Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 324,070 (bp)   Positions: 521
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
1.0
.997
.0
.011
.001
.019
.999
.0
.005
.305
.01
.076
.001
.008
.0
.036
.007
.001
.25
.0
.004
.003
.979
.024
.402
.0
.906
.064
.0
.019
.002
.008
.0
.003
.0
.012
.155
.057
.115
.043
.945
.089
.527
--
--
--
--
.001
.002
.008
.0
.003
.0
.028
.001
.034
.0
.0
.006
.004
.243
.0
.0
.123
.006
.023
.009
.0
1.0
.461
--
.17
--
.528
.27
.295
.925
.562
.001
.032
.0
.0
.09
.124
.553
.0
.001
.0
.006
.0
.0
1.0
.0
1.0
.0
.0
.0
.0
.295
1.0
.041
.955
.211
.128
.0
.823
.159
.045
.046
.173
.227
.136
.088
.151
.342
.332
.728
.007
.003
.002
.005
.039
.008
.035
.006
.162
.16
.241
.001
.016
.0
.0
.0
.0
.005
.032
.025
.0
.004
.074
.1
.954
.262
.006
.05
.001
.015
.051
.028
.973
1.0
1.0
.995
.002
.004
.001
.002
.002
.007
.001
.001
.0
.001
.004
.012
.0
.002
.076
.662
.017
.005
.047
.001
.016
.979
.004
.322
.0
.002
.033
.0
.042
.0
.0
.0
.009
.075
.204
.44
.031
.0
.001
.013
.0
.997
.0
.194
.789
.0
.029
.017
.013
.001
.001
.986
.0
.0
.997
.01
.016
.008
.07
.0
.012
.001
.574
.894
.002
.002
.003
.013
.002
.0
.467
.022
.013
.004
.146
.0
.015
.017
.002
.634
.007
.05
--
--
.208
.0
.0
.003
.005
.006
.011
.046
.005
.082
.014
.036
.014
.005
.132
.026
.594
.009
.002
.013
.004
.044
.019
.996
.373
.032
.001
.0
.012
.027
.008
.0
.001
.304
.454
.003
.0
.012
.004
.434
.053
.356
--
.048
.013
.003
.07
--
.125
.001
.035
.0
.01
.003
.496
.0
.022
.001
.005
.06
.248
.013
.009
.148
.03
.541
.011
.252
.047
.024
.005
.059
.005
.964
.001
.0
.019
.002
.024
.017
.004
.266
.188
.043
.032
.026
.001
.001
.0
--
--
.002
.001
.02
.001
.0
.261
.004
.004
.008
.203
.014
.007
.349
.0
.001
.022
.011
.009
.081
.0
.017
.006
.003
.002
.017
.002
.104
--
.13
.003
.007
.001
.01
.002
.003
.243
.003
--
.003
.001
.186
.272
.042
.015
.001
.001
.002
.035
.685
.003
.007
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.97
.491
.0
.001
.024
.999
1.0
.0
.002
.83
.155
.005
.003
.0
.0
.0
.003
.004
.0
.001
.001
.001
.0
.002
.005
.002
.001
.014
.014
.001
.0
.006
.006
.015
.018
.022
.021
.001
.372
.643
.796
--
.037
.001
.014
.004
.001
.112
.06
.54
.572
.001
.001
.0
.024
.003
.0
.0
.002
.0
.005
.0
.012
.003
.0
.002
.005
.001
.0
.001
.001
.104
.024
.154
.058
.314
.234
.105
.179
.385
.653
.711
.875
.924
.885
.897
.959
.857
.776
.877
.966
.998
.997
.968
.811
.781
.927
.93
.965
.94
.94
.925
.473
.403
.325
.436
.386
.472
.525
.052
.735
.031
.018
.939
.001
.0
.0
.0
.001
.0
.001
.0
.037
.022
.001
.015
.079
.012
.0
.003
.038
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
A
T
C
A
C
A
C
C
G
T
A
T
T
A
C
C
C
T
A
G
A
C
T
A
C
T
A
C
C
C
3
A
T
-
T
-
2
A
C
T
C
T
T
G
T
-
T
C
G
C
T
G
A
-
21
T
A
A
C
T
A
G
A
10
A
G
5
T
T
T
C
A
G
A
G
T
-
T
A
A
A
A
-
T
-
G
G
T
C
-
C
T
G
C
C
G
C
A
-
C
C
-
T
9
A
2
C
-
T
C
G
4
G
C
C
T
T
T
A
C
C
G
2
63
G
-
G
T
2
G
G
A
3
C
-
G
-
A
C
T
-
C
A
G
-
C
A
-
G
A
C
C
C
C
G
4
-
C
A
C
2
G
T
C
C
C
C
T
A
-
-
A
-
C
C
T
-
G
A
A
G
T
C
C
G
C
A
-
A
G
G
C
A
T
-
C
-
A
G
A
G
G
C
G
G
T
T
C
C
T
T
G
11
C
G
T
T
C
T
C
T
G
T
A
A
2
4
G
G
-
G
A
G
7
A
2
G
14
A
A
A
C
A
C
-
G
A
A
C
2
G
C
-
G
A
A
T
C
-
A
A
A
C
A
-
A
C
4
-
C
T
C
A
C
G
G
C
C
T
C
C
T
A
C
G
A
C
G
T
G
2
T
T
A
C
T
T
C
A
A
4
-
A
T
-
A
T
G
T
T
G
T
T
A
C
A
T
A
G
T
G
A
A
T
-
G
T
G
G
C
G
T
C
T
A
G
T
3
4
G
G
C
C
-
C
G
G
A
G
T
T
3
T
G
T
C
G
G
12
G
A
C
C
G
A
A
A
-
A
C
8
T
C
2
G
G
C
C
G
2
C
T
-
A
-
C
A
T
T
-
C
-
T
A
C
G
G
-
A
-
-
-
T
C
A
G
G
G
C
C
T
-
10
21
-
T
A
G
7
-
-
-
A
-
-
-
-
A
T
T
T
T
T
2
-
G
T
G
C
C
A
-
G
C
G
G
T
C
T
G
T
T
G
G
C
A
A
C
-
A
T
G
T
T
C
A
A
C
T
C
-
3
5
4
C
C
T
-
-
-
-
G
-
C
-
-
-
-
-
-
-
A
A
-
-
-
G
G
-
-
C
T
T
C
-
C
C
C
T
T
G
T
A
C
C
T
A
A
A
G
-
  141,039,726
  141,040,346
  141,041,910
  141,042,288
  141,042,673
  141,042,818
  141,042,912
  141,043,501
  141,043,557
  141,046,356
  141,046,907
  141,047,234
  141,047,595
  141,047,769
  141,047,980
  141,048,128
  141,048,129
  141,048,740
  141,051,070
  141,051,149
  141,051,296
  141,052,491
  141,052,559
  141,052,715
  141,053,119
  141,053,410
  141,053,459
  141,053,465
  141,053,567
  141,053,616
  141,053,865
  141,054,238
  141,054,578
  141,054,591
  141,054,643
  141,054,989
  141,055,208
  141,055,331
  141,055,398
  141,055,432
  141,055,458
  141,055,500
  141,056,356
  141,056,519
  141,056,538
  141,056,549
  141,056,553
  141,056,625
  141,056,695
  141,058,074
  141,058,403
  141,058,647
  141,059,063
  141,059,801
  141,060,272
  141,060,402
  141,060,606
  141,060,651
  141,061,010
  141,061,071
  141,061,259
  141,061,791
  141,061,828
  141,061,860
  141,062,721
  141,063,062
  141,063,068
  141,063,557
  141,063,589
  141,063,808
  141,063,848
  141,064,309
  141,064,407
  141,065,808
  141,065,997
  141,066,134
  141,066,390
  141,066,398
  141,066,608
  141,066,939
  141,067,294
  141,068,135
  141,068,338
  141,068,536
  141,069,126
  141,069,365
  141,069,369
  141,069,410
  141,070,618
  141,070,810
  141,071,398
  141,071,723
  141,071,962
  141,072,190
  141,073,320
  141,073,817
  141,074,053
  141,074,738
  141,075,098
  141,075,615
  141,075,899
  141,076,350
  141,076,495
  141,076,507
  141,077,074
  141,077,688
  141,078,062
  141,078,180
  141,080,236
  141,080,935
  141,080,945
  141,081,011
  141,081,077
  141,081,143
  141,081,246
  141,081,247
  141,081,421
  141,081,896
  141,082,078
  141,082,079
  141,082,118
  141,082,173
  141,082,789
  141,082,876
  141,083,005
  141,083,855
  141,085,592
  141,086,546
  141,086,825
  141,087,849
  141,088,214
  141,088,223
  141,088,228
  141,088,941
  141,089,720
  141,090,021
  141,090,198
  141,090,224
  141,090,240
  141,090,266
  141,090,568
  141,091,705
  141,091,737
  141,092,210
  141,095,049
  141,096,077
  141,096,480
  141,096,729
  141,097,021
  141,098,696
  141,099,732
  141,100,017
  141,100,759
  141,102,945
  141,105,959
  141,106,004
  141,107,670
  141,107,700
  141,108,187
  141,108,417
  141,109,147
  141,109,329
  141,110,434
  141,111,778
  141,113,624
  141,113,714
  141,113,750
  141,114,300
  141,114,337
  141,114,911
  141,115,787
  141,116,275
  141,118,468
  141,118,730
  141,119,918
  141,120,156
  141,120,713
  141,120,872
  141,120,891
  141,122,693
  141,123,336
  141,123,751
  141,124,181
  141,124,250
  141,124,327
  141,125,104
  141,125,526
  141,128,190
  141,128,339
  141,128,481
  141,129,250
  141,129,724
  141,130,925
  141,131,448
  141,133,135
  141,133,359
  141,133,474
  141,133,562
  141,134,206
  141,134,841
  141,136,504
  141,136,643
  141,136,650
  141,140,925
  141,141,822
  141,143,071
  141,143,648
  141,143,784
  141,144,355
  141,144,359
  141,144,537
  141,144,665
  141,145,397
  141,146,396
  141,146,798
  141,147,202
  141,148,080
  141,149,929
  141,150,421
  141,150,786
  141,150,819
  141,150,975
  141,151,045
  141,151,924
  141,152,071
  141,152,185
  141,152,188
  141,152,239
  141,152,247
  141,152,615
  141,152,682
  141,153,130
  141,153,794
  141,154,866
  141,154,961
  141,156,862
  141,156,871
  141,156,890
  141,157,843
  141,158,405
  141,158,668
  141,158,846
  141,159,740
  141,160,486
  141,162,834
  141,163,391
  141,163,407
  141,165,952
  141,167,551
  141,173,752
  141,179,897
  141,182,795
  141,183,570
  141,185,580
  141,189,050
  141,189,696
  141,189,788
  141,192,398
  141,199,069
  141,203,480
  141,206,449
  141,207,010
  141,207,587
  141,209,998
  141,211,720
  141,213,101
  141,213,251
  141,218,106
  141,218,910
  141,219,598
  141,221,024
  141,225,425
  141,226,953
  141,227,033
  141,227,572
  141,228,846
  141,231,348
  141,232,179
  141,232,675
  141,240,485
  141,243,005
  141,243,422
  141,244,365
  141,244,417
  141,245,072
  141,245,567
  141,247,695
  141,250,247
  141,251,321
  141,253,873
  141,254,304
  141,254,859
  141,255,733
  141,255,865
  141,255,997
  141,257,738
  141,258,432
  141,258,606
  141,258,660
  141,259,389
  141,259,822
  141,259,859
  141,259,983
  141,260,095
  141,260,392
  141,260,505
  141,260,699
  141,260,742
  141,261,154
  141,261,572
  141,261,932
  141,262,404
  141,262,502
  141,262,687
  141,262,699
  141,263,328
  141,263,421
  141,264,250
  141,264,464
  141,264,577
  141,265,128
  141,265,713
  141,265,958
  141,266,597
  141,270,657
  141,270,803
  141,271,875
  141,271,900
  141,272,724
  141,272,729
  141,273,069
  141,276,132
  141,276,775
  141,282,428
  141,282,852
  141,283,290
  141,286,823
  141,288,875
  141,288,909
  141,289,685
  141,290,733
  141,292,261
  141,295,224
  141,295,242
  141,296,230
  141,296,460
  141,296,821
  141,296,928
  141,300,276
  141,304,261
  141,304,265
  141,305,440
  141,306,022
  141,312,204
  141,313,221
  141,316,487
  141,317,451
  141,320,077
  141,321,088
  141,321,953
  141,321,965
  141,322,600
  141,322,603
  141,323,395
  141,324,329
  141,332,454
  141,332,710
  141,333,505
  141,333,820
  141,335,755
  141,336,132
  141,336,676
  141,337,298
  141,337,899
  141,338,107
  141,342,400
  141,342,602
  141,345,048
  141,345,180
  141,345,401
  141,347,613
  141,347,619
  141,347,657
  141,347,682
  141,347,697
  141,347,732
  141,347,743
  141,347,811
  141,347,817
  141,347,822
  141,349,323
  141,349,393
  141,349,412
  141,349,419
  141,349,439
  141,349,553
  141,349,560
  141,349,701
  141,349,708
  141,349,718
  141,349,723
  141,349,760
  141,349,764
  141,350,518
  141,350,544
  141,350,605
  141,350,654
  141,350,688
  141,350,696
  141,350,704
  141,350,857
  141,350,864
  141,350,894
  141,350,907
  141,350,953
  141,350,960
  141,350,961
  141,350,968
  141,350,978
  141,350,986
  141,350,988
  141,350,992
  141,350,993
  141,350,998
  141,350,999
  141,351,007
  141,351,008
  141,351,466
  141,351,702
  141,351,704
  141,351,706
  141,352,348
  141,352,771
  141,352,932
  141,353,689
  141,354,315
  141,355,502
  141,356,176
  141,356,178
  141,356,192
  141,356,197
  141,356,207
  141,356,223
  141,356,226
  141,356,233
  141,356,236
  141,356,240
  141,356,250
  141,356,252
  141,356,256
  141,356,273
  141,356,278
  141,356,285
  141,356,289
  141,356,295
  141,356,303
  141,356,304
  141,356,315
  141,356,332
  141,356,351
  141,356,420
  141,356,746
  141,357,424
  141,357,707
  141,357,729
  141,357,764
  141,357,784
  141,357,819
  141,357,821
  141,357,843
  141,359,052
  141,359,056
  141,359,061
  141,359,072
  141,359,079
  141,359,082
  141,359,104
  141,359,119
  141,359,122
  141,359,145
  141,359,197
  141,359,206
  141,359,214
  141,359,232
  141,359,245
  141,359,248
  141,359,265
  141,359,266
  141,359,280
  141,359,287
  141,359,288
  141,359,305
  141,359,313
  141,359,317
  141,359,320
  141,359,328
  141,359,338
  141,359,345
  141,359,356
  141,359,382
  141,359,621
  141,359,807
  141,360,157
  141,360,378
  141,361,050
  141,361,052
  141,361,205
  141,361,330
  141,361,645
  141,361,648
  141,361,902
  141,362,182
  141,362,466
  141,362,471
  141,362,522
  141,362,615
  141,362,632
  141,362,644
  141,362,674
  141,362,698
  141,362,898
-
-
T
C
T
G
T
T
T
C
G
G
C
G
T
-
T
C
G
A
G
T
A
T
G
C
-
A
T
T
-
-
C
6
C
2
-
G
T
C
C/T
C
C
A
C
A
A
T
T
A
C
A
T
T
-
G
G
G
T
A
A/C
A
C
-
G
-
5/-
C
C
-
-
C
C
T
A
C
2
C
G
C
G
G
-/49
G
4
A
A
G
T
C
T
C
T
G
T
A
G
A/T
T
T
T
62
A
-
G
-
T
C
C
T
A
-
A
T
T
C
C
C
G
T
A
C
-
-
T
A
T
C
-
C
T
-
3/-
T
2
-
2
G
T
G
2
T
T
A
G
T
G
A
A
T
G
T
T
T
A
-
11
G
C
T
-
A
C
T
T
G
G
C
G
13
A
T
2
T
T
A
5
A
G
G
C
C
G
T
C
G
G
10
-
A
A
T
T
C
A
T
20
-
T
G
T
A
T
A
A
C
C
T
T
A
A
A
-
T
T
C
G
T
-
A
A
A
G
G
G
-
-
C
A
A
A
T
A
-
T
-
C
14/-
G
C
G
A
G
A
2
-
G
G
T
-
A
T
T
A
A/-
G
C
-
6
G
G
C
T
G
9
G
T
-
C
A
C
T
T
T
T
A
T
T
C
T
T
A
G
A
G/-
G
G
A
C
A
-
C
A
-
T
-
-
T
G
T
4/-
2
G
C
17
C
C
A
C
C
A
A
C
T
T
G
C
G
A
A
A
G
T
C
3
A
C
C
C
T
T
C
-
A
T
A
-
-
-
A
A
A
T
7
G
C
A
G
A
C
C
-
C
A
C
C/A
C
A
-
A
C
T
T
A
G
T
G
8
T
T
-
C
A
-
A
A
A
T
T
-
-
-
G
-
C
A
T
-
G
T
-
T
-
-
-
-
-
G
-
G
A
G
-
-
-
-
A
-
-
-
C
C
-
-
C
C
G
-
-
9
C
C
C
T
2
C
C
G
A
A
A
C
C
-
4
A
C
A
G
A
-
G
C
A
-
C
C
A
-
C
-
-
-
-
T
G
T
G
12
T
A
C
C
C
-
G
-
G
-
-
11
-
-
-
G
T/TG
-
A
C
T
G
A
G
A
G
G
T
G
G
G
G
-
C
T
3
2
-
-
T
C
-
C
C
T
T
T
T
T
C
C
-
G
A/-
C/G
T
C
G
T
G
T
2