Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 178,807 (bp)   Positions: 580
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.001
.021
.01
.402
.003
.006
.387
.362
.266
.068
.061
.031
.408
.213
.002
.178
.0
.066
.077
.0
.034
--
--
--
--
--
--
--
.004
.13
.128
.113
.012
.001
.001
.018
.0
.193
.013
.118
.062
.995
.777
.001
.057
.0
.01
.0
.0
.007
.146
--
.002
.938
.04
.013
.0
.009
.034
.016
.067
.0
.0
.0
.0
.0
.007
.003
.02
.0
.0
.018
.0
.0
.002
.0
.001
.016
.003
.002
.001
.017
.021
.078
.0
.0
.001
.911
.0
.0
.002
.001
.017
.002
.015
.0
--
.004
.046
.002
.073
.003
.052
.848
.014
.022
.041
.105
.09
.012
.008
.0
.0
.078
.0
.811
.545
.0
.001
.0
.0
.003
.0
.015
.028
.015
.001
.0
.001
.001
.012
.006
.516
.184
.003
.002
.001
.004
.042
.0
.338
.001
.424
.922
.429
.004
.0
.0
.004
.006
.0
.003
.006
.002
.011
.496
.185
.088
.109
.106
.166
.256
.022
.007
.034
.005
.312
.141
.008
.006
.002
.008
.003
.0
.002
.0
.087
.001
.0
.001
.0
.0
.008
.008
.211
.001
.0
.007
.003
.0
.03
.05
.019
.714
.002
.004
.003
.017
.332
.228
.703
.519
.333
.139
.001
.016
.011
.003
.222
.351
.038
.008
.008
.008
.055
.672
.772
.005
.134
.017
.01
.004
.005
.137
.074
.042
.008
.029
.005
.006
.017
.167
.125
.023
.013
.012
.026
.012
.001
.0
.008
.0
.0
.002
.045
.0
.02
.0
.016
.0
.002
.002
.08
.247
.003
.017
.021
.001
.0
.19
.018
.015
.0
.023
.022
.018
.0
.0
.012
.0
.002
.204
.016
.005
.018
.0
.0
.001
.001
.001
.001
.003
.005
.042
.007
--
--
--
.043
1.0
.024
.0
.001
.023
.002
.042
.017
.001
.005
.001
.066
.005
.0
.001
.0
.01
.0
.002
.016
.01
.037
.621
.167
.0
.025
.037
.003
.01
.001
.001
.001
.012
.0
.827
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.524
.515
.535
.264
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.016
.005
.003
.015
.021
.912
.0
.189
.011
.019
.001
.0
.065
.001
.0
.0
.0
.0
.0
.011
.0
.002
.53
.645
.296
.037
.819
.12
.129
.017
.011
.034
.147
.003
.042
.749
.997
.011
.074
.004
.029
.001
.001
.001
.019
.013
.002
.012
.032
.0
.0
.007
.0
.029
.0
.004
.0
1.0
.003
.001
.028
.002
.004
.001
.001
.001
.004
.006
.0
.0
.002
.009
.058
.01
.001
.001
.001
.001
.0
.049
.002
.0
.0
.001
.002
.036
.034
.008
.007
.012
.195
.002
.002
.028
.002
.001
.004
.137
.003
.004
.0
.021
.016
.015
.084
.039
.008
.085
.001
.059
.027
.0
--
--
.035
.47
.214
.026
.073
.03
.058
.019
.0
.101
.015
.0
.003
.0
.031
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.005
.005
.002
.02
.0
.004
.001
.004
.012
.001
.002
.003
.005
.017
.049
.014
.009
.005
.004
.008
.021
.018
.038
.013
.003
.014
.011
.004
.069
.067
.07
.054
.036
.01
.001
.096
.108
.001
.0
.0
.001
.001
.001
.015
.003
.0
.019
.001
.042
.0
.293
.088
.086
.002
.0
.001
.0
.0
.004
.056
.0
.602
.006
Lepr
Lepr
Lepr
Lepr
Lepr
Lepr
Lepr
Lepr
Lepr
Lepr
Lepr
Lepr
Lepr
Lepr
Lepr
Lepr
Lepr
Lepr
Lepr
Lepr
Lepr
Lepr
Lepr
Lepr
Lepr
Lepr
Lepr
Lepr
Lepr
Lepr
Lepr
Lepr
Lepr
Lepr
Lepr
Lepr
Lepr
Lepr
Lepr
Lepr
Lepr
Lepr
Lepr
Lepr
Lepr
Lepr
Lepr
Lepr
Lepr
Lepr
Lepr
Lepr
Lepr
Lepr
Lepr
Lepr
Lepr
Lepr
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
A
2
A
G
A
A
C
-
A
T
G
T
C
C
T
T
G
A
-
A
A
A
A
T
A
C
C
A
A
A
A
A
-
T
A
A
T
T
A
T
C
A
A
C
A
C
A
-
C
T
A
2
C
-
T
3
C
A
A
A
C
G
C
G
A
C
A
-
C
T
C
-
A
G
C
A
G
A
A
C
A
A
C
-
A
15
C
G
G
C
G
C
G
A
7
A
A
T
-
A
T
T
C
A
T
2
A
-
-
A
-
G
T
A
T
-
T
A
-
T
C
G
G
G
C
A
G
A
G
C
T
T
2
4
A
C
C
C
A
T
G
G
A
C
A
-
A
G
G
G
G
C
G
T
C
-
T
G
G
A
C
-
A
G
-
T
C
A
G
C
C
G
T
G
G
T
T
G
G
-
T
A
-
-
A
T
T
T
T
C
A
G
A
T
-
-
A
-
-
-
T
-
G
A
-
-
-
C
2
G
T
A
G
A
A
-
-
A
A
A
T
C
T
A
-
-
A
A
A
G
G
G
-
A
T
C
-
-
G
C
T
T
A
G
-
T
T
-
C
T
T
A
C
C
G
T
A
A
10
A
G
C
G
C
C
G
T
G
A
A
A
-
G
T
T
A
A
A
C
-
-
-
-
-
T
A
3
A
C
G
T
G
G
G
G
-
G
T
G
-
G
G
C
C
T
A
C
A
C
A
-
G
-
T
T
-
A
-
G
C
T
T
T
G
A
T
C
T
T
C
-
G
-
2
C
A
T
T
A
-
T
T
A
T
G
-
A
3
G
T
-
-
T
G
T
-
2
C
C
G
T
C
G
T
C
C
C
C
T
G
G
G
C
G
C
-
C
G
7
G
G
A
A
A
G
A
T
C
C
C
C
G
G
A
-
C
T
T
C
C
A
T
A
T
T
G
T
G
T
T
C
G
G
A
T
T
T
G
G
G
A
-
T
5
C
-
T
C
G
C
A
4
C
A
A
G
C
T
-
G
A
C
G
C
A
T
A
T
A
T
C
C
C
A
T
-
T
A
A
4
A
12
T
C
A
C
G
C
T
A
A
T
A
T
A
G
T
7
G
T
G
A
4
C
A
G
-
A
A
T
A
11
A
T
A
T
C
T
C
C
C
C
8
G
T
C
T
A
T
-
T
A
C
-
T
A
G
C
C
A
-
C
G
A
G
G
C
G
C
T
A
T
T
A
A
-
10
-
2
3
T
A
A
2
-
T
-
T
T
-
G
G
-
C
6
2
A
A
T
C
T
A
G
A
C
-
G
C
C
C
-
C
G
T
A
C
C
G
G
C
  120,511,510
  120,511,601
  120,515,596
  120,515,676
  120,515,870
  120,517,197
  120,517,802
  120,517,834
  120,518,619
  120,520,773
  120,520,896
  120,521,818
  120,522,204
  120,522,799
  120,523,220
  120,524,837
  120,524,936
  120,525,193
  120,525,208
  120,525,233
  120,525,731
  120,526,180
  120,526,309
  120,526,413
  120,526,520
  120,526,735
  120,526,749
  120,527,420
  120,527,785
  120,528,032
  120,528,033
  120,528,038
  120,529,542
  120,529,746
  120,535,332
  120,535,494
  120,536,789
  120,537,483
  120,540,838
  120,540,857
  120,541,305
  120,542,112
  120,542,416
  120,542,892
  120,543,043
  120,543,129
  120,543,183
  120,545,522
  120,545,569
  120,546,605
  120,546,847
  120,547,698
  120,548,657
  120,548,976
  120,549,076
  120,549,252
  120,549,454
  120,549,522
  120,549,839
  120,549,982
  120,550,009
  120,550,332
  120,550,369
  120,550,901
  120,551,076
  120,551,401
  120,552,431
  120,552,948
  120,553,240
  120,553,327
  120,553,446
  120,553,796
  120,555,683
  120,555,838
  120,556,081
  120,556,084
  120,556,273
  120,557,230
  120,557,362
  120,557,919
  120,558,161
  120,558,444
  120,558,549
  120,560,471
  120,560,511
  120,560,924
  120,561,529
  120,561,717
  120,561,875
  120,561,881
  120,562,044
  120,562,188
  120,562,471
  120,562,564
  120,562,758
  120,563,092
  120,563,273
  120,563,978
  120,564,163
  120,564,390
  120,564,421
  120,564,546
  120,564,602
  120,564,710
  120,565,393
  120,565,602
  120,565,604
  120,565,724
  120,565,740
  120,565,792
  120,565,794
  120,565,874
  120,565,881
  120,566,035
  120,566,081
  120,566,218
  120,566,349
  120,566,566
  120,567,239
  120,567,300
  120,567,473
  120,567,865
  120,568,000
  120,568,013
  120,568,233
  120,568,331
  120,568,372
  120,568,406
  120,568,451
  120,568,494
  120,568,550
  120,568,754
  120,569,145
  120,569,267
  120,569,425
  120,569,514
  120,569,595
  120,569,635
  120,569,641
  120,569,753
  120,569,945
  120,570,220
  120,570,239
  120,570,276
  120,570,431
  120,570,812
  120,570,908
  120,571,010
  120,571,045
  120,571,111
  120,571,153
  120,571,261
  120,571,309
  120,571,310
  120,571,513
  120,571,872
  120,571,885
  120,571,923
  120,572,354
  120,572,386
  120,572,425
  120,572,442
  120,572,925
  120,573,031
  120,573,168
  120,573,182
  120,573,331
  120,573,419
  120,573,476
  120,573,477
  120,573,517
  120,573,611
  120,573,646
  120,573,732
  120,573,746
  120,573,789
  120,574,134
  120,574,276
  120,574,449
  120,574,511
  120,574,658
  120,574,817
  120,574,980
  120,574,989
  120,575,782
  120,578,681
  120,580,108
  120,580,238
  120,581,527
  120,582,287
  120,587,407
  120,588,964
  120,589,822
  120,589,898
  120,589,987
  120,589,994
  120,590,074
  120,590,112
  120,590,226
  120,590,399
  120,590,466
  120,590,507
  120,591,217
  120,591,259
  120,591,268
  120,591,281
  120,591,286
  120,591,289
  120,591,306
  120,591,325
  120,591,389
  120,591,440
  120,591,451
  120,591,457
  120,591,484
  120,591,518
  120,591,562
  120,591,694
  120,591,725
  120,591,742
  120,591,743
  120,591,752
  120,591,753
  120,591,773
  120,591,791
  120,591,794
  120,591,803
  120,591,838
  120,591,856
  120,591,858
  120,591,865
  120,591,874
  120,592,138
  120,592,161
  120,592,166
  120,592,167
  120,592,205
  120,592,209
  120,592,345
  120,592,381
  120,592,441
  120,592,715
  120,592,716
  120,592,759
  120,592,894
  120,593,099
  120,593,147
  120,593,344
  120,593,427
  120,593,445
  120,593,502
  120,593,612
  120,593,691
  120,593,703
  120,593,812
  120,593,830
  120,593,851
  120,594,235
  120,594,485
  120,594,548
  120,594,571
  120,594,663
  120,595,634
  120,595,906
  120,595,910
  120,596,323
  120,596,791
  120,597,164
  120,597,346
  120,597,455
  120,597,568
  120,598,041
  120,598,068
  120,598,201
  120,598,220
  120,598,271
  120,599,072
  120,599,167
  120,599,674
  120,599,913
  120,599,915
  120,600,001
  120,600,016
  120,600,041
  120,600,068
  120,600,199
  120,600,425
  120,600,450
  120,604,492
  120,604,999
  120,605,199
  120,607,143
  120,607,146
  120,607,149
  120,607,513
  120,607,613
  120,607,646
  120,608,040
  120,608,177
  120,608,227
  120,608,275
  120,608,895
  120,608,958
  120,608,987
  120,609,407
  120,609,721
  120,610,305
  120,610,801
  120,611,897
  120,611,928
  120,612,221
  120,612,591
  120,612,608
  120,612,653
  120,612,752
  120,613,725
  120,613,735
  120,613,743
  120,614,147
  120,614,707
  120,614,713
  120,615,434
  120,615,859
  120,616,476
  120,619,661
  120,620,888
  120,621,438
  120,621,892
  120,623,415
  120,623,429
  120,623,450
  120,623,455
  120,623,464
  120,625,616
  120,625,684
  120,626,153
  120,627,381
  120,627,674
  120,629,225
  120,629,236
  120,629,247
  120,629,342
  120,629,548
  120,629,645
  120,629,870
  120,629,895
  120,635,732
  120,635,755
  120,635,834
  120,635,848
  120,635,891
  120,635,907
  120,635,941
  120,635,962
  120,636,009
  120,636,030
  120,636,092
  120,636,102
  120,636,931
  120,637,246
  120,637,395
  120,637,545
  120,637,822
  120,639,612
  120,642,490
  120,642,533
  120,642,679
  120,642,688
  120,642,755
  120,642,808
  120,642,837
  120,642,860
  120,642,868
  120,642,897
  120,642,969
  120,642,983
  120,643,000
  120,643,177
  120,643,192
  120,643,236
  120,644,606
  120,644,619
  120,644,732
  120,644,817
  120,645,001
  120,645,122
  120,645,135
  120,645,412
  120,645,491
  120,645,521
  120,645,715
  120,645,808
  120,646,050
  120,646,312
  120,646,543
  120,646,706
  120,646,801
  120,647,050
  120,647,195
  120,647,255
  120,647,269
  120,647,496
  120,647,613
  120,647,621
  120,647,685
  120,647,884
  120,647,957
  120,648,009
  120,648,016
  120,648,335
  120,648,392
  120,648,589
  120,648,785
  120,648,952
  120,649,159
  120,649,220
  120,649,486
  120,649,858
  120,649,894
  120,649,907
  120,649,924
  120,649,988
  120,650,011
  120,650,014
  120,650,026
  120,650,028
  120,650,033
  120,650,047
  120,650,314
  120,650,330
  120,650,429
  120,650,541
  120,650,834
  120,650,881
  120,650,968
  120,651,008
  120,651,233
  120,651,398
  120,651,468
  120,651,591
  120,651,700
  120,651,850
  120,651,862
  120,651,866
  120,652,062
  120,652,097
  120,652,297
  120,652,373
  120,652,392
  120,652,474
  120,652,488
  120,652,641
  120,652,792
  120,653,050
  120,653,092
  120,653,134
  120,653,161
  120,653,474
  120,653,563
  120,653,596
  120,653,647
  120,653,789
  120,653,844
  120,653,898
  120,653,942
  120,654,014
  120,654,094
  120,654,199
  120,654,219
  120,654,334
  120,654,395
  120,654,466
  120,654,631
  120,654,782
  120,655,049
  120,655,113
  120,655,239
  120,655,315
  120,655,725
  120,655,978
  120,656,059
  120,656,127
  120,656,144
  120,656,452
  120,656,495
  120,656,535
  120,656,568
  120,660,497
  120,660,503
  120,660,864
  120,660,944
  120,661,164
  120,661,646
  120,661,771
  120,661,834
  120,671,209
  120,671,281
  120,671,329
  120,671,341
  120,671,374
  120,671,433
  120,671,500
  120,671,546
  120,671,698
  120,671,873
  120,671,908
  120,671,981
  120,672,010
  120,672,170
  120,675,143
  120,675,250
  120,675,310
  120,675,389
  120,675,415
  120,675,452
  120,675,823
  120,675,927
  120,676,130
  120,676,208
  120,676,641
  120,676,780
  120,677,089
  120,677,098
  120,677,127
  120,677,183
  120,677,410
  120,677,432
  120,677,609
  120,677,717
  120,677,980
  120,678,030
  120,678,106
  120,678,149
  120,678,242
  120,678,244
  120,678,247
  120,678,249
  120,678,268
  120,678,277
  120,678,284
  120,678,291
  120,678,301
  120,678,316
  120,678,318
  120,678,332
  120,678,338
  120,678,342
  120,678,344
  120,678,349
  120,678,353
  120,678,357
  120,678,376
  120,678,387
  120,678,391
  120,678,500
  120,678,515
  120,678,523
  120,678,796
  120,679,329
  120,679,598
  120,679,764
  120,679,815
  120,679,982
  120,680,113
  120,680,170
  120,680,209
  120,680,320
  120,680,379
  120,680,490
  120,680,778
  120,680,789
  120,680,823
  120,680,881
  120,680,962
  120,680,963
  120,681,688
  120,681,759
  120,681,762
  120,681,785
  120,681,856
G
-
G
T
G
G
T
7
G
C
A
C
T
T
G
-
A
A/G
-/T
A/G
G
A/G
G
C
G
C/T
C/T
-
G
A/C
A/C
A/C
C
C
G
G
C
C
G
C
T
G
G
T
G
A
G
C
A
C
C
-
T
8
C
-
T
G
G
G
T
A
T
A
G
T
G
A
T
A
T
4
T
T
A
G
A
C
G
T
T
T
T
9
T
-
A
A
A
T
A
A
A
-
-
G
G
A
5
T
C
C
T
T
T/A
2/-
A/T
-/2
-/22
A/C
-/A
G/T
T/C
A/T
T/C
-/T
T/G
A/G
-/G
T/-
C/T
G/A
G/C
G/C
C/T
A/G
G/A
A/C
G/A
C/T
T/C
T/C
2/-
4/-
A/T
C/T
C/T
C/A
A/G
T/G
G/A
G/A
A/C
C/T
A/T
-/9
A/T
G/A
G/A
G/T
G/C
C/T
G/A
T/C
C/T
-/A
T/C
G/A
G/A
A/G
C/G
-/T
A/G
A
T
C
C/G
A/C
G/T
C/T
C/T
G/A
T/C
A
G/A
T/C
C
G/A
G/A
-/T
T/G
A/G
-/T
-/14
-
C
-
C
C
A
G
A
G
-
G
T
G
G
A
A
-
G
-
-
T
A
T
T
-
-
-
-
A
T
-
T
T
-
-
T
A
T
C
-
G
G
-
-
G
A
-
-
T
-
C
T
A
10
T
A
C
A
T
A
T
C
C
11
T
C
C
G
T
T
T
-
G
C
-
C
A
T
A
A
G
T
C
A/C
G
G
G
T
A
G
-
T
G
C
T
A
A
T
T
T
A
-
-
-
T
T
C
T
T
T
T
21
A
C
A
3
A
A
T
T
-
T
T
G
A
G
A
A
G
C
-
A
G
2
A
G
G
C
C
A
C
A
-
C
-
G
2
-
C
-
-
G
-
A
A/C
-/2
C
T/C
T
T/A
A
C
A/G
3/-
G/C
T/C
C
2
-
T
A
T
-
A
G
T
C
T
A
C
T
T
T
A
A
A
A
A
A
A
A
5
G
A
-
A
C
T
G
G
A
C
C
G
T
T
T
A
A
G
A
G
C
C
T
T
-
A
G
C
C
C
G
A
G
C
A
A
A
G
A
C
-
A
A
A
C
2
C
-
T
3
C
T
A
T
G
-
T
T
G
A
G
-
T
A
T
-
-
-
T
C
G
C
-
C
T
T
G
G
A
A
A
T
C
-
G
-
C
T
G
T
A
T
C
T
C
C
G
C
G
A
C
-
A
C
A
G
-
A
G
A
T
T
C
A
C
-
G
C
C
G
T
G
T
A
G
T
-
A
G
T
C
T
C
A
C
G
T
T
G
G
T
T
-
C
4
T
A
C
T
A
T
A
T
C
C
C
C
-
C
3
-
2
-
-
C
-
G
-
G
-
C
C
-
T
A
-
C
A
-
-
-
G
C
A
C
G
A
G
T
4
T
A
T
T
6
A
A
C
T
A
A
A
A
T