Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 161,239 (bp)   Positions: 509
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.482
.001
1.0
.003
.025
.0
.0
.005
.0
.0
.015
.071
.06
.081
.006
.06
.064
.103
.068
.0
.001
.002
.415
.001
.025
.0
.014
.111
.001
.0
.206
.007
.001
.001
.001
.001
.007
.005
.008
.003
.001
.073
.013
.448
.01
.0
.0
.003
.002
.0
.0
.0
.001
.0
.063
.005
.005
.0
.002
.036
.05
.001
.0
.0
.001
.002
.023
.001
.045
.0
.002
.004
.007
.013
.006
.001
.0
.0
.404
.989
.002
.001
.0
.0
.0
.02
.028
.001
.003
.087
--
.003
.008
.0
.003
.001
.012
.006
.0
.009
.012
.001
.003
.0
.051
.009
.007
.003
.0
.998
.009
.043
.372
.026
.0
.001
.008
.005
.002
.002
.674
.0
.0
.007
.0
.016
.023
.023
.082
.061
.001
.047
.0
.006
.086
.021
.005
.0
.0
.799
.0
.001
.005
.002
.004
.003
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.098
.159
.002
.002
.018
--
.022
.001
.001
.001
.001
.025
.006
.001
.001
.001
.005
.005
.538
.528
.0
.0
.01
.0
.0
.0
.0
.0
.996
.0
.0
.001
.008
--
.018
.018
.007
.005
.001
.0
.003
.0
.006
.0
.001
.02
.038
.072
.001
.0
.004
.001
1.0
.001
.002
.012
.0
.003
.028
.0
.005
.001
.472
.809
.0
.012
.008
.045
.0
.007
.042
.061
.045
.013
.0
.0
.001
.0
.006
.0
.521
.001
.416
.002
.001
.0
.0
.001
.0
.0
.0
.002
.001
.0
.001
.0
.001
.03
.001
.003
.0
.001
.001
.055
.007
.0
.002
.007
.001
.827
.007
.001
.001
.0
.008
.016
.005
.003
.0
.0
.002
.014
.065
.107
.035
.026
.009
.001
.003
.0
.012
.0
.259
.264
.007
.003
.002
.009
.003
.0
.033
--
--
.136
.011
.007
.041
--
.019
.001
.0
.008
.027
.003
.001
.056
.149
.182
--
--
.204
.119
.608
.001
.004
.001
.001
.001
.244
.001
.004
.004
.001
.01
.0
.054
.188
.049
.003
.002
.007
.023
.004
.004
.005
.004
.018
.018
.043
.003
.002
--
--
--
--
.018
.031
.004
--
--
.016
.003
.045
.0
.0
.0
.195
.014
.001
.006
.001
.005
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.002
.002
.001
.002
.001
.011
.085
.117
.001
.002
.004
.0
.9
.0
.032
.128
.972
--
.0
.0
.009
.237
.716
.0
.001
.97
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
1.0
.005
.019
--
.0
.024
.001
.001
.002
.002
.003
1.0
.0
.002
.0
.0
.0
.0
.08
.942
.002
.083
.11
.013
.997
--
.026
.005
.603
.034
--
.023
.021
.001
.0
.0
.007
.051
.44
.018
.01
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.002
.004
.003
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.058
.023
.001
.003
.003
.037
.002
.395
.011
.0
.032
.001
.014
.0
.0
.002
.001
.001
.0
.002
.001
.015
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Hmgb1-ps3
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
G
T
A
A
C
G
T
T
G
A
C
T
T
-
-
-
C
C
G
C
-
G
A
A
64
A
T
C
G
A
G
T
10
G
T
C
A
A
T
A
G
T
A
G
-
G
T
G
A
A
G
T
-
G
C
C
C
C
G
G
C
T
C
T
T
T
C
T
T
G
C
T
T
G
G
A
T
T
C
T
T
T
T
T
T
T
C
A
T
-
T
A
A
A
T
-
T
A
-
A
G
C
G
T
A
A
-
C
T
A
T
-
A
T
T
C
A
G
7
5
A
T
A
-
C
-
-
-
G
A
A
A
G
C
T
G
-
G
G
T
T
-
G
C
A
A
4
-
C
G
G
A
G
A
C
C
T
-
G
2
C
T
G
T
C
G
C
T
C
T
A
A
C
C
A
C
A
C
C
T
C
T
G
C
2
A
T
T
T
T
G
T
A
C
A
T
C
A
C
T
C
T
G
C
A
G
C
C
A
A
C
A
C
G
C
A
G
3
A
C
C
C
A
A
G
-
A
T
-
A
T
T
A
T
C
A
T
A
C
A
-
-
G
G
C
G
T
G
C
A
G
-
C
C
T
T
G
G
2
49
A
C
-
G
-
C
-
C
T
C
C
A
G
A
A
A
T
C
G
T
2
-
-
T
G
T
A
T
C
T
A
G
A
T
A
T
T
G
G
A
-
T
-
T
T
T
A
A
C
C
T
6
G
C
G
G
A
A
G
C
C
G
A
2
G
G
G
T
C
T
C
C
A
C
T
-
C
C
T
G
T
A
C
A
T
C
A
G
T
A
A
G
-
5
3
3
G
T
C
G
C
G
C
C
T
C
C
A
T
G
T
T
T
T
A
C
C
G
A
G
-
A
G
T
G
-
T
T
G
G
T
G
T
G
A
2
C
G
G
T
A
T
G
T
A
A
C
T
9
C
G
-
-
C
C
C
A
A
T
C
A
-
G
8
A
T
A
A
G
C
T
C
G
G
-
-
C
T
C
A
-
T
G
C
T
C
A
T
T
-
-
T
C
A
T
G
A
C
A
T
C
C
C
A
C
C
C
A
A
G
C
C
C
T
C
T
C
A
C
A
C
T
C
A
G
G
T
C
A
C
C
G
C
T
T
C
T
G
T
G
T
G
A
T
C
T
-
2
  132,857,567
  132,857,620
  132,857,839
  132,858,018
  132,858,029
  132,858,414
  132,858,423
  132,858,488
  132,858,656
  132,859,067
  132,859,390
  132,859,718
  132,859,740
  132,859,746
  132,859,910
  132,859,919
  132,859,920
  132,859,939
  132,859,955
  132,860,511
  132,860,617
  132,860,838
  132,861,041
  132,861,173
  132,861,213
  132,861,776
  132,862,441
  132,862,731
  132,862,919
  132,862,950
  132,863,220
  132,863,360
  132,863,364
  132,863,367
  132,863,466
  132,863,488
  132,863,929
  132,863,930
  132,863,932
  132,863,974
  132,864,031
  132,864,105
  132,864,237
  132,864,333
  132,864,391
  132,864,467
  132,864,529
  132,864,553
  132,864,554
  132,864,665
  132,864,946
  132,865,034
  132,865,082
  132,865,105
  132,865,293
  132,865,392
  132,865,406
  132,865,421
  132,865,516
  132,865,558
  132,865,586
  132,865,596
  132,865,599
  132,865,853
  132,865,860
  132,866,154
  132,866,252
  132,866,263
  132,866,272
  132,866,345
  132,866,411
  132,866,432
  132,866,556
  132,866,566
  132,866,744
  132,866,924
  132,866,926
  132,866,927
  132,867,032
  132,867,047
  132,867,217
  132,867,245
  132,867,246
  132,867,261
  132,867,278
  132,868,683
  132,868,749
  132,869,007
  132,869,043
  132,869,245
  132,869,404
  132,869,881
  132,869,993
  132,870,022
  132,870,045
  132,870,056
  132,870,127
  132,870,221
  132,870,244
  132,870,251
  132,870,397
  132,870,481
  132,870,511
  132,870,573
  132,870,587
  132,870,684
  132,870,712
  132,870,722
  132,870,786
  132,870,801
  132,871,019
  132,871,061
  132,871,102
  132,871,104
  132,871,292
  132,871,396
  132,871,414
  132,871,549
  132,871,571
  132,871,574
  132,871,615
  132,871,804
  132,871,815
  132,871,846
  132,871,914
  132,872,000
  132,872,010
  132,872,011
  132,872,020
  132,872,025
  132,872,027
  132,872,105
  132,872,224
  132,872,234
  132,872,804
  132,873,206
  132,873,317
  132,873,465
  132,873,562
  132,873,659
  132,874,128
  132,874,390
  132,874,724
  132,874,848
  132,874,935
  132,875,264
  132,875,296
  132,875,299
  132,875,374
  132,875,399
  132,875,451
  132,875,534
  132,875,566
  132,875,679
  132,875,680
  132,875,711
  132,875,831
  132,876,274
  132,876,575
  132,876,678
  132,876,943
  132,877,126
  132,877,357
  132,877,432
  132,877,433
  132,877,458
  132,877,545
  132,877,737
  132,877,770
  132,877,844
  132,877,872
  132,877,913
  132,878,093
  132,878,095
  132,878,192
  132,878,193
  132,878,318
  132,878,319
  132,878,343
  132,878,378
  132,878,530
  132,878,552
  132,878,585
  132,878,586
  132,878,721
  132,878,810
  132,878,825
  132,879,078
  132,879,103
  132,879,140
  132,879,214
  132,879,435
  132,879,496
  132,879,641
  132,880,486
  132,880,487
  132,880,518
  132,880,771
  132,880,960
  132,881,377
  132,881,548
  132,881,634
  132,881,686
  132,881,702
  132,881,789
  132,881,856
  132,882,761
  132,882,968
  132,883,241
  132,883,661
  132,883,716
  132,884,479
  132,884,803
  132,884,819
  132,884,919
  132,884,933
  132,884,949
  132,885,237
  132,885,265
  132,885,270
  132,885,291
  132,885,311
  132,885,380
  132,885,400
  132,885,412
  132,885,457
  132,885,459
  132,885,460
  132,885,475
  132,885,531
  132,885,534
  132,885,570
  132,885,588
  132,885,613
  132,885,644
  132,885,736
  132,885,856
  132,885,925
  132,885,942
  132,886,004
  132,886,005
  132,886,056
  132,886,057
  132,886,137
  132,886,224
  132,886,231
  132,886,531
  132,886,571
  132,886,588
  132,886,645
  132,886,646
  132,886,655
  132,886,705
  132,886,796
  132,886,980
  132,887,060
  132,887,090
  132,887,233
  132,887,417
  132,888,177
  132,888,262
  132,888,524
  132,888,972
  132,889,170
  132,889,501
  132,889,867
  132,890,014
  132,890,270
  132,890,997
  132,891,013
  132,891,090
  132,891,362
  132,891,364
  132,891,460
  132,891,585
  132,891,606
  132,891,680
  132,891,756
  132,891,887
  132,892,041
  132,892,108
  132,892,110
  132,892,114
  132,892,222
  132,892,352
  132,892,498
  132,892,510
  132,892,573
  132,893,237
  132,893,238
  132,893,489
  132,893,828
  132,893,921
  132,894,081
  132,894,144
  132,894,666
  132,895,161
  132,895,206
  132,895,489
  132,895,607
  132,895,910
  132,895,960
  132,895,996
  132,896,161
  132,896,414
  132,896,561
  132,896,691
  132,896,725
  132,896,953
  132,897,693
  132,898,310
  132,898,667
  132,898,771
  132,898,858
  132,899,082
  132,899,179
  132,899,484
  132,899,620
  132,899,689
  132,900,050
  132,900,091
  132,900,184
  132,900,201
  132,900,412
  132,900,580
  132,900,663
  132,900,669
  132,900,777
  132,900,927
  132,901,371
  132,901,431
  132,901,634
  132,901,736
  132,901,846
  132,901,879
  132,901,977
  132,902,001
  132,902,038
  132,902,146
  132,902,164
  132,902,172
  132,902,177
  132,902,239
  132,902,269
  132,902,390
  132,902,402
  132,902,561
  132,902,638
  132,902,793
  132,902,876
  132,902,968
  132,903,087
  132,903,090
  132,903,634
  132,903,687
  132,903,767
  132,904,073
  132,904,349
  132,905,308
  132,905,782
  132,905,941
  132,905,951
  132,906,043
  132,907,546
  132,908,101
  132,908,122
  132,908,229
  132,908,247
  132,908,437
  132,908,903
  132,908,928
  132,909,121
  132,909,123
  132,909,125
  132,909,127
  132,909,276
  132,909,848
  132,909,959
  132,910,085
  132,910,490
  132,911,351
  132,911,906
  132,912,845
  132,913,376
  132,913,550
  132,913,766
  132,913,780
  132,913,943
  132,914,096
  132,914,236
  132,914,239
  132,914,528
  132,922,226
  132,924,605
  132,925,032
  132,928,342
  132,931,609
  132,932,083
  132,935,136
  132,945,212
  132,946,449
  132,946,965
  132,947,543
  132,947,626
  132,956,067
  132,957,743
  132,957,772
  132,957,879
  132,958,267
  132,958,359
  132,958,382
  132,958,443
  132,959,799
  132,960,113
  132,960,251
  132,960,261
  132,960,295
  132,961,089
  132,961,354
  132,966,086
  132,968,178
  132,968,356
  132,968,778
  132,969,053
  132,969,201
  132,969,230
  132,969,265
  132,969,267
  132,969,621
  132,969,716
  132,969,763
  132,969,948
  132,972,949
  132,973,536
  132,973,537
  132,974,347
  132,974,373
  132,976,088
  132,976,233
  132,976,244
  132,977,534
  132,979,382
  132,979,724
  132,983,544
  132,987,010
  132,987,968
  132,990,470
  132,992,481
  132,992,992
  132,993,103
  132,993,383
  132,994,029
  132,994,325
  132,994,866
  132,996,387
  132,997,289
  132,999,026
  133,000,131
  133,001,060
  133,001,224
  133,001,433
  133,001,860
  133,001,891
  133,002,276
  133,002,432
  133,002,497
  133,002,911
  133,003,378
  133,004,651
  133,004,859
  133,005,030
  133,005,076
  133,005,136
  133,005,503
  133,005,584
  133,005,604
  133,007,276
  133,007,894
  133,007,896
  133,008,161
  133,008,379
  133,008,766
  133,008,870
  133,010,592
  133,010,622
  133,010,623
  133,010,680
  133,011,450
  133,011,470
  133,011,955
  133,011,958
  133,012,124
  133,012,404
  133,013,945
  133,015,463
  133,015,495
  133,015,556
  133,015,700
  133,015,904
  133,015,935
  133,016,102
  133,016,155
  133,016,179
  133,016,278
  133,016,382
  133,016,484
  133,016,485
  133,016,741
  133,017,101
G
A
G
A/C
C
T
A
A
A
A
G
T
T/A
T/A
9
2
6
-
A
A
T
C
A
G
G
-
G
C
A
A
C
T
C
-
A
C
G
T
G
A
G
A
C
G
A
T
A
C
A
C
G
A
C
4
T
G
T
T
T
C
A
T
A
T
C
C
G
G
C
C
A
G
C
A
T
A
G
C
-
T
G
C
C
C
C
C
C
T
G
C
A
C
G
G
G
C
2
G
G
C
C
T
A
-
G
T
G
T
T
C
G
G
G
C
C
C
G
G
-
-
-
T
A
G
2
T/TG
6
18
T
T
T
G
G
A
T
C
C
T
A
A
C
C
2
A
G
G
-
-
C
G
A
A
C
A
T
T
T
C
A
T
-
G
C
A
G
T
A
T
C
T
C
T
G
T
T
G
T
G
T
T
C
T
C
A
A
-
G
C
C
C
G
A
C
G
T
G
A
T
G
T
G
T
C
A
G
G
A
G
T
C
G
G
T
T
C
T
G
A
-
T
T
G
T
G
G
-
21
T
C
10
G
C
C
G
C
T
-
A/A
G
T
G
2
12
A
C
T
A
C
A
T
T
A
T
T
T
C
C
C
A
-
-
G
T
8
A
A
T
A
A
C
T
T
G
T
G
G
T
C
T
A
C
-
3
2
C
A
C
G
C
T
G
G
A
G
A
C
G
C
A
A
T
A
C
9
C
C
A
G
-
G
T
C
-
A
T
C
A
G
C
A
T
T
A
G
-
A
A
A
C
T
C
G
A
T
T
C
6
T
-
C
A
C
G
T
T
C
G
T
A
C
-
G
T
2
-
-
-
A
-
T
C
T
A
T
T
C
T
T
G
C
T
G
G
G
G
G
T
A
A
G
T
T
C
A
C
T
15
C
-
T
A
C
A
C
T
G
-
T
T
T
-
-
C
T
C
A/T
A/C
C/T
T/C
9/-
C/T
G/A
T
T
C/T
C/T
C/A
G
-
G
A
C
5
A
-
C
-
C
G
A
T
C
A
A
A
12
4
G
C
T
T
T
C
A
-
C
T
-
A
C
A
4
C
T
G
C
A
G
G
G
G
T
T
A
C
A
T
T
T
C
C
T
G
T
G
G
G
T
G
G
C
C/T
T/-
C/T
A/G
G/C
G/C
G
G
G
G
T
A
T
C
C
T
C
A
C
A
C
A
G
C
-
G
A
-