Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 98,523 (bp)   Positions: 461
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.946
.037
.084
.057
.565
.574
.568
.001
.892
.89
.991
.511
.972
.98
.567
.091
.08
.102
.182
.025
.657
.037
.0
.003
.019
.008
.011
.01
.038
.0
.002
.003
.025
.001
.132
.001
.001
.001
.012
.778
.217
.0
.003
.996
.137
.985
.068
.004
.029
.056
.005
.011
.002
.0
.011
.023
.033
.148
.178
.151
.054
.033
.024
.001
.004
.004
.01
.006
.02
.004
.023
.001
.018
.0
.062
.011
.003
.153
.052
.003
.006
.017
.006
.001
.021
.002
.0
.056
.001
.001
.002
.001
.001
.001
.204
.029
.335
.012
.008
.015
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.0
.001
.005
.012
.016
.051
.064
.088
.147
.193
.213
.216
.228
.027
.001
.01
.006
.142
.001
.001
.002
.001
.003
.121
.005
.002
.037
.406
.989
.192
.76
.977
.92
.021
.002
.261
.0
.028
.0
.001
.001
.14
.149
.171
.007
.0
.0
.001
.013
.004
.001
.003
.0
.021
.014
.0
.0
.0
.001
.016
.001
.001
.002
.002
.008
.001
.001
.0
.071
.001
.001
.061
.226
.307
.378
.03
.004
.023
.001
.126
.0
.002
.003
.001
.0
.002
.888
.079
.0
.0
.001
.001
.0
.001
.0
.001
.004
.212
.314
.004
.0
.002
.001
.0
.079
.017
.224
.001
.012
.002
.013
.0
.003
.014
.026
.002
.068
.009
.003
.018
.028
.006
.002
.003
.04
.005
.006
.009
.002
.012
.076
.038
.015
.005
.004
.017
.016
.003
.001
.574
.011
.048
.002
.001
.004
--
.003
.004
.012
.019
.008
.005
.012
.004
.002
.001
.001
.594
.29
.278
.0
.003
.002
.029
.004
.002
.136
.03
.0
.001
.015
.088
.0
.001
.001
.0
.0
.0
.001
.0
.0
.007
.0
.003
.562
.001
.011
.357
.002
.001
--
--
.001
.006
.076
.0
.0
.0
.001
.078
.001
.215
.006
.0
.0
.0
.01
.0
.0
.0
.205
.995
.995
.569
.0
.011
.007
.0
.002
.117
.016
.025
.005
.0
.828
.001
.001
.008
.019
.797
.01
.183
.0
.0
.02
.003
.001
.0
.0
.012
.0
.002
.0
.115
.129
.056
.028
.011
.0
.012
.001
.015
.011
.002
.002
.053
.013
.054
.047
.011
.002
.001
.001
.588
.0
.0
.0
.0
.001
.0
.0
.024
.003
.001
.002
.001
.006
.0
.0
.001
.003
.003
.001
.0
.0
.0
.0
.0
.001
.029
.004
.001
.01
.011
.001
.0
.021
.0
.007
.097
.001
.004
.001
.003
.01
.002
.003
.0
.01
.056
.0
.031
.04
.004
.0
.0
.001
.002
.001
--
.0
.0
.008
.037
.008
.002
.002
.022
.028
.0
.01
.003
.001
.003
.249
.0
.1
.095
.001
.0
.001
.0
.001
.0
.0
L3mbtl3
L3mbtl3
L3mbtl3
L3mbtl3
L3mbtl3
L3mbtl3
L3mbtl3
L3mbtl3
L3mbtl3
L3mbtl3
L3mbtl3
L3mbtl3
L3mbtl3
L3mbtl3
L3mbtl3
L3mbtl3
L3mbtl3
L3mbtl3
L3mbtl3
L3mbtl3
L3mbtl3
L3mbtl3
L3mbtl3
L3mbtl3
L3mbtl3
L3mbtl3
L3mbtl3
L3mbtl3
L3mbtl3
L3mbtl3
L3mbtl3
L3mbtl3
L3mbtl3
L3mbtl3
L3mbtl3
L3mbtl3
L3mbtl3
L3mbtl3
L3mbtl3
L3mbtl3
L3mbtl3
L3mbtl3
L3mbtl3
L3mbtl3
L3mbtl3
L3mbtl3
L3mbtl3
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
-
-
G
-
-
-
2
G
G
G
G
C
G
T
G
-
3
A
G
5
G
C
C
C
3
G
T
G
G
G
-
-
-
-
A
C
G
C
3
T
33
A
A
-
A
C
A
C
C
T
G
C
T
C
G
-
-
-
-
C
4
T
C
T
T
G
A
C
T
A
G
C
G
C
G
A
C
G
G
A
G
G
C
A
A
G
G
T
C
G
G
T
G
G
A
9
C
T
C
A
A
T
A
A
A
3
T
T
T
C
A
G
A
T
C
C
A
A
G
T
G
-
A
-
C
T
T
T
G
C
C
A
-
C
T
T
-
A
G
A
G
T
A
T
A
T
T
T
C
A
C
C
C
G
C
G
C
C
T
C
T
G
T
C
G
G
A
-
T
A
G
A
T
G
T
C
-
-
-
A
-
-
G
C
-
A
C
-
G
-
A
-
G
-
G
-
A
-
3
G
-
-
-
-
T
C
C
2
C
T
-
-
G
-
G
2
-
A
2
C
C
T
T
A
A
C
T
G
T
10
G
G
-
G
T
C
C
T
T
C
T
A
C
T
G
A
-
T
G
T
T
C
T
G
G
-
G
G
C
C
T
T
T
A
A
A
C
T
T
C
C
C
C
G
G
T
G
C
G
G
6
C
A
C
G
C
C
C
G
G
G
C
C
G
G
G
C
C
C
G
G
2
T
A
6
8
T
C
T
G
A
C
C
T
C
C
A
C
G
G
G
T
G
A
C
G
C
A
-
A
T
C
C
G
G
C
T
G
C
T
C
T
A
-
-
G
T
T
A
G
T
T
C
C
C
T
T
C
A
G
G
G
A
A
C
C
A
T
A
T
G
A
A
C
G
A
A
T
G
A
C
C
T
G
T
C
G
C
T
C
G
T
T
A
C
T
A
G
C
T
T
G
3
C
-
-
A
T
-
-
G
C
A
G
G
-
T
C
A
T
T
A
G
C
T
A
C
10
G
G
A
C
7
G
-
T
G
-
A
C
G
-
G
G
C
G
C
A
T
A
G
T
T
T
C
C
C
T
C
C
-
  19,999,359
  19,999,462
  19,999,484
  19,999,489
  19,999,514
  19,999,515
  19,999,520
  19,999,533
  19,999,574
  19,999,588
  19,999,601
  19,999,615
  19,999,644
  19,999,645
  19,999,665
  19,999,670
  19,999,673
  19,999,680
  19,999,686
  19,999,930
  20,000,488
  20,000,860
  20,000,908
  20,001,853
  20,001,858
  20,001,960
  20,002,757
  20,003,078
  20,003,080
  20,003,491
  20,003,849
  20,003,905
  20,004,076
  20,004,769
  20,006,907
  20,007,170
  20,007,493
  20,007,533
  20,007,923
  20,008,191
  20,008,692
  20,008,929
  20,009,412
  20,009,483
  20,010,397
  20,010,601
  20,010,666
  20,010,863
  20,011,073
  20,011,206
  20,011,308
  20,011,355
  20,011,501
  20,011,624
  20,011,718
  20,011,855
  20,011,857
  20,011,862
  20,011,878
  20,011,880
  20,011,919
  20,011,924
  20,012,317
  20,012,359
  20,012,375
  20,012,376
  20,012,415
  20,012,422
  20,012,574
  20,012,579
  20,012,598
  20,012,609
  20,012,614
  20,012,886
  20,013,001
  20,013,020
  20,013,169
  20,013,216
  20,013,283
  20,013,414
  20,013,424
  20,013,435
  20,013,464
  20,013,512
  20,013,542
  20,013,548
  20,013,640
  20,013,717
  20,013,728
  20,013,768
  20,013,783
  20,013,797
  20,013,834
  20,013,842
  20,013,893
  20,014,012
  20,014,119
  20,014,172
  20,014,173
  20,014,191
  20,014,301
  20,014,353
  20,014,373
  20,014,378
  20,014,382
  20,014,386
  20,014,490
  20,014,553
  20,014,594
  20,014,651
  20,014,659
  20,014,692
  20,014,697
  20,014,729
  20,014,805
  20,014,833
  20,015,000
  20,015,052
  20,015,123
  20,015,298
  20,015,443
  20,015,450
  20,015,451
  20,015,453
  20,015,458
  20,015,463
  20,015,472
  20,015,474
  20,015,497
  20,015,594
  20,015,616
  20,015,679
  20,015,778
  20,015,803
  20,015,857
  20,015,889
  20,015,959
  20,015,960
  20,016,073
  20,016,083
  20,016,086
  20,016,088
  20,016,093
  20,016,262
  20,016,418
  20,016,441
  20,016,485
  20,016,499
  20,016,510
  20,016,549
  20,016,562
  20,016,593
  20,016,680
  20,016,714
  20,016,738
  20,016,816
  20,016,839
  20,016,849
  20,016,851
  20,016,855
  20,016,909
  20,016,921
  20,016,925
  20,017,007
  20,017,013
  20,017,037
  20,017,076
  20,017,210
  20,017,285
  20,017,329
  20,017,337
  20,017,357
  20,017,410
  20,017,447
  20,017,449
  20,017,490
  20,017,645
  20,017,651
  20,017,652
  20,017,660
  20,017,688
  20,017,692
  20,017,733
  20,017,748
  20,017,766
  20,017,788
  20,017,801
  20,017,822
  20,018,017
  20,018,020
  20,018,024
  20,018,040
  20,018,074
  20,018,100
  20,018,111
  20,018,120
  20,018,141
  20,018,144
  20,018,170
  20,018,185
  20,018,188
  20,018,195
  20,018,229
  20,018,244
  20,018,272
  20,018,274
  20,018,697
  20,018,701
  20,018,706
  20,018,711
  20,018,714
  20,018,722
  20,018,725
  20,018,730
  20,018,739
  20,018,751
  20,018,754
  20,018,756
  20,018,760
  20,018,768
  20,018,895
  20,018,901
  20,018,934
  20,019,009
  20,019,160
  20,019,284
  20,019,413
  20,019,687
  20,019,742
  20,019,775
  20,019,802
  20,019,820
  20,019,992
  20,020,072
  20,020,082
  20,020,135
  20,020,186
  20,020,213
  20,020,235
  20,020,294
  20,020,322
  20,020,387
  20,020,424
  20,020,439
  20,020,455
  20,020,460
  20,020,623
  20,020,785
  20,020,803
  20,020,813
  20,020,921
  20,021,010
  20,021,011
  20,021,138
  20,021,198
  20,021,235
  20,021,418
  20,021,516
  20,021,621
  20,021,716
  20,021,893
  20,021,951
  20,022,074
  20,022,164
  20,022,187
  20,022,201
  20,022,224
  20,022,321
  20,022,576
  20,022,654
  20,022,752
  20,023,278
  20,023,552
  20,023,660
  20,023,665
  20,024,036
  20,024,485
  20,024,536
  20,024,664
  20,024,755
  20,024,774
  20,024,877
  20,024,931
  20,024,985
  20,025,003
  20,025,071
  20,025,083
  20,025,105
  20,025,179
  20,025,186
  20,025,213
  20,025,246
  20,025,282
  20,025,299
  20,025,372
  20,025,379
  20,025,411
  20,025,427
  20,025,579
  20,025,585
  20,025,635
  20,026,045
  20,026,163
  20,026,373
  20,026,539
  20,026,575
  20,026,627
  20,026,793
  20,027,144
  20,027,323
  20,027,406
  20,027,408
  20,027,519
  20,027,521
  20,027,703
  20,028,297
  20,028,328
  20,028,456
  20,028,644
  20,029,205
  20,029,645
  20,030,160
  20,030,191
  20,030,683
  20,030,780
  20,030,790
  20,031,160
  20,031,233
  20,031,245
  20,031,452
  20,031,549
  20,031,561
  20,031,620
  20,031,708
  20,031,765
  20,032,014
  20,032,027
  20,032,133
  20,032,363
  20,032,384
  20,032,496
  20,032,526
  20,032,532
  20,032,722
  20,032,724
  20,032,789
  20,032,834
  20,032,843
  20,033,107
  20,033,237
  20,033,260
  20,033,272
  20,033,299
  20,033,333
  20,033,386
  20,033,446
  20,033,542
  20,033,552
  20,033,827
  20,034,026
  20,034,453
  20,034,511
  20,034,688
  20,034,696
  20,034,708
  20,034,718
  20,034,928
  20,035,072
  20,035,294
  20,035,325
  20,035,367
  20,035,472
  20,035,497
  20,035,592
  20,035,594
  20,035,646
  20,035,814
  20,035,839
  20,035,915
  20,035,959
  20,036,276
  20,036,383
  20,036,384
  20,036,567
  20,036,573
  20,036,575
  20,036,578
  20,036,708
  20,036,742
  20,036,866
  20,036,957
  20,036,975
  20,037,208
  20,037,299
  20,037,300
  20,037,458
  20,037,468
  20,037,686
  20,037,694
  20,037,717
  20,037,725
  20,037,735
  20,037,773
  20,037,806
  20,037,835
  20,037,836
  20,037,846
  20,037,854
  20,038,155
  20,038,156
  20,038,187
  20,038,228
  20,038,239
  20,038,367
  20,038,412
  20,038,425
  20,038,557
  20,038,890
  20,038,941
  20,038,961
  20,039,013
  20,039,211
  20,039,270
  20,039,284
  20,039,362
  20,039,407
  20,039,489
  20,039,554
  20,039,578
  20,039,591
  20,039,628
  20,039,825
  20,039,838
  20,039,912
  20,039,948
  20,040,044
  20,040,108
  20,040,168
  20,040,216
  20,040,310
  20,040,340
  20,040,401
  20,040,618
  20,040,984
  20,041,018
  20,041,069
  20,041,159
  20,041,244
  20,041,360
  20,041,493
  20,041,604
  20,059,614
  20,069,335
  20,069,337
  20,070,391
  20,070,411
  20,070,418
  20,070,420
  20,070,427
  20,070,434
  20,073,056
C
T
A/A
C
C
C
-
-
-
-
-
G
C
G
-
A
-
-
-
-
T
T
T
T
-
C
C
C
C
A
4
C
T
3
G
T
A
T
-
C
-
G
G
T
G
T
T
T
T
A
-
T
C
T
T
T
9
4
C
T
-
C
T
C
C
A
T
T
C
G
A
T
T
G
A
G
A
A
A
G
A
C
G
G
-
T
T
C
G
A
A
C
A
A
-
-
T
G
T
G
G
C
C
A/C
A/C
3/-
A
C
G
T
T
A
G
A
T
T
G
G
A
C
C
T
T
3
T
G
C
C
A
T
T
C
C
T
G
C
C
G
A
T
T
C
G
C
G
C
C
C
G
T
T
T
T
A
A
A
T
T
C
G
C
A
C
T
A
A
G
2
C
G
T
G
C
C
A
T
2
A
A
C
C
C
A
T
G
T
T
8
A
2
G
T
A
G
C
C
-
G
-
-
2
T
2
G
C
G
-
-
-
G
G
G
-
T
-
-
T
-
-
G
T
C
A
G
G
T
C
C
C
10/-
A
A
2
A
C
T
T
C
C
T
A
G
T
C
C
G
7
C
A
C
C
T
G
C
C
20
A
A
T
T
C
C
G
G
C
G
A
C
C
A
T
T
A
T
A
-
T
T
A
A
-
T
-
T
A
T
T
G
A
A
T
T
G
A
A
T
T
T
T
A
A
-
C
G
-
-
C
T
A
-
G
G
T
C
T
T
C
A
A
A
T
C
A
-
-
A
T
G
T
T
C
G
A
A
C
T
C
A
T
C
-
G
G
2
28
A
-
C
C
T
C
A
T
T
A
A
C
T
G
A
A
A
G
-
A
T
T
C
G
G
A
G
C
T
A
G
G
C
A
G
T
T
C
A
C
G
T
-
C
T
A
C
C
G
T
C
G
A
T
C
C
A
-
T
3
17
G
C
C
2
A
A
T
A
T
T
A
T
T
C
A
G
C
T
C
-
T
-
T
C
G
T
-
C
2
G
T
10
G
A
A
2
A
A
T
A
T
C
C
-
A
C
G
G
A
-
A
C
A
A
T