Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 152,410 (bp)   Positions: 325
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
--
--
.432
.166
.001
.026
.0
.0
.011
.001
.005
.017
.001
.001
.101
.15
.121
.048
.134
.173
.0
.425
.575
.002
.025
.382
.586
.463
.062
.045
.0
.021
--
--
.003
.001
.0
.004
.557
.001
.001
.476
.008
.087
.021
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.01
.175
.206
.017
.033
.002
.066
.02
.088
.0
.017
.001
.01
.006
.36
.032
.037
.146
.004
.002
.01
.05
.034
.002
.054
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.013
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.013
.012
.192
.004
.005
.018
.023
.049
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.014
.003
.001
.006
.008
.003
.051
.034
.028
.021
.018
.009
.004
.005
.007
.136
.001
.002
.001
.992
1.0
1.0
1.0
.997
.999
.996
.997
.989
.066
.016
.002
.017
.006
.65
.298
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.027
.004
.017
.009
--
--
--
--
--
--
--
--
.0
.094
.03
.001
.032
.108
.002
.001
.812
.009
.0
.131
.166
.51
.078
.0
.033
.013
.018
--
--
--
--
--
.008
--
.096
.014
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.05
.054
.115
.005
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
.014
.49
.021
.147
.247
.077
.068
.0
.001
.007
.017
.161
.363
.895
--
--
.087
.328
.009
.0
.027
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
LOC108350703
LOC108350703
LOC108350703
LOC108350703
LOC108350703
LOC108350703
LOC108350703
LOC108350703
LOC108350703
LOC108350703
LOC108350703
LOC108350703
LOC108350703
LOC108350703
LOC108350703
LOC108350703
LOC108350703
LOC108350703
LOC108350703
LOC108350703
LOC108350703
LOC108350703
LOC108350703
LOC108350703
LOC108350703
LOC108350703
LOC108350703
LOC108350703
LOC108350703
LOC108350703
LOC108350703
LOC108350703
LOC108350703
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
T
A
G
G
G
G
G
T
C
T
G
A
C
A
G
A
A
G
C
T
A
T
A
T
G
T
A
G
G
T
G
T
C
C
T
T
T
A
C
A
C
A
G
T
T
G
A
T
T
G
T
T
A
G
C
T
C
C
C
C
T
A
A
A
C
C
A
T
G
G
T
A
A
T
A
T
G
G
C
T
A
G
A
A
C
C
G
A
C
C
C
A
C
C
A
C
G
C
T
T
G
T
G
A
T
T
T
A
A
G
C
A
T
T
C
G
T
T
C
C
C
T
T
A
A
C
C
A
T
C
A
A
G
A
T
C
A
T
A
A
G
A
A
T
A
T
A
C
C
G
A
T
A
T
A
G
A
C
A
G
G
G
C
A
C
T
C
C
G
C
C
G
A
A
C
C
G
G
C
A
T
T
A
G
C
T
T
A
A
G
A
C
A
G
T
G
A
T
T
A
T
T
A
G
A
C
T
C
C
A
A
G
C
C
G
T
C
G
G
C
G
A
G
T
C
G
C
G
C
C
A
G
C
C
A
A
T
C
C
T
C
G
C
A
C
G
T
C
A
A
C
T
G
C
G
T
A
G
C
A
A
A
T
A
C
C
T
G
A
T
T
A
T
G
C
C
T
T
T
C
C
A
G
G
A
C
T
C
T
A
A
A
G
G
G
A
C
C
G
A
C
A
C
C
A
A
A
T
A
C
C
A
C
C
C
T
G
T
T
G
C
C
T
C
C
  77,872,379
  77,872,937
  77,873,025
  77,873,061
  77,873,785
  77,873,980
  77,874,022
  77,874,086
  77,874,268
  77,874,363
  77,874,427
  77,874,918
  77,875,676
  77,875,747
  77,875,847
  77,875,934
  77,876,548
  77,876,599
  77,877,329
  77,877,335
  77,877,390
  77,877,400
  77,877,408
  77,877,618
  77,877,623
  77,877,633
  77,877,672
  77,877,682
  77,879,362
  77,879,808
  77,879,914
  77,880,092
  77,880,959
  77,881,183
  77,881,286
  77,881,767
  77,881,872
  77,882,082
  77,882,164
  77,887,045
  77,887,060
  77,888,114
  77,890,156
  77,890,547
  77,890,983
  77,893,344
  77,895,435
  77,895,861
  77,896,047
  77,896,071
  77,896,090
  77,896,114
  77,896,153
  77,896,222
  77,896,248
  77,896,260
  77,896,273
  77,896,277
  77,898,813
  77,899,023
  77,899,611
  77,899,765
  77,901,865
  77,902,011
  77,902,963
  77,903,156
  77,903,414
  77,904,724
  77,906,251
  77,906,465
  77,906,574
  77,906,590
  77,906,674
  77,906,862
  77,907,157
  77,908,114
  77,908,120
  77,908,136
  77,908,416
  77,909,307
  77,909,655
  77,909,937
  77,910,107
  77,910,674
  77,910,686
  77,910,863
  77,910,879
  77,911,996
  77,912,208
  77,912,546
  77,912,918
  77,912,950
  77,913,005
  77,913,266
  77,913,346
  77,927,483
  77,927,546
  77,927,581
  77,927,720
  77,927,850
  77,928,046
  77,928,106
  77,928,333
  77,928,939
  77,929,023
  77,929,074
  77,929,310
  77,929,524
  77,929,545
  77,929,915
  77,930,666
  77,930,861
  77,931,250
  77,931,652
  77,932,220
  77,932,336
  77,936,587
  77,936,763
  77,936,915
  77,937,506
  77,937,618
  77,937,814
  77,937,917
  77,939,106
  77,939,247
  77,939,280
  77,939,479
  77,939,579
  77,939,641
  77,939,731
  77,939,761
  77,939,808
  77,940,422
  77,940,439
  77,940,479
  77,940,484
  77,940,717
  77,941,040
  77,941,117
  77,941,126
  77,941,746
  77,941,825
  77,942,420
  77,942,588
  77,943,163
  77,943,167
  77,943,363
  77,943,384
  77,943,878
  77,943,988
  77,943,992
  77,944,242
  77,944,267
  77,944,329
  77,944,682
  77,944,693
  77,944,713
  77,944,792
  77,944,796
  77,945,265
  77,945,302
  77,945,317
  77,945,565
  77,945,631
  77,945,635
  77,945,638
  77,945,657
  77,945,776
  77,945,808
  77,945,812
  77,947,194
  77,947,659
  77,948,291
  77,949,048
  77,949,085
  77,949,171
  77,949,569
  77,949,579
  77,949,691
  77,949,860
  77,949,880
  77,950,070
  77,950,152
  77,951,270
  77,951,273
  77,951,316
  77,951,469
  77,951,507
  77,951,517
  77,951,520
  77,952,080
  77,952,152
  77,952,622
  77,953,099
  77,953,660
  77,953,771
  77,954,249
  77,954,472
  77,954,909
  77,955,207
  77,955,536
  77,959,689
  77,959,708
  77,959,712
  77,959,734
  77,959,909
  77,960,033
  77,960,516
  77,960,760
  77,961,794
  77,961,798
  77,962,211
  77,963,466
  77,963,534
  77,963,601
  77,963,625
  77,963,730
  77,964,037
  77,964,677
  77,965,104
  77,965,560
  77,965,760
  77,965,775
  77,966,993
  77,967,004
  77,967,135
  77,967,152
  77,968,142
  77,970,171
  77,970,869
  77,971,257
  77,971,500
  77,971,873
  77,972,516
  77,975,840
  77,976,161
  77,976,664
  77,976,838
  77,977,177
  77,977,313
  77,979,867
  77,980,150
  77,980,201
  77,980,352
  77,982,925
  77,983,469
  77,984,491
  77,986,033
  77,986,074
  77,986,378
  77,986,453
  77,986,749
  77,989,030
  77,989,989
  77,990,120
  77,990,199
  77,990,434
  77,990,630
  77,991,566
  77,991,673
  77,991,891
  77,992,453
  77,992,470
  77,993,411
  77,993,616
  77,993,713
  77,994,059
  77,995,613
  77,995,924
  77,996,549
  77,997,137
  77,997,390
  77,997,515
  77,997,517
  77,997,542
  77,997,760
  77,998,071
  77,998,111
  77,998,973
  77,999,106
  77,999,649
  77,999,811
  77,999,899
  78,000,034
  78,000,112
  78,000,144
  78,000,588
  78,000,623
  78,001,959
  78,002,053
  78,002,437
  78,003,031
  78,003,552
  78,003,588
  78,004,502
  78,004,598
  78,004,714
  78,005,116
  78,005,231
  78,005,476
  78,005,507
  78,006,179
  78,006,219
  78,006,295
  78,008,655
  78,008,710
  78,009,161
  78,009,394
  78,010,030
  78,011,050
  78,012,214
  78,012,932
  78,013,398
  78,013,904
  78,015,007
  78,016,972
  78,017,024
  78,017,047
  78,018,318
  78,018,378
  78,019,657
  78,020,454
  78,022,036
  78,023,796
  78,024,416
C
G
A
A
A
A
T
C
T
G
T
G
T
G
C
A/G
C
A
C/G
T/C
A/T
T/C
A/G
T/C
G/A
T/A
A/G
G/A
A
C
A
C
T
A
C
C
C
G
T
A/C
C/A
T
A
C
C
A
T
C
T/C
G/C
T/C
T/C
A/G
G/C
C/T
T/A
C/G
C/T
C/A
A
C
G
A/C
A/G
T
C/G
G
C
A
C
G
G
G
C
G
T/C
G/T
G/T
T
C
G
A
C
G
T
T
A
G
T
A
T
G
T
A
G
G
C
T
G
C
A
C
T
C
C
C
G
G
G
A
G
C
G
C
T
A
C
C
T
T
T
A
C
A/T
T
T
T
G
A
C/A
A/G
A/G
G/A
A/G
T/C
C/T
A/C
T/G
A/G
A/G
G/C
A/G
A/G
T/C
G
T/C
A/T
C/T
C/T
G/T
A/G
C
A/C
T/A
A/G
G/T
A/G
C/G
A/C
C
G/A
G/A
G
T
T
G
T
T
A
A
A
A
G
T
T
T
C
A
T
A/G
T/C
T/C
A/G
G/A
C/T
T/A
T/C
A/T
A/G
G/T
G
T
G
A
C
A
G
G
C
G
C
T/C
A/T
G/A
A/G
C/T
C
T
T
G
G
C
A
T
A
C
T
A
A
T
G/A
A/G
G/A
G
T
T
G
C
T
T
G
A
G
A
C
G
C
T
T
C
A
A
T
G
T
A
C
T
T
A/C
T
C
A
A
A
C
G
T
T
C
G
G
C
G
T
T
C
G/A
C
C
C
C
C
A
G
T
C
C
C
T
T
C
A
C
G
T
C
T
C
T
G
G
A
A
A
T
G
C/T
G/T
A/G
C/G
A/T
C/T
G
G
G
G
A
G
T
T
G
A
T
A
C
T
C
A
A
G
A
G
T
T