Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 327,802 (bp)   Positions: 503
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.014
.0
.356
.028
.085
.071
.063
.001
.009
.232
.032
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.111
.978
.054
.033
.003
.005
.052
.051
.028
.028
.001
.0
.003
.001
.0
--
.015
.0
.002
.001
.0
.001
.0
.0
.001
.001
.0
.0
.0
.0
.0
.002
.002
.0
.089
.0
.002
.0
.004
.0
.0
.046
.038
.015
.011
.345
.019
.002
.017
.035
.0
.076
.083
.059
.098
.366
.037
.066
.119
.06
.014
.001
.002
.002
.004
.0
.014
.0
.001
.009
.006
.004
.001
.002
.001
.233
.002
.011
.011
.0
.672
.012
--
.004
.006
.004
.029
.186
.149
.02
.039
.014
.002
.005
.062
.028
.0
.002
.029
.007
.019
.007
.015
.015
.136
.011
.003
.001
.002
.008
.006
.083
.082
.0
.003
--
--
.004
1.0
.008
.0
.73
.045
.004
.0
.998
.227
.003
.0
.01
.005
.0
.001
.002
.001
.017
.106
.213
.017
.03
.0
.009
.018
.0
.009
--
--
--
.002
.082
.046
.001
.002
.002
.0
.641
.0
.0
.002
.134
.002
.02
.007
.0
.001
.0
.498
.636
.001
.005
.0
.003
.001
.16
.007
.207
.007
.005
.007
.0
.06
.004
.004
.021
.037
.096
.515
.312
.015
.018
.121
.008
.0
.006
.001
.0
--
.182
.001
.003
.0
.0
.001
.193
.173
.105
.002
.002
.001
.012
.037
.034
.007
.02
.123
.0
.099
.0
.3
.012
.0
.056
.006
.001
.113
1.0
.001
.0
.005
.007
.182
.503
.602
.044
.006
.003
.001
.013
.011
.005
.009
.003
.0
.004
.004
.005
.002
.003
.094
.077
.047
.002
.018
.001
.0
.152
.002
.0
.0
.001
.003
.677
.004
.0
.001
.026
.003
.002
.002
.056
.006
.031
.384
.021
.02
.056
.013
.35
.022
.0
.003
.0
.0
.122
.956
.002
.0
.0
1.0
.993
.002
.009
.001
.001
.001
.009
.066
.001
.212
.007
.067
.006
.491
.001
.49
.004
.002
.012
.011
.994
.989
.004
.0
.002
.0
.001
.022
.001
.0
.004
.008
.001
.031
.0
.006
.001
--
.002
.026
.0
.0
.0
.0
.001
.0
.003
.005
.001
.001
.0
.0
.001
.004
.0
.014
.0
.0
.0
.0
.002
.001
.037
.027
.001
.004
.001
.0
.0
.0
.002
.009
.0
.337
.0
.0
.003
.0
.0
.009
.0
.241
.003
.001
.007
.001
.895
.002
.003
.001
.002
--
.001
.0
.187
.001
.022
.003
.011
.112
.049
.095
--
--
--
--
--
--
--
--
.261
.002
.041
.025
.0
.011
.003
.025
.002
.0
.0
.062
.0
.909
.081
.926
.0
.002
.001
.0
.005
.001
.006
.001
.312
--
--
--
--
.004
.003
.002
.013
.016
.002
.984
1.0
.998
.036
.043
.121
.005
.076
.001
.0
.993
.0
.038
.002
.012
.0
.0
.005
.001
.0
.0
.003
.001
.001
.002
.0
.015
.007
.001
.003
.002
.013
.002
.003
.001
.008
.001
.0
.018
.581
.284
.325
.091
.288
.0
.0
Ldlrad4
Ldlrad4
Ldlrad4
Ldlrad4
Ldlrad4
Ldlrad4
Ldlrad4
Ldlrad4
Ldlrad4
Ldlrad4
Ldlrad4
Ldlrad4
Ldlrad4
Ldlrad4
Ldlrad4
Ldlrad4
Ldlrad4
Ldlrad4
Ldlrad4
Ldlrad4
Ldlrad4
Ldlrad4
Ldlrad4
Ldlrad4
Ldlrad4
Ldlrad4
Ldlrad4
Ldlrad4
Ldlrad4
Ldlrad4
Ldlrad4
Ldlrad4
Ldlrad4
Ldlrad4
Ldlrad4
Ldlrad4
Ldlrad4
Ldlrad4
Ldlrad4
Ldlrad4
Ldlrad4
Ldlrad4
Ldlrad4
Ldlrad4
Ldlrad4
Ldlrad4
Ldlrad4
Ldlrad4
Ldlrad4
Ldlrad4
Ldlrad4
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Gapdh-ps118
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
A
A
A
A
C
T
T
A
A
A
A
C
A
G
G
T
C
C
A
T
A
A
A
A
A
T
G
A
G
C
C
T
C
A
A
C
A
G
T
A
C
C
A
T
C
A
T
T
T
G
C
A
G
T
A
C
C
C
C
A
T
T
G
A
A
G
A
C
C
T
G
T
A
A
T
A
G
G
G
G
G
G
C
T
G
T
G
T
G
A
T
C
A
C
G
T
A
T
A
T
T
A
C
G
T
A
C
C
G
T
T
A
C
G
T
A
G
G
G
G
A
C
T
G
A
A
T
C
G
C
C
C
G
G
C
G
C
G
G
T
G
A
C
T
G
G
T
A
T
A
T
C
G
A
T
A
G
A
A
T
G
T
A
C
A
A
T
G
C
A
A
G
C
T
G
A
A
A
C
T
C
T
G
G
A
G
G
C
A
T
T
T
T
T
T
T
A
T
G
T
A
G
C
C
G
C
C
G
A
T
T
A
G
A
A
T
G
A
C
A
A
A
C
C
C
G
A
T
T
G
C
C
G
G
T
T
A
G
G
G
A
C
T
A
T
C
G
A
C
G
A
T
T
G
C
T
G
A
C
T
A
G
T
C
T
A
T
T
C
C
T
T
C
C
G
T
A
A
A
C
C
G
T
A
T
T
T
T
T
A
C
A
T
T
T
T
T
G
C
G
C
T
C
C
C
G
C
A
T
A
C
G
T
T
G
G
T
G
G
A
C
G
T
G
C
G
A
A
A
A
G
G
A
G
A
T
A
T
A
C
T
C
C
T
T
A
C
C
T
G
A
T
G
G
A
C
C
A
G
A
A
C
T
T
A
A
G
G
G
G
G
A
G
T
G
T
G
A
A
A
T
A
C
T
C
G
C
C
A
C
A
T
C
A
C
G
C
G
C
C
A
T
T
A
C
G
A
C
T
A
G
G
A
C
G
T
G
G
C
C
T
G
C
T
A
T
T
A
T
C
G
G
G
C
T
G
G
A
C
A
A
T
A
T
A
T
C
G
G
C
G
G
C
C
C
G
T
T
G
A
A
G
G
G
A
A
C
T
C
C
C
G
C
G
A
A
C
G
G
G
C
T
T
T
T
C
G
A
G
C
C
C
T
G
T
C
A
G
G
A
G
A
A
  63,774,090
  63,774,127
  63,774,181
  63,774,382
  63,774,505
  63,774,507
  63,774,516
  63,774,594
  63,774,660
  63,774,732
  63,774,973
  63,777,853
  63,778,035
  63,778,250
  63,778,431
  63,778,440
  63,779,288
  63,779,290
  63,779,484
  63,779,781
  63,779,860
  63,779,907
  63,780,087
  63,780,912
  63,782,908
  63,783,358
  63,783,372
  63,783,477
  63,783,526
  63,783,542
  63,784,100
  63,784,105
  63,784,115
  63,784,292
  63,784,728
  63,784,958
  63,785,009
  63,788,736
  63,790,132
  63,793,301
  63,794,034
  63,794,201
  63,794,217
  63,794,260
  63,794,288
  63,794,298
  63,794,312
  63,794,343
  63,794,371
  63,794,606
  63,794,610
  63,794,613
  63,794,723
  63,794,875
  63,795,167
  63,795,731
  63,796,436
  63,796,893
  63,797,556
  63,797,576
  63,797,623
  63,797,630
  63,798,242
  63,799,729
  63,800,952
  63,801,084
  63,801,327
  63,801,630
  63,802,281
  63,802,801
  63,802,997
  63,803,063
  63,803,181
  63,803,861
  63,803,995
  63,804,000
  63,804,016
  63,804,129
  63,804,249
  63,804,308
  63,804,326
  63,804,384
  63,804,393
  63,804,594
  63,804,836
  63,804,837
  63,804,850
  63,805,249
  63,805,282
  63,805,422
  63,805,565
  63,805,689
  63,805,806
  63,805,824
  63,806,158
  63,806,264
  63,806,293
  63,806,439
  63,806,645
  63,806,692
  63,806,719
  63,806,736
  63,806,974
  63,807,521
  63,808,147
  63,808,885
  63,809,188
  63,809,393
  63,809,686
  63,810,172
  63,810,208
  63,811,250
  63,811,403
  63,811,414
  63,811,515
  63,811,715
  63,811,724
  63,811,782
  63,811,892
  63,812,330
  63,812,458
  63,812,650
  63,813,023
  63,813,880
  63,813,955
  63,814,276
  63,814,536
  63,814,616
  63,814,657
  63,814,729
  63,814,733
  63,816,045
  63,816,180
  63,816,482
  63,817,189
  63,818,924
  63,819,184
  63,819,288
  63,820,144
  63,823,615
  63,823,657
  63,825,267
  63,825,630
  63,826,324
  63,827,718
  63,828,930
  63,831,307
  63,832,512
  63,832,973
  63,833,044
  63,833,955
  63,834,129
  63,835,879
  63,836,297
  63,836,356
  63,839,696
  63,839,732
  63,840,075
  63,841,177
  63,841,476
  63,841,777
  63,842,043
  63,843,099
  63,843,692
  63,844,676
  63,845,757
  63,845,941
  63,846,185
  63,846,680
  63,847,148
  63,847,150
  63,847,773
  63,847,949
  63,848,239
  63,848,450
  63,849,038
  63,849,088
  63,849,339
  63,850,115
  63,850,751
  63,850,854
  63,850,915
  63,852,435
  63,852,725
  63,854,000
  63,854,467
  63,854,775
  63,855,035
  63,855,356
  63,857,243
  63,857,730
  63,858,140
  63,858,626
  63,858,673
  63,859,216
  63,859,574
  63,859,633
  63,860,258
  63,860,794
  63,860,837
  63,861,037
  63,861,151
  63,861,333
  63,861,947
  63,862,406
  63,863,189
  63,863,278
  63,863,296
  63,863,500
  63,863,558
  63,863,707
  63,863,752
  63,863,942
  63,863,997
  63,864,921
  63,864,979
  63,865,039
  63,865,042
  63,865,089
  63,865,558
  63,865,710
  63,865,761
  63,865,795
  63,866,090
  63,866,356
  63,866,732
  63,866,831
  63,866,835
  63,867,026
  63,867,515
  63,868,013
  63,868,393
  63,868,892
  63,868,992
  63,869,592
  63,869,692
  63,869,958
  63,870,147
  63,871,565
  63,871,578
  63,872,113
  63,879,219
  63,880,502
  63,886,703
  63,887,927
  63,889,771
  63,892,153
  63,893,856
  63,894,192
  63,895,615
  63,895,667
  63,895,881
  63,896,070
  63,896,213
  63,897,509
  63,897,620
  63,898,485
  63,901,575
  63,903,814
  63,904,945
  63,906,544
  63,912,255
  63,913,051
  63,913,713
  63,913,975
  63,914,205
  63,914,298
  63,914,538
  63,914,542
  63,914,554
  63,914,976
  63,915,020
  63,915,026
  63,915,139
  63,915,179
  63,915,253
  63,915,413
  63,915,415
  63,916,899
  63,917,465
  63,917,583
  63,917,598
  63,917,609
  63,917,614
  63,917,733
  63,918,159
  63,918,716
  63,919,022
  63,919,767
  63,922,389
  63,923,660
  63,924,091
  63,924,219
  63,925,856
  63,926,226
  63,926,332
  63,927,244
  63,927,262
  63,927,540
  63,928,008
  63,928,403
  63,930,678
  63,930,860
  63,932,634
  63,932,677
  63,932,832
  63,933,282
  63,933,707
  63,934,108
  63,934,754
  63,935,003
  63,935,365
  63,935,524
  63,935,657
  63,936,175
  63,936,192
  63,936,256
  63,937,078
  63,937,505
  63,938,102
  63,939,537
  63,939,820
  63,940,162
  63,940,312
  63,941,135
  63,941,516
  63,941,614
  63,941,692
  63,942,162
  63,942,304
  63,942,644
  63,942,710
  63,943,331
  63,943,660
  63,944,112
  63,944,267
  63,944,317
  63,944,336
  63,944,339
  63,944,355
  63,944,438
  63,945,472
  63,945,570
  63,945,612
  63,946,170
  63,946,334
  63,946,763
  63,947,008
  63,947,024
  63,949,187
  63,954,240
  63,955,063
  63,956,332
  63,956,364
  63,956,436
  63,956,638
  63,956,642
  63,956,980
  63,956,989
  63,957,097
  63,957,101
  63,957,102
  63,957,207
  63,957,352
  63,957,598
  63,957,901
  63,959,053
  63,960,167
  63,960,523
  63,960,770
  63,961,163
  63,962,341
  63,962,350
  63,962,878
  63,962,899
  63,964,116
  63,964,565
  63,964,746
  63,965,174
  63,965,294
  63,965,382
  63,966,942
  63,967,903
  63,968,687
  63,969,853
  63,969,885
  63,970,461
  63,970,678
  63,970,879
  63,971,292
  63,971,517
  63,971,546
  63,971,665
  63,972,115
  63,972,455
  63,973,367
  63,975,950
  63,976,029
  63,976,156
  63,976,778
  63,977,361
  63,977,575
  63,977,617
  63,977,856
  63,977,989
  63,978,009
  63,978,104
  63,978,200
  63,978,280
  63,978,855
  63,978,889
  63,979,431
  63,979,446
  63,980,275
  63,982,521
  63,984,053
  63,984,182
  63,984,335
  63,984,358
  63,984,634
  63,984,676
  63,985,684
  63,986,778
  63,987,060
  63,987,082
  63,987,160
  63,987,273
  63,987,388
  63,987,395
  63,987,442
  63,987,637
  63,987,723
  63,987,759
  63,987,981
  63,988,136
  63,988,588
  63,988,685
  63,988,855
  63,988,984
  63,989,798
  63,990,092
  63,990,212
  63,990,275
  63,990,283
  63,990,599
  63,990,739
  63,990,925
  63,990,989
  63,991,051
  63,991,097
  63,991,153
  63,992,189
  63,992,349
  63,992,437
  63,992,502
  63,992,731
  63,993,108
  63,993,249
  63,993,300
  63,993,415
  63,994,516
  63,994,961
  63,995,215
  63,996,705
  63,997,346
  64,003,850
  64,004,574
  64,009,133
  64,014,292
  64,015,474
  64,017,130
  64,017,191
  64,017,437
  64,017,443
  64,017,649
  64,018,191
  64,018,200
  64,018,426
  64,019,074
  64,019,076
  64,019,347
  64,019,459
  64,019,947
  64,020,018
  64,020,055
  64,020,089
  64,020,463
  64,020,886
  64,020,951
  64,021,749
  64,022,609
  64,024,050
  64,024,366
  64,024,404
  64,025,941
  64,027,579
  64,027,946
  64,028,081
  64,028,101
  64,031,596
  64,037,257
  64,042,041
  64,043,820
G
G
G
A/G
T
G
A
C
G
G
G
G
C
A
G/A
C
A
T
C
C
T
G
G
C
G
T/A
G/C
T
A
T
A
C
A
G
G
T
T
A
C
G
A
T
C
A
A
T
C
C
A
T
T
G
A
A
G
T
T
A
T
G
C
C
T
G
T
C
G
T
T
C
A
A
G
G
G
G
T
C
T
A
A
A
T
C
A
C
A
C
C
T
A
T
G
A
T
C
G
C
C
C
C
G
C/T
A
C
T
T
G
A
C
G
A/G
T
A
A
G
A
A
A
A
G
T
C
G/C
G
G
A
T
A
T
T
G
A
A
T
T
A
A
A
C
A
A/C
T
C
T
G/C
C
T
G
G
C
T
A
G
G
G
A
C
G
A
G/A
C
G
A
G
G
C
T
A
T
T
C
C/A
G
C
C
C
G
T
C
G
C
C
A
C
A
A
T
G
A
C
C
C
T/A
T/G
C
G
C
A
C
G
A
T
T
A
T
T
A
C
C
C
G
A
G
T
C
T
G
T
C
G
T
G
C/T
T
A
C
C
G
A
T
T
A
A
C
C
G
A
C
A
G
A
C
C
C
T
A
G
T
A
G
C
C
C
A
C
A
G
T
A
G
A
C
T
G
G
C
C
T
T
C
C
T
T
A
C
G
G
G
T
T
A
A
C
C
C
C
C
A
C
G
G
C
A
C
C
C
A
T
A
A
A
A
A
T
A
T
G
C
G
T
C
C
A
A
A
C
T
A
G
A
A
C
A
T
A
C
G
G
G
A
A
G
C
G
G
G
C
G
T
C
T
A
C
C
C
T
T
C
T
G
C
A
A
G
T
T
G
A
T
G
T
C
C
G
G
T
A
A
A
T
C
C
C
A
C
A
C
G
G
C
A/G
T
G
T
T
G
G
G
T
G
A
G
T
T
A
T
A
T
T
C
C
C
G
T
A
G
T
C
G
A
T
G
G
C
A
C
A
T
G
C
A
T
C
G
C
C
T
C
T
A
A
A
A
C
A
A
C
T
G
C
C
G
C
G
C
G
G/C
G/C
C/T
C
C
T
G
T
A
C
C
A
G
G
A
A
A
G
C
G
C
T
T
T
G/A
T
A
G
G
A
A
A
T
T
A
C
C
A
T
A
T
A
A
G
T
C
A
G
T
G
A
A
C
C
G
G