Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 131,556 (bp)   Positions: 280
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.0
.001
.0
--
.034
.001
.001
.125
.01
.001
.071
.017
.006
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
--
--
--
--
.026
.001
.006
.004
.001
.0
.0
.0
.006
.0
.019
.125
.015
.005
.0
.001
.002
.0
.0
.045
.193
.305
.087
.025
.956
.01
.007
.036
.044
.003
.0
.002
.056
.177
.274
.265
.607
.59
.026
.009
.001
.0
.0
.016
.001
.003
.002
.0
.208
.228
.003
.0
.019
.001
.063
.013
.008
.006
.056
.048
.024
.013
.0
.001
.0
.0
.015
.994
.997
.965
.058
.992
.001
.0
.02
.019
.001
.012
--
--
--
--
--
.487
.023
.028
.051
.202
.179
.172
.002
.12
.017
--
--
--
.009
.12
.002
.691
--
.002
--
--
--
--
--
--
--
--
.136
.206
.008
.004
.001
.001
.002
.0
.0
.0
.001
.0
.002
.001
.0
.004
.093
.62
.14
.762
.014
.011
.031
.005
.005
.0
.003
.028
.009
.0
.0
.006
.214
.358
.001
.012
.004
.068
.006
.554
.188
.039
--
--
.026
.713
.957
--
.094
.122
.169
.001
.004
.006
.0
.002
.01
.023
.152
.013
.003
.006
.087
.15
.001
.322
.178
--
--
--
--
--
.08
.013
.006
.0
.025
.007
.005
.004
.549
.026
.0
.007
--
.047
.019
--
--
.002
.001
.0
.0
.003
.0
.005
.0
.006
.291
.001
.001
.032
.004
.02
.007
.002
--
--
--
.029
.043
.001
.19
.007
.045
.011
.014
--
--
.011
.011
.017
.012
.001
.004
.023
.029
--
.055
.005
.017
.117
.003
.002
.011
.001
.817
.169
.858
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Clint1
Clint1
Clint1
Clint1
Clint1
Clint1
Clint1
Clint1
Clint1
Clint1
Clint1
Clint1
Clint1
Clint1
Clint1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
G
A
C
C
A
C
A
C
A
T
T
A
C
C
G
C
G
G
T
G
G
C
G
G
A
G
C
C
T
T
C
T
A
A
A
C
A
G
G
G
A
T
G
T
C
C
G
C
A
A
G
G
A
T
C
T
A
G
T
G
G
T
G
A
A
A
A
T
G
C
G
T
C
A
C
G
G
G
A
G
T
C
C
C
A
A
G
A
G
T
C
A
T
C
T
A
C
T
A
C
G
C
G
A
C
A
T
A
C
C
T
G
A
A
T
T
T
A
G
A
G
A
C
C
T
G
A
G
A
G
A
G
A
T
G
C
C
C
G
A
C
T
T
C
G
T
C
T
C
T
C
T
T
T
G
T
G
T
C
G
G
G
G
G
G
T
G
C
C
T
G
A
T
A
A
A
A
G
G
G
G
A
T
C
A
T
C
C
G
C
C
G
G
T
C
G
T
T
C
C
G
A
C
A
C
C
T
T
T
T
C
G
G
C
G
G
G
C
T
C
T
C
G
A
A
T
C
A
A
A
C
T
A
C
G
G
T
G
C
G
A
A
C
G
A
T
A
A
A
C
C
G
C
A
T
C
A
C
C
G
A
C
A
G
T
T
T
G
T
T
C
T
A
G
A
G
T
A
A
T
  30,766,789
  30,766,819
  30,766,862
  30,767,868
  30,768,214
  30,768,292
  30,768,408
  30,772,290
  30,772,449
  30,773,063
  30,773,415
  30,773,755
  30,775,508
  30,776,543
  30,781,760
  30,783,003
  30,783,494
  30,784,618
  30,784,960
  30,786,932
  30,786,975
  30,786,976
  30,787,026
  30,787,102
  30,787,177
  30,787,196
  30,791,891
  30,793,777
  30,794,291
  30,794,755
  30,794,956
  30,796,954
  30,797,282
  30,797,322
  30,797,445
  30,797,552
  30,797,627
  30,797,628
  30,797,635
  30,797,736
  30,798,125
  30,798,235
  30,799,025
  30,799,073
  30,800,050
  30,800,079
  30,800,187
  30,800,433
  30,800,699
  30,801,031
  30,801,103
  30,801,354
  30,801,797
  30,801,829
  30,802,288
  30,802,357
  30,802,619
  30,802,691
  30,802,993
  30,803,399
  30,803,473
  30,803,712
  30,804,480
  30,804,847
  30,804,870
  30,804,876
  30,805,005
  30,805,080
  30,805,084
  30,805,395
  30,805,632
  30,806,077
  30,807,523
  30,807,946
  30,808,065
  30,808,156
  30,808,361
  30,808,539
  30,808,859
  30,809,030
  30,809,039
  30,809,209
  30,809,215
  30,809,242
  30,809,272
  30,809,331
  30,809,446
  30,809,733
  30,809,749
  30,809,795
  30,809,806
  30,809,808
  30,809,810
  30,809,823
  30,810,829
  30,810,997
  30,811,003
  30,811,047
  30,811,405
  30,811,645
  30,813,582
  30,813,606
  30,813,899
  30,816,337
  30,816,515
  30,816,852
  30,816,853
  30,817,177
  30,817,899
  30,818,440
  30,819,044
  30,819,142
  30,819,995
  30,820,649
  30,821,221
  30,822,044
  30,822,194
  30,822,560
  30,822,802
  30,822,809
  30,822,822
  30,823,181
  30,823,676
  30,823,739
  30,823,824
  30,823,941
  30,824,427
  30,825,028
  30,825,031
  30,825,211
  30,826,145
  30,827,231
  30,828,358
  30,828,563
  30,834,851
  30,834,936
  30,834,951
  30,835,032
  30,835,041
  30,835,051
  30,835,061
  30,836,264
  30,836,332
  30,838,271
  30,838,395
  30,838,419
  30,838,421
  30,838,434
  30,838,438
  30,838,442
  30,838,511
  30,838,514
  30,840,754
  30,840,905
  30,840,925
  30,841,201
  30,841,228
  30,841,354
  30,841,558
  30,842,354
  30,842,395
  30,844,400
  30,844,518
  30,845,434
  30,845,778
  30,846,406
  30,847,138
  30,847,160
  30,848,555
  30,849,316
  30,849,733
  30,849,987
  30,850,842
  30,852,150
  30,853,440
  30,853,932
  30,854,010
  30,854,336
  30,854,402
  30,854,428
  30,854,527
  30,854,743
  30,855,309
  30,855,623
  30,855,697
  30,855,778
  30,855,850
  30,855,909
  30,859,948
  30,860,938
  30,860,944
  30,860,976
  30,868,693
  30,868,864
  30,869,507
  30,869,831
  30,870,202
  30,870,250
  30,875,580
  30,875,649
  30,875,971
  30,876,123
  30,876,124
  30,876,173
  30,876,614
  30,878,077
  30,878,970
  30,878,973
  30,878,976
  30,878,979
  30,878,992
  30,879,007
  30,879,063
  30,879,234
  30,879,371
  30,880,552
  30,881,157
  30,881,489
  30,881,565
  30,882,475
  30,883,304
  30,884,195
  30,884,282
  30,884,936
  30,885,562
  30,885,691
  30,886,828
  30,886,922
  30,887,040
  30,887,091
  30,887,142
  30,887,655
  30,887,919
  30,887,970
  30,888,025
  30,888,036
  30,888,197
  30,888,259
  30,888,575
  30,889,634
  30,889,758
  30,889,765
  30,890,125
  30,890,190
  30,890,249
  30,890,489
  30,890,711
  30,890,990
  30,891,105
  30,891,157
  30,891,315
  30,891,418
  30,891,449
  30,891,480
  30,891,585
  30,891,594
  30,891,640
  30,892,513
  30,892,642
  30,892,742
  30,892,884
  30,892,988
  30,894,239
  30,894,310
  30,894,386
  30,894,532
  30,894,752
  30,894,997
  30,895,334
  30,895,433
  30,895,490
  30,895,498
  30,895,739
  30,895,902
  30,897,052
  30,897,228
  30,897,389
  30,897,525
  30,897,944
  30,897,993
A
G
G
C/A
T
T
G
T
G
C
C
G
A
T
C
G
G/C
G/A
T/G
G/C
G/T
C/T
G/T
G/T
A/G
G/A
T
A
G
C
T
G
G
G
G
A
C
T
C
A
G
A
A
C
T
T
A
T
G
C
A
A
T
C
G
C
G
T
C
C
T
C
A
G
G
T
G
G
A
T
A
C
T
T
T
A
A
T
G
C
A
A
A
T
G
C
A
G
A
A
T
G
G
T
C
G
T
G
C
T
T
A
C
G
A
G
C
G
T
T
T/C
A
G
A/T
A
A
G
T
A
G
A
G
T
A
G
G/A
G
T
G
A
C
A
G
G
G/T
C/G
C/T
A
G/A
A/G
C/T
A
A
T
C
A
A
G
G
G
G
A
G
G
A
G
C
C
T
A
A
A
A
A
A
G
A
T
G
C
A
G
A
G
G
G
G
A
A
A
A
G
C
T
G
C
A
T
A
C/G
C/G
G/C
A
G
T
A
C
C
T
T
A
T
A
C
T
A
G
G
G
G
T
A
T
T
A
A
A
T
C
T
C
G
A
G
G
G
T
G
G
G
T
G
C
T
A
A
A
A
T
A
A/T
A/G
T
A
G
G
G
G
G
G
T
A
T
G
G
T
G
T
T
G/A
G
T
T
A
C
C
C
C
G
C
T
A
G
T
G
A
C
G
T
C