Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 152,410 (bp)   Positions: 328
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
--
.026
.0
.0
.011
.001
.017
.017
.6
.001
.001
.101
.15
.004
.115
.121
.048
.12
.0
.575
.722
.088
.002
.025
.382
.586
.463
.062
.045
.0
.021
--
--
.003
.001
.006
.004
.033
.005
--
--
.009
.096
.126
.002
.189
.087
.031
.033
.021
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.206
.017
.017
.094
.102
.024
.035
.012
.033
.002
.02
.088
.0
.017
.028
.006
.003
.032
.037
.146
.004
.006
.002
.05
.034
.053
.002
.014
.054
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.013
.08
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.013
.389
.192
.004
.018
.049
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.016
.127
.014
.001
.006
.008
.051
.034
.028
.007
.136
.001
.004
.001
1.0
.997
.999
.996
.997
.989
.0
.002
.017
.006
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.009
.027
.009
.002
--
--
--
--
--
--
--
.0
.002
.001
.004
.032
.0
.002
.001
.812
.001
.0
.083
.131
.078
.0
.0
.018
--
--
--
--
.008
--
--
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.49
.005
.021
.147
.077
.007
.025
.217
.0
.001
.233
.017
.161
.363
.895
--
.087
.026
.009
.136
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
LOC108350703
LOC108350703
LOC108350703
LOC108350703
LOC108350703
LOC108350703
LOC108350703
LOC108350703
LOC108350703
LOC108350703
LOC108350703
LOC108350703
LOC108350703
LOC108350703
LOC108350703
LOC108350703
LOC108350703
LOC108350703
LOC108350703
LOC108350703
LOC108350703
LOC108350703
LOC108350703
LOC108350703
LOC108350703
LOC108350703
LOC108350703
LOC108350703
LOC108350703
LOC108350703
LOC108350703
LOC108350703
LOC108350703
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
T
G
G
T
C
T
C
A
A
C
A
G
A
C
T
A
G
C
A
A
G
T
T
G
T
A
G
G
T
G
T
C
C
T
T
C
A
T
T
A
A
A
G
C
G
G
T
C
T
T
G
G
T
T
C
C
G
T
G
C
T
A
T
T
G
G
T
T
T
G
A
C
A
G
T
T
A
G
G
A
C
A
T
A
A
T
C
A
G
T
G
C
G
G
A
A
T
A
T
G
G
T
A
G
A
C
A
C
G
C
A
T
C
C
A
A
C
G
C
T
T
G
T
G
A
T
T
T
A
A
G
C
A
T
T
C
G
A
C
T
C
C
T
T
A
A
C
A
A
C
A
T
C
G
G
G
T
G
A
T
C
T
T
A
C
A
G
A
T
T
A
C
A
C
C
G
T
G
G
A
C
A
C
C
T
G
G
G
G
T
A
A
T
T
C
T
C
T
A
A
C
G
C
A
A
G
A
T
A
G
C
A
G
A
G
C
A
G
A
T
G
A
T
A
T
T
C
C
A
A
C
T
C
G
G
C
T
G
T
C
A
G
A
T
C
A
G
C
C
C
A
T
C
T
C
C
A
C
G
T
A
T
A
C
T
G
G
T
G
A
G
C
A
A
C
T
T
A
T
G
G
T
A
T
G
A
T
T
A
A
C
T
G
A
T
C
A
C
C
A
A
A
C
C
A
C
T
A
A
C
A
T
C
A
G
G
A
C
C
C
T
G
T
G
C
T
T
T
  77,872,379
  77,873,980
  77,874,022
  77,874,086
  77,874,268
  77,874,363
  77,874,522
  77,874,918
  77,875,228
  77,875,676
  77,875,747
  77,875,847
  77,875,934
  77,876,272
  77,876,365
  77,876,548
  77,876,599
  77,877,017
  77,877,390
  77,877,408
  77,877,469
  77,877,575
  77,877,618
  77,877,623
  77,877,633
  77,877,672
  77,877,682
  77,879,362
  77,879,808
  77,879,914
  77,880,092
  77,880,959
  77,881,183
  77,881,286
  77,881,767
  77,881,789
  77,882,082
  77,882,428
  77,882,726
  77,883,240
  77,884,048
  77,884,580
  77,886,123
  77,886,223
  77,886,718
  77,887,515
  77,890,547
  77,890,596
  77,890,608
  77,890,983
  77,892,189
  77,894,377
  77,894,726
  77,895,861
  77,896,348
  77,896,388
  77,896,393
  77,896,773
  77,896,844
  77,897,133
  77,897,220
  77,897,285
  77,897,598
  77,897,599
  77,897,827
  77,897,896
  77,898,059
  77,898,224
  77,898,360
  77,898,602
  77,898,739
  77,899,023
  77,899,036
  77,899,088
  77,899,611
  77,899,655
  77,899,765
  77,900,188
  77,900,258
  77,900,479
  77,901,886
  77,901,982
  77,902,332
  77,902,606
  77,903,414
  77,904,724
  77,904,789
  77,904,814
  77,905,536
  77,905,678
  77,905,813
  77,905,970
  77,906,251
  77,906,465
  77,906,590
  77,906,674
  77,906,862
  77,907,157
  77,908,133
  77,908,136
  77,908,871
  77,909,307
  77,909,655
  77,909,937
  77,910,107
  77,910,374
  77,910,674
  77,910,863
  77,910,879
  77,911,815
  77,911,996
  77,912,020
  77,912,208
  77,912,918
  77,912,950
  77,913,346
  77,927,483
  77,927,546
  77,927,581
  77,927,720
  77,927,850
  77,928,046
  77,928,106
  77,928,333
  77,928,939
  77,929,023
  77,929,074
  77,929,310
  77,929,524
  77,929,545
  77,930,039
  77,930,666
  77,930,861
  77,931,250
  77,931,652
  77,932,220
  77,932,336
  77,932,867
  77,933,866
  77,936,587
  77,937,061
  77,937,506
  77,937,814
  77,937,917
  77,939,106
  77,939,247
  77,939,280
  77,939,380
  77,939,446
  77,939,479
  77,939,579
  77,939,641
  77,939,731
  77,939,946
  77,939,953
  77,940,359
  77,940,394
  77,940,422
  77,940,439
  77,940,479
  77,940,484
  77,941,013
  77,941,040
  77,941,117
  77,941,125
  77,941,126
  77,941,287
  77,942,420
  77,942,588
  77,942,641
  77,942,806
  77,943,788
  77,943,824
  77,943,878
  77,943,942
  77,944,180
  77,944,242
  77,944,469
  77,944,693
  77,944,713
  77,944,792
  77,944,796
  77,944,960
  77,944,993
  77,945,156
  77,945,265
  77,945,302
  77,945,317
  77,945,483
  77,945,596
  77,945,598
  77,945,604
  77,945,606
  77,945,608
  77,945,657
  77,945,787
  77,947,194
  77,947,297
  77,948,291
  77,949,048
  77,949,171
  77,949,579
  77,949,691
  77,949,818
  77,949,860
  77,950,046
  77,950,049
  77,950,070
  77,950,152
  77,950,175
  77,950,922
  77,950,934
  77,950,955
  77,950,973
  77,951,270
  77,951,273
  77,952,467
  77,952,523
  77,952,622
  77,953,660
  77,953,771
  77,954,249
  77,954,909
  77,955,207
  77,955,536
  77,960,033
  77,960,516
  77,960,760
  77,961,197
  77,961,798
  77,963,466
  77,963,625
  77,963,730
  77,964,037
  77,964,677
  77,965,104
  77,965,769
  77,965,775
  77,966,993
  77,967,004
  77,967,596
  77,969,827
  77,970,155
  77,970,166
  77,970,869
  77,971,257
  77,971,500
  77,971,873
  77,972,367
  77,972,516
  77,975,840
  77,976,664
  77,977,177
  77,977,313
  77,979,357
  77,979,867
  77,980,352
  77,980,619
  77,983,530
  77,984,491
  77,986,074
  77,986,293
  77,986,378
  77,986,453
  77,986,749
  77,989,030
  77,989,436
  77,990,199
  77,990,334
  77,990,434
  77,991,189
  77,991,566
  77,991,673
  77,991,891
  77,992,380
  77,992,470
  77,993,241
  77,993,411
  77,994,059
  77,995,613
  77,996,788
  77,997,137
  77,997,390
  77,997,515
  77,997,517
  77,997,829
  77,998,071
  77,998,111
  78,002,437
  78,004,598
  78,004,714
  78,004,819
  78,005,231
  78,005,306
  78,005,376
  78,005,409
  78,005,415
  78,005,422
  78,005,427
  78,005,438
  78,005,461
  78,005,506
  78,005,527
  78,005,528
  78,005,548
  78,006,219
  78,006,436
  78,006,738
  78,008,710
  78,009,049
  78,009,161
  78,009,394
  78,011,050
  78,011,093
  78,011,959
  78,012,244
  78,012,932
  78,013,398
  78,014,841
  78,015,007
  78,016,972
  78,017,024
  78,017,047
  78,019,103
  78,019,657
  78,020,017
  78,022,036
  78,023,910
C
A
T
C
T
G
A
G
G
T
G
C
A/G
T
C
C
A
C/T
A/T
A/G
G/A
T/C
T/C
G/A
T/A
A/G
G/A
A
C
A
C
T
A
C
C
T
G
A
C
C
G
T
C
T
A
A
C
T
G
C
A
C
A
C
C/T
C/T
G/A
C
A
T
C
G
A
A
T
T
A
T/A
C
A
A/G
A
G
C
C
G
G
T
C
G
C/G
A/C
C
A/G
G
C
T
C
A
G
T
A
A
C
G
G
C
G
T/A
G/T
T
C
G
A
C
T
G
T
A
T
G
A
T
T
G
G
G
C
T
G
C
A
C
T
C
C
C
G
A/G
G
A
G
C
G
C
T
A
C
T
C
T
T
A
C
T
T
T
G
T
T
G
A
C/A
G/A
G/A
G/C
T/C
G/A
G
T/C
C/T
T/C
T/G
A/G
C/T
A/G
G/A
A/G
T/C
T/G
G
C/G
A/G
C/G
C/T
G/T
T/C
G/C
G/T
A/G
C/G
A/C
C/A
C/A
T/A
G/C
G/A
G/A
A
G
G
T
A
C
T
A
A
A
G
T
T
A
T
A/T
A/G
G/C
A/G
T/C
A/G
G/T
C/G
A/T
G/A
A/C
G/A
C/T
C
A
G
C
A
G
C
G
C
C
T
T
G
G
A
C
T
A
A
T
C
A
G
T
T
A
A/T
T/C
T
G
A
G
T
A
C
C
T
C
T
A
G
T
A
C
T
C
C
T
C
A
A
C
T
G
A
T
C
G
T
C
C
G
C
G/A
G/A
C
C
C
A
C
C
C
G
T
G
T/G
G/T
A/C
T/A
C/T
A/G
C/A
C/A
A/C
A/G
A/G
C/A
C/T
A/T
C/T
T/G
A/C
G
T
G
A
T
G
G/C
A
G
A
T
A
C
T
C
T
G
C
G
C