Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 196,366 (bp)   Positions: 375
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
SBN/Ygl (MCW) 
.017
--
--
--
--
.011
.0
.0
.081
.002
.0
.014
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.152
.998
.649
.0
.0
.0
.082
.035
--
--
--
--
.067
.009
.0
.001
.001
.009
.006
.004
.002
.014
.001
.998
.0
--
--
--
--
.008
.0
.005
.2
.001
--
.003
.022
.001
.0
.0
.0
.001
.001
.002
.0
.0
.002
.004
.001
.0
.0
.006
.006
.998
.052
.004
.001
.175
.0
.001
.084
.062
.0
.01
.0
.003
.012
.01
.003
.002
.0
.0
--
.008
.005
.0
.002
.193
.002
.004
.0
.001
.002
.005
.041
.023
.02
.043
--
--
--
--
.0
.006
.008
.013
.061
.041
.005
.0
.002
.05
.001
.001
.037
.071
.118
.44
.036
--
--
--
--
.024
.024
.001
.006
.002
.004
.023
.018
.001
.0
.012
.001
.0
.161
.006
.011
.009
.004
.036
.0
.018
.004
.001
.381
--
.003
.001
--
--
.0
.004
.224
.015
.001
.002
.025
.124
.08
--
--
.497
.183
.105
.083
.032
--
.002
.977
.232
.0
.078
.005
.034
.0
.003
--
--
--
--
--
.017
.015
--
.007
.024
.056
.0
.004
.116
.042
.062
.0
.001
.001
.007
.735
.0
.003
.003
.001
.025
.128
.002
--
.0
.01
.0
.001
.011
.005
.04
.001
.053
.0
.006
.037
.038
.026
.021
.033
.018
.001
.284
.154
.001
.002
.011
.178
.01
.001
.002
.0
--
.041
.07
.12
.002
.002
.0
.025
.0
.001
.002
.011
.001
.0
.0
.024
.001
.001
.0
.001
.0
.0
.002
.018
.0
.083
.002
.0
.089
.125
.792
.012
.0
.002
.0
.01
.002
.001
.003
.0
.015
.0
.002
.0
.005
.022
.087
.681
.943
.98
.025
.018
.018
.003
.011
.012
.0
.004
.013
.037
.02
.006
.019
.02
.008
.0
.0
.0
.142
.028
.135
.0
.001
.021
--
.006
.004
.114
.013
.005
.049
.0
.02
.0
.0
.002
.002
.003
.03
.045
.032
--
--
.008
.012
.04
--
.001
.016
.011
.46
.064
.001
.014
.005
--
--
--
.005
.008
.179
.0
.0
.005
--
.016
.123
.01
.044
.001
.026
.001
.013
.02
.0
.99
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Kcnk2
Kcnk2
Kcnk2
Kcnk2
Kcnk2
Kcnk2
Kcnk2
Kcnk2
Kcnk2
Kcnk2
Kcnk2
Kcnk2
Kcnk2
Kcnk2
Kcnk2
Kcnk2
Kcnk2
Kcnk2
Kcnk2
Kcnk2
Kcnk2
Kcnk2
Kcnk2
Kcnk2
Kcnk2
Kcnk2
Kcnk2
Kcnk2
Kcnk2
Kcnk2
Kcnk2
Kcnk2
Kcnk2
Kcnk2
Kcnk2
Kcnk2
Kcnk2
Kcnk2
C
T
G
A
C
C
T
T
A
A
T
A
A
T
T
G
T
T
G
C
C
A
G
G
G
T
T
A
A
A
C
C
T
A
G
C
C
C
T
T
G
C
T
T
G
T
A
A
T
C
G
G
A
C
C
G
T
A
G
G
A
T
T
C
G
T
T
A
C
T
T
T
C
C
G
A
C
T
A
C
G
G
C
T
G
T
G
A
G
A
T
A
T
A
G
C
T
A
A
T
T
A
C
C
A
C
A
T
G
A
T
T
G
C
G
T
G
G
C
A
T
G
T
T
T
G
G
C
G
C
T
A
T
A
G
C
A
C
C
T
G
A
T
G
G
G
C
T
A
A
C
G
C
T
A
T
T
A
C
G
G
A
G
C
A
G
C
G
C
A
A
A
C
C
C
C
C
T
T
T
G
T
G
G
T
A
T
C
C
C
T
G
T
T
T
T
T
G
A
G
G
G
A
T
A
G
T
G
C
G
C
A
G
C
A
A
G
A
T
A
A
G
A
C
G
T
T
T
C
T
T
G
G
T
C
G
C
T
G
C
T
C
A
A
A
C
T
G
G
G
G
A
A
G
C
G
A
T
T
C
G
G
T
A
T
A
T
A
G
A
C
C
C
C
G
C
C
A
G
C
C
G
T
A
G
G
G
A
C
C
C
T
C
G
A
C
A
G
C
A
T
T
G
G
A
T
G
G
C
T
C
A
C
A
A
G
C
A
G
A
T
T
A
T
T
C
C
T
C
C
G
C
G
T
C
G
T
C
C
T
C
C
T
G
C
T
T
G
C
C
G
G
T
A
C
A
A
T
C
T
A
G
G
A
A
A
A
A
A
C
C
A
T
T
G
  107,693,397
  107,695,517
  107,696,188
  107,696,202
  107,696,210
  107,696,533
  107,697,139
  107,701,343
  107,701,823
  107,702,007
  107,702,132
  107,702,346
  107,703,296
  107,704,074
  107,704,077
  107,704,195
  107,704,204
  107,704,622
  107,704,804
  107,705,143
  107,705,150
  107,705,331
  107,705,606
  107,706,461
  107,706,918
  107,708,792
  107,709,174
  107,709,278
  107,709,765
  107,709,917
  107,710,375
  107,710,515
  107,711,798
  107,712,113
  107,712,133
  107,712,166
  107,712,860
  107,713,007
  107,713,020
  107,713,384
  107,713,419
  107,714,061
  107,714,081
  107,714,085
  107,715,247
  107,717,375
  107,717,601
  107,718,170
  107,720,287
  107,721,887
  107,721,953
  107,722,068
  107,722,145
  107,722,696
  107,724,186
  107,724,835
  107,725,310
  107,725,358
  107,726,176
  107,726,764
  107,727,085
  107,728,375
  107,728,954
  107,729,050
  107,729,755
  107,730,772
  107,731,531
  107,732,229
  107,732,331
  107,732,414
  107,732,821
  107,733,565
  107,733,689
  107,733,925
  107,734,041
  107,734,440
  107,734,742
  107,735,011
  107,735,433
  107,735,532
  107,736,527
  107,736,576
  107,736,643
  107,736,904
  107,737,597
  107,739,310
  107,739,550
  107,740,179
  107,740,861
  107,742,307
  107,742,884
  107,743,566
  107,743,639
  107,743,652
  107,743,675
  107,743,691
  107,744,135
  107,744,243
  107,744,406
  107,745,720
  107,748,209
  107,748,601
  107,748,777
  107,748,965
  107,749,241
  107,749,319
  107,750,792
  107,751,224
  107,751,775
  107,751,994
  107,753,097
  107,753,193
  107,754,007
  107,754,434
  107,754,634
  107,754,694
  107,755,799
  107,756,418
  107,756,598
  107,757,655
  107,757,736
  107,757,740
  107,757,866
  107,758,032
  107,758,867
  107,759,418
  107,759,831
  107,759,840
  107,759,892
  107,759,986
  107,760,400
  107,760,468
  107,760,515
  107,760,825
  107,761,369
  107,761,383
  107,761,517
  107,761,856
  107,761,860
  107,761,989
  107,762,069
  107,762,230
  107,763,202
  107,763,542
  107,763,734
  107,763,902
  107,763,955
  107,764,223
  107,764,740
  107,765,494
  107,765,813
  107,765,852
  107,766,074
  107,766,661
  107,767,028
  107,767,432
  107,767,509
  107,768,094
  107,770,545
  107,770,916
  107,770,973
  107,771,552
  107,771,682
  107,772,709
  107,773,046
  107,773,060
  107,774,026
  107,774,031
  107,774,072
  107,774,294
  107,775,142
  107,776,093
  107,776,146
  107,776,201
  107,776,682
  107,776,794
  107,776,939
  107,777,580
  107,777,849
  107,778,061
  107,778,999
  107,779,045
  107,780,383
  107,781,552
  107,782,169
  107,782,352
  107,782,784
  107,782,963
  107,783,065
  107,783,353
  107,784,136
  107,785,069
  107,787,158
  107,787,540
  107,787,608
  107,787,614
  107,787,626
  107,794,671
  107,797,954
  107,799,001
  107,799,047
  107,799,103
  107,799,708
  107,800,534
  107,800,753
  107,801,169
  107,801,370
  107,801,833
  107,802,130
  107,804,682
  107,804,931
  107,805,570
  107,805,871
  107,805,936
  107,806,070
  107,806,096
  107,806,378
  107,806,405
  107,806,459
  107,806,486
  107,807,176
  107,807,270
  107,807,308
  107,807,529
  107,807,743
  107,807,987
  107,808,092
  107,808,115
  107,808,188
  107,808,571
  107,809,477
  107,809,753
  107,809,822
  107,809,847
  107,810,064
  107,810,215
  107,810,493
  107,810,778
  107,810,986
  107,811,179
  107,811,184
  107,811,315
  107,811,316
  107,812,143
  107,812,662
  107,812,888
  107,813,039
  107,813,124
  107,813,413
  107,813,740
  107,813,807
  107,813,819
  107,813,831
  107,814,412
  107,815,973
  107,816,633
  107,816,800
  107,816,966
  107,818,451
  107,818,988
  107,820,004
  107,820,328
  107,820,514
  107,824,646
  107,824,937
  107,826,119
  107,826,132
  107,826,290
  107,826,832
  107,827,138
  107,827,163
  107,827,375
  107,828,315
  107,828,819
  107,829,039
  107,829,282
  107,829,489
  107,829,501
  107,830,678
  107,830,766
  107,831,104
  107,831,113
  107,831,401
  107,831,772
  107,831,787
  107,831,845
  107,831,856
  107,831,889
  107,832,043
  107,832,551
  107,832,567
  107,833,010
  107,833,039
  107,833,091
  107,833,800
  107,834,045
  107,834,063
  107,834,948
  107,835,776
  107,836,605
  107,836,663
  107,836,664
  107,837,634
  107,839,381
  107,839,391
  107,839,605
  107,840,440
  107,841,565
  107,841,581
  107,842,083
  107,842,128
  107,842,773
  107,843,574
  107,843,945
  107,844,023
  107,845,751
  107,847,468
  107,847,951
  107,847,980
  107,848,010
  107,853,673
  107,855,966
  107,859,119
  107,860,190
  107,860,685
  107,863,684
  107,863,765
  107,863,795
  107,864,180
  107,864,307
  107,864,385
  107,864,447
  107,864,743
  107,864,813
  107,865,490
  107,865,989
  107,866,063
  107,866,473
  107,866,593
  107,866,982
  107,867,278
  107,867,328
  107,867,818
  107,868,499
  107,868,599
  107,869,082
  107,869,998
  107,870,742
  107,870,749
  107,870,852
  107,872,379
  107,872,596
  107,872,863
  107,872,972
  107,873,143
  107,873,199
  107,873,355
  107,873,572
  107,873,582
  107,874,606
  107,874,832
  107,876,447
  107,877,059
  107,877,499
  107,877,839
  107,877,892
  107,879,860
  107,880,150
  107,880,410
  107,882,279
  107,882,633
  107,885,614
  107,885,977
  107,886,075
  107,886,383
T
C
G/A
A/G
A
T
A
C
C
G
C
G
G
T/C
T/C
G/C
T/C
G
T
T
T
G
A
A
T
C
G
T
G
G
T
A
C
G
A
T
T
T
C
C
G/A
C/T
T/C
T/C
T
G
T
G
C
T
A
A
T
T
T
T
G
G
G/A
A
G
C
C
T
A
C
C
G
T
C
G
C
T
G
A
C
T
C
G
A
C
A
T
C
A
C
A
G
T
G
G
T
G
G
A
T
C
C
A/G
C
C
C
T
A
C
T
G
C
A
G
C
C
A
T
T
C
A
A
T
G
C
A
C
C
C
T
A
T
A
G
C
G
C
G
A
T
T
T
T
C
T
G
C
A
A
A
A
C
T
T
A
A
A
C
G
C
C
G
T
A
A
G
A
A
G
A
C/T
G/A
C/T
C
G
A/G
T
G
T
T
C/T
C
A
C
A
G
A
A
C
G
C
T
T
C/T
C
A
T/A
T/G
T/G
T/G
T/G
A
G
A
A
A
G
C
G
A
C
A
G
C
T
A/G
A
T
G
G
A
G
C
G
A/C
A
G
A
A
G
A
A
T
C
C
A
T
A
A
A
T
C
A
T
C
T
G
G
C
T
C
A
A
G/A
G/A
A/G
A/G
C
T
T
G
C
C
T
A
A
G
G
A
G
C
C
A
G
T
T
T
T
A
A
A
G
C
C/T
A
C
C
G
A
A
A
C
T
T
T
G
A
T
G
T
G
A
T
G
G
A
C
A
G
C
T
C
G
C
T
G
T
A/G
G
A
T
G
A
G
C
C
G
T/C
T/C
A
T
C
A
T
A
T
A
C
A
T
C
T
T
C
T
T
C
A
T
C
C
G/A
C/T
C/A
C
A
C
G
T
G
G
C
T
C
G
A
A
G
C
G
G
G
C
G
G
G
C
G
A