
T
T
C
A
G
A
C
-
G
T
6/-
A
G
G
T
G
A
C
T
A
C
G
T
C
C
T
T
A
C
T
T
G
A
C
G
T
5
G
T
T
T
-
A
T
T
T
T
G
G
A
T
G
G
5
T
A
C
G
A
-
T
A
C
G
A
-
C
-
T
C
T
T
-
-
A
C
2
-
T
G
C/T
A/G
G/T
A/T
G/A
A
A
T
-
A
G
A
G
G
G
A
C
C
2
A
A
A
T
A
C
-
T
T
A
C
-
2
-
T
T
G
C/T
T/C
G/A
C/T
C/T
G/A
A
2
A
A
-
G
C
T
T
A
-
T
C
C
C