Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 161,239 (bp)   Positions: 564
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.0
.005
.0
.025
.023
.008
.003
.008
.005
.492
.019
.017
.026
.005
.001
.007
.005
.001
.001
.0
.003
.002
.006
.007
.001
.038
.0
.002
.0
--
.009
.001
.001
.021
.027
.025
.827
.0
.026
.009
.019
.01
.0
--
--
.003
--
--
.008
.043
.004
--
--
.016
.003
.027
.032
.058
.045
.0
.0
.0
.195
.014
.001
.006
.001
.005
--
--
--
--
--
.002
.017
.007
.002
.001
.002
.011
.085
.117
.001
.002
.004
.0
.9
.0
.002
.0
.039
.006
.012
.062
.001
.0
.001
.001
.001
.012
.062
.098
.1
.092
.091
.1
.0
.002
.002
.0
.0
.102
.003
.04
.07
.003
.004
--
--
--
--
--
--
--
--
.078
.0
.219
.026
.225
.085
.032
.008
.016
.265
.0
.031
.011
.001
.013
.0
.054
.034
.0
.003
.043
.029
.002
.001
.001
.001
.013
.003
.002
.003
.008
.012
.005
.0
.009
.0
.052
.0
.013
.001
.014
.002
.001
.003
.219
.01
.028
.174
.032
.029
.591
.587
.323
.314
.128
.504
.457
.002
.001
.0
.0
.001
.001
.125
.161
.0
.0
.0
.6
.009
.0
.0
.001
.001
.0
.009
.555
.97
.001
.972
.115
.203
.0
.0
.003
.01
.006
.003
.042
.003
.001
.558
.0
.004
.003
.008
.036
.02
.027
.001
.002
.146
.001
.022
.001
.047
.494
.001
.007
.0
.001
.0
.0
.001
.0
.001
.0
.0
.0
.036
.002
.0
.007
.0
.002
.0
.001
.092
.0
.085
.01
.016
.001
.0
.0
.029
.0
.001
.0
.001
.003
.646
.0
.0
.0
--
.039
.009
.171
.716
.511
.0
.001
.002
.001
.0
.0
.025
.0
.567
.764
.238
.968
.916
.956
1.0
.3
.045
.009
.0
.0
.007
.007
.001
.023
.48
.061
.135
.608
.007
.715
.635
.002
.0
.025
.021
.566
.975
.02
.79
.867
.025
.962
.995
.898
.733
.202
.99
.984
.97
.195
.188
.044
.039
.665
.965
.862
.961
.001
.001
.051
.014
.012
.007
.011
.0
.002
.328
.133
.003
.042
.079
.132
.563
.606
.649
.88
.184
.008
.005
.042
.987
.993
.996
.379
.162
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.004
1.0
.991
.998
.001
.0
.0
.226
.095
.244
.005
.0
.009
.001
.011
.004
.001
.002
.001
.005
.0
.142
.119
.0
.0
.005
.016
.037
.067
.062
.0
.002
.001
.0
.0
.001
.002
.006
.017
.001
.001
.0
.013
.591
.016
--
.0
.024
.001
.001
.002
.053
.009
1.0
.0
.001
.001
.011
.001
1.0
.0
.0
.032
.942
.002
.018
.003
.005
.002
1.0
.023
.013
.001
.001
.001
.012
.003
.103
.001
.112
.588
--
.02
--
--
.026
.02
.268
.001
.005
.034
--
.023
.021
.001
.02
.0
.005
.44
.024
--
--
--
.395
.011
.0
.032
.001
.014
.0
.001
.001
.028
.008
.0
.001
.086
.099
.098
.0
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
T
-
A
T
C
C
C
C
G
T
C
C
A
G
T
A
C
C
A
T
C
A
T
T
T
C
T
G
G
G
A
C
C
A
T
-
C
2
-
A
2
G
6
2
A
T
-
A
A
-
5
3
3
G
G
A
G
T
C
G
C
G
C
C
T
C
C
A
T
-
A
G
A
C
C
G
-
A
T
G
-
T
T
G
G
T
T
A
T
G
T
-
C
A
T
A
-
T
A
C
C
T
G
-
T
G
G
C
-
T
C
4
11
A
A
A
2
A
T
T
G
C
T
8
-
T
T
C
T
C
T
T
T
C
T
115
T
A
C
T
T
C
T
T
T
A
G
G
G
C
T
C
G
T
T
A
T
A
T
A
G
G
C
T
C
T
C
T
C
T
C
T
T
A
T
G
C
G
G
T
3
T
C
T
G
T
2
-
A
A
T
C
T
A
A
T
C
A
T
A
-
-
G
A
C
A
T
T
G
T
G
G
T
A
-
C
G
G
T
T
T
3
-
C
A
G
T
T
C
C
A
G
-
T
G
C
C
G
G
C
T
A
A
C
C
A
T
A
C
C
T
T
G
T
T
A
C
A
G
C
T
C
G
A
-
-
T
T
C
C
G
G
A
A
3
T
G
T
G
T
T
C
C
T
A
G
A
A
T
-
-
T
T
C
G
G
A
T
A
A
C
T
T
T
G
-
G
G
T
G
C
T
T
C
T
G
T
5
G
C
A
T
T
T
C
T
T
G
A
C
C
C
C
G
G
C
A
C
T
C
T
A
C
3
T
T
C
T
C
T
C
C
C
A
T
T
T
C
T
-
C
G
A
A
A
G
A
C
A
A
G
T
G
T
9
G
A
C
C
C
A
A
T
A
C
A
A
G
A
T
G
C
A
A
G
G
T
A
A
C
C
3
G
T
A
T
T
C
T
C
T
G
2
-
A
C
C
T
T
T
C
A
G
T
T
C
G
A
G
A
-
G
-
-
G
A
T
C
G
G
A
C
G
T
G
T
C
T
A
C
7
C
T
-
46
T
A
C
G
T
T
A
C
A
C
A
T
G
G
C
G
C
A
G
A
C
T
G
T
A
T
C
C
A
-
T
T
A
-
G
8
A
T
A
C
G
C
T
C
C
C
A
T
-
C
-
T
C
T
G
T
C
A
G
T
A
C
G
C
C
T
A
A
-
T
G
C
C
T
-
-
G
C
T
T
-
-
T
T
G
C
A
C
C
C
C
T
T
C
T
G
T
T
A
T
C
T
C
-
G
C
G
-
  132,858,414
  132,858,488
  132,858,894
  132,861,213
  132,866,252
  132,866,996
  132,870,511
  132,871,414
  132,872,746
  132,876,041
  132,876,100
  132,876,886
  132,877,921
  132,878,093
  132,879,426
  132,879,496
  132,879,641
  132,879,814
  132,880,486
  132,880,487
  132,880,518
  132,880,614
  132,880,960
  132,881,112
  132,881,548
  132,881,686
  132,882,094
  132,882,349
  132,882,446
  132,882,634
  132,882,775
  132,882,940
  132,883,578
  132,884,569
  132,884,574
  132,889,425
  132,889,867
  132,891,108
  132,892,110
  132,892,114
  132,892,209
  132,892,240
  132,892,524
  132,893,126
  132,893,138
  132,893,828
  132,895,206
  132,896,161
  132,896,725
  132,902,390
  132,903,634
  132,903,687
  132,903,767
  132,904,073
  132,904,349
  132,904,503
  132,905,011
  132,905,255
  132,905,308
  132,905,782
  132,905,941
  132,905,951
  132,906,043
  132,907,546
  132,908,101
  132,908,122
  132,908,229
  132,908,247
  132,908,437
  132,908,903
  132,909,114
  132,909,276
  132,910,085
  132,910,490
  132,910,682
  132,911,140
  132,911,351
  132,911,906
  132,912,845
  132,913,550
  132,913,766
  132,913,780
  132,913,943
  132,914,096
  132,914,236
  132,914,239
  132,914,528
  132,914,803
  132,915,034
  132,915,180
  132,915,211
  132,915,255
  132,915,613
  132,915,638
  132,915,670
  132,915,834
  132,915,980
  132,916,012
  132,916,040
  132,916,239
  132,916,244
  132,916,255
  132,916,259
  132,916,260
  132,916,623
  132,916,738
  132,916,755
  132,917,101
  132,917,139
  132,917,170
  132,917,178
  132,917,215
  132,917,224
  132,917,239
  132,917,318
  132,917,352
  132,917,445
  132,918,077
  132,918,143
  132,918,237
  132,918,309
  132,918,324
  132,918,389
  132,918,393
  132,918,566
  132,918,630
  132,918,658
  132,918,865
  132,919,017
  132,919,112
  132,919,236
  132,919,242
  132,919,360
  132,919,381
  132,919,503
  132,919,562
  132,919,835
  132,920,236
  132,920,435
  132,921,139
  132,921,148
  132,921,239
  132,921,387
  132,921,419
  132,921,456
  132,921,697
  132,921,732
  132,921,751
  132,921,857
  132,921,914
  132,921,921
  132,921,934
  132,921,938
  132,921,962
  132,922,019
  132,922,039
  132,922,084
  132,922,177
  132,922,393
  132,922,630
  132,922,823
  132,922,972
  132,923,655
  132,923,808
  132,923,844
  132,923,859
  132,923,925
  132,924,126
  132,924,132
  132,924,270
  132,924,314
  132,924,329
  132,924,455
  132,924,605
  132,924,628
  132,924,795
  132,924,796
  132,924,819
  132,924,825
  132,925,032
  132,925,250
  132,925,567
  132,925,766
  132,925,791
  132,925,795
  132,925,796
  132,925,990
  132,926,027
  132,926,064
  132,926,076
  132,926,187
  132,926,471
  132,926,529
  132,926,690
  132,926,711
  132,926,899
  132,927,049
  132,927,070
  132,927,090
  132,927,116
  132,927,515
  132,927,669
  132,927,789
  132,927,985
  132,928,342
  132,928,520
  132,929,001
  132,929,157
  132,929,492
  132,929,561
  132,929,746
  132,929,822
  132,929,840
  132,929,855
  132,929,892
  132,929,949
  132,930,199
  132,930,488
  132,930,539
  132,930,568
  132,930,702
  132,930,721
  132,930,794
  132,930,798
  132,930,848
  132,930,849
  132,930,863
  132,930,918
  132,931,121
  132,931,131
  132,931,156
  132,931,221
  132,931,237
  132,931,242
  132,932,062
  132,932,082
  132,932,083
  132,932,118
  132,932,121
  132,932,176
  132,932,608
  132,932,658
  132,932,667
  132,933,044
  132,933,300
  132,933,424
  132,933,425
  132,933,468
  132,933,579
  132,933,580
  132,933,606
  132,933,717
  132,933,769
  132,933,945
  132,933,982
  132,933,995
  132,934,020
  132,934,049
  132,934,064
  132,934,164
  132,934,228
  132,934,450
  132,934,672
  132,935,136
  132,936,613
  132,937,230
  132,937,491
  132,939,176
  132,939,352
  132,941,827
  132,942,892
  132,943,728
  132,945,212
  132,945,767
  132,946,965
  132,947,298
  132,947,543
  132,947,626
  132,947,902
  132,947,903
  132,948,554
  132,949,189
  132,949,219
  132,949,549
  132,949,806
  132,949,916
  132,949,933
  132,950,005
  132,950,057
  132,950,063
  132,950,099
  132,950,133
  132,950,152
  132,950,168
  132,950,173
  132,950,209
  132,950,305
  132,950,385
  132,950,808
  132,950,809
  132,950,987
  132,951,097
  132,951,108
  132,951,579
  132,951,753
  132,952,083
  132,952,086
  132,952,451
  132,952,459
  132,952,512
  132,952,877
  132,953,355
  132,953,544
  132,954,350
  132,954,571
  132,954,821
  132,954,852
  132,955,017
  132,955,033
  132,955,161
  132,955,236
  132,955,429
  132,955,641
  132,956,057
  132,956,067
  132,956,129
  132,956,179
  132,956,195
  132,956,302
  132,956,335
  132,956,369
  132,956,417
  132,956,427
  132,956,502
  132,956,503
  132,956,521
  132,956,572
  132,956,574
  132,956,585
  132,956,587
  132,956,624
  132,956,641
  132,956,677
  132,956,686
  132,956,717
  132,956,742
  132,956,764
  132,956,772
  132,956,783
  132,956,784
  132,956,785
  132,956,791
  132,956,903
  132,956,921
  132,956,927
  132,957,044
  132,957,173
  132,957,213
  132,957,242
  132,957,277
  132,957,290
  132,957,314
  132,957,322
  132,957,326
  132,957,365
  132,957,397
  132,957,404
  132,957,772
  132,957,879
  132,957,931
  132,957,937
  132,957,966
  132,958,007
  132,958,218
  132,958,267
  132,958,359
  132,958,443
  132,958,477
  132,960,251
  132,960,261
  132,960,295
  132,961,017
  132,961,089
  132,961,152
  132,961,225
  132,961,233
  132,961,235
  132,961,382
  132,961,409
  132,961,478
  132,961,528
  132,962,138
  132,962,155
  132,962,164
  132,962,177
  132,962,228
  132,962,321
  132,962,324
  132,962,338
  132,962,345
  132,962,346
  132,962,359
  132,962,368
  132,962,378
  132,962,399
  132,962,413
  132,962,436
  132,962,533
  132,962,535
  132,962,569
  132,962,573
  132,962,594
  132,962,595
  132,962,875
  132,962,878
  132,963,151
  132,963,294
  132,963,369
  132,963,373
  132,963,480
  132,963,643
  132,963,660
  132,963,661
  132,963,818
  132,963,853
  132,963,864
  132,963,871
  132,963,921
  132,963,928
  132,963,957
  132,963,990
  132,964,018
  132,964,083
  132,964,175
  132,964,186
  132,964,228
  132,964,257
  132,964,274
  132,964,462
  132,964,488
  132,964,533
  132,964,539
  132,964,543
  132,964,568
  132,964,589
  132,964,922
  132,964,953
  132,964,988
  132,965,059
  132,965,080
  132,965,149
  132,965,212
  132,965,229
  132,965,236
  132,965,277
  132,965,280
  132,965,334
  132,965,341
  132,965,350
  132,965,362
  132,965,369
  132,965,380
  132,965,382
  132,965,403
  132,965,412
  132,965,426
  132,965,427
  132,965,438
  132,965,439
  132,965,461
  132,965,480
  132,965,527
  132,965,534
  132,965,548
  132,965,570
  132,965,595
  132,965,612
  132,965,616
  132,965,617
  132,965,672
  132,965,683
  132,965,725
  132,965,766
  132,965,823
  132,965,862
  132,965,915
  132,965,938
  132,966,100
  132,966,602
  132,968,778
  132,969,053
  132,969,201
  132,969,230
  132,969,265
  132,969,267
  132,969,363
  132,969,446
  132,969,763
  132,969,948
  132,970,096
  132,970,131
  132,970,321
  132,972,401
  132,973,788
  132,974,347
  132,974,414
  132,976,010
  132,976,233
  132,976,244
  132,976,376
  132,977,622
  132,977,625
  132,978,865
  132,979,017
  132,979,584
  132,979,724
  132,979,989
  132,981,021
  132,981,105
  132,981,501
  132,981,763
  132,984,513
  132,984,523
  132,984,571
  132,984,798
  132,985,101
  132,985,358
  132,986,958
  132,987,056
  132,987,968
  132,988,799
  132,988,866
  132,989,484
  132,990,470
  132,992,992
  132,993,103
  132,993,383
  132,994,029
  132,994,325
  132,997,524
  132,997,858
  132,998,900
  133,000,131
  133,000,862
  133,008,854
  133,008,891
  133,008,904
  133,015,463
  133,015,495
  133,015,556
  133,015,700
  133,015,904
  133,015,935
  133,016,155
  133,016,278
  133,016,382
  133,016,497
  133,016,518
  133,016,729
  133,016,741
  133,017,124
  133,017,378
  133,017,474
  133,017,842
T
A
12
G
G
A
A
G
T
C
C
T
T
G
A
C
G
T
T
G
A
T
G
-
G
C
T
C
A
T
A
C
A
T
C
G
A
T
-
3
G
2/-
A
6/-
2/-
G
C
9
G
T
2
-
-
-
A
-
G
A
-
T
C
T
A
T
T
C
T
T
G
C
12
G
A
G
T
T
T
T
C
C
T
15
C
-
T
A
C
C
T
G
A
C
T
T
G
C
-
5
C
G
G
T
C
A
5
C
A
C
-
2
A
-
-
-
C
C
C
-
G
C
C
A
T
G
-
6
G
C
T
C
A
C
C
C
T
G
-
C
C
G
C
C
A
C
C
C
T
C
T
A
A
C
T
C
-
C
C
C
-
A
G
A
A
T
C
T
C
A
C
T
C
T
C
C
G
C
A
T
A
T
C
-
A
T
C
A
C
-
A
G
G
G
T
C
G
G
C
A
G
C
G
T
16
A
G
T
C
C
A
A
G
A
A
G
G
T
T
A
A
C
C
C
-
A
T
G
A
C
C
G
T
G
A
G
C
A
T
T
C
A
A
C
G
G
T
T
T
C
G
G
G
C
C
T
C
C
G
T
G
A
T
C
T
T
T
8
T
G
C
T
G
A
T
G
-
-
C
T
C
T
G
C
T
A
C
C
A
G
G
A
2
14
C
C
A
A
C
G
C
T
G
T
C
C
A
A/AC
4
A
C
C
A
T
A
A
T
C
C
-
-
A
A
T
G
C
C
T
C
C
T
G
T
T
T
T
A
A
T
T
T
A
T
C
G
T
-
C
G
T
A
A
A
A
G
G
G
C
A
-
T
C
8
A
T
G
-
C
A
C
C/T
A/T
A/G
G/T
T/C
G/A
C
-
G/A
A/T
T
T
A
C
G
C
C
T
G
G
T
G
C
A
T
G
G
A
A
C
T
T
T
T
-
T
C
G
C
C
G
G
T
C
A
-
C
G
T
A
C
A
C
T
G
A
C
C
T
T
G
A
G
-/2
A
16
4
A
G
G
G
-
C
C
T
A
C
A
C
T
C
G
A
-
G
C
A
-
C
-
G
A
A
C
G
T
G
T
G
C
A
A
T
A
T
C
A
G
T
C
A
C
G
C
T
T
G
T
C
C
C
5
A
-
C
-
C
G
A
T
C
T
T
T
T
C
12
A
12
C
T
C
-
G
T
G
A
C
G
T
A
T
T
C
G
G
T
C
A
-
-
C
9
5
A
T
A
C
A
4
C
C
A
T
G
T
C/T
C/T
C/G
C
C
T
C
A
C
C
G
C
T
C
T
A
C
G
A
35