Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 116,591 (bp)   Positions: 483
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.0
.844
.001
.002
.885
.0
.0
.014
.001
.0
.001
.0
.0
.0
.085
.0
.021
.047
.19
.326
.263
.119
.005
.002
.023
.002
.001
.008
.007
.033
.06
.013
.035
.026
.015
.005
.02
.214
.001
.0
.008
.002
.329
.018
.0
.037
.005
.011
.0
.001
.003
.003
.003
.105
.108
.681
.569
.006
.0
.0
.001
.027
.004
.026
.012
.014
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.007
.006
.037
.015
.004
.008
.0
.014
.003
.012
.006
.014
.0
.021
--
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.202
.162
.29
.33
.231
.0
.002
.017
.005
.018
.006
.0
--
.005
.007
.019
.003
.002
.002
.0
.0
.001
.0
.001
.003
.012
.01
.001
.0
.001
.0
.0
.002
.002
.0
.003
.002
.0
.0
.123
.0
.197
.001
.002
.0
.0
.225
.347
.092
.014
.005
.004
.004
.018
.002
.004
.002
.01
.021
.05
.012
.001
.004
.002
.004
.001
.002
.004
.002
.001
.002
.002
.001
.001
.002
.001
.001
.001
.006
.0
.013
.005
.007
.003
.009
.022
.023
.001
.002
.011
.009
.01
.008
.001
.002
.003
.009
.048
.01
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.073
.0
.003
.003
.0
.027
.023
.016
.815
1.0
.0
.001
.0
.0
.0
.01
.003
.0
.0
.0
.0
.002
.001
.044
.001
.003
.0
.0
.001
.0
.0
.001
.011
.0
.01
.0
.002
.036
.099
.005
.002
.0
.002
.004
.002
.002
.003
.0
.0
.003
.0
.001
--
--
.006
.002
.0
.002
.006
.0
.0
.0
.067
.002
.045
.045
.0
.004
.002
.0
.0
.002
.004
.003
.003
.001
.0
.0
.014
.001
.016
.036
.19
.001
.008
.001
.001
.0
.0
.0
.0
.001
.0
.001
.0
.0
.004
.005
.004
.02
.027
.026
.002
.002
.004
.746
.489
.0
.0
.001
.001
.0
.0
.001
.001
.003
.068
.001
.002
.039
.035
.006
.001
.001
.02
.012
.143
.114
.005
.001
.007
.075
.058
--
--
--
--
--
.038
.478
.575
.42
--
--
--
--
--
--
--
--
.008
.004
.003
.001
.002
.005
.001
.001
.039
.023
.001
.0
.001
.0
.0
.004
.174
.022
.008
.004
.005
.003
.039
.016
.179
.052
.126
.029
.291
.208
.196
.234
.056
.015
.004
.005
.002
.003
.008
.005
.0
.012
.0
.002
.0
.0
.0
.0
.001
.001
.076
.003
.0
.0
.0
.004
.977
.999
.418
.0
.0
.008
.0
.001
.706
.0
.002
.004
.005
.001
.002
.0
.039
.001
.0
.177
.602
.0
.0
.745
.597
.031
.123
.0
.018
.005
--
--
.003
.0
.941
.998
.015
.0
.0
.053
Lyn
Lyn
Lyn
Lyn
Lyn
Lyn
Lyn
Lyn
Lyn
Lyn
Lyn
Lyn
Lyn
Lyn
Lyn
Lyn
Lyn
Lyn
Lyn
Lyn
Lyn
Lyn
Lyn
Lyn
Lyn
Lyn
Lyn
Lyn
Lyn
Lyn
Lyn
Lyn
Lyn
Lyn
Lyn
Lyn
Lyn
Lyn
Lyn
Lyn
Lyn
Lyn
Lyn
Lyn
Lyn
Lyn
Lyn
Lyn
Lyn
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
-
C
C
G
G
A
G
3
G
C
A
C
C
A
2
C
T
G
12
T
T
C
C
T
T
G
G
2
G
A
G
G
A
4
A
-
-
-
T
10
C
C
C
C
T
T
G
T
-
T
C
G
T
C
A
T
A
G
T
A
C
3
A
G
A
C
-
-
-
G
C
-
A
-
A
A
A
-
-
A
A
C
C
T
C
G
A
C
-
T
A
G
G
-
G
T
G
A
C
G
C
C
T
C
3
2
-
C
T
C
-
2
-
-
C
A
A
7
2
C
2
A
3
G
G
G
T
G
G
G
A
-
T
-
G
A
T
-
2
G
T
T
T
G
T
G
-
2
T
T
G
T
T
3
A
A
C
-
A
C
-
T
2
A
C
A
-
-
-
-
-
T
C
2
G
-
G
T
A
G
G
A
T
G
G
3
T
G
G
-
G
G
G
T
G
G
G
G
4
G
G
2
T
-
G
-
G
G
-
9
-
2
G
-
3
G
G
A
A
A
-
T
-
C
T
C
-
2
G
G
2
-
G
A
A
C
C
3
A
T
T
A
A
C
C
-
C
C
G
G
C
A
T
-
G
C
G
T
C
A
T
C
G
A
A
C
C
C
T
T
T
G
G
T
G
A
C
T
G
4
T
A
-
6
45
C
C
C
T
C
T
-
2
T
C
G
C
A
G
A
-
T
T
C
T
T
A
A
A
C
A
T
C
2
G
A
7
G
A
T
A
A
T
G
T
G
A
G
G
A
T
G
G
G
C
C
G
A
T
T
C
C
G
A
C
C
G
G
A
A
2
T
T
C
A
G
T
G
C
A
C
G
A
C
C
T
C
C
A
A
A
C
A
3
G
G
-
4
62
A
T
G
C
C
T
G
-
G
G
C
G
A
A
C
C
A
G
G
A
C
A
A
G
C
G
T
A
A
C
T
A
G
8
C
C
C
C
8
C
G
-
-
-
C
T
T
A
7
T
G
G
G
G
C
G
C
G
T
T
C
2
A
A
A
G
G
G
T
C
A
T
T
G
A
A
A
G
C
A
C
A
A
C
11
G
G
A
-
-
C
A
A
T
C
G
T
T
C
A
G
G
A
C
  16,526,124
  16,526,557
  16,526,622
  16,527,846
  16,528,497
  16,528,609
  16,528,702
  16,529,644
  16,529,666
  16,529,713
  16,529,975
  16,530,217
  16,530,499
  16,531,307
  16,531,539
  16,531,590
  16,531,947
  16,532,134
  16,532,147
  16,532,232
  16,532,240
  16,532,302
  16,532,417
  16,532,471
  16,532,520
  16,532,553
  16,532,619
  16,532,625
  16,532,633
  16,532,718
  16,532,932
  16,532,976
  16,532,983
  16,533,132
  16,533,215
  16,533,459
  16,533,513
  16,533,556
  16,533,721
  16,533,723
  16,533,746
  16,533,830
  16,534,293
  16,534,568
  16,535,037
  16,535,533
  16,536,329
  16,536,580
  16,536,712
  16,537,075
  16,537,129
  16,537,246
  16,537,247
  16,537,402
  16,537,539
  16,537,832
  16,538,763
  16,538,793
  16,539,174
  16,539,255
  16,539,470
  16,540,166
  16,540,721
  16,540,859
  16,540,935
  16,541,054
  16,542,379
  16,542,384
  16,542,409
  16,542,421
  16,542,505
  16,546,770
  16,546,792
  16,546,795
  16,546,798
  16,546,816
  16,546,819
  16,546,826
  16,547,085
  16,547,091
  16,547,103
  16,547,376
  16,547,394
  16,547,625
  16,548,310
  16,548,961
  16,549,623
  16,551,124
  16,551,151
  16,551,505
  16,551,871
  16,551,962
  16,553,565
  16,553,708
  16,554,159
  16,554,197
  16,554,624
  16,555,607
  16,556,169
  16,557,125
  16,557,335
  16,557,336
  16,557,339
  16,557,349
  16,557,351
  16,557,355
  16,557,358
  16,557,363
  16,557,373
  16,557,392
  16,557,396
  16,557,419
  16,557,427
  16,557,430
  16,557,431
  16,557,434
  16,557,436
  16,557,441
  16,557,453
  16,557,457
  16,557,460
  16,558,595
  16,558,597
  16,558,675
  16,559,134
  16,559,167
  16,560,694
  16,562,769
  16,566,297
  16,566,402
  16,566,639
  16,567,483
  16,568,180
  16,569,209
  16,570,730
  16,570,731
  16,571,204
  16,571,447
  16,571,449
  16,571,451
  16,571,457
  16,571,458
  16,571,464
  16,571,465
  16,571,467
  16,571,473
  16,571,479
  16,571,480
  16,571,483
  16,571,485
  16,571,490
  16,571,491
  16,571,494
  16,571,498
  16,572,689
  16,573,123
  16,573,451
  16,574,145
  16,574,597
  16,575,867
  16,576,066
  16,576,800
  16,577,780
  16,578,619
  16,578,620
  16,578,626
  16,578,657
  16,578,821
  16,578,834
  16,579,064
  16,579,072
  16,579,076
  16,579,093
  16,579,096
  16,579,110
  16,579,126
  16,579,145
  16,579,148
  16,579,157
  16,579,163
  16,579,172
  16,579,180
  16,579,195
  16,579,213
  16,579,223
  16,579,230
  16,579,235
  16,579,236
  16,579,251
  16,579,256
  16,579,259
  16,579,263
  16,579,266
  16,579,274
  16,579,275
  16,579,289
  16,579,296
  16,579,300
  16,579,303
  16,579,309
  16,579,312
  16,579,319
  16,579,324
  16,579,342
  16,579,371
  16,579,377
  16,579,380
  16,579,389
  16,579,559
  16,579,563
  16,579,576
  16,579,578
  16,579,584
  16,579,587
  16,579,591
  16,579,596
  16,579,598
  16,579,601
  16,580,412
  16,580,544
  16,580,547
  16,580,554
  16,580,579
  16,581,215
  16,581,279
  16,581,284
  16,581,379
  16,581,411
  16,581,436
  16,581,444
  16,581,469
  16,581,473
  16,581,478
  16,581,487
  16,581,491
  16,581,494
  16,581,508
  16,581,518
  16,581,656
  16,583,074
  16,607,512
  16,608,777
  16,608,893
  16,608,914
  16,608,916
  16,609,288
  16,609,423
  16,609,797
  16,609,976
  16,610,253
  16,610,523
  16,610,541
  16,610,563
  16,610,624
  16,610,643
  16,610,765
  16,610,970
  16,610,986
  16,611,001
  16,611,007
  16,611,049
  16,611,162
  16,611,208
  16,611,261
  16,611,265
  16,611,388
  16,611,494
  16,611,523
  16,611,525
  16,611,585
  16,611,616
  16,611,815
  16,611,926
  16,611,998
  16,612,247
  16,612,553
  16,612,574
  16,612,581
  16,612,686
  16,612,727
  16,612,732
  16,612,736
  16,612,740
  16,612,741
  16,612,815
  16,612,865
  16,612,894
  16,613,019
  16,613,084
  16,613,496
  16,613,557
  16,613,584
  16,613,607
  16,613,780
  16,613,937
  16,614,065
  16,614,205
  16,614,237
  16,614,365
  16,614,372
  16,614,396
  16,614,566
  16,614,567
  16,614,702
  16,614,785
  16,614,927
  16,614,934
  16,614,939
  16,614,946
  16,615,142
  16,615,152
  16,615,325
  16,615,382
  16,615,443
  16,615,507
  16,615,538
  16,615,549
  16,615,558
  16,615,561
  16,615,633
  16,615,820
  16,615,839
  16,615,845
  16,615,889
  16,615,932
  16,615,933
  16,615,942
  16,616,267
  16,616,281
  16,616,282
  16,616,285
  16,616,287
  16,616,314
  16,616,319
  16,616,327
  16,616,482
  16,616,512
  16,616,541
  16,616,645
  16,616,754
  16,616,773
  16,616,827
  16,617,006
  16,617,118
  16,617,465
  16,617,496
  16,617,521
  16,617,529
  16,617,592
  16,617,594
  16,617,650
  16,617,935
  16,617,944
  16,617,978
  16,618,010
  16,618,027
  16,618,406
  16,618,407
  16,618,427
  16,618,437
  16,618,439
  16,618,449
  16,618,453
  16,618,514
  16,618,517
  16,618,564
  16,618,569
  16,618,611
  16,618,638
  16,618,639
  16,618,679
  16,618,790
  16,618,813
  16,619,058
  16,619,075
  16,619,149
  16,619,265
  16,619,317
  16,619,339
  16,619,568
  16,619,828
  16,619,835
  16,619,852
  16,619,860
  16,619,870
  16,619,875
  16,619,909
  16,619,918
  16,619,967
  16,620,020
  16,620,128
  16,620,150
  16,620,260
  16,620,500
  16,620,520
  16,621,068
  16,621,111
  16,623,107
  16,623,486
  16,623,614
  16,624,251
  16,624,259
  16,625,892
  16,625,954
  16,627,149
  16,627,457
  16,627,780
  16,627,884
  16,627,929
  16,628,060
  16,628,122
  16,628,142
  16,628,196
  16,628,291
  16,628,374
  16,628,467
  16,628,473
  16,628,475
  16,628,483
  16,628,534
  16,628,663
  16,628,722
  16,628,723
  16,628,734
  16,628,737
  16,628,817
  16,628,832
  16,628,838
  16,628,863
  16,628,880
  16,629,033
  16,629,053
  16,629,187
  16,629,201
  16,629,388
  16,629,456
  16,629,729
  16,629,784
  16,629,820
  16,629,826
  16,629,834
  16,629,931
  16,629,939
  16,630,086
  16,630,115
  16,630,143
  16,630,406
  16,630,680
  16,630,716
  16,630,944
  16,630,946
  16,631,134
  16,631,716
  16,632,283
  16,632,286
  16,632,289
  16,633,429
  16,633,467
  16,633,725
  16,633,736
  16,634,731
  16,634,862
  16,634,999
  16,635,014
  16,635,574
  16,636,111
  16,636,814
  16,636,986
  16,637,387
  16,638,028
  16,638,988
  16,639,414
  16,639,842
  16,640,136
  16,640,147
  16,640,287
  16,640,716
  16,640,795
  16,640,840
  16,641,278
  16,641,445
  16,642,202
  16,642,242
C
G
G
A
T
G
A
-
A
T
T
T
T
C
-
T
C
A
-
G
C
T
T
C
C
T
G/C
2/-
-
C
A
A
G
-
G
9
A
T
-
-
T
A
A
T
C
-
A
C
7
C
T
-
A
T
G
A
T
T
C
G
G
-
C
A
C
T
T
T
T
-
T
A
C
T
-
-
-
A
T
-
-
G
C/G
C
G
A
G
T
4
G
C
A
A
3
T
C
A
T
G
A
-
T
-
-
-
-
8
-
-
G
C
-
6
G
A
T
C
-
-
T
-
-
-
-
T
A
C
C
-
A
T
A
C
4
G/T
A/T
A
3
-
T
C
C
A
A
A
C
2
-
C
A
C
C
A
3/-
G
G
A
T
G
G
5
C
-
G
A
-
T
T
T
T
C
-
T
-
-
T
-
-
T
T
-
-
-
-
-
-
C
T
T/C
4
T
T
T
G
T
-
T
C
-
-
-
-
C
G
-
T
-
-
5/T
-
T
-
C
C
-
A/C
T
T
T
-
-/G
C
T
-
-
T
2
-
-
T
-
G
-
-
-
G
G
-
G
C
G
C
G
C/T
C/T
2
T
T
T
A
T
T
C
3
A
T
A
C
T
C
C
T
A
C
C
T
T
T
C
C
C
A
C
C
A
G
T
C
A
-
-
-
2
-
-
A
T
G
C
T
C
3
-
A
T
A
T
G
T
G
A
T/C
T/C
T
A
C
G
G
G
T
G
G
A
-
A
C
-
T
G
C
G
G
A
C
C
A
G
A
A
G
C
T
C
A
T
T
A
T
C
C
G
T
A
C
T
T
-
A
G
G
-
C
A
T
G
A
C
A
T
G
T
A
G
T
G
C
T
G
T
T
G
A
G
-
A
A
A
-
-
G
C
A
A
T
C
A
3
A
A
T
A
T
G
T
T
G
A
T
G
A
C
G
A
T
A
G
G
G
T
C
G
A
-
G
T
T
T
8/-
T
C
11
2
2
T
C
-
T
-
C
C
A
T
A
T
A
T
A
C
C
T
-
T
G
G
A
A
A
C
T
G
C
C
A
G
G
G
A
T
G
T
G
G
-
11/-
C
A
G
A
T
T
G
G
C
A
A
G
C
T
C
A
A
G
A