Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 167,220 (bp)   Positions: 446
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.123
.034
.0
.0
.008
.012
.014
.001
.0
.897
.88
.01
.0
.208
.001
.001
.053
.001
.0
.028
.002
.003
.033
.172
.028
.0
.098
.063
.002
.002
.0
.158
.165
.026
.032
.291
.068
.015
.065
.511
.877
.0
.001
.002
.018
.011
.0
.977
.0
.0
.0
.0
.0
.001
.054
.002
.02
.033
.168
.012
.0
.0
.015
.005
.004
.022
.004
.02
.0
.0
.005
.114
.029
.0
.017
.055
.756
.675
.512
.016
--
--
.0
.0
.001
.009
.0
.015
.017
.0
.0
.003
.007
.077
.001
.292
.001
.012
.004
.112
.009
.01
.562
.11
.002
.0
.0
.137
.004
.001
.0
.052
.0
.002
.004
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.017
.003
.002
.003
.0
.29
.005
.006
.0
.973
.0
.963
.0
.0
.036
.014
.14
.0
.0
.042
.002
.0
.0
.0
.0
.0
.001
.029
.011
.006
.158
.0
.012
.003
.004
.793
.027
.0
.0
.045
.095
.977
.0
.001
.001
.058
.003
.004
.001
.005
.098
.011
.001
.328
.01
.0
.0
.255
--
--
--
.187
.642
.669
.055
.022
.004
.063
.118
.173
.0
.004
.0
.002
--
.0
.0
.002
.149
.007
.02
.007
.0
.046
.0
.144
.043
.0
.27
.069
.0
.004
.105
.0
.003
.019
.374
.003
.222
.01
.0
.031
.012
.0
.004
.004
--
.003
.043
.001
.779
.0
.001
.002
.001
.004
.0
.002
.004
.009
.132
--
--
--
.005
.031
.004
.009
--
--
--
.026
.0
--
--
.704
.003
.037
.018
.002
.0
.0
.002
.017
.002
.002
.0
.0
.0
.053
.0
.003
.025
.004
.0
.282
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.003
.04
.029
.008
.098
.034
.002
.001
.382
.054
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.006
.001
.114
.053
.005
.037
.003
.003
.001
.164
.0
.012
.105
.0
.494
.043
.538
.024
.017
.066
.001
.012
.007
.281
.003
.002
.0
.0
.013
.0
.0
.0
.0
.003
.001
.0
.001
.031
.004
.026
.109
.002
.006
.006
.165
.004
.0
.0
.006
.0
.001
.425
.717
.191
.001
.001
.001
.0
.288
.208
.917
.036
.285
.042
.001
.002
.009
.002
.002
.0
.0
.0
.131
.005
.019
.0
.001
.0
.004
.01
.0
.101
.002
.005
.0
.003
.056
.177
.0
.0
.0
.0
.003
.193
.0
.0
.0
.168
.038
.016
.001
.001
.004
.991
.046
.002
.002
.047
Katnip
Katnip
Katnip
Katnip
Katnip
Katnip
Katnip
Katnip
Katnip
Katnip
Katnip
Katnip
Katnip
Katnip
Katnip
Katnip
Katnip
Katnip
Katnip
Katnip
Katnip
Katnip
Katnip
Katnip
Katnip
Katnip
Katnip
Katnip
Katnip
Katnip
Katnip
Katnip
Katnip
Katnip
Katnip
Katnip
Katnip
Katnip
Katnip
Katnip
Katnip
Katnip
Katnip
Katnip
Katnip
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
A
C
T
T
-
-
G
C
G
G
A
C
A
T
C
C
G
C
A
T
C
T
T
A
T
10
G
G
G
T
G
T
G
C
G
C
-
T
G
C
-
A
T
A
A
C
G
G
G
T
T
T
G
T
T
C
T
C
C
T
A
G
T
A
3
G
G
A
C
G
A
A
G
A
A
C
A
C
G
G
-
C
C
G
G
T
G
T
-
A
A
C
A
T
C
A
32
T
T
C
G
C
4
G
T
T
A
C
-
G
C
C
A
C
A
C
G
A
A
A
C
A
A
T
C
T
A
T
A
G
T
T
C
A
A
T
G
-
A
G
A
C
G
A
G
T
C
T
T
T
A
T
A
T
G
C
-
A
A
A
G
6
T
C
6
C
C
A
A
G
A
A
A
A
A
G
5
T
A
C
G
C
-
T
A
G
G
T
C
2
T
A
A
T
C
A
C
-
T
A
G
C
A
T
C
C
2
C
A
C
A
A
-
6
A
C
T
G
-
-
A
G
18
A
C
C
G
C
C
A
-
T
G
A
G
A
C
T
G
G
-
T
2
7
T
5
C
C
C
G
A
G
T
T
T
T
A
T
-
T
C
T
C
A
C
T
T
C
G
T
A
T
-
A
13
8
C
G
C
G
A
A
A
G
A
T
T
A
T
6
4
A
C
G
A
C
T
G
T
C
G
C
-
G
G
T
G
C
T
A
-
G
G
A
C
T
G
T
4
-
A
C
C
T
C
T
A
C
G
G
C
A
T
T
T
T
A
A
G
G
T
C
A
A
C
C
T
T
C
T
G
A
C
A
A
A
C
C
G
T
G
G
G
A
A
T
C
G
C
T
A
-
A
C
T
-
T
G
C
G
A
T
2
G
A
A
G
G
A
T
T
C
G
G
A
T
C
G
C
G
G
G
C
T
C
G
G
C
T
3
G
G
A
A
T
G
C
G
A
2
T
T
A
T
C
2
2
C
C
C
C
G
C
4
T
T
A
C
C
G
G
C
C
C
A
G
  197,099,398
  197,099,692
  197,099,851
  197,100,043
  197,101,726
  197,101,823
  197,101,825
  197,101,837
  197,102,881
  197,102,931
  197,102,932
  197,103,319
  197,103,779
  197,103,817
  197,104,067
  197,104,489
  197,104,937
  197,105,725
  197,105,802
  197,106,535
  197,107,203
  197,107,257
  197,107,688
  197,108,007
  197,108,117
  197,108,986
  197,110,240
  197,110,416
  197,111,145
  197,111,511
  197,111,881
  197,112,206
  197,112,632
  197,112,753
  197,112,754
  197,112,998
  197,113,383
  197,113,410
  197,114,240
  197,115,093
  197,115,468
  197,116,379
  197,116,392
  197,116,611
  197,116,811
  197,117,641
  197,118,180
  197,118,686
  197,118,983
  197,119,121
  197,120,486
  197,121,046
  197,121,070
  197,121,247
  197,122,739
  197,122,781
  197,123,328
  197,123,533
  197,124,043
  197,124,138
  197,124,530
  197,124,585
  197,124,734
  197,124,789
  197,125,391
  197,125,542
  197,125,804
  197,126,220
  197,126,452
  197,126,893
  197,127,033
  197,127,073
  197,127,154
  197,127,416
  197,127,759
  197,128,251
  197,128,568
  197,128,729
  197,128,860
  197,129,406
  197,129,829
  197,130,383
  197,131,216
  197,131,368
  197,131,449
  197,131,597
  197,131,685
  197,131,748
  197,131,891
  197,132,105
  197,132,604
  197,133,080
  197,133,455
  197,133,469
  197,133,817
  197,134,271
  197,135,250
  197,135,305
  197,135,390
  197,135,689
  197,136,073
  197,136,101
  197,136,681
  197,136,749
  197,137,024
  197,137,306
  197,138,460
  197,138,754
  197,138,813
  197,139,038
  197,139,180
  197,139,508
  197,139,747
  197,140,016
  197,140,830
  197,141,749
  197,141,808
  197,141,882
  197,141,893
  197,141,901
  197,141,932
  197,141,969
  197,141,981
  197,141,984
  197,141,989
  197,142,017
  197,142,063
  197,142,077
  197,142,087
  197,142,093
  197,142,094
  197,142,096
  197,142,104
  197,142,110
  197,142,171
  197,142,173
  197,142,214
  197,142,243
  197,142,247
  197,142,250
  197,142,284
  197,142,314
  197,142,318
  197,142,327
  197,142,328
  197,142,336
  197,142,353
  197,142,359
  197,142,362
  197,142,455
  197,142,898
  197,142,905
  197,142,970
  197,143,314
  197,143,980
  197,144,208
  197,144,281
  197,144,336
  197,147,240
  197,147,570
  197,147,677
  197,148,376
  197,149,391
  197,150,060
  197,151,485
  197,151,569
  197,151,882
  197,152,167
  197,153,901
  197,153,971
  197,154,740
  197,155,745
  197,156,139
  197,156,413
  197,156,707
  197,156,801
  197,157,437
  197,157,684
  197,157,912
  197,157,921
  197,157,961
  197,158,217
  197,158,996
  197,159,350
  197,159,498
  197,159,794
  197,160,033
  197,161,545
  197,161,769
  197,161,906
  197,161,946
  197,162,079
  197,162,478
  197,163,045
  197,163,407
  197,163,765
  197,164,249
  197,164,266
  197,164,647
  197,165,351
  197,165,392
  197,166,262
  197,166,267
  197,166,347
  197,166,500
  197,166,725
  197,167,005
  197,167,062
  197,167,501
  197,167,506
  197,167,513
  197,167,622
  197,167,732
  197,167,837
  197,168,084
  197,168,574
  197,169,245
  197,169,602
  197,169,610
  197,169,883
  197,170,076
  197,170,748
  197,170,776
  197,171,579
  197,171,845
  197,172,533
  197,172,882
  197,172,892
  197,173,196
  197,174,162
  197,174,505
  197,174,893
  197,175,096
  197,175,354
  197,176,494
  197,177,305
  197,177,350
  197,177,607
  197,177,718
  197,177,773
  197,179,877
  197,179,941
  197,180,159
  197,181,199
  197,181,489
  197,182,528
  197,182,888
  197,183,350
  197,183,641
  197,184,290
  197,184,297
  197,186,011
  197,186,236
  197,187,157
  197,188,277
  197,188,403
  197,189,149
  197,189,489
  197,190,124
  197,190,308
  197,190,373
  197,190,548
  197,191,580
  197,191,695
  197,191,845
  197,191,981
  197,192,120
  197,192,408
  197,193,142
  197,193,754
  197,194,960
  197,198,548
  197,198,730
  197,198,759
  197,199,498
  197,199,534
  197,199,940
  197,200,313
  197,201,148
  197,201,260
  197,201,261
  197,201,526
  197,201,815
  197,202,060
  197,202,110
  197,202,716
  197,203,020
  197,203,058
  197,203,121
  197,203,390
  197,204,109
  197,204,729
  197,205,803
  197,206,488
  197,206,502
  197,206,606
  197,206,966
  197,207,352
  197,207,647
  197,207,773
  197,207,854
  197,208,633
  197,208,721
  197,208,766
  197,208,800
  197,209,207
  197,210,157
  197,210,605
  197,210,623
  197,210,625
  197,210,671
  197,211,125
  197,211,623
  197,212,067
  197,212,117
  197,212,148
  197,212,174
  197,212,353
  197,213,846
  197,213,853
  197,214,158
  197,214,343
  197,214,610
  197,214,786
  197,214,913
  197,214,922
  197,214,945
  197,214,977
  197,215,181
  197,215,229
  197,215,321
  197,215,750
  197,215,811
  197,215,826
  197,215,830
  197,215,855
  197,216,109
  197,216,274
  197,216,881
  197,216,889
  197,216,980
  197,217,207
  197,217,277
  197,217,728
  197,218,115
  197,218,173
  197,218,503
  197,218,848
  197,222,952
  197,223,200
  197,223,522
  197,224,203
  197,224,551
  197,224,589
  197,224,723
  197,224,944
  197,224,999
  197,225,556
  197,225,783
  197,226,067
  197,226,296
  197,226,780
  197,227,511
  197,228,218
  197,228,323
  197,228,577
  197,228,955
  197,229,105
  197,230,411
  197,230,526
  197,230,844
  197,232,181
  197,232,535
  197,232,565
  197,232,828
  197,233,224
  197,234,823
  197,234,872
  197,235,029
  197,235,779
  197,235,813
  197,235,823
  197,235,916
  197,236,378
  197,237,016
  197,237,143
  197,238,009
  197,238,320
  197,238,410
  197,238,560
  197,238,779
  197,238,806
  197,239,069
  197,239,098
  197,239,184
  197,239,508
  197,239,899
  197,241,587
  197,243,442
  197,243,517
  197,243,641
  197,243,769
  197,244,004
  197,244,837
  197,245,220
  197,245,770
  197,245,811
  197,246,089
  197,247,145
  197,247,147
  197,248,191
  197,248,247
  197,249,148
  197,249,182
  197,249,229
  197,249,520
  197,252,507
  197,252,681
  197,252,910
  197,253,179
  197,253,245
  197,253,366
  197,253,486
  197,253,493
  197,253,538
  197,253,931
  197,255,517
  197,255,734
  197,257,444
  197,257,449
  197,257,461
  197,257,708
  197,257,789
  197,258,679
  197,259,053
  197,259,745
  197,259,884
  197,259,891
  197,260,499
  197,260,644
  197,260,916
  197,262,826
  197,263,600
  197,264,340
  197,265,608
  197,265,776
G
G
C
G
2
-/C
A
T
A
A
T
T
G
C
T
T
A
T
G
C
G
C
C
-
G
-
A
-
T
C
A
C
C
T
C
T
15
C
A
T
2
G
A
G
T
G
A
A
A
C
C
-
A
C
C
T
C
T
T
C
G
C
C
T
-
A
A
T
T
-
G
G
A
C
G
T
G
T
A
A
T
T
A
A
A
C
A
G
A
T
T
T
G
C
T
C
-
C
C
T
A
T
-
A
A
A
G
A
C
T
G
T
G
T
G
T
A
G
T
G
T
G
G
C
T
C
T
A
T
A
A
C
T
G
G
A
A
3
G
A
G
T
A
C
A
C
T
C
C
-
-
C
G
-
A
T
4
G
G
G
A
-
C
T
-
T
T
G
G
A
T
G
G
G
G
T
-
C
G
T
A
T
G
A
C
A
T
G
T
-
C
G
G
C
A
C
T
T
C
G
A
A
G
C
G
A
-
T
C
A
C
G
T/T
-
-
T
C
A
C
C
G
T
-
G
T
A
A
T
T
G
A
C
A
G
A
G
G
C
A
T
T
-
-
-
C
-
T
G
A
C
T
A
C
C
C
C
G
G
A
C
T
C
T
G
A
A
C
T
A
C
G
C
T
G
-
-
-
A
T
C
T
G
G
A
G
C
G
C
C
6/-
-
G
T
A
T
T
C
A
C
T
T
T
2
A
A
C
A
T
C
T
4
A
A
G
T
C
A
G
-
2
G
G
T
T/A
T
A
A/G
C/A
G/A
G/A
C/A
A/G
T/A
T/C
T/A
T/C
A/-
A/C
C
A
C
T
G
C
T
T
C
C
T
C
A
G
T
G
C
G
T
T
A
A
A
A
A
C
G
G
T
A
T
G
G
T
G
T
C
2
A
A
T
A
G
C
-
T
G
T
A
A
T
C
C
T
A
A
-
A
T
A
T
A
A
A
T
A
T
A
C
T
-
-
A
A
G
G
C
A
A
A
C
2/-
A
-
G
A
T
-
-
T
T
T
T
T
T
-
C
C
-
-
T
A
A
T
T
G
G
C