Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 121,440 (bp)   Positions: 427
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.245
.04
.0
.325
.22
.175
.033
.01
.008
.134
.015
.004
--
--
--
.001
.002
.007
.046
.054
.051
.017
.013
.112
.016
.002
.002
.0
.001
.001
.018
.008
.003
.017
.016
.036
--
.029
.023
.324
.13
.058
.01
.012
.018
.001
.944
.068
.0
.001
.003
.004
.013
.214
.0
.039
.0
.0
.198
.125
.232
.006
.061
.002
.001
.001
.483
.024
.002
.025
.0
.0
.013
.0
.0
.001
.0
.018
.069
.173
.937
.933
.003
.007
--
--
--
--
.026
.041
--
--
--
--
--
.058
.021
.568
.008
.002
.29
.11
.109
.097
.059
.027
.447
.008
.196
.063
.117
.008
.002
.005
.001
.0
.005
.002
.428
.001
.0
.444
.042
.042
.092
.008
.003
.001
.0
.01
.047
.006
.002
.002
.009
--
--
--
--
--
.112
.064
.002
.029
.008
.011
--
.002
.067
.024
.037
.007
.002
.011
.0
.002
.001
.021
.008
.002
.001
.73
.001
.005
.045
.005
.026
.004
.153
.219
.164
--
--
.024
.027
.034
.004
.043
.026
.019
.147
.095
.033
.046
.457
.914
.004
.0
.726
.006
.007
.004
--
.016
.002
.002
.012
.033
.0
.0
.004
.008
.047
.138
.928
.001
.002
.005
.006
.086
.007
.006
.679
.01
.0
.001
.002
.024
.024
.006
.0
.412
--
--
.0
.128
.001
.001
.009
.024
.016
.015
--
.023
.024
.293
.127
.143
.151
.158
.165
.171
.177
.164
.005
.0
.0
.048
.001
.015
.0
.0
.003
.007
.004
.011
.006
.0
.003
.0
--
.001
.065
.0
.001
.003
.176
.825
.996
.015
.072
.02
.016
--
.082
.0
.0
.012
.003
.0
.359
.108
.003
.006
.01
.01
.039
.007
.364
.103
.097
.438
.029
.001
.002
.432
.019
.02
.0
.001
.006
.011
.138
.021
--
--
.021
.0
.057
.005
.01
.015
.0
.011
.142
.004
.003
--
--
.004
.009
--
--
.31
.003
.004
.046
.007
.166
.006
.0
.0
.0
.275
.084
.171
.095
.041
.0
.005
.037
.2
.001
.003
.259
.003
.175
.011
.004
.001
.0
.002
.002
.005
.023
.0
.002
.038
.023
.0
.378
.001
.0
.039
.15
.009
--
--
--
--
.0
.427
.979
.003
.026
.02
--
--
.025
.015
.003
.001
.0
--
.997
.49
.618
.667
.056
.099
1.0
.002
.024
.011
.0
.0
.996
.18
.823
.009
.008
.0
.0
.0
.0
.002
.0
.0
.001
.0
.008
.054
.0
.067
.003
.0
.012
.349
--
--
.923
.029
.014
.048
.003
.99
.001
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
G
T
G
A
T
G
T
T
A
T
C
C
T
G
G
T
C
-
G
C
-
2
-
C
G
2
T
T
T
A
-
-
T
-
-
A
G
G
C
G
C
A
C
A
C
A
A
G
C
A
G
A
T
-
A
C
A
C
C
A
C
A
-
T
A
C
T
A
110
G
G
G
C
T
A
G
T
A
-
A
G
A
A
G
11
22
G
4
T
A
C
C
A
-
A
C
G
A
G
-
A
G
G
2
-
A
C
T
C
G
-
G
G
C
T
2
24
T
C
G
T
G
2
-
T
-
G
G
T
T
C
A
T
A
T
G
A
A
G
G
-
T
G
A
C
T
T
G
G
C
-
-
-
C
-
G
T
T
T
T
A
T
G
C
G
A
C
T
G
G
T
A
T
C
G
A
C
A
T
63
A
T
G
G
C
G
T
C
C
G
A
A
G
A
C
C
7
-
C
A
A
A
-
A
A
-
-
C
-
-
C
A
G
-
-
-
-
-
6
C
T
G
-
A
G
T
C
T
T
T
G
A
C
A
T
A
T
T
T
T
T
T
T
-
T
G
C
A
-
G
A
T
C
C
T
T
4
A
G
A
C
C
C
C
T
A
A
C
C
A
T
G
G
T
T
C
A
2
G
G
-
C
A
T
T
T
G
C
-
2
18
C
T
T
-
G
A
4
A
C
A
A
G
C
G
C
T
C
A
-
G
A
G
-
G
A
-
G
A
G
T
A
4
G
A
C
G
T
A
C
A
G
A
A
A
A
3
T
-
G
T
-
A
A
G
A
A
-
G
G
T
-
A
A
A
T
-
-
-
C
C
-
T
C
T
C
C
G
C
C
-
G
C
A
T
G
A
T
81
T
A
-
G
-
-
G
C
G
G
C
G
-
-
G
A
T
A
8
27
A
A
A
T
A
C
A
G
T
C
A
A
T
G
4
C
T
G
-
T
C
C
T
A
5
G
C
C
  140,789,003
  140,790,017
  140,790,090
  140,790,661
  140,790,692
  140,791,505
  140,791,782
  140,793,569
  140,793,582
  140,793,620
  140,793,785
  140,793,797
  140,795,284
  140,795,287
  140,795,361
  140,795,411
  140,795,422
  140,795,547
  140,795,585
  140,795,590
  140,795,607
  140,795,614
  140,795,619
  140,795,629
  140,795,658
  140,795,673
  140,795,711
  140,795,717
  140,795,719
  140,795,722
  140,795,735
  140,795,780
  140,795,791
  140,795,844
  140,795,845
  140,795,851
  140,796,816
  140,797,357
  140,797,400
  140,797,493
  140,797,525
  140,797,562
  140,797,569
  140,797,570
  140,797,682
  140,797,784
  140,797,978
  140,798,411
  140,798,456
  140,798,556
  140,798,571
  140,798,590
  140,799,115
  140,799,179
  140,799,607
  140,799,763
  140,799,792
  140,799,800
  140,799,956
  140,800,043
  140,800,114
  140,800,172
  140,800,232
  140,800,301
  140,800,504
  140,800,668
  140,800,727
  140,800,873
  140,801,094
  140,801,409
  140,801,439
  140,801,441
  140,801,491
  140,801,518
  140,801,535
  140,801,813
  140,801,819
  140,802,196
  140,802,291
  140,802,402
  140,802,493
  140,802,498
  140,802,673
  140,802,716
  140,803,132
  140,803,148
  140,803,260
  140,803,397
  140,803,634
  140,804,532
  140,805,248
  140,805,378
  140,805,379
  140,805,396
  140,805,400
  140,806,027
  140,806,631
  140,806,806
  140,807,234
  140,808,055
  140,808,767
  140,809,208
  140,809,209
  140,809,212
  140,809,216
  140,809,227
  140,809,295
  140,809,481
  140,809,515
  140,809,548
  140,809,591
  140,809,908
  140,810,039
  140,810,091
  140,810,115
  140,810,146
  140,810,158
  140,810,227
  140,810,375
  140,810,688
  140,810,852
  140,811,064
  140,811,287
  140,811,291
  140,811,600
  140,811,615
  140,812,045
  140,812,459
  140,812,734
  140,812,760
  140,813,409
  140,813,802
  140,813,803
  140,813,804
  140,814,521
  140,814,660
  140,814,944
  140,815,047
  140,815,298
  140,815,809
  140,816,103
  140,816,568
  140,816,711
  140,816,798
  140,818,125
  140,818,159
  140,818,277
  140,818,667
  140,819,162
  140,819,583
  140,819,621
  140,819,719
  140,819,966
  140,820,034
  140,820,044
  140,820,248
  140,820,720
  140,821,992
  140,823,169
  140,823,633
  140,823,665
  140,823,741
  140,824,151
  140,824,182
  140,824,247
  140,824,440
  140,824,670
  140,825,222
  140,825,396
  140,826,041
  140,826,176
  140,826,293
  140,826,404
  140,826,514
  140,826,951
  140,827,354
  140,827,584
  140,827,596
  140,827,656
  140,828,414
  140,828,715
  140,828,729
  140,828,746
  140,828,754
  140,828,848
  140,829,014
  140,829,579
  140,829,921
  140,830,106
  140,830,884
  140,831,092
  140,831,183
  140,831,375
  140,831,519
  140,831,547
  140,831,827
  140,832,536
  140,832,605
  140,832,730
  140,832,774
  140,833,076
  140,833,404
  140,833,742
  140,834,686
  140,835,031
  140,835,454
  140,835,601
  140,835,690
  140,835,714
  140,835,783
  140,835,837
  140,835,838
  140,835,869
  140,835,920
  140,835,979
  140,835,990
  140,835,996
  140,836,087
  140,836,089
  140,836,228
  140,836,307
  140,836,967
  140,837,182
  140,839,356
  140,839,445
  140,841,360
  140,841,424
  140,841,434
  140,841,450
  140,841,466
  140,842,230
  140,842,238
  140,843,011
  140,843,064
  140,843,744
  140,843,847
  140,844,187
  140,844,189
  140,844,191
  140,844,193
  140,844,195
  140,844,197
  140,844,199
  140,844,207
  140,844,455
  140,844,741
  140,844,817
  140,844,978
  140,845,363
  140,845,373
  140,845,415
  140,845,474
  140,845,510
  140,845,968
  140,846,921
  140,847,239
  140,847,547
  140,847,594
  140,847,690
  140,847,884
  140,848,262
  140,848,315
  140,848,566
  140,848,874
  140,848,945
  140,849,033
  140,849,073
  140,849,539
  140,849,617
  140,850,123
  140,850,215
  140,850,307
  140,850,418
  140,850,509
  140,850,879
  140,850,970
  140,851,105
  140,851,664
  140,851,762
  140,851,830
  140,852,046
  140,852,184
  140,852,287
  140,852,437
  140,852,504
  140,852,507
  140,852,530
  140,852,621
  140,852,975
  140,853,036
  140,853,048
  140,853,192
  140,853,332
  140,853,947
  140,853,967
  140,854,162
  140,854,218
  140,854,232
  140,854,245
  140,854,253
  140,854,270
  140,854,271
  140,854,374
  140,855,004
  140,855,150
  140,855,157
  140,855,321
  140,855,347
  140,856,222
  140,856,288
  140,856,426
  140,856,945
  140,857,067
  140,857,110
  140,857,477
  140,857,534
  140,857,568
  140,857,583
  140,857,647
  140,857,746
  140,857,810
  140,857,876
  140,857,943
  140,858,073
  140,858,326
  140,858,384
  140,858,859
  140,858,933
  140,859,043
  140,859,132
  140,859,443
  140,859,587
  140,859,608
  140,859,663
  140,860,082
  140,860,167
  140,860,483
  140,860,489
  140,860,699
  140,860,846
  140,860,888
  140,861,205
  140,861,744
  140,861,822
  140,862,256
  140,862,405
  140,862,537
  140,862,599
  140,862,620
  140,862,792
  140,862,824
  140,862,843
  140,862,845
  140,862,847
  140,862,851
  140,862,934
  140,863,237
  140,865,120
  140,865,734
  140,866,451
  140,867,052
  140,867,503
  140,867,586
  140,868,817
  140,868,959
  140,869,102
  140,870,260
  140,870,806
  140,870,904
  140,871,041
  140,872,651
  140,872,906
  140,872,976
  140,877,207
  140,879,346
  140,881,928
  140,882,358
  140,882,850
  140,885,430
  140,885,692
  140,886,544
  140,888,421
  140,888,549
  140,890,085
  140,892,539
  140,892,547
  140,892,555
  140,892,556
  140,892,729
  140,892,730
  140,892,745
  140,892,900
  140,893,054
  140,893,071
  140,893,077
  140,893,097
  140,893,511
  140,899,146
  140,899,454
  140,899,688
  140,900,794
  140,901,737
  140,902,229
  140,902,518
  140,902,540
  140,902,638
  140,902,764
  140,902,821
  140,902,872
  140,902,951
  140,904,373
  140,904,568
  140,904,867
  140,904,889
  140,904,965
  140,905,069
  140,905,185
  140,905,199
  140,905,288
  140,905,326
  140,907,383
  140,907,794
  140,907,852
  140,908,145
  140,909,257
  140,910,078
  140,910,191
A
G
A
T
C
T
C
C
G
C
T
T
G
-
T
G
-
G
-
-
G
-
2
-
-
-
-
-
G
-
C
C
-
G
T
-
C
C
T
A
T
T
T
C
T
T
G
A
T
G
A
G
C
C
G
T
T
A
T
G
T
C
10
C
T
T
C
G
-
A
T
A
T
C
G
T
A
C
4
G
T
T
G
A
-
-
T
-
G
G
T
A
T
C
G
T
T
-
A
11
G
C
T
-
3
G
T
C
T
T
A
A
A
G
C
-
-
C
A
A/T
G
T
-
2
A
C
A
A
A
C
T
G
A
C
C
A
G
G
-
A
A
C
A
G
T
C
C
A
A
T
G
G
2
T
4
A
A
C
C
G
G
A
A
T
A
G
T
C
A
A
C
C
C
G
A
T
T
G
C
-
G
C
A
A
T
C
C
T
A
A
G
T
A
G
T
T
-
G
T
G
C
G
G
G
G
2
5
-
A
2
T
C
T
A
T
C
C
G
-
T
C
A
-/13
G
C
A
T
C
A
A
A
G
G
G
-
G
A
A
A
A
A
A
A
-/2
C
T
T
G
T
A
G
C
T
T
C
C
-
-
A
G
-
A
T
T
G
T
T
G
T
G
-
A
A
-
G
T
T
-
A
T
A
T
G
G
C
C
A
T
4
-
18/-
T
A
C
2
A
G
-
G
G
T
T
A
T
A
T
C
T
G
A
A
C
A
22
A
G
8
T
G
-
C
C
-
A
G
G
A
C
G
T
G
-
G
C
G
G
-
C
2
A
A
3
G
G
A
G
G
4
A
T
C
6
G
G
G
C
C
T
4
T
T
42
C
T
G
T
C/T
T
C/G
C/A
2
A
T
G
C
A
G
G
-
A
G
T
A
12
C
-
G
A
C
G
-
C
G
-
-
-
G
-
-
C
G
G
C
G
T
G
A
C
T
G
C
C
A
-
T
C
C
3
-
A
T
C
T
5/-
C
T
T