Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 406,863 (bp)   Positions: 383
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.0
.001
.0
.0
.001
.0
.004
.082
.744
.55
.006
.144
.005
.001
.0
.335
.001
.0
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.002
.0
.002
.0
.008
.002
.16
.0
.0
--
--
--
.056
--
.0
.004
.885
.0
.0
--
--
.071
.017
.062
.024
.046
.181
.002
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.003
.0
.0
.032
.0
.002
.076
.0
.139
.009
.017
.006
.009
.003
.001
.004
.012
.151
.0
.0
.062
--
.006
.047
.159
.004
.005
.004
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.012
--
.144
.998
1.0
1.0
1.0
.234
.004
.053
.0
.044
.238
.0
.003
.015
.001
--
--
.009
--
--
--
--
.001
.0
.376
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.102
.229
.026
.012
.085
.293
.103
.004
.029
.4
--
.011
.013
.0
.002
.032
.002
.013
.001
--
--
--
--
--
.0
.09
.344
.017
.009
.009
.003
.229
.001
.0
.001
.0
.022
.947
.024
.004
.834
.0
.098
.665
.003
.001
.068
.004
.628
.066
.992
.021
.007
.106
.073
.01
.005
.002
.004
.797
.045
.0
.014
.037
.005
.0
.023
.051
.189
.01
.011
.065
.005
.028
.048
.006
.004
.004
.002
.012
.011
.096
.005
.458
.0
.02
.034
.764
.001
.066
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.008
1.0
1.0
.0
.05
.001
--
1.0
.135
.001
.104
.027
.02
--
.168
.005
.002
--
--
.342
.005
--
.0
--
--
.002
.131
.268
.336
.173
.143
--
--
.05
.005
.037
.0
.074
.001
.0
.037
.935
.0
--
--
--
.178
.066
.037
.146
.649
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.009
.001
.997
.002
.001
.001
.001
.0
.001
.0
.0
.226
.004
.0
.416
.0
.042
.004
.0
--
.001
.072
.737
.633
.693
.004
.001
.013
.033
.073
.3
.034
--
--
--
--
--
.006
.003
.001
.003
.03
.009
.378
.032
.001
.071
.0
.001
.002
.001
.521
.097
--
.001
.001
.0
.011
.004
.019
.002
.0
.0
.003
.0
.0
.064
.013
.218
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Gli3
T
C
A
G
G
G
T
C
A
G
T
T
T
G
T
G
G
C
T
A
T
C
A
C
G
G
G
T
A
G
T
A
T
G
G
A
G
A
C
T
C
A
A
G
C
G
T
G
A
C
C
G
G
T
T
G
G
G
C
T
A
T
A
C
G
T
C
A
G
A
G
A
C
C
T
G
C
T
G
G
A
G
A
T
G
A
T
A
G
T
C
T
A
C
C
G
T
C
T
T
G
A
G
C
G
C
G
G
C
G
T
C
G
T
C
T
T
A
G
T
T
A
T
T
A
G
C
C
G
T
C
C
C
A
G
A
T
T
A
G
C
G
T
A
T
G
A
G
A
T
T
T
G
T
G
A
A
A
G
G
A
A
A
C
C
A
A
G
A
A
C
C
C
G
G
G
G
G
C
C
T
C
G
C
C
A
A
C
G
A
C
T
G
C
A
A
A
A
T
G
G
C
C
C
T
T
G
G
T
A
T
C
A
T
C
C
G
G
A
C
C
A
C
A
A
G
A
G
G
A
G
A
A
T
C
A
A
A
G
T
A
G
A
A
T
G
A
A
C
C
G
T
C
T
A
C
T
A
T
A
C
A
C
C
A
G
G
G
T
T
A
T
C
G
T
T
A
C
C
A
T
T
A
T
C
T
A
A
C
A
G
T
C
G
G
G
T
A
C
C
A
A
C
A
C
C
T
G
C
T
A
G
A
C
A
A
C
T
G
A
T
C
G
G
A
A
G
C
C
A
C
C
T
C
A
G
T
T
A
A
A
G
T
T
G
C
T
A
A
G
G
T
C
A
G
G
T
C
C
C
T
G
A
C
A
G
C
T
C
G
T
G
A
A
C
T
A
C
A
A
C
T
C
  51,920,501
  51,920,554
  51,920,756
  51,920,986
  51,921,526
  51,921,611
  51,921,706
  51,922,126
  51,922,916
  51,922,944
  51,923,932
  51,924,465
  51,925,207
  51,925,364
  51,926,071
  51,928,140
  51,928,811
  51,929,005
  51,933,195
  51,934,302
  51,934,623
  51,934,637
  51,934,981
  51,934,994
  51,935,062
  51,935,904
  51,936,175
  51,936,211
  51,936,580
  51,936,810
  51,938,563
  51,938,641
  51,938,764
  51,939,376
  51,939,689
  51,940,265
  51,940,660
  51,940,750
  51,941,272
  51,941,355
  51,941,556
  51,943,229
  51,943,601
  51,946,582
  51,946,613
  51,947,373
  51,947,387
  51,948,022
  51,948,353
  51,949,279
  51,951,019
  51,951,069
  51,951,154
  51,951,862
  51,952,058
  51,952,100
  51,952,148
  51,952,416
  51,953,137
  51,953,320
  51,953,456
  51,953,486
  51,953,642
  51,953,945
  51,954,072
  51,954,110
  51,954,339
  51,954,697
  51,954,782
  51,955,219
  51,955,235
  51,956,187
  51,956,706
  51,956,852
  51,956,862
  51,957,224
  51,957,267
  51,957,354
  51,957,479
  51,957,535
  51,958,060
  51,958,256
  51,958,320
  51,958,417
  51,958,662
  51,958,775
  51,958,827
  51,959,535
  51,959,630
  51,959,656
  51,960,332
  51,960,410
  51,960,643
  51,960,699
  51,960,773
  51,961,213
  51,961,515
  51,961,762
  51,961,788
  51,962,115
  51,962,116
  51,962,330
  51,962,439
  51,962,443
  51,962,995
  51,963,353
  51,963,639
  51,963,888
  51,964,945
  51,967,677
  51,967,785
  51,970,503
  51,972,479
  51,972,698
  51,972,829
  51,972,937
  51,973,120
  51,973,753
  51,975,995
  51,976,477
  51,977,406
  51,979,870
  51,980,175
  51,981,506
  51,982,101
  51,982,382
  51,983,716
  51,984,791
  51,984,901
  51,986,220
  51,986,962
  51,988,571
  51,991,817
  51,991,962
  51,993,127
  51,993,160
  51,993,264
  52,000,381
  52,000,424
  52,000,520
  52,000,679
  52,000,718
  52,000,799
  52,000,848
  52,001,009
  52,001,039
  52,001,151
  52,001,219
  52,001,529
  52,001,785
  52,002,050
  52,002,307
  52,002,352
  52,002,554
  52,003,539
  52,003,822
  52,005,201
  52,008,105
  52,008,403
  52,010,060
  52,010,250
  52,010,681
  52,011,623
  52,012,313
  52,013,333
  52,015,866
  52,017,822
  52,018,676
  52,022,087
  52,022,088
  52,022,332
  52,023,219
  52,023,287
  52,024,491
  52,025,365
  52,026,046
  52,026,361
  52,026,555
  52,026,773
  52,026,898
  52,026,986
  52,027,175
  52,028,074
  52,028,133
  52,028,653
  52,028,811
  52,029,492
  52,029,946
  52,030,024
  52,067,450
  52,067,530
  52,067,996
  52,068,426
  52,068,735
  52,069,282
  52,069,644
  52,069,850
  52,069,883
  52,072,053
  52,072,772
  52,073,344
  52,073,466
  52,073,510
  52,073,555
  52,073,762
  52,074,835
  52,075,210
  52,075,477
  52,075,707
  52,076,242
  52,077,267
  52,078,096
  52,079,790
  52,080,597
  52,080,770
  52,081,068
  52,081,224
  52,081,225
  52,081,851
  52,082,513
  52,083,455
  52,083,512
  52,084,143
  52,084,923
  52,085,013
  52,085,199
  52,088,393
  52,089,364
  52,089,403
  52,090,669
  52,091,613
  52,091,744
  52,092,102
  52,092,882
  52,093,361
  52,093,598
  52,094,437
  52,094,651
  52,095,466
  52,096,173
  52,096,518
  52,097,389
  52,099,139
  52,103,660
  52,106,648
  52,107,651
  52,108,271
  52,113,792
  52,113,883
  52,121,048
  52,121,609
  52,122,019
  52,134,342
  52,152,750
  52,154,069
  52,154,768
  52,154,834
  52,156,100
  52,156,158
  52,157,342
  52,158,306
  52,158,605
  52,161,383
  52,171,343
  52,173,634
  52,175,722
  52,176,252
  52,176,830
  52,180,194
  52,185,004
  52,190,755
  52,190,918
  52,191,618
  52,191,628
  52,191,735
  52,191,786
  52,191,889
  52,197,769
  52,198,224
  52,198,826
  52,199,352
  52,199,775
  52,199,817
  52,202,246
  52,204,778
  52,205,552
  52,206,893
  52,206,969
  52,207,088
  52,207,634
  52,209,333
  52,209,371
  52,209,906
  52,210,012
  52,210,152
  52,210,519
  52,210,741
  52,216,904
  52,216,921
  52,217,033
  52,217,211
  52,217,242
  52,217,573
  52,217,593
  52,217,762
  52,217,807
  52,218,036
  52,218,198
  52,218,688
  52,218,775
  52,218,896
  52,219,236
  52,220,822
  52,221,194
  52,222,231
  52,224,626
  52,225,364
  52,226,194
  52,226,195
  52,226,218
  52,226,263
  52,226,265
  52,226,363
  52,226,425
  52,226,519
  52,227,177
  52,227,887
  52,239,001
  52,239,240
  52,239,762
  52,240,029
  52,240,038
  52,240,764
  52,242,375
  52,242,774
  52,243,984
  52,246,040
  52,247,353
  52,247,614
  52,248,553
  52,252,143
  52,252,607
  52,253,025
  52,253,703
  52,253,734
  52,254,413
  52,257,948
  52,259,195
  52,259,565
  52,259,566
  52,263,136
  52,263,345
  52,263,972
  52,264,521
  52,264,668
  52,264,947
  52,265,325
  52,265,518
  52,265,758
  52,266,274
  52,266,480
  52,267,384
  52,267,882
  52,268,047
  52,268,101
  52,268,409
  52,268,505
  52,269,074
  52,269,492
  52,269,724
  52,270,498
  52,271,224
  52,271,394
  52,278,029
  52,293,806
  52,297,758
  52,302,036
  52,302,581
  52,303,300
  52,307,944
  52,308,907
  52,309,050
  52,309,611
A
T
T
A
C
T
C
T
G
A
C
G
C
C
C
A
A
T
G
C
G
T
C
T
A
A
A
C
G
A
T/C
G
C
A
C
G
A
G
A
C
A
G
G
A
A
A
C
A
T
T
C/G
G/C
G/T
A
C
T
C
C
A
C
T
A
G
T
G/C
A
T
G
T
G
A
G
G
T
A
A
T
G
T
T
C
T
G
G
G/C
T
A
G
T
C
T
C
C
T
T
C
C
G
A
C
A
G
A
A
A
T
A
T
G
T
A
T
C
A
G
C
G
G
A
C
A
G
A
C
G
A
A
A
T
C
T
T
G
G
A
G
C
C
C
C
T
A
C
G
C
A
G
A
T
C
G
C
C
C
A
T
G
G
A
T
C
G
G
G
G
G
G
C
T
C
T
C/G
T
C
A
T
T
A
A
A
A
T
A
T
T
G
G
T
A
C
A
G
A
T
T
T
G
G
A
A
C
T
T
G
C
C
A
A
G
A/C
G
T
T
C
T
G
C
A
G
A
C/A
T
T
G
G
A
G
A
A
G
A
G
G
C
T
T
G
G
A
C
G
G/A
G
A/G
G
A
G
G
T
T
G/C
C
C/T
C
C
G
C
G
G
G
T
G
G
T
G
G/A
C
A
G
T/C
C
C
A
A
C
G
T
T
T
T
C
C
C
G
G
C
T
C
T
G
A
C
T
A
A
C
C
G
T
T
G
G
T
G
T
T
C
A
T
G
G
T
C
G
C
G
A
C
A
G
C
T
A
A
T
T
A
G
T
G
T
T
C
A
G
T
G
T/C
G
C
G
A
C
C
T
A
G
T
A/T
G/C
G/A
A
T
G
T
A
C
A
A
G
A
C
A/G
T
G
A
T
C
T
G/A
C
A
G
T
A
C
C
T
G
G
A
G
A